基因總覽
EML4（EMAP like 4）是蛋白質編碼基因，產物屬於 WD repeat EMAP family。其蛋白質長 981 個胺基酸，具有 N 端微管結合區，以及由 13 個 WD repeats 構成的區段；序列另有多段被註記為無序區。這些結構特色構成 EML4 的基本分子特徵，與其微管相關角色相呼應。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000318522 ★ | 42,169,353–42,332,548 | 23 |
| ENST00000402711 | 42,169,330–42,332,548 | 22 |
| ENST00000401738 | 42,169,330–42,332,548 | 24 |
| ENST00000862356 | 42,169,330–42,332,548 | 23 |
| ENST00000862357 | 42,169,330–42,332,548 | 24 |
| ENST00000921467 | 42,169,330–42,332,548 | 22 |
| ENST00000921468 | 42,169,330–42,332,548 | 23 |
| ENST00000921469 | 42,169,330–42,332,548 | 24 |
| ENST00000921470 | 42,169,330–42,332,548 | 23 |
| ENST00000921471 | 42,169,330–42,332,548 | 9 |
| ENST00000921472 | 42,169,330–42,332,548 | 23 |
| ENST00000921473 | 42,169,330–42,332,535 | 22 |
顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
EML4 對微管（MTs）的形成與穩定至關重要。它與微管的關聯不僅是細胞骨架的一部分，也涉及有絲分裂期間的細胞結構組織，使微管能在細胞分裂相關過程中發揮作用。
在有絲分裂時，EML4 是組織有絲分裂紡錘體所需的因子之一，並協助動粒正確連接到微管。紡錘體的組織與動粒—微管連接共同關係到染色體分離所需的分裂架構；來源指出 EML4 對上述組織與連接具有必要性，但未進一步說明其作用的分子步驟或調控方式。
EML4 也促進 NUDC 被招募至有絲分裂紡錘體，並與有絲分裂進程相關。這項作用將 EML4 的微管相關功能連結到紡錘體上的因子配置；來源支持其促進 NUDC 招募及參與有絲分裂進程，但沒有界定 NUDC 招募如何改變分裂的其他結果。
Promoter 與基因調控
>EML4 ENST00000318522 GRCh38 chr2:42168353-42169453 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCTTCTCTCTCTTACTCTAATCTGCACAACTGAGCCCCAGGAGGGACTTGACAAACCATGAGAAAGTCTT TAGAAGTATGGGAAATCGTGTTGGGGAAGGGAGGAAGAATATGAACGCTATGTATATTTACATGTTTTGG TTACATGTCCAGACAACCAATTTGCAAATGAATAAAGTGACGCCTAAATAAATTAGGTGATTTGACACTC TTGAGTCATACGGAGTTGGGCCTAGAACTCAGTGTTACTTCATTTGAAATAACCCTTATTATGGTTCCCT AGCAGGCCATCCTATAGCCTGCCATATATGGTCGTTTTGCACCCCTAGACGACAGAACGCTAGGGAGAGT AAGGAAGGCTGAGTTTTTGCTTCTACTAGGTTCGATGACCTTGGGCAGGTTGTCCTCTCTAAGGCTCTGT GTTTTTCTTCATAAGAAGGGTTAGACAAGATGAACTTTTGGGTCATGTCCAGCACTAAAATTCCTTGCTT CTGATCTGTCCCGGGCCCTGCGGCTGTGGCAGTGGTGGTATCGAGCTAGTCAAGAAGCTTCGCCCCTATT TGTCCCCCACCCTATTGGGGGAGAGGGAGAACCTCTCCCTCTTGGTTGCTTCTTTAGTGTCCTTGTAGGA CCCACGTGGTGGTCATCTCCCGTCACGGGGGTCCAGTCTTGGCTCTGCGGGCTTCCCAGGGGCCACATAG GGAGAGGATCCTTCATGCATCAGAGTATCGCAGGCCAGAGTCTATGCCTTATCCCCACCTGTTTGGAACC AGCTTCCAAACCGTGGTCCCCAGCCTTCAGCAGGCCTACCGCGCAGGCGCAACCACCAGCCTGGCGCGAG GCGGACAAACGCCGAGGCCGAGGCAAGGTGAGAGGGCGGGGCTGGCAAGACCCCGCCTCCGTGGCGTCAC GTGGGAGGCGGAGTCGGAAGTGTGACGGCGTGCGCGGGGCGGGGCTACTGCTGCGCGCGGGCGCGGGGGC GGGGCGGGGCGCGGCGCGGCGCGGCGCTCGCGGCTGCTGCCTGGGAGGGAGGCCGGGCAGGCGGCTGAGC GGCGCGGCTCTCAACGTGACGGGGAAGTGGTTCGGGCGGCCGCGGCTTACT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| EML4_1 ↗ | 2:42,169,353 | 正股 | 42,169,304–42,169,363 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_838GRL · enhancer · 42167632–42167820 · regulatory
ENSR2_BBCXT · promoter · 42168863–42169471 · regulatory
ENSR2_BBCXZ · enhancer · 42169472–42170274 · regulatory
ENSR2_9LPX5 · promoter · 42170275–42170775 · regulatory
ENSR2_C66ZL · enhancer · 42171005–42172118 · regulatory
· motif · 42165166–42165175 · motif
· motif · 42165166–42165175 · motif
· motif · 42168651–42168666 · motif
· motif · 42168651–42168666 · motif
· motif · 42168974–42168990 · motif
· motif · 42168974–42168990 · motif
· motif · 42169162–42169173 · motif
· motif · 42169162–42169173 · motif
· motif · 42169217–42169230 · motif
· motif · 42169258–42169267 · motif
· motif · 42169258–42169267 · motif
· motif · 42169258–42169271 · motif
· motif · 42169316–42169327 · motif
· motif · 42169316–42169327 · motif
· motif · 42169322–42169335 · motif
· motif · 42169427–42169444 · motif
· motif · 42170336–42170349 · motif
· motif · 42171847–42171869 · motif
· motif · 42171847–42171869 · motif
· motif · 42173174–42173189 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：981 aa
EML4 蛋白長 981 個胺基酸，屬於 WD repeat EMAP family。N 端第 1–249 位胺基酸為微管結合區；第 259–864 位包含 13 個 WD repeats。註解另將第 1–20、57–205 及 881–981 位胺基酸列為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
EML4 位於細胞質與細胞骨架相關區域，包括紡錘體、微管組織中心及中體。 其與微管的定位會隨細胞週期改變：間期可定位於微管上，有絲分裂期間對微管的親和力則顯著降低。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Midbody。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
EML4 可形成同源三聚體，其自我結合由 N 端 coiled coil 介導。EML4 透過 WD repeats 與 NUDC 互作；有絲分裂期間也與 alpha- and beta-tubulin 互作。這些資料分別描述其寡聚狀態及與其他蛋白質的互作。
疾病與遺傳關聯
部分非小細胞肺癌患者中曾發現涉及 EML4 的染色體異常，並產生由 EML4 N 端與 ALK C 端構成的融合蛋白。該融合蛋白的形成是否源自 2p 區域的簡單倒位，或涉及更複雜的染色體易位，尚不明確。在異源系統中測試時，EML4-ALK 具有轉化活性，且依賴 ALK 的催化活性；來源提出 EML4 部分可能促進自發二聚化，進而活化 ALK kinase。這些結果不表示 EML4 本身已被證實造成該疾病。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | EML4 對微管（MTs）的形成與穩定至關重要，也有助於組織有絲分裂紡錘體及確保動粒正確連接微管。此外，EML4 促進 NUDC 被招募至有絲分裂紡錘體，並與有絲分裂進程相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Essential for the formation and stability of microtubules (MTs). Required for the organization of the mitotic spindle and for the proper attachment of kinetochores to MTs. Promotes the recruitment of NUDC to the mitotic spindle for mitotic progression PMID 16890222 ↗ · PMID 25789526 ↗ · PMID 31409757 ↗ |
| 交互作用 | EML4 可形成同源三聚體，並透過 N 端 coiled coil 介導自我結合。它透過 WD repeats 與 NUDC 互作；在有絲分裂期間，也與 alpha- and beta-tubulin 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homotrimer; self-association is mediated by the N-terminal coiled coil. Interacts (via WD repeats) with NUDC. Interacts with alpha- and beta-tubulin during mitosis PMID 25740311 ↗ · PMID 25789526 ↗ · PMID 31409757 ↗ |
| 細胞定位 | EML4 位於細胞質、細胞骨架、紡錘體、微管組織中心及中體等區域，也可定位於微管。其微管定位具有細胞週期差異：間期可與微管結合，有絲分裂期間對微管的親和力則顯著降低。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm, cytoskeleton; Cytoplasm; Cytoplasm, cytoskeleton, spindle; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center; Midbody; Localizes to microtubules (MTs) during interphase with a significantly reduced affinity for MTs during mitosis PMID 16890222 ↗ · PMID 31409757 ↗ · PMID 25789526 ↗ |
| 疾病關聯 | 部分非小細胞肺癌患者有涉及 EML4 的染色體異常，可產生 EML4 N 端與 ALK C 端融合蛋白；其形成是否來自 2p 區域簡單倒位或更複雜的易位仍不明。在異源系統中，EML4-ALK 的轉化活性依賴 ALK 催化活性；可能的解釋是 EML4 部分促進自發二聚化並活化 ALK kinase。 | 含實驗來源 | 證據與來源A chromosomal aberration involving EML4 has been identified in a subset of patients with non-small-cell lung carcinoma. This aberration leads to the production of a fusion protein between the N-terminus of EML4 and the C-terminus of ALK. It is unclear whether the fusion protein is caused by a simple inversion within 2p (inv(2)(p21p23)) or whether the chromosome translocation involving 2p is more complex. When tested in a heterologous system, the fusion protein EML4-ALK possesses transforming activity that is dependent on ALK catalytic activity, possibly due to spontaneous dimerization mediated by the EML4 moiety, leading to ALK kinase activation PMID 17625570 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCGGCGCTCGCGGCTGCTGCCTGGGAGGGAGGCCGGGCAG40GCGGCTGAGCGGCGCGGCTCTCAACGTGACGGGGAAGTGG80TTCGGGCGGCCGCGGCTTACTACCCCAGGGCGAACGGACG120GACGACGGAGGCGGGAGCCGGTAGCCGAGCCGGGCGACCT160AGAGAACGAGCGGGTCAGGCTCAGCGTCGGCCACTCTGTC200GGTCCGCTGAATGAAGTGCCCGCCCCTCTAAGCCCGGAGC240CCGGCGCTTTCCCCGCAAGATGGACGGTTTCGCCGGCAGT280CTCGATGATAGTATTTCTGCTGCAAGTACTTCTGATGTTC320AAGATCGCCTGTCAGCTCTTGAGTCACGAGTTCAGCAACA360AGAAGATGAAATCACTGTGCTAAAGGCGGCTTTGGCTGAT400GTTTTGAGGCGTCTTGCAATCTCTGAAGATCATGTGGCCT440CAGTGAAAAAATCAGTCTCAAGTAAAGGCCAACCAAGCCC480TCGAGCAGTTATTCCCATGTCCTGTATAACCAATGGAAGT520GGTGCAAACAGAAAACCAAGTCATACCAGTGCTGTCTCAA560TTGCAGGAAAAGAAACTCTTTCATCTGCTGCTAAAAGTGG600TACAGAAAAAAAGAAAGAAAAACCACAAGGACAGAGAGAA640AAAAAAGAGGAATCTCATTCTAATGATCAAAGTCCACAAA680TTCGAGCATCACCTTCTCCCCAGCCCTCTTCACAACCTCT720CCAAATACACAGACAAACTCCAGAAAGCAAGAATGCTACT760CCCACCAAAAGCATAAAACGACCATCACCAGCTGAAAAGT800CACATAATTCTTGGGAAAATTCAGATGATAGCCGTAATAA840ATTGTCGAAAATACCTTCAACACCCAAATTAATACCAAAA880GTTACCAAAACTGCAGACAAGCATAAAGATGTCATCATCA920ACCAAGAAGGAGAATATATTAAAATGTTTATGCGCGGTCG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。