演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

EID1EID-1

EP300 interacting inhibitor of differentiation 1

EID1 是蛋白質編碼基因,產物可抑制 MYOD1 的轉錄活性,並抑制 EP300 與 CBP 的組蛋白乙醯轉移酶活性。

Homo sapiens15q21.1UniProt Q9Y6B2
OFFICIAL SYMBOL
EID1
CHROMOSOME
15
UNIPROT
Q9Y6B2
PDB / ALPHAFOLD
7SMD
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

EID1(EP300 interacting inhibitor of differentiation 1)是人類蛋白質編碼基因,其產物可與 EP300、RB1 等蛋白質互作。現有資料將 EID1 描述為具有轉錄抑制相關作用的蛋白質,並指出它可能參與細胞週期退出與細胞分化所需基因轉錄活化之間的連結。來源未提供其蛋白質家族分類或完整結構特徵;其已知功能與互作細節見下方說明。

Official symbol
EID1
Gene name
EP300 interacting inhibitor of differentiation 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1191
UniProt
Q9Y6B2
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
EID-1C15orf3CRI1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1515q21.1
chr15 · 101,991,189 bp · GRCh38chr15p13 · 1–4200000 · gvarchr15p12 · 4200001–9700000 · stalkchr15p11.2 · 9700001–17500000 · gvarchr15p11.1 · 17500001–19000000 · acenchr15q11.1 · 19000001–20500000 · acenchr15q11.2 · 20500001–25500000 · gnegchr15q12 · 25500001–27800000 · gpos50chr15q13.1 · 27800001–30000000 · gnegchr15q13.2 · 30000001–30900000 · gpos50chr15q13.3 · 30900001–33400000 · gnegchr15q14 · 33400001–39800000 · gpos75chr15q15.1 · 39800001–42500000 · gnegchr15q15.2 · 42500001–43300000 · gpos25chr15q15.3 · 43300001–44500000 · gnegchr15q21.1 · 44500001–49200000 · gpos75chr15q21.2 · 49200001–52600000 · gnegchr15q21.3 · 52600001–58800000 · gpos75chr15q22.1 · 58800001–59000000 · gnegchr15q22.2 · 59000001–63400000 · gpos25chr15q22.31 · 63400001–66900000 · gnegchr15q22.32 · 66900001–67000000 · gpos25chr15q22.33 · 67000001–67200000 · gnegchr15q23 · 67200001–72400000 · gpos25chr15q24.1 · 72400001–74900000 · gnegchr15q24.2 · 74900001–76300000 · gpos25chr15q24.3 · 76300001–78000000 · gnegchr15q25.1 · 78000001–81400000 · gpos50chr15q25.2 · 81400001–84700000 · gnegchr15q25.3 · 84700001–88500000 · gpos50chr15q26.1 · 88500001–93800000 · gnegchr15q26.2 · 93800001–98000000 · gpos50chr15q26.3 · 98000001–101991189 · gnegEID1pq1 bp101,991,189 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr15:48,878,085–48,880,173
Gene span
2,089 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000530028 ★48,878,134–48,880,1731
ENST0000056049048,878,085–48,879,8042

顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

EID1 可抑制 MYOD1 的轉錄活化作用,並抑制 EP300 與 CBP 的組蛋白乙醯轉移酶活性。這些作用顯示 EID1 可參與轉錄調控;來源並未進一步說明其抑制作用的分子步驟或對下游基因表現的具體影響。

EID1 可能參與細胞週期退出與細胞分化所需基因轉錄活化之間的連結。這項描述指出其可能涉及細胞由增殖狀態轉向分化相關活動的協調,但來源以「可能」表述,並未提供足以確認其因果關係或完整機制的細節。

此外,EID1 可能是 NR0B2 的候選共抑制因子,並可直接連結至轉錄抑制機制。此角色仍屬候選性描述;資料未指出它在何種特定生物情境中發揮作用,也未詳述與 NR0B2 協同抑制轉錄的方式。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 48878134 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>EID1 ENST00000530028 GRCh38 chr15:48877134-48878234 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CAACATCCTATCTTTGTGAGGCAGGATTTTCCACAGTAACAGCAACCAAAATGAGATTACAGAATAGACC
GGACATAAGGAACACACCTCGGGTGTCACTGTGTCTCATCACCCCCAGATGGGACCATCTAGTTGCAGGA
AAACAAGCTCAGGGCTCCCATTGATTCTACATTATGGTGAGTTGTATAATTCTACATAACTATAATGTAA
TAATAATAGAAATAAAGTGCAGAATAAATGAAATGTGCTTGAATCCTGTAAGTATACACAGTCATATAAT
TCATATAAGTATATACAACTTAAAACCTGAGGCTTTTAAGTTGAAGGTAAAAACAGGTAAAACATGTTTT
TAAAAAACACACAAAATAGTATTTTGCTGTCAATACATAAAGATACATGTAAATGCAAATAAAAAGAATT
CAAAGAATACACACCGCATTGCTAATAGTGGAAAGATACCTCCCAGGCGAAAAGAAATGGGACCAAGTAT
TTCTTCACTATAACTAAAAAAAAAAAAAGTACAATATATCTGTTGTTTGTGAATTTAACTTTTTAAATGA
AAACACTAAAAGGACAAAATGGATTAGTTCTTAATATGCTGATCTGTGGTTATGGATGTTGTCTGGTTTG
GAGACGTGGATTTACAAGTCATCAGTACATCGGTAAATTGCCCAGGGGAAGAGGAAGGGGGGGAAGGAGC
ATTAAATGTTACGAAGGCCATGTAAGGTTATTTTCCGGTTTGCAGCATTACAAGCAGCAGTAGGGTTAAG
TAACACAGAAACTGTTACGCTCTTGCATGCAGGGTCCCTAGATACGAAGTTCGAATCGATGGAAACGTAG
CTCAAAAGGCGACGCCAACACCCCGGAGAAAACACTGAGCTACTCCAACCACAGTGGCGCGCCAAGTAGG
AGGCGGTACCTGAGGACCACGCCTGCGCGCGGGGTTACGCAAGCGCGCAGCCTTTGCGCACGCGCACGAA
CGCACGGCCGCGCAGCATCTGTCTTGCTGGAAGCTTTTTCCTAGAGGTTGAGCGGTTTGCACAATGTCGG
AAATGGCTGAGTTGTCCGAGCTGTATGAAGAGAGCAGTGACCTGCAGATGG
EID1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CRI1_1 ↗15:48,878,168正股48,878,119–48,878,178

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR15_9PDRT · promoter · 48877479–48877979 · regulatory

ENSR15_5FHF28 · CTCF_binding_site · 48878032–48878053 · regulatory

ENSR15_74TL8T · promoter · 48878044–48878146 · regulatory

· motif · 48875475–48875490 · motif

· motif · 48877848–48877863 · motif

· motif · 48877866–48877881 · motif

· motif · 48877895–48877910 · motif

· motif · 48878034–48878050 · motif

· motif · 48878061–48878072 · motif

· motif · 48878061–48878072 · motif

· motif · 48878077–48878086 · motif

· motif · 48878077–48878086 · motif

· motif · 48878079–48878090 · motif

· motif · 48878079–48878090 · motif

· motif · 48878098–48878109 · motif

· motif · 48878098–48878109 · motif

· motif · 48878370–48878380 · motif

· motif · 48880647–48880658 · motif

· motif · 48880770–48880782 · motif

· motif · 48880774–48880796 · motif

· motif · 48880774–48880796 · motif

在分化中的 U-937 白血病細胞中,EID1 表現量下調。此資料描述的是該細胞模型分化期間觀察到的變化,未提供其他細胞或條件下的調控資訊。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:187 aa

1 aa187 aa功能區域基序
依 Q9Y6B2 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

EID1 蛋白質長 187 個胺基酸。其第 1–118 位被註記為無序區域;第 54–120 位則與 NR0B2 互作相關。第 178–182 位含有 LXCXE motif,來源指出此基序參與與 RB1 的互作。

功能區域Disordered1–118 aa
功能區域Interaction with NR0B254–120 aa
基序LXCXE motif178–182 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7SMD…

PDB · 7SMD

X-ray · 2.15 A · B=174-187

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus;Cytoplasm

EID1 位於細胞核與細胞質,並可能在兩者之間穿梭;來源未進一步指出穿梭發生的條件或方向。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
EID-1EID1FBXO21NDNNdn
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

EID1 透過自身的 LXCXE motif 與 RB1 的完整 pocket region 互作。資料亦記載 EID1 與 EP300、NR0B2 及 TRIM27 互作;來源未對這些互作逐一提供更詳細的結合條件。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能EID1 與 RB1、EP300 互作,並抑制 MYOD1 的轉錄活化作用;它也抑制 EP300 與 CBP 的組蛋白乙醯轉移酶活性。EID1 可能連結細胞週期退出與細胞分化所需基因的轉錄活化,並可能作為 NR0B2 的候選共抑制因子,直接參與轉錄抑制機制。含實驗來源
證據與來源

Interacts with RB1 and EP300 and acts as a repressor of MYOD1 transactivation. Inhibits EP300 and CBP histone acetyltransferase activity. May be involved in coupling cell cycle exit to the transcriptional activation of genes required for cellular differentiation. May act as a candidate coinhibitory factor for NR0B2 that can be directly linked to transcription inhibitory mechanisms

PMID 11073989 ↗ · PMID 11073990 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用EID1 透過自身的 LXCXE motif 與 RB1 的完整 pocket region 互作;資料亦記載 EID1 與 EP300、NR0B2 及 TRIM27 互作。含實驗來源
證據與來源

Interacts via its LXCXE motif with the entire pocket region of RB1. Interacts with EP300, NR0B2 and TRIM27

PMID 11073989 ↗ · PMID 11073990 ↗ · PMID 11223246 ↗ · PMID 15837424 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位EID1 位於細胞核與細胞質,且可能在細胞核和細胞質之間穿梭;來源未說明其移動的條件或方向。含實驗來源
證據與來源

Nucleus; Cytoplasm; May shuttle between nucleus and cytoplasm

PMID 11223246 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控在分化中的 U-937 白血病細胞內,EID1 的表現量下調;此結果限定於該細胞模型的分化過程。含實驗來源
證據與來源

Down-regulated in differentiating U-937 leukemia cells

PMID 11073989 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000530028 · 2,040 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTCTTGCTGGAAGCTTTTTCCTAGAGGTTGAGCGGTTTGC40
41ACAATGTCGGAAATGGCTGAGTTGTCCGAGCTGTATGAAG80
81AGAGCAGTGACCTGCAGATGGATGTGATGCCTGGCGAGGG120
121TGACCTTCCGCAGATGGAGGTAGGCAGCGGGAGCCGGGAG160
161CTATCCCTGCGTCCCTCCCGCAGCGGGGCCCAACAGCTCG200
201AGGAGGAAGGCCCAATGGAGGAGGAGGAGGCCCAGCCAAT240
241GGCGGCGCCAGAGGGGAAACGGAGCCTTGCTAACGGGCCC280
281AACGCTGGGGAGCAGCCAGGCCAGGTGGCGGGCGCAGACT320
321TCGAGAGCGAGGACGAGGGCGAGGAATTTGATGACTGGGA360
361GGACGACTACGACTATCCCGAAGAGGAGCAGCTCAGTGGT400
401GCCGGCTACAGAGTATCAGCCGCTCTTGAAGAAGCCGACA440
441AGATGTTTCTGAGAACAAGAGAACCAGCCCTGGATGGCGG480
481GTTTCAGATGCATTATGAGAAGACCCCGTTTGATCAGTTA520
521GCTTTTATCGAAGAGCTTTTTTCACTGATGGTTGTCAATC560
561GTCTGACCGAAGAACTCGGCTGTGATGAGATTATTGATAG600
601AGAGTAGTTAGATGCTGTTAAAAGAGGAGGAAACTACTTG640
641AGGAGGGACCCAACTTTCCGCTATCTTTTGGGTTCATTCC680
681AAATAGTTTTGTGCCATTGAAAAACTTGACCTTCAAAAAA720
721ATTTGTTTTTCAGAATAGAACACAATAGGACAGTGACTGC760
761ACAGTTGTGAAAAAGGAAGAGAATCATTAAAGAAAAAGAA800
801AAAAGATTTTAAGACCGTTGAAATCAATTATCAAGAACGT840
841CCTAAAACACCTATGGCTTTGACTTTGTTATTGATCCAGA880
881TTATTTTCCTTGCATTGGGGAAAATATCTTTCATATTTGT920
921TTGCTGTAAAGATGGTTTTGCAAGAATAAGTCATGACCAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。