基因總覽
ERO1A 是蛋白質編碼基因,其產物 endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 alpha 屬於 EROs 家族。這種氧化還原酵素參與內質網內的蛋白質成熟,並與免疫球蛋白的正確折疊有關。其功能也連結到內質網壓力下的細胞反應,以及特定感染情境中的毒素處理。蛋白質序列含有位於第 1 至 23 個胺基酸的訊號序列。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000395686 ★ | 52,639,915–52,695,558 | 16 |
| ENST00000910737 | 52,639,915–52,696,025 | 15 |
| ENST00000910738 | 52,639,915–52,696,025 | 13 |
| ENST00000964628 | 52,639,915–52,696,025 | 17 |
| ENST00000964629 | 52,639,915–52,696,025 | 13 |
| ENST00000964630 | 52,639,915–52,696,025 | 16 |
| ENST00001118741 | 52,639,915–52,696,025 | 14 |
| ENST00001133001 | 52,639,915–52,696,025 | 16 |
| ENST00000556358 | 52,646,252–52,658,541 | 6 |
| ENST00000629528 | 52,657,949–52,695,705 | 9 |
| ENST00001107582 | 52,663,178–52,696,025 | 8 |
| ENST00000554251 | 52,666,377–52,695,529 | 6 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 alpha 參與內質網中的二硫鍵形成。它透過重新氧化 P4HB/PDI,讓負責催化蛋白質二硫鍵形成的 P4HB/PDI 能持續進行後續反應。因此,ERO1A 支援新生蛋白質的折疊過程;來源並指出,它是免疫球蛋白正確折疊所需的因子。
在氧化還原反應中,ERO1A 將電子經由 FAD 傳遞給分子氧,並伴隨活性氧(ROS)生成。反應式描述了含硫基團形成二硫鍵時,氧氣被還原並產生 H₂O₂;另一種表示方式則指出,蛋白質二硫醇氧化為蛋白質二硫鍵時同樣生成 H₂O₂。這些反應與其維持 P4HB/PDI 氧化狀態的作用相連。
ERO1A 也參與內質網壓力誘發、依賴 CHOP 的細胞凋亡,來源描述其透過活化 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor IP3R1 促進此反應。這項作用將其氧化還原功能與細胞壓力下的反應連結起來;來源未進一步界定此過程的其他調控細節。
在 V.cholerae 感染情境中,ERO1A 參與未折疊 cholera toxin 從還原態 P4HB/PDI 釋放,並因此與毒素的逆向轉位有關。此描述限定於感染相關的毒素處理,不應延伸為一般蛋白質運輸作用。
Promoter 與基因調控
>ERO1A ENST00000395686 GRCh38 chr14:52695458-52696558 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GTGAGCTGCGATCGCATCATTGCAGGCCAGCCTGGGTGACCCAGGGAGACCCTGTCTGGAAAAAAAAAAA GCGGATAGACTAGTCCCAACTCTGAATGTTAAAAGACCAGGACTGGGTATCAGAGGACCTCCAATCCTTG CTCACCTTACCTCACTTCTCTAGGCCTGTTTCTTCCTATGATATGAGCGGGTGGCTTCCACCCTCGCTGT CTAATACAGTGGGCACTAGCCAGCCACATTTGACTATGAAATGGGTCTAGTTCGCATCGAATACACACTG GATTTCAAAGACAAAAAAAGTCAAATATCTTATGAATAAATTTAATGTTGGTTATATTTTGAAATAATAT TTTGCACATTCGGGGTTAAATAAAAATATTTTAAAAATAAAATGTACCTGTTATTTTTACTCTTTTGCTG TGGCTACTAAAAATATAAATGACATATGCTGCCCTGGTCTAGATGCTCTCTAATATCCCTTTCAGCTTTA AGACTCCGCCGGGAACACGGTGGACACGTAATTCGTACGATTTGATTGTCTCGCATTGAGATACGGAAGG ATTGGCCGGGAGTGAGCGGGCTGGGGCTGGGCGGGGCGGCGCGGGGCGGGCACCCCCCGCCCCCCAACCC CGCAGGAAAACACAGGCCCCTCCGGCTTTCGCTCTCGCTCTGGGAACTGGAAGGACCCCCGACTCCCGCG CAGGGTCTGGGGTTGTGCGCGTCGGGTTGCGTCTCCAGGCCGGGGGCGTCAGGGAGCCGGGGGCGGGGAC GGGCGCGGGCGCAGCGGACCGGGCGGGGCCGAGCCGGGAAGCTGGTCGGTGCGTCAGCCTCACGCGGCGG GAAGGAACCGGTCCGAGGCCCCGGGCTGCCGGCGCGGGCGCCGCGGCACGTCCACAGGCTGGGTCGCGAG GTGGCGATCGCTGAGAGGCAGGAGGGCCGAGGCGGGCCTGGGAGGCGGCCCGGAGGTGGGGCGCCGCTGG GGCCGGCCCGCACGGGCTTCATCTGAGGGCGCACGGCCCGCGACCGAGCGTGCGGACTGGCCTCCCAAGC GTGGGGCGACAAGCTGCCGGAGCTGCAATGGGCCGCGGCTGGGGATTCTTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ERO1A_2 ↗ | 14:52,695,529 | 負股 | 52,695,519–52,695,578 |
| ERO1A_1 ↗ | 14:52,695,704 | 負股 | 52,695,694–52,695,753 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR14_9QWNN · enhancer · 52692277–52692786 · regulatory
ENSR14_5GDMGJ · CTCF_binding_site · 52694819–52694840 · regulatory
ENSR14_5GDMJ3 · CTCF_binding_site · 52695148–52695169 · regulatory
ENSR14_BDGCS · promoter · 52695548–52696195 · regulatory
ENSR14_5GDMLC · CTCF_binding_site · 52695639–52695660 · regulatory
· motif · 52692188–52692210 · motif
· motif · 52692188–52692210 · motif
· motif · 52692202–52692214 · motif
· motif · 52694667–52694675 · motif
· motif · 52694821–52694837 · motif
· motif · 52694880–52694888 · motif
· motif · 52694880–52694895 · motif
· motif · 52694897–52694908 · motif
· motif · 52695150–52695166 · motif
· motif · 52695591–52695600 · motif
· motif · 52695641–52695657 · motif
· motif · 52695786–52695799 · motif
· motif · 52695792–52695805 · motif
· motif · 52695809–52695822 · motif
· motif · 52695998–52696009 · motif
· motif · 52696589–52696600 · motif
· motif · 52697000–52697022 · motif
· motif · 52697000–52697022 · motif
· motif · 52700451–52700464 · motif
缺氧會刺激 ERO1A;此現象提示其可能受到 HIF pathway 調控。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:468 aa
endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 alpha 全長 468 個胺基酸,屬於 EROs 家族。其 N 端第 1 至 23 個胺基酸被註記為訊號序列。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ERO1A 可位於內質網膜的腔側,也有高基氏體腔、分泌型及神經元樹突中的定位紀錄;神經元樹突定位標示為依相似性推定。 ERP44 的結合對 ERO1A 留存在內質網中至關重要。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
未繪示構造:Cell projection, dendrite。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- APPBP2Q92624 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LHX4Q969G2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- P4HBP07237 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PDIA3P30101 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ERO1A 主要以單體形式存在,但可能以單體或同源二聚體發揮功能。來源記載其與 PDILT 及 ERP44 互作;其中與 ERP44 的互作會使 ERO1A 留存在內質網。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ERO1A 參與內質網二硫鍵形成,藉由重新氧化催化蛋白質二硫鍵形成的 P4HB/PDI,使其能持續進行後續反應。電子經 FAD 傳給分子氧時會生成活性氧,且此蛋白質為免疫球蛋白正確折疊所需。它也參與內質網壓力誘發、依賴 CHOP 的細胞凋亡,透過活化 IP3R1 發揮作用;在 V.cholerae 感染時,則參與未折疊 cholera toxin 從還原態 P4HB/PDI 釋放及毒素逆向轉位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Oxidoreductase involved in disulfide bond formation in the endoplasmic reticulum. Efficiently reoxidizes P4HB/PDI, the enzyme catalyzing protein disulfide formation, in order to allow P4HB to sustain additional rounds of disulfide formation. Following P4HB reoxidation, passes its electrons to molecular oxygen via FAD, leading to the production of reactive oxygen species (ROS) in the cell. Required for the proper folding of immunoglobulins. Plays an important role in ER stress-induced, CHOP-dependent apoptosis by activating the inositol 1,4,5-trisphosphate receptor IP3R1. Involved in the release of the unfolded cholera toxin from reduced P4HB/PDI in case of infection by V.cholerae, thereby playing a role in retrotranslocation of the toxin PMID 10671517 ↗ · PMID 10970843 ↗ · PMID 11707400 ↗ · PMID 12403808 ↗ · PMID 18833192 ↗ · PMID 18971943 ↗ · PMID 23027870 ↗ · PMID 29858230 ↗ |
| 分子活性 | 2 R'C(R)SH + O2 = R'C(R)S-S(R)CR' + H2O2 | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | [protein]-dithiol + O2 = [protein]-disulfide + H2O2 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | ERO1A 主要以單體形式存在,但可能以單體或同源二聚體執行功能。它與 PDILT 互作,也與 ERP44 互作;ERP44 的結合會使 ERO1A 留存在內質網。 | 含實驗來源 | 證據與來源Predominantly monomer. May function both as a monomer and a homodimer. Interacts with PDILT. Interacts with ERP44; the interaction results in retention of ERO1A in the endoplasmic reticulum PMID 11847130 ↗ · PMID 15475357 ↗ · PMID 18971943 ↗ · PMID 29858230 ↗ |
| 細胞定位 | ERO1A 可定位於內質網膜腔側、高基氏體腔,也有分泌及細胞突起樹突中的定位紀錄。ERP44 結合對 ERO1A 留存在內質網至關重要;神經元樹突定位是依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Endoplasmic reticulum membrane / Peripheral membrane protein / Lumenal side; Golgi apparatus lumen; Secreted; Cell projection, dendrite; The association with ERP44 is essential for its retention in the endoplasmic reticulum. In neurons, it localizes to dendrites (By similarity) PMID 10671517 ↗ · PMID 14517240 ↗ · PMID 29858230 ↗ |
| 調控 | 缺氧會刺激 ERO1A;這項觀察提示其可能經由 HIF pathway 受到調控。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ATCTGAGGGCGCACGGCCCGCGACCGAGCGTGCGGACTGG40CCTCCCAAGCGTGGGGCGACAAGCTGCCGGAGCTGCAATG80GGCCGCGGCTGGGGATTCTTGTTTGGCCTCCTGGGCGCCG120TGTGGCTGCTCAGCTCGGGCCACGGAGAGGAGCAGCCCCC160GGAGACAGCGGCACAGAGGTGCTTCTGCCAGGTTAGTGGT200TACTTGGATGATTGTACCTGTGATGTTGAAACCATTGATA240GATTTAATAACTACAGGCTTTTCCCAAGACTACAAAAACT280TCTTGAAAGTGACTACTTTAGGTATTACAAGGTAAACCTG320AAGAGGCCGTGTCCTTTCTGGAATGACATCAGCCAGTGTG360GAAGAAGGGACTGTGCTGTCAAACCATGTCAATCTGATGA400AGTTCCTGATGGAATTAAATCTGCGAGCTACAAGTATTCT440GAAGAAGCCAATAATCTCATTGAAGAATGTGAACAAGCTG480AACGACTTGGAGCAGTGGATGAATCTCTGAGTGAGGAAAC520ACAGAAGGCTGTTCTTCAGTGGACCAAGCATGATGATTCT560TCAGATAACTTCTGTGAAGCTGATGACATTCAGTCCCCTG600AAGCTGAATATGTAGATTTGCTTCTTAATCCTGAGCGCTA640CACTGGTTACAAGGGACCAGATGCTTGGAAAATATGGAAT680GTCATCTACGAAGAAAACTGTTTTAAGCCACAGACAATTA720AAAGACCTTTAAATCCTTTGGCTTCTGGTCAAGGGACAAG760TGAAGAGAACACTTTTTACAGTTGGCTAGAAGGTCTCTGT800GTAGAAAAAAGAGCATTCTACAGACTTATATCTGGCCTAC840ATGCAAGCATTAATGTGCATTTGAGTGCAAGATATCTTTT880ACAAGAGACCTGGTTAGAAAAGAAATGGGGACACAACATT920ACAGAATTTCAACAGCGATTTGATGGAATTTTGACTGAAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。