基因總覽
FAM78B 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 family with sequence similarity 78 member B。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 1q24.1。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000354422 ★ | 166,069,299–166,167,001 | 2 |
| ENST00000338353 | 166,066,684–166,166,969 | 3 |
| ENST00001145814 | 166,066,684–166,167,006 | 2 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>FAM78B ENST00000354422 GRCh38 chr1:166166901-166168001 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCCTGCCAGGCAGGCAGTCAGCCTTTGCTGAATGAAAGGACCAGTGATTGAGGTCTGTGGCTACACGGTA AAATGAGAGAGACGAGTCATCAAAGGGAAAAACTGCTTTTTTGTTAACTATAAAGTGAACCAAGGTGTCA GAACAGTTAAAACAAGGATGAAGAGTGCTTTTAGATCTCAATCAATTTTTAAATTACTCGTCACACCTGT CCTAGCTAAAGACTAACTCTAGCACCTCCTGCGGCCTGTTAGTCAGTATTTCACACTTGGGCAGCAGATC CAGCAAATGTTCAATGATCGCAGAAGAAATACTTAGAAGCTATTGGCTTTGAAAATAAAAATGTAAGAAG ATGCCTAGTAAAAGCATCTGCTAAATATTCTTCCTGTTTGGCACATTAGACTGCAGTATCAGACACATGA CCGTGGTCATACTGTACACAATGCCCAATGTCTGCCAAAACTCTGGCATATGAGAGACTTAGTGCTGGAG TACGGAGGGATTCTTCCGGTATCCCCACTACACACAGTGGTGGAAAGAAGAGCTTCCAGAACAAACCCAG TCAGGCAAAGAGGCAAATACACTGCATTTAGTAACGCTGCTGGAGCCCGCCCTTCACCCTTTCTGAAGGT AGGATACTAAAAGGGCTCAAGCCTAAATCTAATCCAACAAGCTATATTCTGAATAACGACCAATCTCTGA TAAAGCTGTTCCCCTAACCCTTCTGCTGCCCGAAACACTCACTCTACAGCCCCTACTGGGCTACCGGGTT CCCCACTGGACTCTGGACAGCGCCGCGCCCTGCTCGGCCTCACCCACCCGGTGGCGCTTGGGCCCGCCCT AGTCCCCCACCCCCACCCCAGGGCACCACCTACCAGGGCCCCGCCCCGCCTCAGCCCCACGTGCGGGGCC CCACCCCGGCGCTAGCGGCCCTTTAAACACCCCCACCCTTACACATTACCCCCCCCCCACCCGGACGGCA GCCGAATAGGGACAAAACTCATGGCGTACAGCCAGTTTCCTCCGCGGAGCACGTCCTGTGCTGCTCCAGC CGTTGGGGCTCTCCACCCCGGGCCACAGCCTCCTGGCGCCCCCCGGGCCGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FAM78B_1 ↗ | 1:166,166,988 | 負股 | 166,166,978–166,167,037 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_86TWH9 · enhancer · 166164830–166165084 · regulatory
ENSR1_53G48XM · CTCF_binding_site · 166165041–166165062 · regulatory
ENSR1_B37ZD5 · promoter · 166165085–166165845 · regulatory
ENSR1_53G496G · CTCF_binding_site · 166166300–166166321 · regulatory
ENSR1_B37ZDD · promoter · 166166959–166167491 · regulatory
ENSR1_53G49BH · CTCF_binding_site · 166167172–166167193 · regulatory
ENSR1_53G49GR · CTCF_binding_site · 166168096–166168117 · regulatory
· motif · 166165043–166165059 · motif
· motif · 166166302–166166318 · motif
· motif · 166166452–166166465 · motif
· motif · 166166462–166166475 · motif
· motif · 166166631–166166644 · motif
· motif · 166166721–166166734 · motif
· motif · 166167053–166167066 · motif
· motif · 166167174–166167190 · motif
· motif · 166167212–166167227 · motif
· motif · 166167267–166167289 · motif
· motif · 166167267–166167289 · motif
· motif · 166167490–166167501 · motif
· motif · 166167492–166167501 · motif
· motif · 166167733–166167745 · motif
· motif · 166167793–166167805 · motif
· motif · 166167858–166167870 · motif
· motif · 166168098–166168114 · motif
· motif · 166169189–166169201 · motif
· motif · 166169192–166169199 · motif
· motif · 166169331–166169344 · motif
· motif · 166169331–166169344 · motif
· motif · 166169383–166169390 · motif
· motif · 166169383–166169396 · motif
· motif · 166169688–166169701 · motif
· motif · 166169715–166169727 · motif
· motif · 166170185–166170198 · motif
· motif · 166170185–166170198 · motif
· motif · 166170319–166170331 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
ATGGCGTACAGCCAGTTTCCTCCGCGGAGCACGTCCTGTG40CTGCTCCAGCCGTTGGGGCTCTCCACCCCGGGCCACAGCC80TCCTGGCGCCCCCCGGGCCGAGGCAGCCGGGCCGAGGAGT120GTCGGTGTGGTCCGGCTACGGGGCGGGGCCGGCGGGAGCT160CCGGTCGCCGCCGCCGCCGCTGCTGCCTCCGCCTGCCTCT200TGGGCCGCCCGCTCGCCCGCCGCTGGGTGCGCTGCACGCG240GGGGGCAGCCGTGGTGCAGAGGTTCATGCAGCGGCGGCGG280CGGCGGCGGCTGCTGCTGCTGCCGCCGCGGAGGCAGACAG320ACCGGGCGCTGCCACCGCCGCCCTCCCCCGGCTCCATGCC360GCCGCCGCTGCCGCCTCCTCCTCTCCGGCGAGGGGCGGGG400GGCTCCGGCCCGGGGTGGGCACCATTCCTCGCAGCGCCGC440TCCCCTCCCTGCCCTCCGCCCGGGCGCTGGAGCCGGCGAG480GGCACCCGCCGCCTCCTAGGAGTGCACCCTCCGCGCGCCC520TGCCGGAGCGAGGGGGCGGGCGTGGGCGGACGTCGGGGCA560GCGGGGACCCCGCGCGGCTGCAAGAGGAGGGGGCTTCCCC600AAGGATGCCCGGCGGCTCCCCGCTCCTAGGTGCGAGCTGA640GTCTGACCGGGAGCGAGCGGCGCGTCGCCATGCCGGCGTG680ACGGGCGCCCCCGGCTGCCCGCGCGGGCCCCCGCGCTGCC720CCACGCCGCGCCGTGCCGGCACCGGGCTGCAGGATGGGCT760GTATCCAAAGCATCACCTGCAAGGCGCGGATCCGGCGCGA800GAACATCGTGGTGTACGATGTGTGCGCCACCATCGACCAG840TGCCCCACGCGCATCGAGGAGACCTCGCCCATCGTCCTGC880GCTACAAGACCCCCTACTTCAAAGCCTCCGCCCGCGTGGT920CATGCCCCCCATCCCCCGCCACGAGACCTGGGTGGTGGGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。