演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ELSPBP1HE12

epididymal sperm binding protein 1

ELSPBP1(epididymal sperm binding protein 1)屬於 seminal plasma protein family,為分泌型蛋白質;來源指出它在射精時與精子結合,並可能參與精子獲能。

Homo sapiens19q13.33UniProt Q96BH3
OFFICIAL SYMBOL
ELSPBP1
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q96BH3
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ELSPBP1(epididymal sperm binding protein 1)是蛋白質編碼基因,產物屬於 seminal plasma protein family。其蛋白質全長為223個胺基酸,序列包含一段訊號肽,以及四個 Fibronectin type-II 結構域。資料將其描述為分泌型蛋白質,並指出它具有 phosphorylcholine 結合活性;此活性標註為依相似性推定。這些基本特徵將 ELSPBP1 歸為具有多個 Fibronectin type-II 結構域的精液蛋白家族成員。

Official symbol
ELSPBP1
Gene name
epididymal sperm binding protein 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14417
UniProt
Q96BH3
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HE12E12EDDM12

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.33
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ELSPBP1pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:47,994,632–48,025,154
Gene span
30,523 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000339841 ★47,994,632–48,025,1547
ENST0000059751947,994,632–48,025,1544
ENST0000059604347,994,705–48,022,2435
ENST0000059378248,015,893–48,025,1344
ENST0000059341348,019,805–48,025,1483

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ELSPBP1 的資料記載其會在射精時與精子結合。這項描述指出了蛋白質與精子接觸的時機,但未進一步說明結合發生的位置、持續時間或具體分子機制,因此不宜據此推定更細緻的作用方式。

ELSPBP1 可能參與精子獲能;來源以「可能」描述此功能,未提供可將其表述為確定作用的細節。現有資訊也未說明 ELSPBP1 對獲能過程的影響方向,或它是否直接調控其中的特定步驟。

此外,ELSPBP1 具有 phosphorylcholine 結合活性,但這項註記是依相似性推定。來源沒有進一步交代該結合活性與精子結合或獲能之間的關係,因此兩者不應被視為已確立的因果鏈。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 47994632 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ELSPBP1 ENST00000339841 GRCh38 chr19:47993632-47994732 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AAAATACAAAAATTTTATTTTTGGGGTGTGCTGGGGTGTGCCAGCAGACCCCAGCAGAGATGGGGTTTCA
CCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCGGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCT
GGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCACCTCTTTCCTTCTTGTTTGAACATCTTTTACAGATCTT
GATTATATTCTACAACATAATGGGTGGTCTCTGGCACACTGCCTTTTTGCTATTATTATTGATACTTTAT
GAAGACCAAGTGTGCTAAGACATTGTACATTTGCGGAGCCACCCATTCTCCCCTTTAACATCTTTGTTTC
ATGTCACTCTTCACTGCATTGCATGTCATCAGTTTCCCATTCTGCAAGTATTTCTTCAATCAGTTTCCCT
TTATTATTAGCCATACGAGATCCAAAAATCCCTTAGCAGGTTAATGTGGACTGGGTGCAGTGGCTCATGC
CTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGGTGGGTAGATCACCTGAGGCCAGGAATTTGACACTAGCCTG
GCCAACCTGGTGAAACCCTGTCTCTCCTAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGTGTCTGT
GGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAAAGGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGTGGTAAGCC
AAGATCATACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAAATTCTATCTAAAAAAAAAAAGAAAGAAAG
AAAAGAAAAGAAAATAGTAGGGCTTTTTCATTGTTCAGCTGAAACCTCTCCAGCTCCTCATAGCTGAATT
TCTGGGAACGTTCCCTCCTCTGTTCATTGATATTCTTGTCCCTGACCCCAGCCCCCGCAAGGCCCCTTCT
GTGTACACTTGACTGAATTTTATGGGCCTCGTGGATATGCATGGGCTTATCTCCAGACATCATAAATTAA
CCACAGCTGATCTCATCCAGACTGCCTTCTGACAGTAACCACTGATGAAGAACCCTCCTTTGAGAAGCTG
CCTTTGTGTCCTACAGACAGGCTGGGGCCAAAGCCATTCAACCAATCCCCA
ELSPBP1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ELSPBP1_1 ↗19:47,994,687正股47,994,638–47,994,697

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:223 aa

1 aa223 aa結構域訊號胜肽
依 Q96BH3 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ELSPBP1 蛋白質長223個胺基酸,N端第1至24位為訊號肽。序列中有四個 Fibronectin type-II 結構域,分別位於第25至68、第69至117、第124至170及第177至223位;蛋白質屬於 seminal plasma protein family。

訊號胜肽1–24 aa
結構域Fibronectin type-II 125–68 aa
結構域Fibronectin type-II 269–117 aa
結構域Fibronectin type-II 3124–170 aa
結構域Fibronectin type-II 4177–223 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q96BH3…

AlphaFold · Q96BH3

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

ELSPBP1 被註記為分泌型蛋白質。 此定位資訊描述的是 ELSPBP1 本身,未提供其在不同條件下定位改變或異構型差異的資料。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HE12ELSPBP1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ELSPBP1 在射精時與精子結合,並可能參與精子獲能;此外,它具有 phosphorylcholine 結合活性,但此活性是依相似性推定,不能視為直接證實。推論支持
證據與來源

Binds to spermatozoa upon ejaculation and may play a role in sperm capacitation. Has phosphorylcholine-binding activity (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted含實驗來源
證據與來源

Secreted

PMID 11144225 ↗ · PMID 17307309 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000339841 · 1,079 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTGCCTTCTGACAGTAACCACTGATGAAGAACCCTCCTT40
41TGAGAAGCTGCCTTTGTGTCCTACAGACAGGCTGGGGCCA80
81AAGCCATTCAACCAATCCCCAGATAATCCAGAGCTCTTGG120
121GAGCAGAACCTTAAAGAGAGATCGTGGAGAGAGCCAGGGC160
161CCAGAAGAACTCTCTCAAAGAGAAGAGGGCAGCCAAGATG200
201ACCCGATGGTCCAGTTACCTGTTGGGATGGACAACCTTCC240
241TTCTCTATTCCTATGAGTCAAGTGGAGGGATGCATGAGGA280
281ATGTGTCTTTCCTTTCACCTACAAGGGATCTGTTTACTTC320
321ACTTGCACCCATATTCATAGCTTATCCCCTTGGTGTGCCA360
361CCAGAGCCGTGTACAACGGCCAGTGGAAGTACTGCCAGAG400
401TGAAGATTACCCACGCTGTATCTTCCCTTTCATCTATCGA440
441GGAAAGGCTTATAACAGCTGCATCTCCCAGGGCAGCTTCT480
481TAGGCAGTCTGTGGTGCTCAGTCACCTCTGTCTTCGATGA520
521GAAACAGCAGTGGAAATTCTGTGAAACGAATGAGTATGGG560
561GGAAATTCTCTCAGGAAGCCCTGCATCTTCCCCTCCATCT600
601ACAGAAATAATGTGGTCTCTGATTGCATGGAGGATGAAAG640
641CAACAAGCTCTGGTGCCCAACCACAGAGAACATGGATAAG680
681GATGGAAAGTGGAGTTTCTGTGCCGACACCAGAATTTCCG720
721CGTTGGTCCCTGGCTTTCCTTGTCACTTTCCGTTCAACTA760
761TAAAAACAAGAATTATTTTAACTGCACTAACGAAGGATCA800
801AAGGAGAACCTTGTGTGGTGTGCAACTTCTTACAACTACG840
841ACCAAGACCACACCTGGGTGTATTGCTGATGCTGAGGAAA880
881GGAGAAATATCTTCAGAGGAAGACTGCCGCCATACTGAGG920
921CTGAGCACAGATTTGTCTTTTTCATTGCATCTGTCAAGCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。