基因總覽
FAM117B 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 family with sequence similarity 117 member B。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 2q33.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000392238 ★ | 202,634,969–202,769,757 | 8 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>FAM117B ENST00000392238 GRCh38 chr2:202633969-202635069 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATGGATAGGCAATTTATAGCCAGACAGGTGGGAGTGTAGGTTTTGGCTCCACCATTTTTTATTTTCTTGA TGAGGAGCCCTTTAGGTCATTTTAGAAATAGTGTCACTGCCTGCCTTCCCGAGTCTTTGCCACACCAAAG ACTTGTTTCCTCCGCTAGACAAAAATATGGATGGCTGTCCCAGTTCTGTCTCAAACAATGATCGTGTAGA ATCAAATAAGGCCCTCTGTAAACTATAGCACTTTACAAACTGGTAAGGTAGCAGCCATCCTTCCAAGGTA TCAGGGAACAGCGAAGCAGCTGATTAAAATAGTCTTGATTACTTGAGATACAGGAGGGTAGGAATAACAT GTGGTAACTGAACTCTATAGATACTATCTAAAATCGCATTCTAACAGGCAAGTTTAATCTTTCTGAGATT TGCCTCTTTGTAGAGCTCTAAAAAATAAAAGGAGAGGGGCGTAAAATGCCAGTAAGATTAGTTAAATTTC TTCTCCTTTTGAGCCCTGCCCATAGGTAGATGGAATTAGGGCAGAACAAAAACATTAAGAATAAAAGCCC GAACGAGATGCGCGTACAGGTGAACACAAGTGAACACTGGGGTAAGGAAATGAGTTATGCGGAAAAGGCT TCAGACCATCCCTGGGAACTGCTCCGGGTCTGGACATTTCCTTTGGCAACCTTCCAGAGTCTGAGTCCCC AGGGCTCCCCCCGGCGGGAAAGGAAAGGCGCGCGTGGCTAGGCGCGCGCGTACACGGGCACTCACGTGTA CACACACACGCGCGCACACTACACATACACACAGGGCCCATTTCCTCCGCTCCCTCCCCGCGGGGGGCGG GTCTCTTTCTCTTTAAAGAGCAGACGGTCTCCGCGCACACCCAGGCTCTCAAGGCCTCGGGGGCCCGGGA CCCGAGCTGCTCGTAGCCAATGGGAGCAGTGGAGCGGCTCGAGCGCGGCTGACGCTGCACCAATGGGCGA TCGTGGGGGGCGGGGGCAGCAGAGGAGACACTATTGTTGATGAGGAGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCT GCACCACCTCGTTGCTGCCTGCCCCGGCCCGGTCTCCCCCTGCACCCCGGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_94ZFK7 · enhancer · 202632751–202633165 · regulatory
ENSR2_94ZFKP · promoter · 202634479–202634979 · regulatory
ENSR2_53QMTD5 · CTCF_binding_site · 202635016–202635037 · regulatory
ENSR2_87XT8J · enhancer · 202638184–202638427 · regulatory
ENSR2_53QMTX9 · CTCF_binding_site · 202638293–202638314 · regulatory
· motif · 202632861–202632874 · motif
· motif · 202632861–202632874 · motif
· motif · 202633115–202633121 · motif
· motif · 202634583–202634594 · motif
· motif · 202634584–202634595 · motif
· motif · 202634662–202634675 · motif
· motif · 202634709–202634720 · motif
· motif · 202634741–202634752 · motif
· motif · 202634741–202634752 · motif
· motif · 202634801–202634811 · motif
· motif · 202634954–202634964 · motif
· motif · 202634955–202634968 · motif
· motif · 202635018–202635034 · motif
· motif · 202635237–202635254 · motif
· motif · 202635660–202635669 · motif
· motif · 202635933–202635944 · motif
· motif · 202637475–202637490 · motif
· motif · 202637480–202637492 · motif
· motif · 202637632–202637647 · motif
· motif · 202637743–202637758 · motif
· motif · 202637743–202637758 · motif
· motif · 202637744–202637758 · motif
· motif · 202637797–202637810 · motif
· motif · 202637797–202637810 · motif
· motif · 202637926–202637941 · motif
· motif · 202638112–202638127 · motif
· motif · 202638295–202638311 · motif
· motif · 202638828–202638840 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：589 aa
Protein FAM117B 長 589 個胺基酸。序列註解標示三段無序區域，分別位於第 1–310、370–464 與 556–589 個胺基酸；其餘區段未列出無序註解。
蛋白質三維結構
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 24 個夥伴
- AGR2O95994 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
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- WFS1O76024 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AGAGGAGACACTATTGTTGATGAGGAGCGGCGGCGGCGGC40GGCGGCGGCTGCACCACCTCGTTGCTGCCTGCCCCGGCCC80GGTCTCCCCCTGCACCCCGGAGTCCGGCTTCGTCACCCCG120TCTTGGGGGGCCTGCCCTCCGGCCTCGAGAATCCTCCCCC160TGCAGCCCAACAACAACAAAACCCCCCGTCTCGCCCAGTC200ACCGGGGAGGGGGGGGACCATGTCCCAGCGGGTGAGGCGC240AATGGGTCCCCCACGCCGGCCGGCTCCCTTGGGGGTGGTG280CGGTGGCCACGGCCGGGGGACCCGGGAGCCGCTTGCAGCC320CATGAGGGCGACGGTTCCGTTCCAGCTGAAGCAGCAGCAG360CAGCAGCAACATGGCAGCCCCACGCGGAGCGGCGGCGGCG400GCGGCGGCAACAACAACGGTGGCTGCTGTGGTGGCGCCTC440AGGCCCCGCAGGCGGCGGCGGCGGCGGTGGCCCGCGCACC480GCCTCGCGCAGCACCAGCCCCACGCGCGGCGGCGGGAACG520CGGCCGCGCGCACCAGCCCCACGGTGGCCACGCAGACGGG560CGCGTCCGCGACGTCCACGCGAGGCACCAGCCCCACGCGC600AGCGCCGCGCCTGGAGCTCGCGGGAGCCCCCCACGGCCGC640CGCCGCCGCCGCCGCTGCTGGGCACCGTGTCGTCGCCCAG680CTCGTCGCCCACCCACCTGTGGACCGGCGAGGTGAGCGCG720GCCCCACCCCCAGCCCGCGTCCGGCATCGGAGGAGGTCTC760CGGAGCAGAGCCGAAGCTCGCCGGAGAAGAGGAGCCCCAG800CGCCCCGGTTTGCAAAGCAGGTGACAAAACACGACAGCCT840TCTTCAAGCCCCTCCAGTATTATCCGACGCACTTCCTCCC880TGGATACTCTTGCTGCACCGTATCTTGCTGGACACTGGCC920TCGGGATAGCCATGGGCAAGCTGCACCTTGCATGAGGGAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。