演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

EXOC5SEC10

exocyst complex component 5

EXOC5(exocyst complex component 5)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 SEC10 家族,並參與胞吐囊泡的停靠。

Homo sapiens14q22.3UniProt O00471
OFFICIAL SYMBOL
EXOC5
CHROMOSOME
14
UNIPROT
O00471
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

EXOC5 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 exocyst complex component 5。其蛋白質屬於 SEC10 家族,並為 exocyst complex 的組成部分。現有資料未提供蛋白質長度、結構域或其他序列特徵,因此不據此延伸描述其分子結構。

Official symbol
EXOC5
Gene name
exocyst complex component 5
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10696
UniProt
O00471
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SEC10SEC10PSEC10L1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1414q22.3
chr14 · 107,043,718 bp · GRCh38chr14p13 · 1–3600000 · gvarchr14p12 · 3600001–8000000 · stalkchr14p11.2 · 8000001–16100000 · gvarchr14p11.1 · 16100001–17200000 · acenchr14q11.1 · 17200001–18200000 · acenchr14q11.2 · 18200001–24100000 · gnegchr14q12 · 24100001–32900000 · gpos100chr14q13.1 · 32900001–34800000 · gnegchr14q13.2 · 34800001–36100000 · gpos50chr14q13.3 · 36100001–37400000 · gnegchr14q21.1 · 37400001–43000000 · gpos100chr14q21.2 · 43000001–46700000 · gnegchr14q21.3 · 46700001–50400000 · gpos100chr14q22.1 · 50400001–53600000 · gnegchr14q22.2 · 53600001–55000000 · gpos25chr14q22.3 · 55000001–57600000 · gnegchr14q23.1 · 57600001–61600000 · gpos75chr14q23.2 · 61600001–64300000 · gnegchr14q23.3 · 64300001–67400000 · gpos50chr14q24.1 · 67400001–69800000 · gnegchr14q24.2 · 69800001–73300000 · gpos50chr14q24.3 · 73300001–78800000 · gnegchr14q31.1 · 78800001–83100000 · gpos100chr14q31.2 · 83100001–84400000 · gnegchr14q31.3 · 84400001–89300000 · gpos100chr14q32.11 · 89300001–91400000 · gnegchr14q32.12 · 91400001–94200000 · gpos25chr14q32.13 · 94200001–95800000 · gnegchr14q32.2 · 95800001–100900000 · gpos50chr14q32.31 · 100900001–102700000 · gnegchr14q32.32 · 102700001–103500000 · gpos50chr14q32.33 · 103500001–107043718 · gnegEXOC5pq1 bp107,043,718 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr14:57,200,507–57,268,974
Gene span
68,468 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000621441 ★57,200,507–57,268,90518
ENST0000034091857,200,507–57,268,92117
ENST0000085428657,200,507–57,268,97418
ENST0000085428757,200,507–57,268,92114
ENST0000085428857,200,507–57,268,92115
ENST0000085428957,200,507–57,268,92118
ENST0000085429057,200,507–57,268,92118
ENST0000085429157,200,507–57,268,92117
ENST0000097053057,200,507–57,268,92117
ENST0000097053157,200,507–57,268,92118
ENST0000113752057,200,507–57,268,92118
ENST0000112685057,239,480–57,268,9214

顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

EXOC5 是 exocyst complex 的組成部分。此複合體參與胞吐囊泡的停靠,使囊泡能停靠於質膜上的融合位點。現有資料支持的功能描述限於此停靠作用,未提供更詳細的分子機制或其他生物學過程。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 57268905 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>EXOC5 ENST00000621441 GRCh38 chr14:57268805-57269905 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCGGAGATCGCACCACTGCACTCTAGCCTGGGGAACAGAGCGAGA
CTCCGTCTCAAAAAAATAAAAACAAAAAAATAAAAGTCTGATATAACTTAGCATGGATTTTTCAGTAGAA
TAAGTTAAAATGTTCTGGAACGATTTTGTCAATGCATGTTGAAAAATCTGAAAATGTTTAGTGCTCAGTA
AATTTTCTACCGTTCCCTTAGTCATCTCCATTTTAATTCTAAGCAGACGGAGGTCATTTTAAAACACAAT
ACTAATAGAAAACATATACCGTAAATAATATGTACCAGTCATCAACTCAATTCTCACAACACTGTAAGGT
AGGACTATTAAAATCTCCATTTAACAGACGAAACAGAGGTCTGTTAACTGGCTAGCCCAAGGTCACGCAG
CTATTCGTGGCAAACCTGGGCCACGAAGCACCACAAAACTATGCTACTTCATCGATCTTCTGATCCATCA
TCCCTGAGGATTCAGATTTGCATTTACCTGGAGAATCTCACGGTGCCACAAAGTGGAGTTCCCGGTTCGT
GGCTTATGAGCCACACTGCCCGCTGCGCCATGGTTAAGTCAGTAAAGCATTAGCTCATCTCATAATTAAG
GTCGCCACCGAGGAACAGCGCAGACCGGCTTTCTCAGACAGACTCTTAACAGAAGCCCTGAGGCTCATCC
TGCGCCGCATACCGGTCGCGCTCAGCAGAGAGGTTAGCTTTTTTAGGTGAAGTCACTAACGCTTCTGAGT
CGCTCTAGGCCAACACACACCACAAAAAGTTCTAAGAACCCCAACCTATAACCTTGAGAAATTTACCTAT
ACCCTGCAACTCCGGTATTTTCTTCCTCTAAATTCTACTTCCGGAATGGTGGCCCGCAAGGATCAAAGTT
CCTCATACACGGTAGCGTCGAGCCTTTTTTCGGTTCTTTCGCCGCTCGTTTTATTCGCCGGCCCCTCCCG
ACAACCTCCCTGGCGCGCGCAGTTCCACTTCCGGCGTATGAGGCGGTGACAATGGGAGCAGCGCGGGCGG
CGCCGGGAGGCAGCTGACAAGCGTTTGCGGCTTCGCTTCATGGCCGCTCTC
EXOC5 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
EXOC5_1 ↗14:57,268,840負股57,268,830–57,268,889

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR14_83NGF6 · enhancer · 57266151–57266327 · regulatory

ENSR14_BFCTC · enhancer · 57267979–57268888 · regulatory

ENSR14_5HGNPQ · CTCF_binding_site · 57268664–57268685 · regulatory

ENSR14_83NGGQ · promoter · 57268889–57269066 · regulatory

ENSR14_C7NFQ · enhancer · 57269067–57270104 · regulatory

· motif · 57268211–57268228 · motif

· motif · 57268373–57268386 · motif

· motif · 57268373–57268386 · motif

· motif · 57268443–57268453 · motif

· motif · 57268498–57268510 · motif

· motif · 57268572–57268587 · motif

· motif · 57268666–57268682 · motif

· motif · 57268889–57268900 · motif

· motif · 57268889–57268900 · motif

· motif · 57268891–57268900 · motif

· motif · 57268992–57269007 · motif

· motif · 57268992–57269007 · motif

· motif · 57268993–57269007 · motif

· motif · 57268994–57269007 · motif

· motif · 57269019–57269030 · motif

· motif · 57269019–57269030 · motif

· motif · 57269021–57269030 · motif

· motif · 57269081–57269094 · motif

· motif · 57269321–57269338 · motif

· motif · 57269341–57269356 · motif

· motif · 57269390–57269403 · motif

· motif · 57271723–57271734 · motif

· motif · 57273447–57273462 · motif

· motif · 57273447–57273462 · motif

· motif · 57273448–57273462 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:708 aa

EXOC5 蛋白屬於 SEC10 家族。現有資料未提供其結構域、功能區域或序列特徵的進一步註解。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O00471…

AlphaFold · O00471

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Midbody

EXOC5 定位於細胞質與中體。 其在中體的定位需要 RALA、EXOC2 與 EXOC3 存在。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Midbody。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 46 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SEC10EXOC5BARD1BARD1BDNFBRMS1LC1orf216CCDC102BCRYABCRYBB1DEUP1EDRF1ENO2EXOC6EXOC6BFGAFRMD6GAPDHHDDC3HGSHGSHTTIFT57KIFC3KXD1MAGEA3MAGEA6OAS1PMP22PSTPIP1PTK6PYCARDRAB14RAB4ARAB4BSNCASPACA9SPRED1STUB1TARDBPTHOC1TNPO2TSC1TTC23LTXLNBTXNL4AUSP2WFS1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 46 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

依相似性推定,exocyst complex 由 EXOC1、EXOC2、EXOC3、EXOC4、EXOC5、EXOC6、EXOC7 與 EXOC8 組成。EXOC5 與 EXOC3L1 的互作也屬依相似性推定。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能EXOC5 是 exocyst complex 的組成部分,參與胞吐囊泡在質膜融合位點的停靠;此敘述界定其複合體角色與相關細胞作用。資料庫紀錄
證據與來源

Component of the exocyst complex involved in the docking of exocytic vesicles with fusion sites on the plasma membrane

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用依相似性推定,exocyst complex 包含 EXOC1 至 EXOC8;另依相似性推定,EXOC5 與 EXOC3L1 互作,這些內容均屬推論性註記。推論支持
證據與來源

The exocyst complex is composed of EXOC1, EXOC2, EXOC3, EXOC4, EXOC5, EXOC6, EXOC7 and EXOC8 (By similarity). Interacts with EXOC3L1 (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位EXOC5 位於細胞質與中體;其在中體的定位需要 RALA、EXOC2 和 EXOC3 存在,來源未指出這些條件是否適用於其他定位。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Midbody; Localization at the midbody requires the presence of RALA, EXOC2 and EXOC3

PMID 9119050 ↗ · PMID 18756269 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000621441 · 10,486 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTTCCACTTCCGGCGTATGAGGCGGTGACAATGGGAGCA40
41GCGCGGGCGGCGCCGGGAGGCAGCTGACAAGCGTTTGCGG80
81CTTCGCTTCATGGCCGCTCTCCCGCCCCTCCTGGGATCTG120
121TGGGGAGCTGGGGAGCCCGCAGCGGCCCGGAGCCGGAGCT160
161GGCGAGCCGAGCGGAGACCTGTGCGCCGCGCCTCTGAGGC200
201GCAGCATGTGAAGCGGAGACGGCATCCAGTGGGGGGCGAG240
241CCTCTCAGCCGGCCGGGATGGCTACCACGGCCGAGCTCTT280
281CGAGGAGCCTTTTGTGGCAGATGAATATATTGAACGTCTT320
321GTATGGAGAACCCCAGGAGGAGGCTCTAGAGGTGGACCTG360
361AAGCTTTTGATCCTAAAAGATTATTAGAAGAATTTGTAAA400
401TCATATTCAGGAACTCCAGATAATGGATGAAAGGATTCAG440
441AGGAAAGTAGAGAAACTAGAGCAACAATGTCAGAAAGAAG480
481CCAAGGAATTTGCCAAGAAGGTACAAGAGCTGCAGAAAAG520
521CAATCAGGTTGCCTTCCAACATTTCCAAGAACTAGATGAG560
561CACATTAGCTATGTAGCAACTAAAGTCTGTCACCTTGGAG600
601ACCAGTTAGAGGGGGTAAACACACCCAGACAACGGGCAGT640
641GGAGGCTCAGAAATTGATGAAATACTTTAATGAGTTTCTA680
681GATGGAGAATTGAAATCTGATGTTTTTACAAATTCTGAAA720
721AGATAAAGGAAGCAGCAGACATCATTCAGAAGTTGCACCT760
761AATTGCCCAAGAGTTACCTTTTGATAGATTTTCAGAAGTT800
801AAATCCAAAATTGCAAGTAAATACCATGATTTAGAATGCC840
841AGCTGATTCAGGAGTTTACCAGTGCTCAAAGAAGAGGTGA880
881AATCTCCAGAATGAGAGAAGTAGCAGCAGTTTTACTTCAT920
921TTTAAGGGTTATTCCCATTGTGTTGATGTTTATATAAAGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。