基因總覽
EHMT2 是蛋白質編碼基因，產物 euchromatic histone lysine methyltransferase 2 屬於組蛋白離胺酸甲基轉移酶家族，並歸入 Suvar3-9 子家族；其家族分類亦屬 class V-like SAM-binding methyltransferase 超家族。此蛋白具有多個 ANK 重複序列，以及 Pre-SET、SET 和 Post-SET 區域。這些特徵構成其蛋白質的主要結構概貌；具體的甲基化標的與相關生物學作用見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000375537 ★ | 31,879,759–31,897,698 | 28 |
| ENST00000375528 | 31,879,758–31,897,222 | 26 |
| ENST00000892695 | 31,879,758–31,897,723 | 28 |
| ENST00000892696 | 31,879,758–31,897,723 | 27 |
| ENST00000892697 | 31,879,758–31,897,723 | 27 |
| ENST00000892698 | 31,879,758–31,897,723 | 28 |
| ENST00000892699 | 31,879,758–31,897,723 | 18 |
| ENST00000892700 | 31,879,758–31,897,723 | 28 |
| ENST00000892701 | 31,879,758–31,897,723 | 28 |
| ENST00000892702 | 31,879,758–31,897,723 | 28 |
| ENST00000892703 | 31,879,758–31,897,723 | 28 |
| ENST00000892704 | 31,879,758–31,897,723 | 27 |
顯示 12/32 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
EHMT2 是組蛋白甲基轉移酶，可在常染色質中單甲基化或雙甲基化組蛋白 H3 的 Lys-9，形成 H3K9me1 與 H3K9me2。H3K9 的甲基化標記可招募 HP1 蛋白至甲基化組蛋白，形成表觀遺傳性轉錄抑制的標記，因而將組蛋白修飾與基因轉錄調控相連。來源也指出，EHMT2 可能透過 E2F6、MGA、MAX 或 DP1 等不同 DNA 結合蛋白被帶至組蛋白 H3；此為可能的定位方式，而非唯一確定途徑。
EHMT2 也能在細胞週期 G1 期單甲基化組蛋白 H3 的 Lys-56。此修飾可促進組蛋白 H3 與 PCNA 的交互作用，並參與 DNA 複製調節。它亦可弱度甲基化 H3 的 Lys-27；來源未進一步說明此修飾的功能後果，因此不宜將其延伸解讀為特定調控作用。
其底物不限於組蛋白。EHMT2 可在組蛋白 H1-4 的 Lys-26 進行單甲基化及雙甲基化，也可使 p53/TP53 的 Lys-373 雙甲基化；另有 CDYL、WIZ、ACIN1、DNMT1、HDAC1、ERCC6、KLF12 及 EHMT2 本身被列為甲基化對象。來源列出這些底物，但未為每一項提供相同程度的功能說明。
EHMT2 也被指出是 DNA 甲基化所需因子，但其組蛋白甲基轉移酶活性並非 DNA 甲基化所必需。這表示兩種活性可彼此獨立，不能將 DNA 甲基化需求直接歸因於組蛋白甲基化作用。整體來看，來源支持 EHMT2 具有多種組蛋白與非組蛋白甲基化作用，並涉及轉錄抑制、DNA 複製調節及 DNA 甲基化；不同作用的具體機制與相互關係則未全部界定。
Promoter 與基因調控
>EHMT2 ENST00000375537 GRCh38 chr6:31897598-31898698 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTTGTCTGGGGTAAATAGGTCATGTCTTCAGGAAAGCTAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTAAGTTTGGATTA AGGTGCAGGGAAAACTACAATTCCCAGAAAGCTCTGGAATAGTTAACCAAAGAGAACTACAGTTCCCAGA AGGCCTTTAATTGGCCTCAGGTGCCCCACCTGCCTGTGTCAAATACTGCGTGTGAAATCATACAGATCTT TTCCAAACTCGACCAAAACGTAATACCTAAAGGGATGGTACCCTAAATACAGCTATCGAGATTGTCTATC TTGGTGTATATCATTTATACTTAAATTGTCCGCTGGGCTATGACCCACGGAGTACCTGACTGTGCTTATG AAGTGTTCGGCAAAAAAGGTTTACTTACTGCAGTGTCACCAGTCAGTAATGACGTTCGGGCCGCTGGGCT TACCTGGATCCCTAGTGCGTGTGAAGGTGTAACACGCCTGATATAAACAGAAGAGACATTTAGCCACAGG TTTTCAGAAGGGCACGCTGCTCCAGGGGACATGAAGCAGCATGCTAGAACCAGCCAAGAATAAAGGTGTC CTCCGCGTCCCTATCGCCCCTTCGTGCTCGTTAGAAAGAGCAAAAAGGCGAGGCCAAAACTGAGGCCAAG CCTTCTATCTGGTAACCCAAAAACTAGAAAGGCAGAAAAGCAACCAGAGGCGGGAAAAGCCCAACCAGGC CAGAGGAAATACAGCCGCTGCCGAGAGCCGAGAAGTTCAGAAGCTCCGCTTGTTACCTAAAACCAGATGG GGACAGAGACGCCACACCTGGGCCCAGGCGTGTCTCGCCCTCGGTCCCTGCAGAACTGAGGCCAGGAATG ACAGGAATTCTCCCTTGCAGCTCCCAGCTTAGGACAGTCACAGCCATCTCCGAGGCCGCTCTCAGGGGAA AATGGCCAAAAAGCATGTAGCGGCTCCTTTAAGGCTCCTCCTCGCCCTCCCTCCCTCGCCCACGTGACCC GGGGCGGCCGCGCGCCGGCTCGGCCCCCAGCGCAAGCGGCGATGGCGGCGGCGGCGGGAGCTGCAGCGGC GGCGGCCGCCGAGGTGCGGAAGGGGAGGGGGAGAGGCGGGTGCATGCCCGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| EHMT2_2 ↗ | 6:31,897,206 | 負股 | 31,897,196–31,897,255 |
| EHMT2_1 ↗ | 6:31,897,697 | 負股 | 31,897,687–31,897,746 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_B8BWR · promoter · 31897192–31897797 · regulatory
ENSR6_C56GG · enhancer · 31897798–31899060 · regulatory
ENSR6_9GMTJ · promoter · 31900509–31901009 · regulatory
ENSR6_59HKX7 · CTCF_binding_site · 31900642–31900663 · regulatory
ENSR6_59HKZP · CTCF_binding_site · 31900963–31900993 · regulatory
ENSR6_9GMTZ · promoter · 31902076–31902576 · regulatory
ENSR6_59HL75 · CTCF_binding_site · 31902140–31902161 · regulatory
· motif · 31892768–31892778 · motif
· motif · 31892826–31892838 · motif
· motif · 31892936–31892949 · motif
· motif · 31897226–31897239 · motif
· motif · 31897250–31897263 · motif
· motif · 31897256–31897269 · motif
· motif · 31897408–31897421 · motif
· motif · 31897465–31897478 · motif
· motif · 31897489–31897502 · motif
· motif · 31897669–31897679 · motif
· motif · 31897721–31897730 · motif
· motif · 31897721–31897730 · motif
· motif · 31897788–31897801 · motif
· motif · 31897788–31897801 · motif
· motif · 31898495–31898510 · motif
· motif · 31898495–31898510 · motif
· motif · 31899098–31899109 · motif
· motif · 31900644–31900660 · motif
· motif · 31900959–31900968 · motif
· motif · 31900959–31900968 · motif
· motif · 31900965–31900981 · motif
· motif · 31900974–31900990 · motif
· motif · 31901664–31901677 · motif
· motif · 31901693–31901706 · motif
· motif · 31901716–31901732 · motif
· motif · 31901768–31901781 · motif
· motif · 31901793–31901806 · motif
· motif · 31901823–31901839 · motif
· motif · 31901823–31901839 · motif
· motif · 31901934–31901945 · motif
· motif · 31901934–31901945 · motif
· motif · 31901952–31901968 · motif
· motif · 31901957–31901968 · motif
· motif · 31901959–31901970 · motif
· motif · 31901959–31901970 · motif
· motif · 31901961–31901972 · motif
· motif · 31901961–31901972 · motif
· motif · 31901967–31901980 · motif
· motif · 31901981–31901994 · motif
· motif · 31902003–31902016 · motif
· motif · 31902043–31902056 · motif
· motif · 31902046–31902059 · motif
· motif · 31902049–31902062 · motif
· motif · 31902142–31902158 · motif
· motif · 31902144–31902157 · motif
· motif · 31902209–31902220 · motif
· motif · 31902211–31902220 · motif
· motif · 31902283–31902294 · motif
· motif · 31902283–31902294 · motif
· motif · 31902285–31902301 · motif
· motif · 31902285–31902301 · motif
· motif · 31902387–31902402 · motif
· motif · 31902401–31902412 · motif
· motif · 31902401–31902412 · motif
· motif · 31902403–31902414 · motif
· motif · 31902403–31902414 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1210 aa
euchromatic histone lysine methyltransferase 2 長 1,210 個胺基酸，含有七個 ANK 重複序列，以及 Pre-SET、SET 和 Post-SET 區域。序列註解另標示組蛋白 H3K9me 結合區，以及兩段與組蛋白 H3 交互作用的區域；N 端及其他數段則註解為無序區。此蛋白屬於 class V-like SAM-binding methyltransferase 超家族的組蛋白離胺酸甲基轉移酶家族，並歸於 Suvar3-9 子家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
EHMT2 位於細胞核及染色體，並與常染色質區域相關；來源指出它不與異染色質相關，未提供定位隨條件或異構型改變的資料。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Chromosome。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 33 個夥伴
- ATF7IPQ6VMQ6-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDC73Q6P1J9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DNMT3BQ9UBC3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- EIF4A3P38919 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EPDR1Q9UM22 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GATA3P23771 · UniProt INTERACTION · 20 experiments
- GFI1Q99684 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- HDAC1Q13547 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- HIC2Q96JB3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KAT2BQ92831 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KDM1AO60341-1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments · 2 筆來源紀錄
- KLF12Q9Y4X4 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- KLF3P57682 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MTA1Q13330 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- MTA2O94776 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- MTA3Q9BTC8 · UniProt INTERACTION · 18 experiments
- MX2P20592 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NAA11Q9BSU3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NKX3-1Q99801-1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PLOD3O60568 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- PRDM5Q9NQX1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRRC2BQ5JSZ5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RD3Q7Z3Z2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- REREQ9P2R6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VEZF1Q14119 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
EHMT2 與 EHMT1/GLP 形成異源二聚體，也與 GFI1B、WIZ、UHRF1、CDYL 及 SMYD5 有交互作用。它與 REST 的交互作用需有 CDYL 存在；與 PRDM9 和 CDYL 的交互作用則僅在 PRDM9 結合熱點 DNA 時發生，此項依據為相似性推定。EHMT2 亦屬於含 TRIM28、HDAC1、HDAC2 的複合體，以及包含 CDYL、REST、WIZ、SETB1、EHMT1 等成員的複合體；在 G0 期則為 E2F6.com-1 複合體的一員。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | EHMT2 可在常染色質中單甲基化及雙甲基化組蛋白 H3 的 Lys-9，形成的 H3K9me 標記可招募 HP1 蛋白並參與表觀遺傳性轉錄抑制。它在 G1 期也能修飾 H3 的 Lys-56，促進 H3 與 PCNA 交互作用並調節 DNA 複製；另可弱度修飾 H3 Lys-27、甲基化組蛋白 H1-4 Lys-26，以及多種非組蛋白。EHMT2 也是 DNA 甲基化所需因子，但此作用不需要其組蛋白甲基轉移酶活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Histone methyltransferase that specifically mono- and dimethylates 'Lys-9' of histone H3 (H3K9me1 and H3K9me2, respectively) in euchromatin. H3K9me represents a specific tag for epigenetic transcriptional repression by recruiting HP1 proteins to methylated histones. Also mediates monomethylation of 'Lys-56' of histone H3 (H3K56me1) in G1 phase, leading to promote interaction between histone H3 and PCNA and regulating DNA replication. Also weakly methylates 'Lys-27' of histone H3 (H3K27me). Also required for DNA methylation, the histone methyltransferase activity is not required for DNA methylation, suggesting that these 2 activities function independently. Probably targeted to histone H3 by different DNA-binding proteins like E2F6, MGA, MAX and/or DP1. Also able to mono- and dimethylate histone H1-4 at 'Lys-26' (H1.4K26me1 and H1.4K26me2, respectively). In addition to the histone methyltransferase activity, also methylates non-histone proteins: mediates dimethylation of 'Lys-373' of p53/TP53. Also methylates CDYL, WIZ, ACIN1, DNMT1, HDAC1, ERCC6, KLF12 and itself PMID 11316813 ↗ · PMID 12004135 ↗ · PMID 18438403 ↗ · PMID 19144645 ↗ · PMID 20084102 ↗ · PMID 20118233 ↗ · PMID 22387026 ↗ |
| 分子活性 | N(6)-methyl-L-lysyl(9)-[histone H3] + S-adenosyl-L-methionine = N(6),N(6)-dimethyl-L-lysyl(9)-[histone H3] + S-adenosyl-L-homocysteine + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源N(6)-methyl-L-lysyl(9)-[histone H3] + S-adenosyl-L-methionine = N(6),N(6)-dimethyl-L-lysyl(9)-[histone H3] + S-adenosyl-L-homocysteine + H(+) PMID 11316813 ↗ · PMID 20084102 ↗ |
| 分子活性 | L-lysyl(9)-[histone H3] + S-adenosyl-L-methionine = N(6)-methyl-L-lysyl(9)-[histone H3] + S-adenosyl-L-homocysteine + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源L-lysyl(9)-[histone H3] + S-adenosyl-L-methionine = N(6)-methyl-L-lysyl(9)-[histone H3] + S-adenosyl-L-homocysteine + H(+) PMID 11316813 ↗ · PMID 20084102 ↗ |
| 分子活性 | L-lysyl(56)-[histone H3] + S-adenosyl-L-methionine = N(6)-methyl-L-lysyl(56)-[histone H3] + S-adenosyl-L-homocysteine + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源L-lysyl(56)-[histone H3] + S-adenosyl-L-methionine = N(6)-methyl-L-lysyl(56)-[histone H3] + S-adenosyl-L-homocysteine + H(+) PMID 22387026 ↗ |
| 分子活性 | N(6)-methyl-L-lysyl(56)-[histone H3] + S-adenosyl-L-methionine = N(6),N(6)-dimethyl-L-lysyl(56)-[histone H3] + S-adenosyl-L-homocysteine + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源N(6)-methyl-L-lysyl(56)-[histone H3] + S-adenosyl-L-methionine = N(6),N(6)-dimethyl-L-lysyl(56)-[histone H3] + S-adenosyl-L-homocysteine + H(+) PMID 22387026 ↗ |
| 交互作用 | EHMT2 與 EHMT1/GLP 形成異源二聚體，並與 GFI1B、WIZ、UHRF1、CDYL、SMYD5 等蛋白有交互作用。它參與多種蛋白複合體，包括 G0 期的 E2F6.com-1 複合體及含 TRIM28、HDAC1、HDAC2 的複合體。EHMT2 與 REST 的交互作用需有 CDYL 存在；與 PRDM9 和 CDYL 的交互作用則僅在 PRDM9 結合熱點 DNA 時發生，後者為相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Heterodimer; heterodimerizes with EHMT1/GLP. Interacts with GFI1B and WIZ. Part of the E2F6.com-1 complex in G0 phase composed of E2F6, MGA, MAX, TFDP1, CBX3, BAT8, EHMT1, RING1, RNF2, MBLR, L3MBTL2 and YAF2. Part of a complex composed of TRIM28, HDAC1, HDAC2 and EHMT2. Interacts with UHRF1. Interacts with CDYL. Interacts with REST only in the presence of CDYL. Part of a complex containing at least CDYL, REST, WIZ, SETB1, EHMT1 and EHMT2. Interacts with PRDM9 and CDYL; interaction only takes place when PRDM9 is bound to hotspot DNA (By similarity). Interacts with SMYD5 (By similarity) PMID 12004135 ↗ · PMID 16688220 ↗ · PMID 16702210 ↗ · PMID 19056828 ↗ · PMID 19061646 ↗ · PMID 21549307 ↗ |
| 細胞定位 | EHMT2 位於細胞核及染色體，並與常染色質區域相關；來源明確指出它不與異染色質相關。這筆資料未提供定位改變的條件或不同異構型之間的定位差異。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Chromosome; Associates with euchromatic regions. Does not associate with heterochromatin PMID 11316813 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CGGCCCCCAGCGCAAGCGGCGATGGCGGCGGCGGCGGGAG40CTGCAGCGGCGGCGGCCGCCGAGGGGGAGGCCCCCGCTGA80GATGGGGGCGCTGCTGCTGGAGAAGGAAACCAGAGGAGCC120ACCGAGAGAGTTCATGGCTCTTTGGGGGACACCCCTCGTA160GTGAAGAAACCCTGCCCAAGGCCACCCCCGACTCCCTGGA200GCCTGCTGGCCCCTCATCTCCAGCCTCTGTCACTGTCACT240GTTGGTGATGAGGGGGCTGACACCCCTGTAGGGGCTACAC280CACTCATTGGGGATGAATCTGAGAATCTTGAGGGAGATGG320GGACCTCCGTGGGGGCCGGATCCTGCTGGGCCATGCCACA360AAGTCATTCCCCTCTTCCCCCAGCAAGGGGGGTTCCTGTC400CTAGCCGGGCCAAGATGTCAATGACAGGGGCGGGAAAATC440ACCTCCATCTGTCCAGAGTTTGGCTATGAGGCTACTGAGT480ATGCCAGGAGCCCAGGGAGCTGCAGCAGCAGGGTCTGAAC520CCCCTCCAGCCACCACGAGCCCAGAGGGACAGCCCAAGGT560CCACCGAGCCCGCAAAACCATGTCCAAACCAGGAAATGGA600CAGCCCCCGGTCCCTGAGAAGCGGCCCCCTGAAATACAGC640ATTTCCGCATGAGTGATGATGTCCACTCACTGGGAAAGGT680GACCTCAGATCTGGCCAAAAGGAGGAAGCTGAACTCAGGA720GGTGGCCTGTCAGAGGAGTTAGGTTCTGCCCGGCGTTCAG760GAGAAGTGACCCTGACGAAAGGGGACCCCGGGTCCCTGGA800GGAGTGGGAGACGGTGGTGGGTGATGACTTCAGTCTCTAC840TATGATTCCTACTCTGTGGATGAGCGCGTGGACTCCGACA880GCAAGTCTGAAGTTGAAGCTCTAACTGAACAACTAAGTGA920AGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGAAGAAGAAGAGGAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。