基因總覽
ENDOU 是一個蛋白質編碼基因，其產物屬於 ENDOU 家族，具有分泌訊號與多個結構區域。蛋白質全長 410 個胺基酸，包含位於 N 端的訊號胜肽、兩個 SMB 結構域，以及涵蓋 C 端大部分序列的 EndoU 結構域。這些特徵勾勒出 ENDOU 蛋白的基本組成；其 RNA 切割方式與調節 mRNA 表現的作用見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000422538 ★ | 47,709,734–47,725,490 | 10 |
| ENST00000229003 | 47,709,734–47,725,567 | 9 |
| ENST00000545824 | 47,709,734–47,725,567 | 8 |
| ENST00001134221 | 47,709,734–47,725,567 | 10 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ENDOU 蛋白是一種核糖核酸內切酶，作用標的是單股 RNA。它在尿苷酸（uridylate）前方切開 RNA，並使切割後產物的 3′ 端形成 2′,3′-環狀磷酸。這種切割反應改變 RNA 分子的末端結構，反應產物包括具有 5′ 端去磷酸化尿苷的 RNA，以及帶有 3′ 端 2′,3′-環狀磷酸核糖核苷酸的 RNA。
切割效率會依切割位點附近的核苷酸組合而異：UU 與 GU 位點比 CU 與 AU 位點更容易被切開。因此，ENDOU 對單股 RNA 的作用並非在各種序列背景下都同樣有效；來源指出的差異限定於這些位點組合，並未提供其他序列或條件的比較。
除 RNA 切割活性外，ENDOU 也會作用於 mRNA，以調節其表現。這項作用將其核酸酶活性連結至 mRNA 調控；現有資料未進一步說明哪些 mRNA 是其標的，也未界定切割與表現調節之間的具體步驟或細胞情境。
Promoter 與基因調控
>ENDOU ENST00000422538 GRCh38 chr12:47725390-47726490 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCACTCCCAACCTCCAGAAAAAAATCACTGATAGAGTGGCCTCCACTGTTCACCAATTTTGCCTTTTTAT ATGATAGTTTTCTTTCCTGAGAGGGTTGAGAATCCCCATGCAGTGCTCTTTCTGGCAAGGGCATCATACT TGGCAGATTTTACCTTTATTATCGGGGAAAACTGGACAGTCACGGGGAGCTGCTCCCCTTCTTTTGGACT TGGAAACAAAAGAACCTCACTGGGGAGGAGTTCCTGAGGAGAGGAGTGTAAGTTGGGGTGAAGGGAGTGA AACCCTGGGCTCCCAGGGGAAGAAGAGTGGGCCTTCGGCTGCCTTTAAGAGGCCTCTTGCCCCTCCCCTG CCTCATAAGGAATCTGAAACGTTTAAACCCCAGAGGCTGACTCAGTAAGAGTCATTTGCATAATATTTTA GAGTGATTTAGCCATGCGCTCGACATGTGGCTGATTTAGCTATGCTGGGCTTGGTGGTCATAAGAATAGC ACTGGTTCTGACCGACACATCCTCTATCTCTCTGTCCAATGACCCCAACCCTTGCTTGGGCACTTACTGT TTGTCAAATTTGGACCAATCACCTTACTGTGTGCCAGTGTCATGCTAAGCTCCAGGAATTTGAAGATGAA TCCAACCTGTGGCCCCTTGGAAAGTCAGGTCTGAGACTTGGAAGTAGGTGTCTGTTTGGTGGGGATCACC CAAAGATCAGCCCATGGGTGTCCCTAATTTGGACAAAGAACCCTCCAAACTGGACCCATCTTGGTGTGCC TGCCTGCATGACCTATTTTTTAAGCTGCAAACAGCTAGCATTACCTGTTCTCAACATCTGGCATTACCTA CCTTCTTAGTCACCTTCCCTCAGGCTTCAAACAGCTGTAGGGCCCCACCTCCTATCCATCTAGGGTCCCT CCCTCCCCTTTTTCTTCCTGAAAGGATCTGGAGACACCAGCTCCACAAGTCCTGGTGTCTTTAAAAGGAT CAGCTTGAGGAATAAGGCTCGTCTGAGAGCTGTGACATTCATCTGACTCTAGTGAAAGTCCAACAGCCAC TCCCTTTTTGGCCTCCAACTGGGCACCATGAGGGCCTGCATCTCCCTGGTA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ENDOU_1 ↗ | 12:47,725,490 | 負股 | 47,725,480–47,725,539 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR12_83DTSN · enhancer · 47721545–47721732 · regulatory
ENSR12_83DTT4 · enhancer · 47722238–47722416 · regulatory
ENSR12_83DTWZ · promoter · 47725480–47725679 · regulatory
ENSR12_9NXGM · enhancer · 47725884–47726307 · regulatory
ENSR12_9NXHL · enhancer · 47729177–47729650 · regulatory
ENSR12_9NXHT · enhancer · 47730083–47730572 · regulatory
· motif · 47721846–47721861 · motif
· motif · 47721847–47721860 · motif
· motif · 47721852–47721864 · motif
· motif · 47721854–47721861 · motif
· motif · 47725756–47725771 · motif
· motif · 47726077–47726090 · motif
· motif · 47726189–47726202 · motif
· motif · 47726189–47726202 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：410 aa
ENDOU 蛋白長 410 個胺基酸，N 端第 1–18 位為訊號胜肽。其後含有 SMB 1（第 20–62 位）與 SMB 2（第 86–130 位）兩個結構域；EndoU 結構域位於第 137–410 位，涵蓋 C 端區域。此蛋白屬於 ENDOU 家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ENDOU 的定位註記為分泌型；資料未提供其他定位或定位變化條件。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
ENDOU 以單體形式存在。現有資料未列出其實體結合夥伴或所屬複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ENDOU 是一種核糖核酸內切酶，會在單股 RNA 的尿苷酸前方切割，產生 3′ 端帶有 2′,3′-環狀磷酸的產物。UU 與 GU 位點的切割效率高於 CU 與 AU 位點；此外，ENDOU 也作用於 mRNA，參與調節其表現。 | 含實驗來源 | 證據與來源Endoribonuclease that cleaves single-stranded RNAs at 5' of uridylates and releases a product with a 2',3'-cyclic phosphate at the 3'-end. The UU and GU sites are more efficiently cleaved than CU and AU sites. Targets mRNAs to regulate their expression PMID 18936097 ↗ · PMID 37803019 ↗ |
| 分子活性 | ribonucleotidyl-uridine-RNA = a 5'-end dephospho-uridine-RNA + a 3'-end 2',3'-cyclophospho-ribonucleotide-RNA | 含實驗來源 | 證據與來源ribonucleotidyl-uridine-RNA = a 5'-end dephospho-uridine-RNA + a 3'-end 2',3'-cyclophospho-ribonucleotide-RNA PMID 18936097 ↗ |
| 交互作用 | Monomer | 推論支持 | |
| 細胞定位 | Secreted | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GTCTGAGAGCTGTGACATTCATCTGACTCTAGTGAAAGTC40CAACAGCCACTCCCTTTTTGGCCTCCAACTGGGCACCATG80AGGGCCTGCATCTCCCTGGTATTGGCCGTGCTGTGTGGCC120TGGCCTGGGCTGGAAAAATAGAATCCTGTGCATCTCGATG160TAATGAGAAATTTAACCGGGACGCTGCCTGCCAGTGTGAC200CGCCGGTGTCTCTGGCATGGGAACTGCTGTGAAGACTATG240AACATCTGTGTACTGAGGACCACAAAGAGTCAGAGCCATT280GCCACAGCTGGAGGAAGAGACAGAAGAGGCCCTCGCCAGC320AACTTGTACTCGGCACCCACCTCCTGCCAGGGCCGCTGCT360ACGAAGCCTTTGACAAGCACCACCAATGTCACTGCAATGC400CCGCTGCCAAGAGTTTGGGAACTGCTGCAAGGATTTTGAG440AGCCTGTGTAGTGACCACGAGGTCTCCCACAGCAGTGATG480CCATAACAAAAGAGGAGATTCAGAGCATCTCTGAGAAGAT520CTACAGGGCAGACACCAACAAAGCCCAGAAGGAAGACATC560GTTCTCAATAGCCAAAACTGCATCTCCCCGTCAGAGACCA600GAAACCAAGTGGATCGCTGCCCAAAGCCACTCTTCACTTA640TGTCAATGAGAAGCTGTTCTCCAAGCCCACCTATGCAGCC680TTCATCAACCTCCTCAACAACTACCAGCGGGCAACAGGCC720ATGGGGAGCACTTCAGTGCCCAGGAGCTGGCCGAGCAGGA760CGCCTTCCTCAGAGAGATCATGAAGACAGCAGTCATGAAG800GAGCTCTACAGCTTCCTCCATCACCAGAATCGCTATGGCT840CAGAGCAAGAGTTTGTCGATGACTTGAAGAACATGTGGTT880TGGGCTCTATTCAAGAGGCAATGAAGAGGGGGACTCGAGT920GGCTTTGAACATGTCTTCTCAGGTGAGGTAAAAAAAGGCA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。