基因總覽
ERC2-IT1（ERC2 intronic transcript 1）屬於非編碼 RNA，不是蛋白質編碼基因。現有資料提供其正式名稱與基因類型，但未說明 RNA 的長度、結構特徵、所屬 RNA 家族或表現情形，因此不宜進一步推定其分子特性。資料將 ERC2-IT1 列於染色體 3 的 3p14.3 區域；這些資訊用於描述基因身分與位置，並未提供其轉錄產物的功能機制。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000629461 ★ | 55,657,206–55,659,382 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有註釋將 ERC2-IT1 描述為可能的腫瘤抑制基因。這是推定性質的功能註釋，並非來源所記載的已證實作用；資料沒有提供支持此判斷的實驗結果、作用機制或相關生物學情境。因此，目前只能保留「可能具有腫瘤抑制功能」這一有限結論，無法據此說明其如何影響腫瘤形成或細胞活動。
Promoter 與基因調控
>ERC2-IT1 ENST00000629461 GRCh38 chr3:55659282-55660382 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCAAAGATTGTGCCCCTTCCCTGCACCAGGCACTCAATTCCAGGGGTGGAAGTTGTGATGGAGACATTTT TATAACTTGGACATAAAGATCAGGAGCCAAAAGGAATATCAGGTGGAACAAATGCTATTGCTTACATTTT ATCTGGAGGTGGGGGTGCGGGTTGATGTGCCAATTTGCTCTCAGTTGCATGTACAGAAATTGTGACCTCA AATTCAGCCAATGGAAAGTCTGAGTATGAACATTCACATTGTTCAGACATTTAACAAATATGAACTGAGC TTCCATAATGTGATGGGGTTTGCATGAGAAGCTAATGATGCAGTAATGAATAAGGTGAGTTCCATACTCA TAGATCTTCCAGGCTCCATTACTCCAGGCTAATGAAGGAAGCACAGAAAAGCAAGCAATTTCAGGATAGT ATAATAAGTGCTGTAGTGGAGGAGGCACTAGATGCCTAGAGCAAATATGGGAGAGACGCCATACCGAGAT TCAGAAGCCAGAAGTAGTGACCCTTGAGCTGTGGCCTCACGGATAAGTAGGAGTTGGCCAGGTACAGAGG CGGCAGAGGAGAATAGCCCAGCCCCAGGGGATGTCATGATGTAGATCTGATCTGGGAGCCTACCTATGTC CATAAATACATCTGGAGTATAGGAGGCAAACAGGCTATCGGTTGAGACTGAGGTCAGAAAGCCTTTCTGC TAGTTTTTTGAAGAGATTGAACTTAATTATAAGGGGACTTGGAAACCATTGAAAGAAAAGGCTGAGCAGT GGCATGGACGGATGTGGGTGCTTTAGAAGGACCCCTCTGGTGGAAGAGCCAAGAATTGATGGAGGGGAGT GAGTGGAGCACAGAGACTATTGGGACCTGAGAGAGGTGGTAGGGGGTAGAAAGGAAGGGTGGGGAGATCA GGGATGGGGAAAAGCAGCGGGATTCCAGAGCTATCTGAGGAGGAGGGGCCACGGGGTTTGTTCGTCTGGT GGAGGGAGAGAAGGGAGCCCAGGATGACAGACAGCCAGGCCTGATTTGGCCAAATCATCATGCAAATATT ATTCTGGGCTGACAGGCCCAAGTTGCAGTCAGCAGAGGCAACACGGGCTTA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_BF37T · enhancer · 55654123–55654757 · regulatory
ENSR3_9S4H2 · enhancer · 55658717–55659050 · regulatory
ENSR3_9S4J6 · enhancer · 55662733–55663012 · regulatory
· motif · 55654379–55654387 · motif
· motif · 55658477–55658485 · motif
· motif · 55658582–55658602 · motif
· motif · 55658898–55658911 · motif
· motif · 55658898–55658911 · motif
· motif · 55661454–55661467 · motif
· motif · 55661454–55661467 · motif
RNA 轉錄本與序列
ERC2-IT1 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000629461 ★ | lncRNA | 2,177 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ERC2-IT1 被註釋為可能的腫瘤抑制基因；此描述屬推定，來源未提供支持該判斷的實驗資料或作用機制。 | 資料庫紀錄 |
DNA 與 RNA 序列
AGGATGACAGACAGCCAGGCCTGATTTGGCCAAATCATCA40TGCAAATATTATTCTGGGCTGACAGGCCCAAGTTGCAGTC80AGCAGAGGCAACACGGGCTTATAATTTGCCATTTGTGAAT120GTCCTGAGGACTGGAGAATCAGCTAGGAAGCAAATCTTCC160TTCTGCTGCATAAGACAGCCAAAAGCACCTCTGAGGATAG200GCATCTCAGGGATTTCAGAGCAGGTAACGCCTTTTGGTTG240TTTTGAATATGCTGACAGAAGAACAAAAGCTTTCAGGAAA280ACAAAGCCCAACCCCTTAATGAAACAGGAAAGGATATACA320GTTTCAAATGCTTGCTTGCTTTCCTTGTTTTCTGAGAAGA360AAGATGCCTTGCCTGTTGAAGGTGGCAGATGCAGGTTGCT400CTGTGGGCCTCGGGAAGGTTCACTGCAGCTGTCACCTGCC440CAACCCACGTGTCCTGAGGCACTGTGACATCTTGACAGGT480GTCCTGACTCTTGGCCTTGACATGTCCTGTCACGCCTGCC520TGTCAGCTGGGACTGGGCTTGGGGAAGAGCTTGTGGGCCT560GGGGCCTGGTAGTACTTGCTTAGTTAAACATCTGTGGCTG600CTATTTCCCTGTCACAGGCTGGCAAGTCAGAACTACTCAG640ATTCACTTGCACAGCAATGGTCCTTCAGTCTTCTGATTAT680GTGGCTCTGCAACAGGGAGAGGGAGATATTCATGAGCAAG720TGTGCAAAATGCATTTAATGCCTGCTAATGGTGTACAGCC760ATCCATTGCTTTGGTCTGCCCAGTGTCTGTCTCCCTATCT800TTTGATACCAGGGGCCAAGTTTCTCTGGGGAATTCCTTTC840AGTTTTTGCAGTTCTGGGACAGTTACCCTTCACCCAGCAC880TATGTCAATATGGGCACATGACTCAAGCCAGCCAATCAGA920GTTCACTTTCCCTAGACTTGGTCACTCAGAGGGAGCTATC960cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。