基因總覽
EXOC5 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 exocyst complex component 5。其蛋白質屬於 SEC10 家族,並為 exocyst complex 的組成部分。現有資料未提供蛋白質長度、結構域或其他序列特徵,因此不據此延伸描述其分子結構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000621441 ★ | 57,200,507–57,268,905 | 18 |
| ENST00000340918 | 57,200,507–57,268,921 | 17 |
| ENST00000854286 | 57,200,507–57,268,974 | 18 |
| ENST00000854287 | 57,200,507–57,268,921 | 14 |
| ENST00000854288 | 57,200,507–57,268,921 | 15 |
| ENST00000854289 | 57,200,507–57,268,921 | 18 |
| ENST00000854290 | 57,200,507–57,268,921 | 18 |
| ENST00000854291 | 57,200,507–57,268,921 | 17 |
| ENST00000970530 | 57,200,507–57,268,921 | 17 |
| ENST00000970531 | 57,200,507–57,268,921 | 18 |
| ENST00001137520 | 57,200,507–57,268,921 | 18 |
| ENST00001126850 | 57,239,480–57,268,921 | 4 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
EXOC5 是 exocyst complex 的組成部分。此複合體參與胞吐囊泡的停靠,使囊泡能停靠於質膜上的融合位點。現有資料支持的功能描述限於此停靠作用,未提供更詳細的分子機制或其他生物學過程。
Promoter 與基因調控
>EXOC5 ENST00000621441 GRCh38 chr14:57268805-57269905 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCGGAGATCGCACCACTGCACTCTAGCCTGGGGAACAGAGCGAGA CTCCGTCTCAAAAAAATAAAAACAAAAAAATAAAAGTCTGATATAACTTAGCATGGATTTTTCAGTAGAA TAAGTTAAAATGTTCTGGAACGATTTTGTCAATGCATGTTGAAAAATCTGAAAATGTTTAGTGCTCAGTA AATTTTCTACCGTTCCCTTAGTCATCTCCATTTTAATTCTAAGCAGACGGAGGTCATTTTAAAACACAAT ACTAATAGAAAACATATACCGTAAATAATATGTACCAGTCATCAACTCAATTCTCACAACACTGTAAGGT AGGACTATTAAAATCTCCATTTAACAGACGAAACAGAGGTCTGTTAACTGGCTAGCCCAAGGTCACGCAG CTATTCGTGGCAAACCTGGGCCACGAAGCACCACAAAACTATGCTACTTCATCGATCTTCTGATCCATCA TCCCTGAGGATTCAGATTTGCATTTACCTGGAGAATCTCACGGTGCCACAAAGTGGAGTTCCCGGTTCGT GGCTTATGAGCCACACTGCCCGCTGCGCCATGGTTAAGTCAGTAAAGCATTAGCTCATCTCATAATTAAG GTCGCCACCGAGGAACAGCGCAGACCGGCTTTCTCAGACAGACTCTTAACAGAAGCCCTGAGGCTCATCC TGCGCCGCATACCGGTCGCGCTCAGCAGAGAGGTTAGCTTTTTTAGGTGAAGTCACTAACGCTTCTGAGT CGCTCTAGGCCAACACACACCACAAAAAGTTCTAAGAACCCCAACCTATAACCTTGAGAAATTTACCTAT ACCCTGCAACTCCGGTATTTTCTTCCTCTAAATTCTACTTCCGGAATGGTGGCCCGCAAGGATCAAAGTT CCTCATACACGGTAGCGTCGAGCCTTTTTTCGGTTCTTTCGCCGCTCGTTTTATTCGCCGGCCCCTCCCG ACAACCTCCCTGGCGCGCGCAGTTCCACTTCCGGCGTATGAGGCGGTGACAATGGGAGCAGCGCGGGCGG CGCCGGGAGGCAGCTGACAAGCGTTTGCGGCTTCGCTTCATGGCCGCTCTC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| EXOC5_1 ↗ | 14:57,268,840 | 負股 | 57,268,830–57,268,889 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR14_83NGF6 · enhancer · 57266151–57266327 · regulatory
ENSR14_BFCTC · enhancer · 57267979–57268888 · regulatory
ENSR14_5HGNPQ · CTCF_binding_site · 57268664–57268685 · regulatory
ENSR14_83NGGQ · promoter · 57268889–57269066 · regulatory
ENSR14_C7NFQ · enhancer · 57269067–57270104 · regulatory
· motif · 57268211–57268228 · motif
· motif · 57268373–57268386 · motif
· motif · 57268373–57268386 · motif
· motif · 57268443–57268453 · motif
· motif · 57268498–57268510 · motif
· motif · 57268572–57268587 · motif
· motif · 57268666–57268682 · motif
· motif · 57268889–57268900 · motif
· motif · 57268889–57268900 · motif
· motif · 57268891–57268900 · motif
· motif · 57268992–57269007 · motif
· motif · 57268992–57269007 · motif
· motif · 57268993–57269007 · motif
· motif · 57268994–57269007 · motif
· motif · 57269019–57269030 · motif
· motif · 57269019–57269030 · motif
· motif · 57269021–57269030 · motif
· motif · 57269081–57269094 · motif
· motif · 57269321–57269338 · motif
· motif · 57269341–57269356 · motif
· motif · 57269390–57269403 · motif
· motif · 57271723–57271734 · motif
· motif · 57273447–57273462 · motif
· motif · 57273447–57273462 · motif
· motif · 57273448–57273462 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
細胞內定位
EXOC5 定位於細胞質與中體。 其在中體的定位需要 RALA、EXOC2 與 EXOC3 存在。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Midbody。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 46 個夥伴
- BARD1A0AVN2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BARD1Q99728 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BDNFP23560-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BRMS1LQ5PSV4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C1orf216Q8TAB5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC102BQ68D86 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CRYABP02511 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CRYBB1P53674 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DEUP1Q05D60 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- EDRF1Q3B7T1-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ENO2Q6FHV6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EXOC6Q8TAG9 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- EXOC6BQ9Y2D4 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- FGAP02671-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FRMD6Q96NE9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GAPDHP04406 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HDDC3Q8N4P3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HGSA0A0S2Z4Q4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HGSO14964 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IFT57Q9NWB7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KIFC3Q9BVG8-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KXD1Q9BQD3 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MAGEA3P43357 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAGEA6P43360 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
依相似性推定,exocyst complex 由 EXOC1、EXOC2、EXOC3、EXOC4、EXOC5、EXOC6、EXOC7 與 EXOC8 組成。EXOC5 與 EXOC3L1 的互作也屬依相似性推定。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | EXOC5 是 exocyst complex 的組成部分,參與胞吐囊泡在質膜融合位點的停靠;此敘述界定其複合體角色與相關細胞作用。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Component of the exocyst complex involved in the docking of exocytic vesicles with fusion sites on the plasma membrane |
| 交互作用 | 依相似性推定,exocyst complex 包含 EXOC1 至 EXOC8;另依相似性推定,EXOC5 與 EXOC3L1 互作,這些內容均屬推論性註記。 | 推論支持 | 證據與來源The exocyst complex is composed of EXOC1, EXOC2, EXOC3, EXOC4, EXOC5, EXOC6, EXOC7 and EXOC8 (By similarity). Interacts with EXOC3L1 (By similarity) |
| 細胞定位 | EXOC5 位於細胞質與中體;其在中體的定位需要 RALA、EXOC2 和 EXOC3 存在,來源未指出這些條件是否適用於其他定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Midbody; Localization at the midbody requires the presence of RALA, EXOC2 and EXOC3 PMID 9119050 ↗ · PMID 18756269 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTTCCACTTCCGGCGTATGAGGCGGTGACAATGGGAGCA40GCGCGGGCGGCGCCGGGAGGCAGCTGACAAGCGTTTGCGG80CTTCGCTTCATGGCCGCTCTCCCGCCCCTCCTGGGATCTG120TGGGGAGCTGGGGAGCCCGCAGCGGCCCGGAGCCGGAGCT160GGCGAGCCGAGCGGAGACCTGTGCGCCGCGCCTCTGAGGC200GCAGCATGTGAAGCGGAGACGGCATCCAGTGGGGGGCGAG240CCTCTCAGCCGGCCGGGATGGCTACCACGGCCGAGCTCTT280CGAGGAGCCTTTTGTGGCAGATGAATATATTGAACGTCTT320GTATGGAGAACCCCAGGAGGAGGCTCTAGAGGTGGACCTG360AAGCTTTTGATCCTAAAAGATTATTAGAAGAATTTGTAAA400TCATATTCAGGAACTCCAGATAATGGATGAAAGGATTCAG440AGGAAAGTAGAGAAACTAGAGCAACAATGTCAGAAAGAAG480CCAAGGAATTTGCCAAGAAGGTACAAGAGCTGCAGAAAAG520CAATCAGGTTGCCTTCCAACATTTCCAAGAACTAGATGAG560CACATTAGCTATGTAGCAACTAAAGTCTGTCACCTTGGAG600ACCAGTTAGAGGGGGTAAACACACCCAGACAACGGGCAGT640GGAGGCTCAGAAATTGATGAAATACTTTAATGAGTTTCTA680GATGGAGAATTGAAATCTGATGTTTTTACAAATTCTGAAA720AGATAAAGGAAGCAGCAGACATCATTCAGAAGTTGCACCT760AATTGCCCAAGAGTTACCTTTTGATAGATTTTCAGAAGTT800AAATCCAAAATTGCAAGTAAATACCATGATTTAGAATGCC840AGCTGATTCAGGAGTTTACCAGTGCTCAAAGAAGAGGTGA880AATCTCCAGAATGAGAGAAGTAGCAGCAGTTTTACTTCAT920TTTAAGGGTTATTCCCATTGTGTTGATGTTTATATAAAGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。