基因總覽
FAM53C 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 family with sequence similarity 53 member C。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 5q31.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000239906 ★ | 138,338,266–138,349,729 | 5 |
| ENST00000927751 | 138,332,099–138,349,729 | 7 |
| ENST00000927754 | 138,332,099–138,349,729 | 6 |
| ENST00000927755 | 138,332,176–138,349,729 | 6 |
| ENST00000434981 | 138,337,511–138,349,729 | 5 |
| ENST00000927758 | 138,337,511–138,349,729 | 5 |
| ENST00000513056 | 138,338,258–138,347,080 | 5 |
| ENST00000889027 | 138,338,258–138,349,729 | 5 |
| ENST00000889028 | 138,338,258–138,349,729 | 5 |
| ENST00000889029 | 138,338,258–138,349,729 | 5 |
| ENST00000960844 | 138,338,258–138,349,729 | 5 |
| ENST00001132862 | 138,338,258–138,349,729 | 5 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>FAM53C ENST00000239906 GRCh38 chr5:138337266-138338366 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTACATTCAATCTCTTTAAAAAAGACTTAAATTTTGGCTCATGTGGGAGGTGGTGGTAGTGGTGGAGACT TAATAAAAGGTGGTTTTGTCTTCCTGAAGTGGAAATATAGCGCCGTCAACATCTTTTCCCCATCTGCCTG TTTCCTCCTTCCCTTTCTGTTTAAGGAAAGTCTAACCACCGCACTTCTCCCCACCTCCCCGCACCTCCCC CCAGGCAAACGCAAGCAACTGAACCGCCTATGATGTCATAATCACAATCCCATTACCTCATCCTGCTGGG GGGGAGGGGGCGGAGAGAGAAGAGAGGGAGTGAACAGCCCTGGGCTATCCTGAGCTTTACAAAGTGTTCT GGGTGAGGGCAAATTACAGAACCAAGTGGAAACGTCCCCGCAACCATTATAAGTCCTGGGTTTTTAAGGT TCAGGCCGATCCGGCAGCTGCAAGAGGGGCTCCTGGGACTCCGAGCAGGCCCTAATCCGCGCTTGGACCA CACTTCCCAGCAGCCTTCACGCCGCGGACGGGTCCTTTGCTGGGGGAAGGGGGATTCCTTCGAAGAGGTG GTCGTGGAGGGCGGGGCAGCAGAGCAGGTGAGGGGCACTGTGGCTAATTGCGTGACGCGGCCCGAACCGA GTGGGAGGCTGCAGTTGGGCCGTTGGAGGGAGGGAGGGCAGGGGCGATGCCTTTGTTTACCTTCTTCCGA CATGGCCTCCCCCGCGGGTTTCAAGATGTGCCTCCAACTGGGGCCGTCCACTTTCTGCGATATTTTGGAG GGGGTGACTCGTTAGTGAGGAAACCACCCCCATCCCTAAATCAAAGCGCCAGGCTCGTTCCCAACAGCGC TGTCCGAGAGACACTTTGAGAGAGACACGACACGGAGCTGCGCCCTCCATGGGTGGCTTGGGGGGATTCT GCGAGCCGGAGCTGTCCCCCTACTCTCCTCAGGGACTCGTTGGTTCGCGCCAGCGCCTTTTAAGGGCACC GTGGGGCGAACCGAGCGCTCAGAGCTGCTCCGGCCGCGGCCCTGGGAGCTGGAGGAACCGCGGTAGGTGG TGGAGGGCAGGTGGCGCTGGGGCCTCGGGGCGGGCACCTCAACCGTCCCTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FAM53C_1 ↗ | 5:138,338,266 | 正股 | 138,338,217–138,338,276 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR5_7B5M48 · enhancer · 138336916–138337027 · regulatory
ENSR5_942WJ6 · promoter · 138337065–138337521 · regulatory
ENSR5_942WJC · promoter · 138337776–138338276 · regulatory
ENSR5_942WJJ · promoter · 138338345–138338845 · regulatory
ENSR5_537JJMC · CTCF_binding_site · 138338777–138338798 · regulatory
ENSR5_7B5M7L · enhancer · 138339846–138339947 · regulatory
· motif · 138337453–138337463 · motif
· motif · 138337466–138337476 · motif
· motif · 138337503–138337516 · motif
· motif · 138337503–138337516 · motif
· motif · 138337545–138337555 · motif
· motif · 138337551–138337561 · motif
· motif · 138337832–138337842 · motif
· motif · 138337891–138337904 · motif
· motif · 138337970–138337983 · motif
· motif · 138338056–138338066 · motif
· motif · 138338058–138338068 · motif
· motif · 138338199–138338212 · motif
· motif · 138338199–138338212 · motif
· motif · 138338381–138338391 · motif
· motif · 138338456–138338466 · motif
· motif · 138338460–138338470 · motif
· motif · 138338779–138338795 · motif
· motif · 138339699–138339712 · motif
· motif · 138341580–138341591 · motif
· motif · 138343239–138343247 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：392 aa
Protein FAM53C 長 392 個胺基酸，屬於 FAM53 family。序列註解指出四段無序區，分別位於第 78–119、141–167、204–294 及 341–364 個胺基酸；其中第 204–294 位區段最長。
蛋白質三維結構
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- DYRK1AQ13627 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- HEL2V9HW98 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MEOX2Q6FHY5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NCK2O43639 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- SFNP31947 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SORBS3O60504 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YWHAGP61981 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AGAGCTGCTCCGGCCGCGGCCCTGGGAGCTGGAGGAACCG40CGACTCAGCAGGCATGACTGGAGAGGGAAGTCCCAATGGT80GCTAGAATGGTGCTGCAGTGGCAGAAGACGGCTCACAAGT120GAGGTCTGGAAGAACAACAGGGAAGACATCCATCATTTGC160TCCAAAGTGTGCAAGTCAAATCCTGGGGAGAATCATGATA200ACCCTGATCACTGAGCAGCTACAGAAGCAGACTCTGGATG240AGCTGAAATGCACACGCTTCAGCATCAGTCTGCCTTTGCC280TGATCATGCAGACATCTCCAACTGTGGGAACTCTTTCCAG320CTTGTGTCTGAAGGTGCTTCCTGGAGGGGCCTGCCCCACT360GTTCCTGTGCTGAGTTCCAGGACAGCCTCAACTTCAGCTA400CCATCCCTCAGGCCTGAGCCTGCACCTCAGACCACCCAGT440CGGGGAAACTCCCCCAAGGAGCAGCCCTTCTCCCAAGTCC480TAAGACCTGAGCCCCCAGATCCAGAGAAGCTTCCTGTGCC520CCCTGCCCCTCCATCCAAGAGGCACTGCCGCTCACTCTCA560GTGCCCGTGGACCTGTCTCGCTGGCAGCCGGTGTGGCGGC600CCGCCCCCTCCAAGCTGTGGACTCCCATAAAGCACCGGGG640CAGTGGTGGAGGGGGTGGGCCGCAGGTGCCTCACCAGAGC680CCCCCAAAGCGGGTCTCCAGCCTCAGGTTCCTCCAAGCTC720CCAGTGCCTCTTCTCAATGTGCCCCAGCTCACAGACCCTA760CAGCCCTCCTTTCTTCAGCCTGGCCCTGGCCCAAGATTCC800TCTCGACCCTGCGCCGCCTCCCCTCAAAGTGGCTCCTGGG840AGAGTGATGCTGAGTCCTTGTCACCTTGCCCACCTCAGCG880CCGCTTCTCCCTGTCACCCAGTCTGGGCCCGCAGGCAAGC920CGCTTCTTGCCCTCTGCCCGGAGCTCTCCCGCATCCTCCC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。