基因總覽
EVA1C(eva-1 homolog C)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 EVA1 family。此蛋白質全長 441 個胺基酸,具有一段跨膜區,屬於單次跨膜的 type I membrane protein。其結構包含位於細胞外的區域及位於細胞質的區域,並含有兩個 SUEL-type lectin 結構域。資料亦指出,EVA1C 可結合 heparin。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000300255 ★ | 32,412,706–32,515,387 | 8 |
| ENST00000401402 | 32,411,710–32,517,158 | 7 |
| ENST00000382699 | 32,411,710–32,517,158 | 8 |
| ENST00000898243 | 32,411,710–32,517,158 | 6 |
| ENST00000898244 | 32,411,710–32,517,158 | 8 |
| ENST00000898245 | 32,411,710–32,517,158 | 6 |
| ENST00000898246 | 32,411,710–32,517,158 | 4 |
| ENST00000898247 | 32,411,710–32,517,158 | 6 |
| ENST00000898248 | 32,411,710–32,517,158 | 8 |
| ENST00000898249 | 32,411,710–32,517,158 | 6 |
| ENST00000898250 | 32,411,710–32,517,158 | 7 |
| ENST00000898251 | 32,411,710–32,517,158 | 5 |
顯示 12/26 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
EVA1C 的已知分子作用之一是結合 heparin。現有資料僅記載此結合特性,未提供結合位置、作用方式或其生物學後果等進一步說明,因此目前無法據此延伸描述其參與的細胞過程或功能意義。
Promoter 與基因調控
>EVA1C ENST00000300255 GRCh38 chr21:32411706-32412806 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTCCCGCCGGGTTCGGGAACACTGTGTGCCTAGCGCCCGCCCTCCTCCCTTCCGCCGGCCCCGCGCGATC CATAGGGTTTGGGTCGCTGGGCGCCAGGTACCCGCACCCGGCAAGCAGCCACGGAGCCCCTCGCGCACTT GTCCTCGATACCCTTGAGTTGGGGCTACGCAGGCCACTCCTAGGCCACTGGCTGGGCGTCCGAACGTGGG TCACCCCGCGCACAGTCTAGAGGTTCAGAAAGATGCTGTGGCCCACTTTAAAACAAAGCCCAATTATTAG CGCTCGGCGGCTGTTTGCGCCGGTGCAGTGTCAGATCCCCCAGCGCTGCGGACAACCAGCACCCAAAGGA AGCCGAGCTGGAGCTAAAGATCCCGGCTCCGGAGCCATCTGACCGGTTTTGAGACCTCCAGCTCGTCGCC GTCCTGGCTGCGAGAGCTTGGGCACGGCGCCGGGGCTCAGTCTCCTCTTCTGTGGAATGGCGATAACTGT ATGTGCCGGGTGACTGCACGTGGCGCGCGGCGGGTGGCGGGGATGGCAGCGGTGCGATCCCACGCCTCCA GGACCCCACCTTCCTGCGGCCCCCGATCGGCCCCGCCCCGGGGGCGCCCCAGCTGCACGCGCGGCGCTGG CTCCAAAGTGCGTCACGGGCACCGGCCGCGCTCCTTCTGCCGCCAGGGCGAGGCTGGCACCCGGCCAGCG CGGGCAGGGCCACGGGTGCCCGGCTGTTTCCCGGGTGTGGAAGGCGCTCAAGGTGCGCGGCCCGGGGCGC GCTACTGGGGGCGCCCTCCGCGGTGGGCAGCGCGCCAGGGATCGGCCTGGGCAGCCGCGGGGCGCGCGAA GGCTGCGCTTTCCCTACGGCCCCCCTCGCTTCCTCCGGCACGGCGGCAACGGAGATTTCCTCTCGGGGAA ACTACGCGGATCCTTTTCGGGGATCCTCGCCCCGCCCCAGTTCTCCGCCCCCTCCCCTTTGCTGGGGCGC CTGGGCTGGCCCGCGCAGGGGAGGAGGCTCTGGCAGCCTGGGCAGGGAGGCGGCGGGGGGCCGCGGAGCC GCTGGCCATCGATTCTCCCCGCCATGTGACGCCGTCCTTAGCCCTGCGACC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| EVA1C_2 ↗ | 21:32,411,723 | 正股 | 32,411,674–32,411,733 |
| EVA1C_3 ↗ | 21:32,412,417 | 正股 | 32,412,368–32,412,427 |
| EVA1C_1 ↗ | 21:32,412,715 | 正股 | 32,412,666–32,412,725 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:441 aa
EVA1C 蛋白質全長 441 個胺基酸,含有兩個 SUEL-type lectin 結構域;序列註解並標示其具有訊號胜肽、單一螺旋跨膜區,以及細胞外與細胞質區域。N 端 1–23 個胺基酸及細胞質區域中的 362–390 段被註解為無序區。蛋白質屬於 EVA1 family。
蛋白質三維結構
細胞內定位
EVA1C 被註解為膜蛋白,具有單次跨膜的 type I 膜蛋白拓撲結構;資料未提供定位改變條件或不同異構型的定位差異。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | EVA1C 可結合 heparin;來源僅記載這項結合特性,未說明結合位置、作用方式、實驗系統或其生物學結果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | EVA1C 被註解為膜上的單次跨膜 type I 膜蛋白;來源未說明其定位變化的條件或動態。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GAGGAGGCTCTGGCAGCCTGGGCAGGGAGGCGGCGGGGGG40CCGCGGAGCCGCTGGCCATCGATTCTCCCCGCCATGTGAC80GCCGTCCTTAGCCCTGCGACCCCCAGCGCGTCCCGGGCCT120GCGCCTCCGCCCCGCCGCGCAGCGCACGATGCTTCTGCCG160GGACGCGCACGCCAACCGCCGACGCCCCAGCCCGTGCAGC200ATCCCGGCCTCCGCCGGCAGGTAGAGCCGCCGGGGCAGCT240CCTGCGCCTCTTCTACTGCACTGTCCTGGTCTGCTCCAAA280GAGATCTCAGCGCTCACCGACTTCTCTGGTTACCTAACCA320AACTCCTGCAAAACCACACCACCTATGCCTGTGATGGGGA360CTATTTGAATCTACAGTGCCCTCGGCATTCTACGATAAGT400GTCCAATCGGCATTTTATGGGCAAGATTACCAAATGTGTA440GTTCCCAGAAGCCTGCCTCCCAGAGGGAAGACAGCTTAAC480CTGTGTGGCAGCCACCACCTTCCAGAAGGTGCTGGACGAA520TGCCAGAACCAGCGGGCCTGCCACCTCCTGGTCAATAGCC560GTGTTTTTGGACCTGACCTTTGTCCAGGAAGCAGTAAATA600CCTCCTGGTCTCCTTTAAATGCCAACCTAATGAATTAAAA640AACAAAACCGTGTGTGAAGACCAGGAGCTGAAACTGCACT680GCCATGAATCCAAGTTCCTCAACATCTACTCTGCGACCTA720CGGCAGGAGGACCCAGGAAAGGGACATCTGCTCCTCCAAG760GCAGAGCGGCTCCCCCCTTTCGATTGCTTGTCTTACTCAG800CTTTGCAAGTCCTATCCCGAAGGTGCTATGGGAAGCAGAG840ATGCAAAATCATCGTCAACAATCACCATTTTGGAAGCCCC880TGTTTGCCAGGCGTGAAAAAATACCTCACTGTGACCTACG920CATGTGTTCCCAAGAACATACTCACAGCGATTGATCCAGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。