基因總覽
ERLIN2（ER lipid raft associated 2）是位於人類第 8 號染色體 8p11.23 的蛋白質編碼基因。其蛋白質屬於 band 7/mec-2 家族，是內質網膜的單次跨膜蛋白，並與內質網膜中類脂筏區域相關。蛋白質全長 339 個胺基酸，包含短的細胞質端、跨膜區，以及較長的腔內區；其中一段腔內區與 ERLIN1 互動。ERLIN2 是 ERLIN1/ERLIN2 複合體的組成成員，並參與內質網蛋白質降解及膽固醇恆定相關調節。其具體分子作用與相關生物學過程如下方功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000519638 ★ | 37,736,634–37,758,422 | 12 |
| ENST00000523887 | 37,736,594–37,746,550 | 6 |
| ENST00001126614 | 37,736,594–37,741,403 | 4 |
| ENST00001126615 | 37,736,594–37,741,398 | 4 |
| ENST00000518586 | 37,736,620–37,746,553 | 6 |
| ENST00000335171 | 37,736,620–37,746,548 | 7 |
| ENST00000861237 | 37,736,620–37,758,422 | 12 |
| ENST00000861238 | 37,736,620–37,758,422 | 13 |
| ENST00000861243 | 37,736,620–37,758,422 | 12 |
| ENST00001126616 | 37,736,620–37,741,396 | 4 |
| ENST00000518526 | 37,736,623–37,751,697 | 8 |
| ENST00000648919 | 37,736,634–37,746,550 | 7 |
顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ERLIN2 與 ERLIN1 組成複合體，參與內質網相關降解（ERAD），可介導肌醇 1,4,5-三磷酸受體（IP3Rs）的降解，例如 ITPR1。這項作用將 ERLIN1/ERLIN2 複合體與內質網中受體蛋白的品質及周轉調節相連；來源指出其參與此降解過程，但未進一步描述完整的分子步驟。
ERLIN2 也促進固醇加速的 HMGCR 降解。此作用可能涉及含 AMFR/gp78 的泛素連接酶複合體，因此來源對相關複合體的參與仍保留推論性。這項 ERAD 調節與細胞膽固醇恆定相連，顯示 ERLIN2 的功能不僅涉及特定受體的周轉，也與膽固醇相關蛋白的降解調節有關。
此外，ERLIN2 參與 SREBP 訊號路徑調節，並可能促進 SCAP-SREBF 複合體滯留於內質網。這一作用描述為可能性，而非確定的定位結果；它提供了 ERLIN2 影響細胞膽固醇恆定的另一條途徑。整體而言，來源支持 ERLIN2 參與內質網相關降解及膽固醇調節，但對部分複合體組成與作用方式使用「可能」等保留語氣。
Promoter 與基因調控
>ERLIN2 ENST00000519638 GRCh38 chr8:37735634-37736734 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCCCTGTGCACTGTGGCAGGAGTTTAAAAAGCAGTGAACTCAAGATATTAAGGAAACACAAAGGAAACTT TCCTTGGCTTTTACCCTTGAACCTCGCTGAACTTCTTAGATTCCGTTCATTAAAATTAGAATAATAATTC CTTGTTAATATACTTTGTGGCGTTGCAGGATCCCAAGGGCCAAAGCTCCCAGAAAAATATAAAGAACAAC TCAAGGTAGGGATTTTTGATTGGTGAGGTAATGATGCTAATCTGTACATTGAAAAGACTGTTTCATTTCA GCTGTGCTATAGGAAAGCAAACAGTTGCAACTCGCCAGTACCTTATCAAGGAGAGAAAAAAAAAAAGGCC GCGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCAGTTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGGATTGCTTGAAGCCAG AGTTTGAGACCAGAAATACCAAGACCCTGTCTTTACTAAAAATAAAATTGTCAAGTGTCGTGGCGTGCGC CTGTGGTCCCAGCTACTCAGCAGGGTGAGGTGGGAGGATCGCTTAAGCCCAGGAGTTCGAGGCTGTAGTG AGCTATGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGCGAGACCTTGTCTCTAAAAAAACCAAAAC GAACCAGGTTCGGCCTAATGCAGAAGGAAATCCGGAGCAATCCCCAAAGTCAACGCCTTGGAAAGGTTCG CCCTGGGTCTCAGTACTCCGGGGCATGCGCGTCCTGCCGCTCGCTCTCGGGGAGCTCCCACCAACACCGC CCTCATCCCCAGCCCCAGGACGGATACCCAAGACCGAGGTCCAGGACCGCACCGACCAAGTCGCGGGCGA TCCCTGGCGGCCAGCTACGGCCATTGACCGCTGGGAGCGCGAGGGGCGGGGCGCAGAGCGAGCGCGGGGC GGGGGTGTGGTCTTCTCGCGTGAATTGATGGCGTCATCGAAGCGACGGCCCGGAAGGAAGTCGCGTGCTG AGGGGTGTGACGGTTTTCTTGCTCGTGGGCTCGGACGAGTACGGAGCGCCTGCAGGGACAGCCTGGTACG CGGCCCCCGCCCCTTCGTGCGCGCGCTGGGCCTAGCTGCCGCTCAGGGTCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ERLIN2_1 ↗ | 8:37,736,634 | 正股 | 37,736,585–37,736,644 |
| ERLIN2_2 ↗ | 8:37,736,745 | 正股 | 37,736,696–37,736,755 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR8_B9H7K · promoter · 37736135–37737018 · regulatory
ENSR8_B9H7N · enhancer · 37737019–37737621 · regulatory
ENSR8_9JZFJ · promoter · 37737622–37738122 · regulatory
· motif · 37736101–37736114 · motif
· motif · 37736353–37736364 · motif
· motif · 37736353–37736364 · motif
· motif · 37736387–37736398 · motif
· motif · 37736447–37736464 · motif
· motif · 37736498–37736515 · motif
· motif · 37736569–37736582 · motif
· motif · 37736569–37736582 · motif
· motif · 37736592–37736601 · motif
· motif · 37736896–37736908 · motif
· motif · 37736899–37736906 · motif
· motif · 37736934–37736946 · motif
· motif · 37737725–37737738 · motif
· motif · 37737805–37737813 · motif
· motif · 37738057–37738066 · motif
· motif · 37738057–37738068 · motif
· motif · 37738609–37738624 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：339 aa
ERLIN2 蛋白長 339 個胺基酸，屬於 band 7/mec-2 家族。其第 1–3 個胺基酸位於細胞質端，第 4–24 個胺基酸為螺旋狀跨膜區，第 25–339 個胺基酸位於腔內。第 177–309 個胺基酸區段註記為與 ERLIN1 互動的區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ERLIN2 是內質網膜上的單次跨膜蛋白，並與內質網膜的類脂筏區域相關。 來源未提供定位隨條件變化或不同異構型之間差異的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- AMFRQ9UKV5 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- ERLIN1O75477 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- SYVN1Q86TM6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TMUB1Q9BVT8 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- HMGCRP00347 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
ERLIN2 與 ERLIN1 形成異源複合體，並在此複合體中與 RNF170 互動；它也與活化的 ITPR1 互動，且此互動不受 ITPR1 多聚泛素化程度影響，後者依相似性推定。膽固醇充足時，ERLIN2 與 SCAP、INSIG1、SREBF1 及 SREBF2 互動，顯示其與 SCAP-SREBP-INSIG 複合體相關。ERLIN2 可能參與含 AMFR/gp78 與 INSIG1 的泛素連接酶複合體，並與 TMUB1、SYVN1、RNF139、TMEM259（依相似性）及 TMEM41B 互動；TMUB1 可橋接其與 AMFR 的關聯。
疾病與遺傳關聯
ERLIN2 的變異與兩種遺傳型態不同的痙攣性截癱相關。常染色體隱性 SPG18B 為較嚴重的形式，通常幼年早期發病，多數患者有嚴重精神運動發育遲緩，部分患者可能出現明顯關節攣縮。常染色體顯性 SPG18A 則屬純型，症狀可從兒童期至成年期開始。兩者均屬神經退化性疾病，可有下肢漸進性無力與痙攣，但進展速度及嚴重程度各異；來源將疾病歸因於影響 ERLIN2 的變異。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ERLIN2 與 ERLIN1 組成複合體，介導內質網相關降解（ERAD），作用對象包括 ITPR1 等肌醇 1,4,5-三磷酸受體。ERLIN2 也促進固醇加速的 HMGCR 降解，此作用可能涉及含 AMFR/gp78 的泛素連接酶複合體；此外，它參與 SREBP 訊號調節，並可能促進 SCAP-SREBF 複合體滯留於內質網。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the ERLIN1/ERLIN2 complex which mediates the endoplasmic reticulum-associated degradation (ERAD) of inositol 1,4,5-trisphosphate receptors (IP3Rs) such as ITPR1. Promotes sterol-accelerated ERAD of HMGCR probably implicating an AMFR/gp78-containing ubiquitin ligase complex. Involved in regulation of cellular cholesterol homeostasis by regulation the SREBP signaling pathway. May promote ER retention of the SCAP-SREBF complex PMID 17502376 ↗ · PMID 19240031 ↗ · PMID 21343306 ↗ · PMID 24217618 ↗ |
| 交互作用 | ERLIN2 與 ERLIN1 形成異源複合體，並與 RNF170、活化的 ITPR1 互動；膽固醇充足時也與 SCAP、INSIG1、SREBF1 及 SREBF2 互動。它可能參與含 AMFR/gp78 與 INSIG1 的泛素連接酶複合體，並與 TMUB1、SYVN1、RNF139、TMEM259（依相似性）及 TMEM41B 互動；TMUB1 可橋接 ERLIN2 與 AMFR。 | 含實驗來源 | 證據與來源Forms a heteromeric complex with ERLIN1. In complex with ERLIN1, interacts with RNF170. Interacts with activated ITPR1, independently of the degree of ITPR1 polyubiquitination (By similarity). Interacts with SCAP, INSIG1, SREBF1 and SREBF2 under cholesterol sufficiency conditions; indicative for an association with the SCAP-SREBP-INSIG complex. Probably part of an AMFR/gp78 and INSIG1-containing ubiquitin ligase complex involved in ERAD of HMGCR. Interacts with TMUB1; TMUB1 bridges the association with AMFR. Interacts with SYVN1 and RNF139. Interacts with TMEM259 (By similarity). Interacts with TMEM41B PMID 19240031 ↗ · PMID 21343306 ↗ · PMID 21610068 ↗ · PMID 24217618 ↗ · PMID 30352685 ↗ |
| 細胞定位 | ERLIN2 是內質網膜上的單次跨膜蛋白，並與內質網膜中的類脂筏區域相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Endoplasmic reticulum membrane / Single-pass type II membrane protein; Associated with lipid raft-like domains of the endoplasmic reticulum membrane PMID 16835267 ↗ · PMID 17502376 ↗ · PMID 19240031 ↗ |
| 疾病關聯 | ERLIN2 變異與常染色體隱性痙攣性截癱 18B（SPG18B）相關。此嚴重形式在幼年早期發病，多數患者有嚴重精神運動發育遲緩，部分患者可能出現明顯關節攣縮。痙攣性截癱通常造成下肢漸進性無力與痙攣，但病程及症狀嚴重度可有差異，也可能伴隨平衡困難、肌肉痙攣或膀胱症狀。 | 含實驗來源 | 證據與來源Spastic paraplegia 18B, autosomal recessive SPG18B A form of spastic paraplegia, a neurodegenerative disorder characterized by a slow, gradual, progressive weakness and spasticity of the lower limbs. Rate of progression and the severity of symptoms are quite variable. Initial symptoms may include difficulty with balance, weakness and stiffness in the legs, muscle spasms, and dragging the toes when walking. In some forms of the disorder, bladder symptoms (such as incontinence) may appear, or the weakness and stiffness may spread to other parts of the body. SPG18B is a severe form with onset in early childhood. Most affected individuals have severe psychomotor retardation. Some may develop significant joint contractures. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 611225 PMID 21330303 ↗ · PMID 27824013 ↗ · PMID 28832565 ↗ |
| 疾病關聯 | ERLIN2 變異與常染色體顯性痙攣性截癱 18A（SPG18A）相關。SPG18A 屬純型，症狀起始年齡可從兒童期至成年期，差異相當大。痙攣性截癱可造成下肢漸進性無力與痙攣，病程及嚴重度不一；部分形式也可能伴隨膀胱症狀，或使無力與僵硬擴及身體其他部位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Spastic paraplegia 18A, autosomal dominant SPG18A A form of spastic paraplegia, a neurodegenerative disorder characterized by a slow, gradual, progressive weakness and spasticity of the lower limbs. Rate of progression and the severity of symptoms are quite variable. Initial symptoms may include difficulty with balance, weakness and stiffness in the legs, muscle spasms, and dragging the toes when walking. In some forms of the disorder, bladder symptoms (such as incontinence) may appear, or the weakness and stiffness may spread to other parts of the body. SPG18A is a pure form. Age at onset of symptoms varies considerably from childhood to adulthood. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620512 PMID 29528531 ↗ · PMID 32094424 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCTCGTGGGCTCGGACGAGTACGGAGCGCCTGCAGGGACA40GCCTGGATAAAGGCTCACTGATGGCTCAGTTGGGAGCAGT80TGTGGCTGTGGCTTCCAGTTTCTTTTGTGCATCTCTCTTC120TCAGCTGTGCACAAGATAGAAGAGGGACATATTGGGGTAT160ATTACAGAGGCGGTGCCCTGCTGACTTCGACCAGCGGCCC200TGGTTTCCATCTCATGCTCCCTTTCATCACATCATATAAG240TCTGTGCAGACCACACTCCAGACAGATGAGGTGAAGAATG280TACCTTGTGGGACTAGTGGTGGTGTGATGATCTACTTTGA320CAGAATTGAAGTGGTGAACTTCCTGGTCCCGAACGCAGTG360TATGATATAGTGAAGAACTATACTGCTGACTATGACAAGG400CCCTCATCTTCAACAAGATCCACCACGAACTGAACCAGTT440CTGCAGTGTGCACACGCTTCAAGAGGTCTACATTGAGCTG480TTTGATCAGATTGATGAAAATCTCAAACTGGCTTTGCAAC520AGGACCTGACCTCCATGGCCCCTGGGCTGGTCATTCAAGC560TGTGCGGGTAACAAAGCCCAACATACCAGAGGCAATCCGC600AGAAACTACGAGTTGATGGAAAGTGAGAAGACAAAGCTTC640TCATTGCCGCCCAGAAACAGAAGGTGGTGGAAAAGGAAGC680AGAGACAGAGCGGAAGAAGGCGCTCATTGAGGCAGAAAAA720GTGGCCCAGGTGGCTGAGATCACCTACGGGCAGAAGGTGA760TGGAGAAGGAGACTGAGAAGAAGATTTCAGAAATTGAAGA800TGCTGCATTTCTGGCCCGGGAGAAGGCAAAGGCAGATGCT840GAGTGCTACACTGCTATGAAAATAGCCGAAGCCAATAAGC880TGAAGCTAACCCCTGAATATCTGCAGCTGATGAAGTACAA920GGCCATTGCTTCCAACAGCAAGATTTACTTTGGCAAAGAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。