演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

FAM234ADKFZP761D0211

family with sequence similarity 234 member A

FAM234A 的基因身分與分類資料已收錄,功能註解尚待補充。

Homo sapiens16p13.3UniProt Q9H0X4
OFFICIAL SYMBOL
FAM234A
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q9H0X4
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

FAM234A 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 family with sequence similarity 234 member A。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 16p13.3。

Official symbol
FAM234A
Gene name
family with sequence similarity 234 member A
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14163
UniProt
Q9H0X4
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
DKFZP761D0211FLJ32603C16orf9ITFG3

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.3
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegFAM234Apq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr16:234,521–272,183
Gene span
37,663 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000399932 ★234,821–266,09613
ENST00000301679234,521–270,08014
ENST00000301678234,521–266,12013
ENST00000872365234,521–266,12113
ENST00000872366234,521–266,09613
ENST00000872367234,521–266,12113
ENST00000872368234,521–266,12013
ENST00000872369234,521–266,11811
ENST00000872370234,521–266,12014
ENST00000872371234,521–266,11612
ENST00000872372234,521–266,12014
ENST00000872373234,521–266,12113

顯示 12/104 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用;有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 234821 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>FAM234A ENST00000399932 GRCh38 chr16:233821-234921 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCAAGATCTCAGTTCACCGCAAACTCTTGCCTCCCAGGTTGAAGCAA
CTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTATGATTACAAGCACGCGCCACCAAGTCCAGCTAATTTTGGAT
TTTTAGTAGAGACTGGGTTTATACATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACC
TGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCCCTAGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTTTTGAGACACGGTCTGGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAGTCTAAGCTCACTGCA
ACCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCG
CCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACAGTGTTAGCCAGGATGGTCT
CGATCTCCTGACCTTGTAATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCGTGAGCCACCG
CCCCCGGCCCTGGCACCGTATTTCAAGGCCGAAAATTCGCATCCTCAGTGCCAGCAATTCTCCTCGTGGT
CAAAGAGGAGAAACACTGGGGAGAGCACCCGGAAGCGGGGGCGAGGACGCAGATCGGGGGTCGACGTCAA
GAAAGAAGGCGGGAAGAGGACAAGGTCGGGAGAGGAGGAGGAGGGGAGCGAGGACGCAGAGAAGGAGGGG
AAAGAGGACGGAGAGGAGCGAGGACGGAGGGGGGACGGGAACGAAGAGGGGCGAGGACGTTCAGCATCCA
TTGCGACAGCGACAAACAGGACACCGCCAGGTTCCCGGCGGAGGCAGCGCCCAAGATCCCCGTTGCCGAG
CAACCGAAGCATGGCGGTGGGGCGGGGTCGGAGCCTGCGCATTTCCGCCCCCGCCCGCCCGGCTGGTCGG
AAGTGACGCCAGGGGGCGGGGCCAGCGGCGCGGTCGGGTGAGAGGCCGCGGCGGCAGGTGAGTGAGCGCG
GCCTCGTACTCGCGCGTGCACGCCGCAGGGGCGCCGCAGGCCGCCCCTTCG
FAM234A 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 7 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
FAM234A_3 ↗16:234,501正股234,452–234,511
FAM234A_1 ↗16:234,830正股234,781–234,840
FAM234A_7 ↗16:240,210正股240,161–240,220
FAM234A_4 ↗16:249,538正股249,489–249,548
FAM234A_2 ↗16:254,375正股254,326–254,385
FAM234A_5 ↗16:259,521正股259,472–259,531
FAM234A_6 ↗16:264,847正股264,798–264,857

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_86XR · enhancer · 231098–231296 · regulatory

ENSR16_94HR · enhancer · 234121–234446 · regulatory

ENSR16_94HW · promoter · 234447–234856 · regulatory

ENSR16_53H94 · CTCF_binding_site · 234802–234823 · regulatory

ENSR16_CM2 · enhancer · 234857–235887 · regulatory

ENSR16_94KG · enhancer · 239791–240268 · regulatory

· motif · 234310–234325 · motif

· motif · 234315–234327 · motif

· motif · 234318–234333 · motif

· motif · 234377–234390 · motif

· motif · 234476–234487 · motif

· motif · 234476–234487 · motif

· motif · 234478–234487 · motif

· motif · 234482–234495 · motif

· motif · 234730–234746 · motif

· motif · 234760–234771 · motif

· motif · 234770–234781 · motif

· motif · 234770–234784 · motif

· motif · 234774–234787 · motif

· motif · 234804–234820 · motif

· motif · 237766–237779 · motif

· motif · 237766–237779 · motif

· motif · 239447–239458 · motif

· motif · 239767–239778 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:552 aa

1 aa552 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 Q9H0X4 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Protein FAM234A 長 552 個胺基酸,屬於 FAM234 family。其 N 端第 1–49 個胺基酸位於細胞質,第 50–70 位形成螺旋跨膜區,並作為 type II 膜蛋白的訊號錨定序列;第 71–552 位於細胞外。第 1–40 位另註記為無序區。

拓樸區域Cytoplasmic1–49 aa
跨膜區Helical; Signal-anchor for type II membrane protein50–70 aa
拓樸區域Extracellular71–552 aa
功能區域Disordered1–40 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9H0X4…

AlphaFold · Q9H0X4

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane

FAM234A 被註記為膜蛋白,屬單次跨膜的 type II 膜蛋白。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
DKFZP761D021FAM234ASLC16A2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
細胞定位FAM234A 被註記為膜蛋白,並具有單次跨膜的 type II 膜蛋白分類。推論支持
證據與來源

Membrane / Single-pass type II membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000399932 · 2,909 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCCAGCGGCGCGGTCGGGTGAGAGGCCGCGGCGGCAGGTC40
41CACCTGGGCTTGCGAAGGCACAGATTCCCCGTCCACAGCT80
81CACGACCAGATGCACCAGCAGGAGTCCACATCGAGGACGT120
121CCTCCGGGCACTCCCACGACCAGTGACCAGGAGTTAAACT160
161TTGGGATGTGCCCGTGATGTTGGACCACAAGGACTTAGAG200
201GCCGAAATCCACCCCTTGAAAAATGAAGAAAGAAAATCGC240
241AGGAAAATCTGGGAAATCCATCAAAAAATGAGGATAACGT280
281GAAAAGCGCGCCTCCACAGTCCCGGCTCTCCCGGTGCCGA320
321GCGGCGGCGTTTTTTCTTTCATTGTTTCTCTGCCTTTTTG360
361TGGTGTTCGTCGTCTCATTCGTCATCCCGTGTCCAGACCG400
401GCCGGCGTCACAGCGAATGTGGAGGATAGACTACAGTGCC440
441GCTGTTATCTATGACTTTCTGGCTGTGGATGATATAAACG480
481GGGACAGGATCCAAGATGTTCTTTTTCTTTATAAAAACAC520
521CAACAGCAGCAACAATTTCAGCCGATCCTGTGTGGACGAA560
561GGCTTTTCCTCTCCCTGCACCTTTGCAGCTGCTGTGTCGG600
601GGGCCAACGGCAGCACGCTCTGGGAGAGACCTGTGGCCCA640
641AGACGTGGCCCTCGTGGAGTGTGCTGTGCCCCAGCCAAGA680
681GGCAGTGAGGCACCTTCTGCCTGCATCCTGGTGGGCAGAC720
721CCAGTTCTTTCATTGCAGTCAACTTGTTCACAGGGGAAAC760
761CCTGTGGAACCACAGCAGCAGCTTCAGCGGGAATGCGTCC800
801ATCCTGAGCCCTCTGCTGCAGGTGCCTGATGTGGACGGCG840
841ATGGGGCCCCAGACCTGCTGGTTCTCACCCAGGAGCGGGA880
881GGAGGTTAGTGGCCACCTCTACTCCGGCAGCACCGGGCAC920
921CAGATTGGCCTCAGAGGCAGCCTTGGTGTGGACGGGGAAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。