基因總覽
FAM13B 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 family with sequence similarity 13 member B。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 5q31.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000689681 ★ | 137,937,960–138,033,079 | 24 |
| ENST00000033079 | 137,937,960–138,033,114 | 23 |
| ENST00000425075 | 137,937,960–138,033,086 | 22 |
| ENST00000420893 | 137,937,960–138,033,114 | 22 |
| ENST00000874970 | 137,937,960–138,033,114 | 23 |
| ENST00000874971 | 137,937,960–138,033,114 | 24 |
| ENST00000874972 | 137,937,960–138,032,727 | 23 |
| ENST00000921477 | 137,937,960–138,032,727 | 24 |
| ENST00000956469 | 137,937,960–138,033,114 | 23 |
| ENST00000956470 | 137,937,960–138,033,114 | 25 |
| ENST00000956471 | 137,937,960–138,019,898 | 21 |
| ENST00001137615 | 137,937,960–138,033,114 | 24 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>FAM13B ENST00000689681 GRCh38 chr5:138032979-138034079 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTACACATGGTTTACTCTCTCTGATGAAATGTGGGAGACACTGTGGCCTCTGTAGCCCATTTACAGATCA TTTCATAGGGTAACTTTATTTTTTTCAAATCTTGTCCCAAGTTCTATGAGGGTTCTTGTTTTACATTTTC CAAGTTACTAACTTCCAGCTCAGGTAGGTAAGGGACAACTGAATTGTGGTGGCTGCTATTTTTTGTGCAG GTGTTGATCTACCGGCTGTCAAGGAGTCCAAATGGAAGATCTCAAAGCCCTTAACAGACTATAACAAAGA AGAGATTGGCTGAATATTCATACCCTTGTGAGTTCAAGGGAGTTGTAGGGATGGTCTGGGTAGCCATGCA AGTTCAGAGAGCTCATTCTTTCTGCCTCCTTTCAGCTCTGCCTCCGCAGCTGGCTGATTTTAGTATACGA AGCTCCCTGTAAGCCCGCAGCCTATCGACTTCCACAGTCCCAGACTAAGGCACCGAAGCCTTACTGTTCT CTCTGGAGTCTAGGTCAGGTCCTGAGGTGAAGGGGTAGGGTGGGGGCGGGCAGGACGCAGGTGCAGCCCC GTGGTCCCGGATCTAACTCACATCTCTGGGAATGGGAACCGAAGTCACCGCTTAGGTCTCCCCCAGCGGT TTTCGGTTCAGGTCTCTGTGCTCCTCACCTGGATATGGGCGCCCTGGGGGCCTGGCTTCCTCCGCAGAGA CCAGAAGCGATCTCTGTGTTCCGGATTTTCCCTTTATCTTTCCTCTCCCCAGTGTCCTCTCTGTTTCCCA ACCTCCCCATACCGAGGACCCCACAACCCGCCCCGGGATGGCGCCTGGCTGCTCGCACCCTAATTCAGGA CCCCAATTGGTGGGAGAGGAACCGCGGTCCTCAAGCTTGCAGGACACAGGGCCGCTGCCCGGAATGCTGT GGGGGTGGGGACCCTCGCCGCCCCGCCCCCACCAGCGGCCTGCCCCGCCCCCTCCCACGCACGTCACGTC CGGCCCGGCCTCCGCCCGCCAGCCGCTCTCCTCCCGCTCGCCGTTAGGGAGGCTCTGCACCTCAGCCGCC GCCTCTGTCGCCACTCTCTCCCCCTGTTCCGCGTCTGCGTCGCCACCACCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FAM13B_1 ↗ | 5:138,033,079 | 負股 | 138,033,069–138,033,128 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR5_863KFK · enhancer · 138028357–138028573 · regulatory
ENSR5_942R8Z · promoter · 138032284–138032784 · regulatory
ENSR5_863KJ6 · enhancer · 138032785–138033020 · regulatory
ENSR5_863KJ9 · promoter · 138033021–138033172 · regulatory
ENSR5_CHNS4 · enhancer · 138033173–138034363 · regulatory
ENSR5_B32DMH · enhancer · 138035723–138036570 · regulatory
ENSR5_537GLQG · CTCF_binding_site · 138036185–138036206 · regulatory
· motif · 138028442–138028455 · motif
· motif · 138028442–138028455 · motif
· motif · 138028571–138028584 · motif
· motif · 138028665–138028677 · motif
· motif · 138028667–138028674 · motif
· motif · 138028667–138028682 · motif
· motif · 138028718–138028729 · motif
· motif · 138028801–138028813 · motif
· motif · 138028803–138028810 · motif
· motif · 138028803–138028818 · motif
· motif · 138029037–138029050 · motif
· motif · 138032320–138032329 · motif
· motif · 138032320–138032329 · motif
· motif · 138032322–138032334 · motif
· motif · 138032446–138032458 · motif
· motif · 138032448–138032455 · motif
· motif · 138032586–138032599 · motif
· motif · 138032632–138032641 · motif
· motif · 138032674–138032685 · motif
· motif · 138032743–138032754 · motif
· motif · 138032743–138032754 · motif
· motif · 138032778–138032795 · motif
· motif · 138032829–138032846 · motif
· motif · 138033107–138033120 · motif
· motif · 138033112–138033122 · motif
· motif · 138033113–138033126 · motif
· motif · 138033118–138033128 · motif
· motif · 138033135–138033148 · motif
· motif · 138033140–138033150 · motif
· motif · 138033159–138033169 · motif
· motif · 138033161–138033171 · motif
· motif · 138033161–138033174 · motif
· motif · 138033223–138033234 · motif
· motif · 138033275–138033285 · motif
· motif · 138033374–138033391 · motif
· motif · 138033441–138033456 · motif
· motif · 138034042–138034064 · motif
· motif · 138034042–138034064 · motif
· motif · 138036121–138036134 · motif
· motif · 138036121–138036134 · motif
· motif · 138036187–138036203 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：915 aa
Protein FAM13B 長 915 個胺基酸，屬於 FAM13 family。其 N 端第 23–212 位胺基酸含有 Rho-GAP domain；第 487–521 位與第 621–671 位則各有一段預測為無序的區域。
蛋白質三維結構
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AGCCGCTCTCCTCCCGCTCGCCGTTAGGGAGGCTCTGCAC40CTCAGCCGCCGCCTCTGTCGCCACTCTCTCCCCCTGTTCC80GCGTCTGCGTCGCCACCACCGCCGGGGGTATCCGGGGGGT120CGCTTACCGGGCTGGCCCCGCGCCACAGCCGTAGCTTTAA160CCTCCCGTCAGCGGCCGCCCCAGGAAGAGGCTTCTCGGCC200GCGGAGCCACTTGGGGCCTCAGTTCTCGCCCTCTTGCCGT240CGCCGCGGGTCCTGGAGAAGCGGCCGCGGCCAGGGAACGG280GGCATCGCGGTTCCAACGATTAACTGCTGAAGTACTGATC320GAGTTCTGCATTTCTTCAATGAGGAACTACAGGCTGATCT360TCTGCCATAATCTCAAACAGCCATAAATGACAAAAGAATG400CTTGCTCAGTGAGGGTAGCTGGTGCAGAAGCCATTTTTTA440AACTTAGGTATTTAAGTACTGAAAGAAAAGACAGCTTTGA480TTTCTGGCTGCAAAAAAGATATGAGGAAGAGCTCCTCCCC520TTCCTTGAGTAACTGCAACTCCGTTCTTGCTAACAAAATA560TTTGGAATTCCACTTGATGAGCTGCAGCAGGGAGGACATC600CAGACAATGAGGTTCCATTCATAGTCCGCCACGTTGTGGA640CTATATTGAGGAACATGGAGGTCTGGAGCAACAAGGACTT680TTTCAAGTCAATGGAAATGCTGAGACAGTGGAGTGGCTTC720GGCAGAGATACGACAGCGGAGAAGAGGTGGATTTGGTTAA760GGAAGCAGATGTTCCCTCAGCTATTAGCCTTCTTAGATTT800TTTCTTCAAGAACTTCCTGAACCTGTTATCCCTGGCAGTT840TACATATTCACTTGATGCAGCTTTCTCAAGATTATAATAA880TGAAGATGAATTTGGAAGAAAGTTGAGGTTCCTCTTGCAA920CAGCTTCCACCTGTTAATTATAGTTTGTTAAAGTTTCTGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。