演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN GENE LOCUS

ERVK-6HERV-K(HML-2.HOM)

endogenous retrovirus group K member 6, envelope

ERVK-6 是內源性逆轉錄病毒 K 群的 envelope 基因;其產物與 RNA 結合、蛋白質二聚及基因表現調控相關。

Homo sapiens7p22
OFFICIAL SYMBOL
ERVK-6
CHROMOSOME
7
LOCUS TYPE
endogenous retrovirus
TRANSCRIPTS
—
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ERVK-6 的正式名稱為 endogenous retrovirus group K member 6, envelope,屬於內源性逆轉錄病毒基因。現有資料將其產物描述為具有 envelope 身分,並列出 RNA stem-loop 結合與蛋白質同源二聚等分子活動。來源未提供其序列、結構域或其他結構特徵,因此不宜據名稱推定更具體的蛋白質組成。

Official symbol
ERVK-6
Gene name
endogenous retrovirus group K member 6, envelope
Organism
Homo sapiens
Gene type
endogenous retrovirus
HGNC ID
HGNC:13915
Locus type
endogenous retrovirus
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HERV-K(HML-2.HOM)HERV-K108HERV-K(C7)envK2ERVK6

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77p22
尚未取得本染色體的長度與帶型資料,完成來源同步後繪製。
Assembly 待同步 / 1-based inclusiveDirection: 待同步

帶型資料未取得,未套用其他染色體的條紋或著絲點位置。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ERVK-6 產物具有 RNA stem-loop 結合活性,並可進行蛋白質同源二聚;資料也將其與蛋白質同源寡聚化列為相關功能。這些描述指出它能與特定 RNA 結構及相同蛋白質分子發生作用,但來源未進一步說明結合或組裝的條件與分子細節。

在細胞過程方面,ERVK-6 被列為參與 mRNA 自細胞核輸出的因子,也與基因表現的正向調控相關。現有資料沒有交代它如何影響 mRNA 輸出,或基因表現增加所涉及的具體步驟,因此不能據此延伸為特定的轉錄或轉譯機制。

此外,ERVK-6 被描述為蛋白質複合體的一部分。這項資訊支持其存在於含蛋白質的複合體中,但未指明複合體成員,也未說明複合體與 RNA 結合、寡聚化或 mRNA 輸出之間的關係。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS 座標待同步
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
ERVK-6 的股向待同步。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 TSS 尚未取得;請在後台同步此基因來源。
目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / GENE ANATOMY

基因座與轉錄註解

endogenous retrovirus

ERVK-6 依 HGNC/Ensembl 分類為 endogenous retrovirus。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。

轉錄本Biotype拼接長度Exons
尚未取得轉錄本資料。

拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與基因產物定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleolus

ERVK-6 產物位於細胞質與核仁。 資料未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的基因產物定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ERVK-6 具有 RNA stem-loop 結合及蛋白質同源二聚活性,並參與 mRNA 自細胞核輸出與基因表現正向調控;也與蛋白質同源寡聚化相關,位於細胞質和核仁,且屬於含蛋白質的複合體。資料庫紀錄
證據與來源

Enables RNA stem-loop binding activity and protein homodimerization activity. Involved in mRNA export from nucleus; positive regulation of gene expression; and protein homooligomerization. Located in cytoplasm and nucleolus. Part of protein-containing complex.

開啟資料庫紀錄 ↗

· CC BY 4.0
細胞定位ERVK-6 位於細胞質與核仁;此項定位描述未提供其他條件或異構型差異。資料庫紀錄
證據與來源

Located in cytoplasm and nucleolus.

開啟資料庫紀錄 ↗

· CC BY 4.0
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

DNA 與 RNA 序列

完整非編碼轉錄本 · FASTA
正在取得完整參考轉錄本…

cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。

13 / DATA PROVENANCE

資料來源與研究連結