演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ERO1BERO1-L(beta)

endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 beta

ERO1B 編碼內質網氧化還原酶 endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 beta,參與內質網中的蛋白質二硫鍵形成,並可協助維持相關氧化還原反應的持續進行。

Homo sapiens1q42.3UniProt Q86YB8
OFFICIAL SYMBOL
ERO1B
CHROMOSOME
1
UNIPROT
Q86YB8
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ERO1B(endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 beta)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 EROs family,與內質網中的氧化還原作用相關。此蛋白質長 467 個胺基酸,序列註解含有位於第 1 至 33 個胺基酸的訊號序列。其主要角色是參與內質網蛋白質二硫鍵形成所需的氧化還原流程;更具體的電子傳遞與底物再氧化作用見功能段落。

Official symbol
ERO1B
Gene name
endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 beta
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14355
UniProt
Q86YB8
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ERO1-L(beta)Ero1betaERO1LB

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q42.3
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegERO1Bpq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr1:236,214,681–236,282,019
Gene span
67,339 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000354619 ★236,215,101–236,281,95816
ENST00000687487236,215,101–236,275,67916
ENST00001119432236,215,101–236,282,01515
ENST00001145862236,215,101–236,282,01516
ENST00001106123236,246,335–236,282,0155
ENST00001106124236,252,117–236,282,0154

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ERO1B 是參與內質網二硫鍵形成的氧化還原酶。它能有效重新氧化 P4HB/PDI;P4HB/PDI 負責催化蛋白質二硫鍵形成,而 ERO1B 的作用可使 P4HB 得以再次進行二硫鍵形成反應。這項作用與蛋白質氧化折疊所需的反應循環相連,使相關酵素不只完成單次反應。

ERO1B 也能重新氧化其他 protein disulfide isomerase 家族成員,但效率低於對 P4HB 的作用:PDIA2 的再氧化速率約為 P4HB 的 50%,PDIA3、PDIA4、PDIA6 與 NXNDC12 則低於 P4HB 的 10%。因此,來源所述的底物作用具有明確差異,不能將對 P4HB 的效率直接套用至其他家族成員。

P4HB 被重新氧化後,ERO1B 透過 FAD 將電子傳遞給分子氧,並在細胞中產生活性氧(ROS)。相應反應可概括為以分子氧作為受電子者,使蛋白質或含硫基團形成二硫鍵,同時生成 H₂O₂。這使二硫鍵形成與活性氧生成連結在同一氧化還原流程中。

此外,ERO1B 可能參與胰臟細胞中的氧化型 pro-insulin 折疊,因此可能在葡萄糖恆定中具有作用。此關聯以可能性表述,來源並未將其描述為已確立的直接因果關係。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 236281958 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ERO1B ENST00000354619 GRCh38 chr1:236281858-236282958 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGTAATGAATTTCTTTTGTTGTATGCAACTAAATGTGTGATAGTTTCTTACAGCATCAATGAGAAACTAA
TACACGCTACATAAACACAAGGGAGATGTATTACTCGTTTTGTAGAAATCAAAGGCATTAATAAAACTAA
TAGCAGTTACCATTTATTGAGTGCTTCCTAGGTGCTAGGCACTATACTCAGCTCTTTCTGTATCTAATCT
TATGTAGCCCTAGAACAAGATATGAGGTGGGAATTAAGGCCCAATAACTAGCTAGAATGTTTTAGAGTTG
GGATCTGCGCCCAATCTATGTCACTCTAAGTTTTTTTTTGTTTTACCCCATCCCCATATTTCATCATAAG
CCTTTGGGTTTGTCTTCATTCTTTAGCATGCGTTATACTCGCACGTGTCAACCTAGGAGTCGGGCTGGGG
CGGGGCAGGAGATGACATCCACATCTAGGGTGCATGAAATTAAAAAAGAGCCGAAGCCATCTCTACAAGT
CACAGGTAGCTTACATAGGCACCCACAGCAGATGTGAGGCTACAGAAAAATGAATGAGACAAAGAATACG
CTTCAGACCGAAAGTCAAAGATCCCGCACCGTCCGTTCCTAACTCGCCCGCGTACTGGGTGAATCCTAGA
GCCTGGCGTCTGCGAGGACTCCAGGAGCGACAGCAGGGACCGACGCAGAGAGGTCCTCAGCCTGGTTTCC
CGGAGAAGAGGTCGCCCCGCTTCCCCCGCCCGCACCCCCCGGTGTTTTGGAGGCCCGCGTGGTCCCGCCT
CATTGGCCGCCGCGGAGCCCGAGGCCTCGGGGAGGCGGGGCGGCCTTCGCAGTTGTAGTTCCCGAGTCCT
CTCGTTCAGCGGCTCCGCCTTCCTGCCGCGGCGCCTAGGCGACCGCCCAGGACCACAACTCCCACAAGGC
CCCGCGCTTGGGGGCGTGGCCGAGGAGCCAAGCGAGCCGGGGGCGGGGCCGCCTGGGGGATGAAGTGGGG
GCGCTCGCCTTTCCTGCCTCACTCGCAGCTGCCGGGTGTTGGGGAAAGAGTCGCCTGCCTCCGGACTGGA
GTGCAGACCTCTGACCCTGGAGTCGCTCGGCCGCTGGGAACCGTCCCCTTG
ERO1B 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ERO1B_1 ↗1:236,281,958負股236,281,948–236,282,007

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_CTG34 · enhancer · 236280657–236281947 · regulatory

ENSR1_88XKC9 · promoter · 236281948–236282102 · regulatory

ENSR1_B3PW4D · enhancer · 236282103–236283063 · regulatory

ENSR1_B3PW4N · enhancer · 236284166–236285044 · regulatory

ENSR1_95GR7L · enhancer · 236285292–236285550 · regulatory

ENSR1_543KKC8 · CTCF_binding_site · 236285463–236285484 · regulatory

· motif · 236281298–236281311 · motif

· motif · 236281298–236281311 · motif

· motif · 236281369–236281380 · motif

· motif · 236281455–236281465 · motif

· motif · 236281782–236281794 · motif

· motif · 236281785–236281792 · motif

· motif · 236281786–236281799 · motif

· motif · 236281889–236281901 · motif

· motif · 236281891–236281904 · motif

· motif · 236282000–236282010 · motif

· motif · 236282029–236282039 · motif

· motif · 236282052–236282069 · motif

· motif · 236282054–236282064 · motif

· motif · 236282148–236282158 · motif

· motif · 236282182–236282198 · motif

· motif · 236282560–236282569 · motif

· motif · 236282560–236282569 · motif

· motif · 236282915–236282927 · motif

· motif · 236284242–236284254 · motif

· motif · 236284244–236284251 · motif

· motif · 236284311–236284325 · motif

· motif · 236284392–236284401 · motif

· motif · 236284595–236284608 · motif

· motif · 236284605–236284620 · motif

· motif · 236284667–236284675 · motif

· motif · 236284816–236284825 · motif

· motif · 236285026–236285034 · motif

· motif · 236285222–236285237 · motif

· motif · 236285317–236285328 · motif

· motif · 236285424–236285436 · motif

· motif · 236285465–236285481 · motif

· motif · 236285547–236285569 · motif

· motif · 236285547–236285569 · motif

ERO1B 的表現會受到未摺疊蛋白反應(UPR)誘導因子的上調。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:467 aa

1 aa467 aa訊號胜肽
依 Q86YB8 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ERO1B 蛋白質長 467 個胺基酸,屬於 EROs family。序列註解指出,其第 1 至 33 個胺基酸為訊號序列;來源未提供其他結構域或功能區域的註解。

訊號胜肽1–33 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q86YB8…

AlphaFold · Q86YB8

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Endoplasmic reticulum membrane

ERO1B 位於內質網膜的腔面,屬周邊膜蛋白。 來源指出,與 ERP44 的關聯可能對 ERO1B 滯留於內質網至關重要;此敘述是對其滯留條件的可能性描述。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ERO1-L(beta)ERO1BPDIA3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ERO1B 可形成以二硫鍵連結的同源二聚體,也可與 ERO1A 形成二硫鍵連結的異源二聚體;此外亦有單體形式的記錄。同源二聚體的活性可能略低於單體。ERO1B 另與 P4HB 及 ERP44 有互作記錄;來源未進一步說明這些互作是否均屬直接結合或同一複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ERO1B 是參與內質網二硫鍵形成的氧化還原酶,能有效重新氧化催化蛋白質二硫鍵形成的 P4HB/PDI,使其繼續進行後續反應。其他 protein disulfide isomerase 家族成員也可被重新氧化,但效率較低:PDIA2 約為 P4HB 再氧化速率的 50%,PDIA3、PDIA4、PDIA6 與 NXNDC12 則低於 10%。電子經 FAD 傳給分子氧後會產生活性氧;ERO1B 也可能參與胰臟細胞中的氧化型 pro-insulin 折疊,並可能與葡萄糖恆定有關。含實驗來源
證據與來源

Oxidoreductase involved in disulfide bond formation in the endoplasmic reticulum. Efficiently reoxidizes P4HB/PDI, the enzyme catalyzing protein disulfide formation, in order to allow P4HB to sustain additional rounds of disulfide formation. Other protein disulfide isomerase family members can also be reoxidized, but at lower rates compared to P4HB, including PDIA2 (50% of P4HB reoxidation rate), as well as PDIA3, PDIA4, PDIA6 and NXNDC12 (<10%). Following P4HB reoxidation, passes its electrons to molecular oxygen via FAD, leading to the production of reactive oxygen species (ROS) in the cell. May be involved in oxidative pro-insulin folding in pancreatic cells, hence may play a role in glucose homeostasis

PMID 11707400 ↗ · PMID 21091435 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性2 R'C(R)SH + O2 = R'C(R)S-S(R)CR' + H2O2含實驗來源
證據與來源

2 R'C(R)SH + O2 = R'C(R)S-S(R)CR' + H2O2

PMID 11707400 ↗ · PMID 21091435 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性[protein]-dithiol + O2 = [protein]-disulfide + H2O2含實驗來源
證據與來源

[protein]-dithiol + O2 = [protein]-disulfide + H2O2

PMID 11707400 ↗ · PMID 21091435 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ERO1B 可形成以二硫鍵連結的同源二聚體,也可與 ERO1A 形成以二硫鍵連結的異源二聚體,並有單體形式的記錄。同源二聚體的活性可能略低於單體。此外,ERO1B 與 P4HB 及 ERP44 有互作記錄。含實驗來源
證據與來源

Homodimer; disulfide-linked. Heterodimer with ERO1A; disulfide-linked. Also detected as monomer. Homodimers may be somewhat less active than monomers. Interacts with P4HB. Interacts with ERP44

PMID 11847130 ↗ · PMID 16012172 ↗ · PMID 21091435 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ERO1B 位於內質網膜的腔面,屬於周邊膜蛋白。與 ERP44 的關聯可能是 ERO1B 滯留於內質網所必需;來源以可能性描述此關聯的重要性。含實驗來源
證據與來源

Endoplasmic reticulum membrane / Peripheral membrane protein / Lumenal side; The association with ERP44 may be essential for its retention in the endoplasmic reticulum

PMID 10818100 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控未摺疊蛋白反應(UPR)的誘導因子會上調 ERO1B。含實驗來源
證據與來源

Up-regulated by inducers of the unfolded protein response (UPR)

PMID 10818100 ↗ · PMID 12752442 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000354619 · 4,994 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1ACTCGCAGCTGCCGGGTGTTGGGGAAAGAGTCGCCTGCCT40
41CCGGACTGGAGTGCAGACCTCTGACCCTGGAGTCGCTCGG80
81CCGCTGGGAACCGTCCCCTTGGGTCGTCGCCTGGGCCGCC120
121CGTCGTTCCCCGGCCCCGAGGGGTCCGGCTGGCCGCGGTG160
161TGGGTAGAGGTCAGCATGAGCCAAGGGGTCCGCCGGGCAG200
201GCGCTGGGCAGGGGGTAGCGGCCGCGGTGCAGCTGCTGGT240
241CACCCTGAGCTTCCTGCGGAGCGTCGTCGAGGCGCAGGTC280
281ACTGGAGTTCTGGATGATTGCTTGTGTGATATTGACAGCA320
321TCGATAACTTCAATACCTACAAAATCTTCCCCAAAATAAA360
361AAAATTGCAAGAGAGAGACTATTTTCGTTATTACAAGGTT400
401AATCTGAAGCGACCTTGTCCTTTCTGGGCAGAAGATGGCC440
441ACTGTTCAATAAAAGACTGTCATGTGGAGCCCTGTCCAGA480
481GAGTAAAATTCCGGTTGGAATAAAAGCTGGGCATTCTAAT520
521AAGTACTTGAAAATGGCAAACAATACCAAAGAATTAGAAG560
561ATTGTGAGCAAGCTAATAAACTGGGAGCAATTAACAGCAC600
601ATTAAGTAATCAAAGCAAAGAAGCTTTCATTGACTGGGCA640
641AGATATGATGATTCACGGGATCACTTTTGTGAACTTGATG680
681ATGAGAGATCTCCAGCTGCTCAGTATGTAGACCTATTGCT720
721GAACCCAGAGCGTTACACTGGCTATAAAGGGACCTCTGCA760
761TGGAGAGTGTGGAACAGCATCTATGAAGAGAACTGTTTCA800
801AGCCTCGATCTGTTTATCGTCCTTTAAATCCTCTGGCGCC840
841TAGCCGAGGCGAAGATGATGGAGAATCATTCTACACATGG880
881CTAGAAGGTTTGTGTCTGGAGAAAAGAGTCTTCTATAAGC920
921TTATATCGGGACTTCATGCTAGCATCAATTTACATCTATG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。