基因總覽
EID1(EP300 interacting inhibitor of differentiation 1)是人類蛋白質編碼基因,其產物可與 EP300、RB1 等蛋白質互作。現有資料將 EID1 描述為具有轉錄抑制相關作用的蛋白質,並指出它可能參與細胞週期退出與細胞分化所需基因轉錄活化之間的連結。來源未提供其蛋白質家族分類或完整結構特徵;其已知功能與互作細節見下方說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000530028 ★ | 48,878,134–48,880,173 | 1 |
| ENST00000560490 | 48,878,085–48,879,804 | 2 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
EID1 可抑制 MYOD1 的轉錄活化作用,並抑制 EP300 與 CBP 的組蛋白乙醯轉移酶活性。這些作用顯示 EID1 可參與轉錄調控;來源並未進一步說明其抑制作用的分子步驟或對下游基因表現的具體影響。
EID1 可能參與細胞週期退出與細胞分化所需基因轉錄活化之間的連結。這項描述指出其可能涉及細胞由增殖狀態轉向分化相關活動的協調,但來源以「可能」表述,並未提供足以確認其因果關係或完整機制的細節。
此外,EID1 可能是 NR0B2 的候選共抑制因子,並可直接連結至轉錄抑制機制。此角色仍屬候選性描述;資料未指出它在何種特定生物情境中發揮作用,也未詳述與 NR0B2 協同抑制轉錄的方式。
Promoter 與基因調控
>EID1 ENST00000530028 GRCh38 chr15:48877134-48878234 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CAACATCCTATCTTTGTGAGGCAGGATTTTCCACAGTAACAGCAACCAAAATGAGATTACAGAATAGACC GGACATAAGGAACACACCTCGGGTGTCACTGTGTCTCATCACCCCCAGATGGGACCATCTAGTTGCAGGA AAACAAGCTCAGGGCTCCCATTGATTCTACATTATGGTGAGTTGTATAATTCTACATAACTATAATGTAA TAATAATAGAAATAAAGTGCAGAATAAATGAAATGTGCTTGAATCCTGTAAGTATACACAGTCATATAAT TCATATAAGTATATACAACTTAAAACCTGAGGCTTTTAAGTTGAAGGTAAAAACAGGTAAAACATGTTTT TAAAAAACACACAAAATAGTATTTTGCTGTCAATACATAAAGATACATGTAAATGCAAATAAAAAGAATT CAAAGAATACACACCGCATTGCTAATAGTGGAAAGATACCTCCCAGGCGAAAAGAAATGGGACCAAGTAT TTCTTCACTATAACTAAAAAAAAAAAAAGTACAATATATCTGTTGTTTGTGAATTTAACTTTTTAAATGA AAACACTAAAAGGACAAAATGGATTAGTTCTTAATATGCTGATCTGTGGTTATGGATGTTGTCTGGTTTG GAGACGTGGATTTACAAGTCATCAGTACATCGGTAAATTGCCCAGGGGAAGAGGAAGGGGGGGAAGGAGC ATTAAATGTTACGAAGGCCATGTAAGGTTATTTTCCGGTTTGCAGCATTACAAGCAGCAGTAGGGTTAAG TAACACAGAAACTGTTACGCTCTTGCATGCAGGGTCCCTAGATACGAAGTTCGAATCGATGGAAACGTAG CTCAAAAGGCGACGCCAACACCCCGGAGAAAACACTGAGCTACTCCAACCACAGTGGCGCGCCAAGTAGG AGGCGGTACCTGAGGACCACGCCTGCGCGCGGGGTTACGCAAGCGCGCAGCCTTTGCGCACGCGCACGAA CGCACGGCCGCGCAGCATCTGTCTTGCTGGAAGCTTTTTCCTAGAGGTTGAGCGGTTTGCACAATGTCGG AAATGGCTGAGTTGTCCGAGCTGTATGAAGAGAGCAGTGACCTGCAGATGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CRI1_1 ↗ | 15:48,878,168 | 正股 | 48,878,119–48,878,178 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR15_9PDRT · promoter · 48877479–48877979 · regulatory
ENSR15_5FHF28 · CTCF_binding_site · 48878032–48878053 · regulatory
ENSR15_74TL8T · promoter · 48878044–48878146 · regulatory
· motif · 48875475–48875490 · motif
· motif · 48877848–48877863 · motif
· motif · 48877866–48877881 · motif
· motif · 48877895–48877910 · motif
· motif · 48878034–48878050 · motif
· motif · 48878061–48878072 · motif
· motif · 48878061–48878072 · motif
· motif · 48878077–48878086 · motif
· motif · 48878077–48878086 · motif
· motif · 48878079–48878090 · motif
· motif · 48878079–48878090 · motif
· motif · 48878098–48878109 · motif
· motif · 48878098–48878109 · motif
· motif · 48878370–48878380 · motif
· motif · 48880647–48880658 · motif
· motif · 48880770–48880782 · motif
· motif · 48880774–48880796 · motif
· motif · 48880774–48880796 · motif
在分化中的 U-937 白血病細胞中,EID1 表現量下調。此資料描述的是該細胞模型分化期間觀察到的變化,未提供其他細胞或條件下的調控資訊。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:187 aa
EID1 蛋白質長 187 個胺基酸。其第 1–118 位被註記為無序區域;第 54–120 位則與 NR0B2 互作相關。第 178–182 位含有 LXCXE motif,來源指出此基序參與與 RB1 的互作。
蛋白質三維結構
細胞內定位
EID1 位於細胞核與細胞質,並可能在兩者之間穿梭;來源未進一步指出穿梭發生的條件或方向。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- FBXO21O94952 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- NDNQ99608 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NdnP25233 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
EID1 透過自身的 LXCXE motif 與 RB1 的完整 pocket region 互作。資料亦記載 EID1 與 EP300、NR0B2 及 TRIM27 互作;來源未對這些互作逐一提供更詳細的結合條件。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | EID1 與 RB1、EP300 互作,並抑制 MYOD1 的轉錄活化作用;它也抑制 EP300 與 CBP 的組蛋白乙醯轉移酶活性。EID1 可能連結細胞週期退出與細胞分化所需基因的轉錄活化,並可能作為 NR0B2 的候選共抑制因子,直接參與轉錄抑制機制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with RB1 and EP300 and acts as a repressor of MYOD1 transactivation. Inhibits EP300 and CBP histone acetyltransferase activity. May be involved in coupling cell cycle exit to the transcriptional activation of genes required for cellular differentiation. May act as a candidate coinhibitory factor for NR0B2 that can be directly linked to transcription inhibitory mechanisms PMID 11073989 ↗ · PMID 11073990 ↗ |
| 交互作用 | EID1 透過自身的 LXCXE motif 與 RB1 的完整 pocket region 互作;資料亦記載 EID1 與 EP300、NR0B2 及 TRIM27 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts via its LXCXE motif with the entire pocket region of RB1. Interacts with EP300, NR0B2 and TRIM27 PMID 11073989 ↗ · PMID 11073990 ↗ · PMID 11223246 ↗ · PMID 15837424 ↗ |
| 細胞定位 | EID1 位於細胞核與細胞質,且可能在細胞核和細胞質之間穿梭;來源未說明其移動的條件或方向。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | 在分化中的 U-937 白血病細胞內,EID1 的表現量下調;此結果限定於該細胞模型的分化過程。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GTCTTGCTGGAAGCTTTTTCCTAGAGGTTGAGCGGTTTGC40ACAATGTCGGAAATGGCTGAGTTGTCCGAGCTGTATGAAG80AGAGCAGTGACCTGCAGATGGATGTGATGCCTGGCGAGGG120TGACCTTCCGCAGATGGAGGTAGGCAGCGGGAGCCGGGAG160CTATCCCTGCGTCCCTCCCGCAGCGGGGCCCAACAGCTCG200AGGAGGAAGGCCCAATGGAGGAGGAGGAGGCCCAGCCAAT240GGCGGCGCCAGAGGGGAAACGGAGCCTTGCTAACGGGCCC280AACGCTGGGGAGCAGCCAGGCCAGGTGGCGGGCGCAGACT320TCGAGAGCGAGGACGAGGGCGAGGAATTTGATGACTGGGA360GGACGACTACGACTATCCCGAAGAGGAGCAGCTCAGTGGT400GCCGGCTACAGAGTATCAGCCGCTCTTGAAGAAGCCGACA440AGATGTTTCTGAGAACAAGAGAACCAGCCCTGGATGGCGG480GTTTCAGATGCATTATGAGAAGACCCCGTTTGATCAGTTA520GCTTTTATCGAAGAGCTTTTTTCACTGATGGTTGTCAATC560GTCTGACCGAAGAACTCGGCTGTGATGAGATTATTGATAG600AGAGTAGTTAGATGCTGTTAAAAGAGGAGGAAACTACTTG640AGGAGGGACCCAACTTTCCGCTATCTTTTGGGTTCATTCC680AAATAGTTTTGTGCCATTGAAAAACTTGACCTTCAAAAAA720ATTTGTTTTTCAGAATAGAACACAATAGGACAGTGACTGC760ACAGTTGTGAAAAAGGAAGAGAATCATTAAAGAAAAAGAA800AAAAGATTTTAAGACCGTTGAAATCAATTATCAAGAACGT840CCTAAAACACCTATGGCTTTGACTTTGTTATTGATCCAGA880TTATTTTCCTTGCATTGGGGAAAATATCTTTCATATTTGT920TTGCTGTAAAGATGGTTTTGCAAGAATAAGTCATGACCAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。