演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ERP29ERp28

endoplasmic reticulum protein 29

ERP29 編碼 endoplasmic reticulum protein 29,參與內質網內分泌蛋白質的處理;其可能作用於蛋白質折疊,但來源指出它似乎不是二硫鍵異構酶。

Homo sapiens12q24.13UniProt P30040
OFFICIAL SYMBOL
ERP29
CHROMOSOME
12
UNIPROT
P30040
PDB / ALPHAFOLD
2QC7
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ERP29 是蛋白質編碼基因,產物名稱為 endoplasmic reticulum protein 29。現有資料將其與內質網中的分泌蛋白質處理相關聯,並提出它可能參與蛋白質折疊。來源也指出,ERP29 似乎不是二硫鍵異構酶;因此,不宜將其描述為具有二硫鍵異構酶活性。資料未提供其家族分類或更完整的結構特徵。

Official symbol
ERP29
Gene name
endoplasmic reticulum protein 29
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13799
UniProt
P30040
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ERp28ERp31PDI-DBPDIA9C12orf8

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1212q24.13
chr12 · 133,275,309 bp · GRCh38chr12p13.33 · 1–3200000 · gnegchr12p13.32 · 3200001–5300000 · gpos25chr12p13.31 · 5300001–10000000 · gnegchr12p13.2 · 10000001–12600000 · gpos75chr12p13.1 · 12600001–14600000 · gnegchr12p12.3 · 14600001–19800000 · gpos100chr12p12.2 · 19800001–21100000 · gnegchr12p12.1 · 21100001–26300000 · gpos100chr12p11.23 · 26300001–27600000 · gnegchr12p11.22 · 27600001–30500000 · gpos50chr12p11.21 · 30500001–33200000 · gnegchr12p11.1 · 33200001–35500000 · acenchr12q11 · 35500001–37800000 · acenchr12q12 · 37800001–46000000 · gpos100chr12q13.11 · 46000001–48700000 · gnegchr12q13.12 · 48700001–51100000 · gpos25chr12q13.13 · 51100001–54500000 · gnegchr12q13.2 · 54500001–56200000 · gpos25chr12q13.3 · 56200001–57700000 · gnegchr12q14.1 · 57700001–62700000 · gpos75chr12q14.2 · 62700001–64700000 · gnegchr12q14.3 · 64700001–67300000 · gpos50chr12q15 · 67300001–71100000 · gnegchr12q21.1 · 71100001–75300000 · gpos75chr12q21.2 · 75300001–79900000 · gnegchr12q21.31 · 79900001–86300000 · gpos100chr12q21.32 · 86300001–88600000 · gnegchr12q21.33 · 88600001–92200000 · gpos100chr12q22 · 92200001–95800000 · gnegchr12q23.1 · 95800001–101200000 · gpos75chr12q23.2 · 101200001–103500000 · gnegchr12q23.3 · 103500001–108600000 · gpos50chr12q24.11 · 108600001–111300000 · gnegchr12q24.12 · 111300001–111900000 · gpos25chr12q24.13 · 111900001–113900000 · gnegchr12q24.21 · 113900001–116400000 · gpos50chr12q24.22 · 116400001–117700000 · gnegchr12q24.23 · 117700001–120300000 · gpos50chr12q24.31 · 120300001–125400000 · gnegchr12q24.32 · 125400001–128700000 · gpos50chr12q24.33 · 128700001–133275309 · gnegERP29pq1 bp133,275,309 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr12:112,012,815–112,026,066
Gene span
13,252 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000261735 ★112,013,426–112,023,4493
ENST00000880255112,012,815–112,026,0664
ENST00000880256112,013,308–112,026,0664
ENST00000993118112,013,308–112,026,0663
ENST00000938511112,013,330–112,026,0664
ENST00000455836112,013,348–112,026,0662
ENST00000880257112,013,348–112,022,9832
ENST00000938510112,013,348–112,023,2422
ENST00000938512112,013,348–112,022,9962
ENST00000938513112,013,348–112,022,9902
ENST00000938514112,013,348–112,022,9852
ENST00000993121112,013,348–112,026,0663

顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ERP29 在內質網內分泌蛋白質的處理過程中具有重要作用。來源提出,它可能透過參與內質網中的蛋白質折疊,協助這類蛋白質的處理;不過,此處以可能性描述其折疊參與,並未進一步交代具體分子機制或作用步驟。

來源另指出,ERP29 似乎不是二硫鍵異構酶。這項描述限制了對其功能的解讀:雖然它可能參與內質網蛋白質折疊,不能因此推定它是催化二硫鍵異構化的酶。現有資料未說明其如何影響分泌蛋白質的折疊或後續處理,也未提供特定底物或實驗條件。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 112013426 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ERP29 ENST00000261735 GRCh38 chr12:112012426-112013526 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACAGGCACGCACCACCACACTCGCCTGATTTTTAGTAGAAACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGT
CTCGAACTCCTGACCTCAGGTAATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGTC
AACGCGCCCAGCCGGAATAATATTTTACAGCAATTACACTGCACTGTTTAGATCATTATTCCTATGCCGC
CTCCTCCCCCAACAAAGTGCGTGCCTTCAGCACACAACGGTCTTGTTTCTGCTTATTCCGTAGCCCCGCA
GGCAAAGCCAGAGTCTGGCACAAGCCAGGGACCGAGTGACTACCTGCGGAACAGAATGATTAGAATTGCG
TCTGGGGTTCCTGGAGGGTGGGCCTTGGCTGGGCGGATCCCAGGAGCCTGGCGTCTCCCAGGGGAGGCGC
TCACCTCAGATCGGGCCTAAGAGGGCCCTGCTTGCCACACTGACCGCCAAGCCTGGCCAAAAAGCTCAGG
GAAGCCGCGGAGCCACTGCCCGCCTGGGTCAGGGTGGTGACGGAGCCTGACTGAGAATAACGGCTGAACT
TGACTAATAGACTGACCGAGGGTTGGAGCGGGTCCCAACCAACTGCCTGACGGCCCAAAGGCAGGAAGAA
ACGATGGTAGGCCTTGTCATCTTCGAAGGAGAGGAAGGACAGCAAACGAATTGCTATAGCGTCCCCATGC
GCACTTGGCGCTTCTCCTCAAGCGGAGCAGGAACGGAACTGGGCGGACCCGCCGGAAGACTCGGCGAGTG
CGCGCGCGCAGGAGCCCATTTTCCCGCCCGCAACGTGGCCCCGCCCTTTTACCCAGGCCCTACGCGAGCT
TCGCCGAGTACGCGTGCGCAGCAGCTTCCCCTCCCTCGCCCCGCCCCTCACGTGGCCCCACCCTCTCACC
CTAGACAGATGGGAGCCTCCTGGGGTGTCCACGTGAGCGCGCGTGAGTCCGCCCCCCCAGTCACGTGACC
GCTGACTCGGGGCGTTCTCCACTATCGCTTACCTACCTCCCTCTGCAGGAACCCGGCGATATGGCTGCCG
CTGTGCCCCGCGCCGCATTTCTCTCCCCGCTGCTTCCCCTTCTCCTGGGCT
ERP29 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ERP29_1 ↗12:112,013,427正股112,013,378–112,013,437

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR12_CF54Q · enhancer · 112011937–112013114 · regulatory

ENSR12_93MGF8 · promoter · 112013115–112013436 · regulatory

ENSR12_5ZCCQH · CTCF_binding_site · 112013808–112013829 · regulatory

ENSR12_93MGFH · promoter · 112013856–112014356 · regulatory

ENSR12_5ZCCSL · CTCF_binding_site · 112014264–112014285 · regulatory

ENSR12_93MGGD · enhancer · 112017134–112017398 · regulatory

· motif · 112012829–112012842 · motif

· motif · 112012829–112012842 · motif

· motif · 112012877–112012894 · motif

· motif · 112013117–112013128 · motif

· motif · 112013194–112013205 · motif

· motif · 112013194–112013205 · motif

· motif · 112013233–112013243 · motif

· motif · 112013274–112013285 · motif

· motif · 112013274–112013285 · motif

· motif · 112013303–112013313 · motif

· motif · 112013312–112013321 · motif

· motif · 112013312–112013321 · motif

· motif · 112013320–112013330 · motif

· motif · 112013324–112013337 · motif

· motif · 112013354–112013370 · motif

· motif · 112013395–112013404 · motif

· motif · 112013395–112013404 · motif

· motif · 112013540–112013556 · motif

· motif · 112013615–112013625 · motif

· motif · 112013810–112013826 · motif

· motif · 112014266–112014282 · motif

· motif · 112014309–112014322 · motif

· motif · 112014558–112014571 · motif

· motif · 112014671–112014680 · motif

· motif · 112015019–112015030 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:261 aa

1 aa261 aa基序訊號胜肽
依 P30040 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

endoplasmic reticulum protein 29 的長度為 261 個胺基酸。其第 1 至 32 位胺基酸為訊號序列;第 258 至 261 位則有一段與防止蛋白質自內質網分泌相關的基序。

訊號胜肽1–32 aa
基序Prevents secretion from ER258–261 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2QC7…

PDB · 2QC7

X-ray · 2.90 A · A/B=34-261

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Endoplasmic reticulum lumen;Melanosome

ERP29 位於內質網腔,也曾以質譜分析於黑色素體分餾中辨識;該分析涵蓋第一至第四期的黑色素體。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Melanosome。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 16 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ERp28ERP29ADIPOQBMP10DESI1GLP1RHMG20BNRMSGTASGTBSLC35B4SLC38A7TMBIM6TMEM86BTSPO2TTMPUBQLN1UBQLN2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 16 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ERP29 可形成同源二聚體。它也被列為大型伴護蛋白多蛋白複合體的組成成分;該複合體含 CABP1、DNAJB11、HSP90B1、HSPA5、HYOU、PDIA2、PDIA4、PPIB、SDF2L1 與 UGGT1,並含極少量 ERP29。CALR 與 CANX 則未見於該複合體,或僅以極低量存在。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ERP29 在內質網內參與分泌蛋白質的處理,可能藉由參與蛋白質折疊發揮作用;來源同時指出,它似乎不是二硫鍵異構酶。資料庫紀錄
證據與來源

Does not seem to be a disulfide isomerase. Plays an important role in the processing of secretory proteins within the endoplasmic reticulum (ER), possibly by participating in the folding of proteins in the ER

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ERP29 可形成同源二聚體,也屬於大型伴護蛋白多蛋白複合體;該複合體含多種指定蛋白並僅含極少量 ERP29,CALR 與 CANX 則未見或含量極低。含實驗來源
證據與來源

Homodimer. Part of a large chaperone multiprotein complex comprising CABP1, DNAJB11, HSP90B1, HSPA5, HYOU, PDIA2, PDIA4, PPIB, SDF2L1, UGGT1 and very small amounts of ERP29, but not, or at very low levels, CALR nor CANX

PMID 12475965 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ERP29 位於內質網腔;質譜分析也在第一至第四期黑色素體的分餾中辨識到它,來源未進一步說明此定位的功能意義。資料庫紀錄
證據與來源

Endoplasmic reticulum lumen; Melanosome; Identified by mass spectrometry in melanosome fractions from stage I to stage IV

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000261735 · 1,623 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTATCGCTTACCTACCTCCCTCTGCAGGAACCCGGCGAT40
41ATGGCTGCCGCTGTGCCCCGCGCCGCATTTCTCTCCCCGC80
81TGCTTCCCCTTCTCCTGGGCTTCCTGCTCCTCTCCGCTCC120
121GCATGGCGGCAGCGGCCTGCACACCAAGGGCGCCCTTCCC160
161CTGGATACGGTCACTTTCTACAAGGTCATTCCCAAAAGCA200
201AGTTCGTCTTGGTGAAGTTCGACACCCAGTACCCCTACGG240
241TGAGAAGCAGGATGAGTTCAAGCGTCTTGCTGAAAACTCG280
281GCTTCCAGCGATGATCTCTTGGTGGCAGAGGTGGGGATCT320
321CAGATTATGGTGACAAGCTGAACATGGAGCTGAGTGAGAA360
361ATACAAGCTGGACAAAGAGAGCTACCCAGTCTTCTACCTC400
401TTCCGGGATGGGGACTTTGAGAACCCAGTCCCATACACTG440
441GGGCAGTTAAGGTTGGAGCCATCCAGCGCTGGCTGAAGGG480
481GCAAGGGGTCTACCTAGGTATGCCTGGTTGCCTGCCTGTA520
521TACGACGCCCTGGCCGGGGAGTTCATCAGGGCCTCTGGTG560
561TGGAGGCCCGCCAGGCCCTCTTGAAGCAGGGGCAAGATAA600
601CCTCTCAAGTGTGAAGGAGACTCAGAAGAAGTGGGCCGAG640
641CAATACCTGAAGATCATGGGGAAGATCTTAGACCAAGGGG680
681AGGACTTCCCAGCATCAGAGATGACACGGATCGCCAGGCT720
721GATTGAGAAGAACAAGATGAGTGACGGGAAGAAGGAGGAG760
761CTCCAGAAGAGCTTAAACATCCTGACTGCCTTCCAGAAGA800
801AGGGGGCCGAGAAAGAGGAGCTGTAAAAAGGCTGTCTGTG840
841ATTTTCCAGGGTTTGGTGGGGGTAGGGAGGGGAGAGTTAA880
881CCTGCTGGCTGTGAGTCCCTTGTGGAATATAAGGGGGTAG920
921TGGGAAAAGTGGTACTAACCCACGATTCTGAGCCCTGAGT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。