基因總覽
EQTN(equatorin)是蛋白質編碼基因,產物為錨定於頂體膜的蛋白質。資料將其描述為與受精過程及頂體生合成有關的膜蛋白;目前提供的資料未進一步指出其所屬蛋白質家族或更細緻的分子作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000380032 ★ | 27,284,654–27,297,150 | 8 |
| ENST00000537675 | 27,284,723–27,297,136 | 7 |
| ENST00000380031 | 27,292,133–27,297,150 | 4 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Equatorin 是頂體膜上的錨定蛋白,來源將它與受精過程及頂體生合成兩項生物學過程相連結。這些資訊支持它與精子頂體的形成,以及受精相關過程有所關聯;但未具體說明它在其中執行的分子步驟、作用對象或影響方向。
現有資料亦未提供能進一步界定其功能的實驗條件或機制,因此不宜據此推定它如何參與頂體生合成,或在受精過程中扮演何種具體角色。
Promoter 與基因調控
>EQTN ENST00000380032 GRCh38 chr9:27297050-27298150 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTCGGCTCGCTGCAAACTCTGCCTCCCATGTTCAAGCACGTGGGCCAC CACGCCTGGCTAACTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGAGGTTTCACCATGTTGCCCAGGGTGGTCTTGAAC TCCTGACCTCAAGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCGT CCAGCCTCTGACTAGTTTTTAAAAGATATTTTTATTGCATTTATCCAAGAAAACACATCATATTGCAATG CTTTGAGAAACAAAAAGATCTGTTCTCATTTTACTCTTAACAATATTAATGGTTGCAGGGAGCCGAAGGC TCGTGGGACGTGAGCCACTCAGCATTCCACTGGAGGCTATATGATCAAACAGCAAACTGTTTATTATGAA TGCAGGATGTGGGCAAACTCACGACTGCTCCTGCCCACAGAAGGTTTGCTGGAGGCAATCACTCCCTGGC ACCGAGGTTATCTACTGCGACATCTAGAGAATGCAGTGTTGCATGCCTACTCTGGACCGGGCAGCTGACC CCTTCTTCCATCCTCCTTCTCACTATCTCTCTTGCCTAATAAATACAGAGGGCTGTGTAAAGCTCAGGGC CCTTGCCCACTAGAGGCAAGGTGCCCCCGACCCCTTCTTCCAAATATACTCTTTTGTCTTTGTCTTTTAT TCCCGCATTCGTCCCCCTTTGTTCAGTCCCCTAGGTCCGTGCGGGTTACAAGTGGCACCCTGACTAGCCA CAGAATCGAGTGCTCTACAAATGGTTCTTTAAAATCCAGAGCCGAGTAATTAACATTCTTTTATGAAAAC ACACTTATTAACTTTCAAAGAAAATCTTGTAATGGTTTATTTAAAAAATAACTAAAAACCATTATAGTAC CTGAGATAAAGCAGTCTTCAGACTGAGTCACAAAGCTGTTGGGAACCCCCACCCCCACCAACATTCTGAT GCCCATCTGACAGTGATGTCATAATGTCCTAGTTAGACACAGGACCTGCTGGGCCACAGAAAGGAGGCTC TGGGTAGACGCACTAGATTACTGGATAAATCACTTCAATTTCCCAATGAAT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| EQTN_1 ↗ | 9:27,297,136 | 負股 | 27,297,126–27,297,185 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR9_9DSH8 · enhancer · 27292718–27292988 · regulatory
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:294 aa
Equatorin 全長 294 個胺基酸。其 N 端第 1–14 位為訊號序列,第 15–181 位是囊泡側拓樸區域;第 182–202 位為螺旋型跨膜區,第 203–294 位位於細胞質側。第 107–126 位另標註為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Equatorin 位於頂體膜,資料描述其分布會因頂體區域而異:前端區域在內頂體膜較豐富、外頂體膜含量極少;後端區域則在內、外頂體膜均較豐富。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
資料記載 Equatorin 與 SNAP25 有交互作用,但未說明此關係是否為直接結合、是否構成複合體,或其功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | Equatorin 是錨定於頂體膜的蛋白質,與受精過程及頂體生合成有關;現有敘述未進一步界定其在這些過程中的具體作用機制。 | 推論支持 | 證據與來源Acrosomal membrane-anchored protein involved in the process of fertilization and in acrosome biogenesis |
| 交互作用 | Equatorin 與 SNAP25 有交互作用;這項敘述未說明交互作用是否為直接結合,亦未提供複合體或功能結果的資訊。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | Equatorin 是單次穿膜的第一型膜蛋白,定位於囊泡與分泌囊泡中的頂體膜,包括內、外頂體膜。其頂體區域分布不同:前端在內膜較豐富、外膜極少;後端則在兩種膜上均較豐富。 | 推論支持 | 證據與來源Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle, acrosome membrane / Single-pass type I membrane protein; Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle, acrosome inner membrane / Single-pass type I membrane protein; Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle, acrosome outer membrane / Single-pass type I membrane protein; In the anterior acrosome region, enriched on the inner acrosomal membrane but minimal on the outer acrosomal membrane; in contrast in the posterior acrosome region enriched on both the inner and outer acrosomal membranes |
核酸與蛋白質序列
ATAATGTCCTAGTTAGACACAGGACCTGCTGGGCCACAGA40AAGGAGGCTCTGGGTAGACGCACTAGATTACTGGATAAAT80CACTTCAATTTCCCAATGAATTTTATATTGTTTATTTTTA120TACCTGGAGTTTTTTCCTTAAAAAGTAGCACTTTGAAGCC160TACTATTGAAGCATTGCCTAATGTGCTACCTTTAAATGAA200GATGTTAATAAGCAGGAAGAAAAGAATGAAGATCATACTC240CCAATTATGCTCCTGCTAATGAGAAAAATGGCAATTATTA280TAAAGATATAAAACAATATGTGTTCACAACACAAAATCCA320AATGGCACTGAGTCTGAAATATCTGTGAGAGCCACAACTG360ACCTGAATTTTGCTCTAAAAAACGATAAAACTGTCAATGC400AACTACATATGAAAAATCCACCATTGAAGAAGAAACAACT440ACTAGCGAACCCTCTCATAAAAATATTCAAAGATCAACCC480CAAACGTGCCTGCATTTTGGACAATGTTAGCTAAAGCTAT520AAATGGAACAGCAGTGGTCATGGATGATAAAGATCAATTA560TTTCACCCAATTCCAGAGTCTGATGTGAATGCTACACAGG600GAGAAAATCAGCCAGATCTAGAGGATCTGAAGATCAAAAT640AATGCTGGGAATCTCGTTGATGACCCTCCTCCTCTTTGTG680GTCCTCTTGGCATTCTGTAGTGCTACACTGTACAAACTGA720GGCATCTGAGTTATAAAAGTTGTGAGAGTCAGTACTCTGT760CAACCCAGAGCTGGCCACGATGTCTTACTTTCATCCATCA800GAAGGTGTTTCAGATACATCCTTTTCCAAGAGTGCAGAGA840GCAGCACATTTTTGGGTACCACTTCTTCAGATATGAGAAG880ATCAGGCACAAGAACATCAGAATCTAAGATAATGACGGAT920ATCATTTCCATAGGCTCAGATAATGAGATGCATGAAAACG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。