基因總覽
ERG28 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 ergosterol biosynthesis 28 homolog。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 14q24.3。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000256319 ★ | 75,649,791–75,660,876 | 5 |
| ENST00000882798 | 75,648,079–75,661,211 | 5 |
| ENST00000882799 | 75,648,079–75,661,133 | 6 |
| ENST00000882800 | 75,648,079–75,657,642 | 4 |
| ENST00000939743 | 75,648,079–75,661,570 | 5 |
| ENST00000939744 | 75,648,079–75,661,211 | 5 |
| ENST00000955834 | 75,648,079–75,660,834 | 5 |
| ENST00000981321 | 75,648,079–75,661,211 | 3 |
| ENST00000981323 | 75,648,079–75,661,211 | 5 |
| ENST00001068930 | 75,648,079–75,661,211 | 4 |
| ENST00001139856 | 75,648,079–75,661,211 | 5 |
| ENST00000981322 | 75,650,895–75,661,211 | 4 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>ERG28 ENST00000256319 GRCh38 chr14:75660776-75661876 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAAAAAAACAGACCCCGATAATGATCAAAGATCTTCGGCGCAATAGGCAATGTCTAACAACTTCAATGGC TTTCTTCAGGGGATTCTCAACGGGATTTCTTGATCTTTCCCAAAATGCTGGGAAGCCCTTTAAGTTTAAA CAAACAAAACCTCCAAACGGGAAGGGATGCCAACCTCTCCTAGGCTGCCTGCAGAGCGGGGAGAAACAGG TCTATCGGAAGAAGAGTAGAGATACTCACCTAAGGAGACTCCTCTCCCGAAAGGAATCTGCTTCTCAGCC CCACCCCCAGCTCACCCCAATCCCACGTAGGTCCGCAGATGCTCCCCCCGGGAAGGACGGGACGACCCCG CAGCCGCGATTCAACGCGGCGCGCCCGGAAGCCAACAGCTACTCCCGGGCTCTGAGCGGGAAGTCCTGCT GCAGGCGCCAGCCCGGACCCGGGAATGCTCCTCCCTAGGGTAGGGAAGCGCGCGGGCGCAGGCGTTTACC TGTCTCATCTTCCCATGGTTCGGGGCGAGCAGGCGTGGACCGCGCTCTGCGCCTACCTCCCTCCTCCTTC CCCAGGAAGGCTCAGGGCAGCCGCCGACGGCTGCTTCCCCGGTTACTACAACAACCAACAAGCAACCGCC CGCTCGGAGCCACTGCGCAGGCGCTCATAACGCTCAGCTGCGGACGCGGGCGAATGTCGTCACCGCCGCG CAGCGCGGGCGCAGAGCCCTGCCCTCAGCTGAAGGGAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTCCGCTGTTTTT TTCTCCGCCCCTAAGAGGTTGACTCCAAACCCGGAGTTCCGCTAGGTCCAACAGGAGGGCTTACGGCGTG AGCGGCGTACCTGGGGAGAGGCTTAGGCAGCGGCAACCGCTGATTGGCAGTAAAGGGGTTCACTCCCCAT CTCCTGCTCGGGCGAAACCGGGACAGCCAATCAGAGAGAGTACTGACGGAAACGGCCCAATCCTGGAGCA GGGCTGAGGGAGGGGGCGGGGACAAATGGCTCAGGTGGACTCCGGGCTGGAGCTGTCCTGGGGGAGCTTG TTTGCGGCAGCGGCTGCTGCTGCCACTGCTGTGCTGGGGGCCCGGTCGCCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| C14orf1_1 ↗ | 14:75,660,876 | 負股 | 75,660,866–75,660,925 |
| C14orf1_2 ↗ | 14:75,661,116 | 負股 | 75,661,106–75,661,165 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR14_5MRGKC · CTCF_binding_site · 75656012–75656033 · regulatory
ENSR14_5MRGMD · CTCF_binding_site · 75656447–75656468 · regulatory
ENSR14_BK2F8 · enhancer · 75660053–75660865 · regulatory
ENSR14_9352SN · promoter · 75660866–75661288 · regulatory
ENSR14_BK2FF · enhancer · 75661289–75662255 · regulatory
· motif · 75656014–75656030 · motif
· motif · 75656449–75656465 · motif
· motif · 75660342–75660357 · motif
· motif · 75660643–75660654 · motif
· motif · 75660644–75660655 · motif
· motif · 75660875–75660885 · motif
· motif · 75660881–75660891 · motif
· motif · 75661164–75661175 · motif
· motif · 75661164–75661175 · motif
· motif · 75661182–75661195 · motif
· motif · 75661182–75661195 · motif
· motif · 75661222–75661233 · motif
· motif · 75661222–75661233 · motif
· motif · 75661261–75661276 · motif
· motif · 75661261–75661276 · motif
· motif · 75661332–75661347 · motif
· motif · 75661350–75661361 · motif
· motif · 75661350–75661361 · motif
· motif · 75661494–75661503 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：140 aa
ERG28（ergosterol biosynthesis 28 homolog）屬於 ERG28 family，蛋白質長 140 個胺基酸。序列中有四段預測的螺旋型跨膜區，分別位於第 4–24、52–72、79–99 與 105–125 個胺基酸位置。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ERG28 位於內質網膜，註記為多次跨膜蛋白質；其序列所列的四段螺旋型跨膜區支持此定位描述。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 53 個夥伴
- AQP2P41181 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AQP3Q92482 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AQP6Q13520 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BCL2L13Q9BXK5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CD53P19397 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CD74P04233-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CLDN5O00501 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CLDN7O95471 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CREB3L1Q96BA8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYB561P49447 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EBPQ15125 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ELOVL4Q9GZR5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM174AQ8TBP5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM209AQ5JX71 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FFAR2O15552 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FXYD3Q14802-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GET1O00258 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GJB5O95377 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPR152Q8TDT2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPR37L1O60883 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPX8Q8TED1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSD17B11Q8NBQ5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- JAGN1Q8N5M9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KCNJ6P48051 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LHFPL5Q8TAF8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | ERG28 位於內質網膜，並被註記為多次跨膜蛋白質。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GACAAATGGCTCAGGTGGACTCCGGGCTGGAGCTGTCCTG40GGGGAGCTTGTTTGCGGCAGCGGCTGCTGCTGCCACTGCT80GTGCTGGGGGCCCGGTCGCCAGGCAAAAAGCCCTCCCACG120TTTGAGGGGAGTCATGAGCCGTTTCCTGAATGTGTTAAGA160AGTTGGCTGGTTATGGTGTCCATCATAGCCATGGGGAACA200CGCTGCAGAGCTTCCGAGACCACACTTTTCTCTATGAAAA240GCTCTACACTGGCAAGCCAAACCTTGTGAATGGCCTCCAA280GCTCGGACCTTTGGGATCTGGACGCTGCTCTCATCAGTGA320TTCGCTGCCTCTGTGCCATTGACATTCACAACAAGACGCT360CTATCACATCACACTCTGGACCTTCCTCCTTGCCCTGGGG400CATTTCCTCTCTGAGTTGTTTGTCTATGGAACTGCAGCTC440CCACGATTGGCGTCCTGGCACCCCTGATGGTGGCAAGTTT480CTCCATCCTGGGTATGCTGGTCGGGCTCCGGTATCTAGAA520GTAGAACCAGTATCCAGACAGAAGAAGAGAAACTGAGGCC560AGCATTATCACCTCCAGGACTTTCTCGTTTTCCACCTTGG600CCATCTTCTTCCTTCGTCGTCTCTCCTCTTTAATTTCTTT640TCTATTCCATCATCTGCCCTTTTATTCACTTTTAGCCTCT680TTTTTTAATTTTTAAAATTTAAAGATATGCATACTGAAAA720GTATATAACATGTACGTACAATTTAAAGAATAATTTTAAA760GTGAATACTACGTAACTCCATCCAAGTCAAGAAATTGCCA800GCTTCTCGGAAGCCCACTGTGTCTCCTTCCCCTACCTGCA840ACCTCTTCCAGGCTCCCTTTTCCAGCCTTCCCCTTTTTCC880CTTTTATTTTCATGCCTTGATTTGACTTGTGTGGTGGGAA920CATGTGAACTATGAAACTTAAACCTGCTGCCCACCCAGAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。