基因總覽
ELSPBP1(epididymal sperm binding protein 1)是蛋白質編碼基因,產物屬於 seminal plasma protein family。其蛋白質全長為223個胺基酸,序列包含一段訊號肽,以及四個 Fibronectin type-II 結構域。資料將其描述為分泌型蛋白質,並指出它具有 phosphorylcholine 結合活性;此活性標註為依相似性推定。這些基本特徵將 ELSPBP1 歸為具有多個 Fibronectin type-II 結構域的精液蛋白家族成員。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000339841 ★ | 47,994,632–48,025,154 | 7 |
| ENST00000597519 | 47,994,632–48,025,154 | 4 |
| ENST00000596043 | 47,994,705–48,022,243 | 5 |
| ENST00000593782 | 48,015,893–48,025,134 | 4 |
| ENST00000593413 | 48,019,805–48,025,148 | 3 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ELSPBP1 的資料記載其會在射精時與精子結合。這項描述指出了蛋白質與精子接觸的時機,但未進一步說明結合發生的位置、持續時間或具體分子機制,因此不宜據此推定更細緻的作用方式。
ELSPBP1 可能參與精子獲能;來源以「可能」描述此功能,未提供可將其表述為確定作用的細節。現有資訊也未說明 ELSPBP1 對獲能過程的影響方向,或它是否直接調控其中的特定步驟。
此外,ELSPBP1 具有 phosphorylcholine 結合活性,但這項註記是依相似性推定。來源沒有進一步交代該結合活性與精子結合或獲能之間的關係,因此兩者不應被視為已確立的因果鏈。
Promoter 與基因調控
>ELSPBP1 ENST00000339841 GRCh38 chr19:47993632-47994732 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AAAATACAAAAATTTTATTTTTGGGGTGTGCTGGGGTGTGCCAGCAGACCCCAGCAGAGATGGGGTTTCA CCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCGGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCT GGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCACCTCTTTCCTTCTTGTTTGAACATCTTTTACAGATCTT GATTATATTCTACAACATAATGGGTGGTCTCTGGCACACTGCCTTTTTGCTATTATTATTGATACTTTAT GAAGACCAAGTGTGCTAAGACATTGTACATTTGCGGAGCCACCCATTCTCCCCTTTAACATCTTTGTTTC ATGTCACTCTTCACTGCATTGCATGTCATCAGTTTCCCATTCTGCAAGTATTTCTTCAATCAGTTTCCCT TTATTATTAGCCATACGAGATCCAAAAATCCCTTAGCAGGTTAATGTGGACTGGGTGCAGTGGCTCATGC CTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGGTGGGTAGATCACCTGAGGCCAGGAATTTGACACTAGCCTG GCCAACCTGGTGAAACCCTGTCTCTCCTAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGTGTCTGT GGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAAAGGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGTGGTAAGCC AAGATCATACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAAATTCTATCTAAAAAAAAAAAGAAAGAAAG AAAAGAAAAGAAAATAGTAGGGCTTTTTCATTGTTCAGCTGAAACCTCTCCAGCTCCTCATAGCTGAATT TCTGGGAACGTTCCCTCCTCTGTTCATTGATATTCTTGTCCCTGACCCCAGCCCCCGCAAGGCCCCTTCT GTGTACACTTGACTGAATTTTATGGGCCTCGTGGATATGCATGGGCTTATCTCCAGACATCATAAATTAA CCACAGCTGATCTCATCCAGACTGCCTTCTGACAGTAACCACTGATGAAGAACCCTCCTTTGAGAAGCTG CCTTTGTGTCCTACAGACAGGCTGGGGCCAAAGCCATTCAACCAATCCCCA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ELSPBP1_1 ↗ | 19:47,994,687 | 正股 | 47,994,638–47,994,697 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:223 aa
ELSPBP1 蛋白質長223個胺基酸,N端第1至24位為訊號肽。序列中有四個 Fibronectin type-II 結構域,分別位於第25至68、第69至117、第124至170及第177至223位;蛋白質屬於 seminal plasma protein family。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ELSPBP1 被註記為分泌型蛋白質。 此定位資訊描述的是 ELSPBP1 本身,未提供其在不同條件下定位改變或異構型差異的資料。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ELSPBP1 在射精時與精子結合,並可能參與精子獲能;此外,它具有 phosphorylcholine 結合活性,但此活性是依相似性推定,不能視為直接證實。 | 推論支持 | 證據與來源Binds to spermatozoa upon ejaculation and may play a role in sperm capacitation. Has phosphorylcholine-binding activity (By similarity) |
| 細胞定位 | Secreted | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACTGCCTTCTGACAGTAACCACTGATGAAGAACCCTCCTT40TGAGAAGCTGCCTTTGTGTCCTACAGACAGGCTGGGGCCA80AAGCCATTCAACCAATCCCCAGATAATCCAGAGCTCTTGG120GAGCAGAACCTTAAAGAGAGATCGTGGAGAGAGCCAGGGC160CCAGAAGAACTCTCTCAAAGAGAAGAGGGCAGCCAAGATG200ACCCGATGGTCCAGTTACCTGTTGGGATGGACAACCTTCC240TTCTCTATTCCTATGAGTCAAGTGGAGGGATGCATGAGGA280ATGTGTCTTTCCTTTCACCTACAAGGGATCTGTTTACTTC320ACTTGCACCCATATTCATAGCTTATCCCCTTGGTGTGCCA360CCAGAGCCGTGTACAACGGCCAGTGGAAGTACTGCCAGAG400TGAAGATTACCCACGCTGTATCTTCCCTTTCATCTATCGA440GGAAAGGCTTATAACAGCTGCATCTCCCAGGGCAGCTTCT480TAGGCAGTCTGTGGTGCTCAGTCACCTCTGTCTTCGATGA520GAAACAGCAGTGGAAATTCTGTGAAACGAATGAGTATGGG560GGAAATTCTCTCAGGAAGCCCTGCATCTTCCCCTCCATCT600ACAGAAATAATGTGGTCTCTGATTGCATGGAGGATGAAAG640CAACAAGCTCTGGTGCCCAACCACAGAGAACATGGATAAG680GATGGAAAGTGGAGTTTCTGTGCCGACACCAGAATTTCCG720CGTTGGTCCCTGGCTTTCCTTGTCACTTTCCGTTCAACTA760TAAAAACAAGAATTATTTTAACTGCACTAACGAAGGATCA800AAGGAGAACCTTGTGTGGTGTGCAACTTCTTACAACTACG840ACCAAGACCACACCTGGGTGTATTGCTGATGCTGAGGAAA880GGAGAAATATCTTCAGAGGAAGACTGCCGCCATACTGAGG920CTGAGCACAGATTTGTCTTTTTCATTGCATCTGTCAAGCT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。