演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ENTPD4LALP70

ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 4

ENTPD4 編碼 GDA1/CD39 NTPase 家族的多次穿膜蛋白,可在鈣或鎂離子依賴下水解核苷酸二磷酸與三磷酸,對不同核苷酸具有底物偏好。

Homo sapiens8p21.3UniProt Q9Y227
OFFICIAL SYMBOL
ENTPD4
CHROMOSOME
8
UNIPROT
Q9Y227
PDB / ALPHAFOLD
6WG5
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ENTPD4(ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 4)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 GDA1/CD39 NTPase 家族。蛋白質具有兩段穿膜區,兩端為細胞質區域,中間的大段區域朝向膜腔側。不同異構型的細胞內分布有所不同:Isoform 1 與自噬體及溶酶體膜相關,Isoform 2 則位於 Golgi apparatus 膜。這些特徵構成 ENTPD4 的基本分子與細胞定位背景;其核苷酸水解活性及底物差異另見功能說明。

Official symbol
ENTPD4
Gene name
ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 4
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14573
UniProt
Q9Y227
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
LALP70LAP70KIAA0392NTPDase-4UDPaseLYSAL1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88p21.3
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegENTPD4pq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr8:23,385,783–23,457,722
Gene span
71,940 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000358689 ★23,429,162–23,457,64713
ENST0000051847123,385,783–23,437,0925
ENST0000035620623,385,783–23,457,72213
ENST0000111476123,406,801–23,457,72213
ENST0000111476223,427,405–23,457,72213
ENST0000110555023,427,421–23,457,72213
ENST0000091238623,429,156–23,457,72212
ENST0000096134623,429,162–23,457,72213
ENST0000113355623,429,162–23,457,72213
ENST0000091238723,430,461–23,457,72213
ENST0000091238823,432,049–23,457,72214
ENST0000091238923,432,359–23,457,66913

顯示 12/24 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ENTPD4 催化核苷酸三磷酸與二磷酸的水解,將高磷酸化核苷酸轉為少一個磷酸基的產物,並釋出磷酸與 H⁺。反應需要 Ca²⁺ 或 Mg²⁺;一項描述指出兩種離子均可支持活性,另一項則記載 Ca²⁺ 的活化效果優於 Mg²⁺,因此來源對兩種離子的相對作用有所不同,不能概括為完全相同。

其底物偏好以嘧啶核苷酸為主。資料指出 UTP 與 TTP 可優先水解,也列出 CTP、UDP、CDP、GTP 與 GDP 為偏好的底物;另一方面,AMP、ADP、ATP 與 UMP 被列為不適用的底物。這些描述顯示 ENTPD4 可作用於多種核苷酸,但並非對所有核苷酸都具有相同活性。

具體反應包括 UTP 水解為 UDP、UDP 水解為 UMP、CTP 水解為 CDP,以及 GTP 水解為 GDP;GDP 也可進一步水解為 GMP。另有 5-methyl-UTP 水解為 5-methyl-UDP 的反應記錄。對核糖核苷酸二磷酸與三磷酸的概括反應,分別是生成相應的一磷酸或二磷酸核苷酸,並伴隨磷酸與 H⁺ 生成。這些反應共同說明 ENTPD4 可調整核苷酸的磷酸化狀態;來源未進一步界定其在特定生理過程中的功能意義。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 23457647 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ENTPD4 ENST00000358689 GRCh38 chr8:23457547-23458647 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTTCTGAGGCTTCATGGTTTCTTCCGTTAACAGTAGCTGAATCCAGGAAGAGGAGGTGACCCAGGCGGGT
GCTGGACCAAGAAGGATTCTGTGTTAAGATGTAGAACTGCCAGTTCTGTCTATGCTTGTTTTACTTGATA
AATGGAATGGAGTAGACGTTTCTAGGGCTCTTGTTTTTAAAAATCTTTTAAAGTGGCTGGATTGCTGGTC
ACTTCCTATCTCTGGGCCACAGTGCATTCACCTGTATACAAGGTGGAAGAAAGGATGGAACCCGGGATTC
CCAAGGTCTCTTCCGGCTCTCAAGTGCAAAGTTCTGTGTCTTCAAAGCAGTTTATTGCTAAGCCAGAGAG
CTAAGAGAGCTTAGCCTTGTACTAAGTGTAGGTCATGGGGTCAATCTCAGGAACACCCTTCGCTTTATTT
CTTCTCATAACCATTGCGTGTGTTGGGGAGGGCTGGGGCAGTCTGCCTCCCCCAACATAGGCACTAACAT
ATGCCATCGACGGGCAAGAATGAAATCCTGGCTCTACCTCTCACGAATCAGGTGGATCTCAAGAGAGACT
GAATAAGTGTGAGCCTCCGTTTCCCCATCTGTGAAACAGGGAGAGTTACCGGCAAAGGTGTAAATGTCAA
GAGTTGAGCAACAATGCCTAGTCCTTACCAGGTTTTCAAGCGCTATTTTCCATAACCGTTAGGAGCGCTA
AGGAAAGATAAACTGCGGTGTCCTAAGTACGCTGAGGCTCGCTGACGACCAGACGAGCACCACGCCACAG
TACTGGGTGCCTCCGTGCTCCCACGTCCACATTTCCCGTGCACAGCACACTGGCGTGGCCGCGCGGGTCC
ACGGAACAGCCCAGCGCTCGGACGCCAATCATCCCGCATCAGGCTCCGCCCCCCAGCGCTCAACGCGCCC
CTCGGCGTGCGCGCTCCCGCCGCCAGCGGGCGCGCTCCGGGCGCAGGCGGTGACGTGTTGCCGGCGGGGG
CCGGGCGGGGGTGCGGCTCCAGGAAAGGAGCGCGGCCTCCAGGAAGCCGGCTGGCCGTGATGCTGCCCAC
TGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGGTCCCCGGCCGGCCAAGCAGGTGAGGTTGC
ENTPD4 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ENTPD4_2 ↗8:23,457,485負股23,457,475–23,457,534
ENTPD4_1 ↗8:23,457,647負股23,457,637–23,457,696

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_B6MN3 · enhancer · 23452283–23453096 · regulatory

ENSR8_B6MND · enhancer · 23454847–23455500 · regulatory

ENSR8_B6MNJ · enhancer · 23455837–23456567 · regulatory

ENSR8_B6MNN · enhancer · 23456822–23457636 · regulatory

ENSR8_57HZ7Z · CTCF_binding_site · 23457588–23457609 · regulatory

ENSR8_8NLR4 · promoter · 23457637–23457837 · regulatory

ENSR8_57HZ8P · CTCF_binding_site · 23457745–23457766 · regulatory

ENSR8_9CBDP · promoter · 23458111–23458611 · regulatory

ENSR8_8NLRM · enhancer · 23458612–23458851 · regulatory

· motif · 23452745–23452754 · motif

· motif · 23452793–23452802 · motif

· motif · 23452806–23452817 · motif

· motif · 23457590–23457606 · motif

· motif · 23457747–23457763 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:616 aa

1 aa616 aa跨膜區拓樸區域
依 Q9Y227 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ENTPD4 蛋白質長 616 個胺基酸,屬於 GDA1/CD39 NTPase 家族。其 N 端第 1–33 位與 C 端第 581–616 位位於細胞質;第 34–54 位及第 560–580 位各形成一段螺旋型穿膜區。兩段穿膜區之間,第 55–559 位為朝向膜腔側的區域。

拓樸區域Cytoplasmic1–33 aa
跨膜區Helical34–54 aa
拓樸區域Lumenal55–559 aa
跨膜區Helical560–580 aa
拓樸區域Cytoplasmic581–616 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6WG5…

PDB · 6WG5

X-ray · 2.60 A · A=58-559

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasmic vesicle, autophagosome membrane;Lysosome membrane;Golgi apparatus membrane

Isoform 1 與細胞質囊泡的自噬體膜及溶酶體膜相關,並以多次穿膜蛋白形式定位於這些膜。 Isoform 2 則定位於 Golgi apparatus 膜,同樣為多次穿膜蛋白。 來源呈現兩種異構型不同的膜定位,未描述定位隨條件改變的動態。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
LALP70ENTPD4PCYOX1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

12 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 12 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ENTPD4 在鈣或鎂離子依賴下催化核苷三磷酸與二磷酸水解,偏好嘧啶核苷酸,尤其可優先水解 UTP 與 TTP。AMP、ADP、ATP 和 UMP 不作為其底物;另有資料指出其活性較受 Ca²⁺ 而非 Mg²⁺ 活化。含實驗來源
證據與來源

Catalyzes the hydrolysis of nucleoside triphosphates and diphosphates in a calcium- or magnesium-dependent manner, with a preference for pyrimidines. Preferentially hydrolyzes UTP and TTP. AMP, ADP, ATP and UMP are not substrates. Preferentially activated by Ca(2+) over Mg(2+)

PMID 10858452 ↗ · PMID 9556635 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能ENTPD4 可水解多種核苷酸二磷酸與三磷酸,但 ADP 和 ATP 例外。其偏好水解的底物包括 CTP、UDP、CDP、GTP 和 GDP;此描述指出 Ca²⁺ 或 Mg²⁺ 均可作為反應所需離子。含實驗來源
證據與來源

Has a broad substrate specificity with the ability of cleaving all nucleotide di- and triphosphates with the exception of adenosine di- and triphosphate (ADP and ATP). Preferentially hydrolyzes CTP, UDP, CDP, GTP and GDP. Can use either Ca(2+) or Mg(2+) equally

PMID 10858452 ↗ · PMID 9556635 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性a ribonucleoside 5'-diphosphate + H2O = a ribonucleoside 5'-phosphate + phosphate + H(+)含實驗來源
證據與來源

a ribonucleoside 5'-diphosphate + H2O = a ribonucleoside 5'-phosphate + phosphate + H(+)

PMID 10858452 ↗ · PMID 9556635 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性a ribonucleoside 5'-triphosphate + H2O = a ribonucleoside 5'-diphosphate + phosphate + H(+)含實驗來源
證據與來源

a ribonucleoside 5'-triphosphate + H2O = a ribonucleoside 5'-diphosphate + phosphate + H(+)

PMID 10858452 ↗ · PMID 9556635 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性UDP + H2O = UMP + phosphate + H(+)含實驗來源
證據與來源

UDP + H2O = UMP + phosphate + H(+)

PMID 10858452 ↗ · PMID 9556635 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性UTP + H2O = UDP + phosphate + H(+)含實驗來源
證據與來源

UTP + H2O = UDP + phosphate + H(+)

PMID 10858452 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性CTP + H2O = CDP + phosphate + H(+)含實驗來源
證據與來源

CTP + H2O = CDP + phosphate + H(+)

PMID 10858452 ↗ · PMID 9556635 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性GDP + H2O = GMP + phosphate + H(+)含實驗來源
證據與來源

GDP + H2O = GMP + phosphate + H(+)

PMID 10858452 ↗ · PMID 9556635 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性GTP + H2O = GDP + phosphate + H(+)含實驗來源
證據與來源

GTP + H2O = GDP + phosphate + H(+)

PMID 10858452 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性5-methyl-UTP + H2O = 5-methyl-UDP + phosphate + H(+)含實驗來源
證據與來源

5-methyl-UTP + H2O = 5-methyl-UDP + phosphate + H(+)

PMID 10858452 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Isoform 1 定位於細胞質囊泡的自噬體膜及溶酶體膜,並標示為多次穿膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Isoform 1; Cytoplasmic vesicle, autophagosome membrane / Multi-pass membrane protein; Lysosome membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 10393803 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Isoform 2 定位於 Golgi apparatus 膜,並標示為多次穿膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Isoform 2; Golgi apparatus membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 9556635 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 12 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000358689 · 5,803 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGGAAAGGAGCGCGGCCTCCAGGAAGCCGGCTGGCCGTGA40
41TGCTGCCCACTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGGTCCCCGGC80
81CGGCCAAGCAGGAGGGCTCTAACTCCGTGAGGACCCCAGC120
121ATTATTTCTATAATTGTTTGTGAGAAGGACTGAATCCCAG160
161AGCATTGCCTTGTTGCTGACCTTTCAGTATGGGGAGGATT200
201GGCATCTCCTGTCTTTTTCCTGCTTCTTGGCATTTTAGCA240
241TATCTCCAGTAGGGTGTCCTCGAATTCTGAATACCAATTT280
281ACGCCAAATTATGGTCATTAGTGTCCTGGCTGCTGCTGTT320
321TCACTTTTATATTTTTCTGTTGTCATAATCCGAAATAAGT360
361ATGGGCGACTAACCAGAGACAAGAAATTTCAAAGGTACCT400
401GGCACGAGTTACCGACATTGAAGCTACAGACACCAATAAC440
441CCCAATGTGAACTATGGGATCGTGGTGGACTGTGGTAGCA480
481GTGGGTCTCGAGTATTTGTTTACTGCTGGCCAAGGCATAA520
521TGGCAATCCACATGATCTGTTGGATATCAGGCAAATGAGG560
561GATAAAAACCGAAAGCCAGTGGTCATGAAGATAAAACCGG600
601GCATTTCAGAATTTGCTACCTCTCCAGAGAAAGTCAGTGA640
641TTACATTTCTCCACTTTTGAACTTTGCTGCAGAGCATGTG680
681CCACGGGCAAAACACAAAGAGACACCTCTCTACATTCTCT720
721GCACGGCTGGAATGAGAATCCTCCCCGAAAGCCAGCAGAA760
761AGCTATTCTGGAAGACCTTCTGACCGATATCCCCGTGCAC800
801TTTGACTTTCTGTTTTCTGACTCTCATGCAGAAGTAATTT840
841CTGGGAAACAAGAAGGTGTGTATGCTTGGATTGGCATTAA880
881TTTTGTCCTTGGACGATTTGAGCATATTGAAGATGATGAT920
921GAGGCCGTTGTGGAAGTTAACATTCCTGGAAGTGAAAGCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。