演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

EDARADDCR

EDAR associated via death domain

EDARADD 編碼 Ectodysplasin-A receptor-associated adapter protein,參與外胚層器官形態發生期間的 EDA 訊號傳遞,並協助活化 NF-kappa-B。

Homo sapiens1q42.3-q43UniProt Q8WWZ3
OFFICIAL SYMBOL
EDARADD
CHROMOSOME
1
UNIPROT
Q8WWZ3
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

EDARADD(EDAR associated via death domain)是蛋白質編碼基因,其產物為 Ectodysplasin-A receptor-associated adapter protein。這是一種接頭蛋白,主要角色是連結受體與 EDA 訊號路徑。蛋白質含有 Death domain,並具有數段被註記為無序的區域;這些結構特徵提供了認識其分子構造的基本線索。

Official symbol
EDARADD
Gene name
EDAR associated via death domain
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14341
UniProt
Q8WWZ3
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CR

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q42.3-q43
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegEDARADDpq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr1:236,348,257–236,502,915
Gene span
154,659 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000334232 ★236,394,286–236,484,9306
ENST00000637660236,348,257–236,486,4056
ENST00000439430236,348,262–236,482,3198
ENST00001145816236,394,286–236,486,4056
ENST00000359362236,395,413–236,486,4056

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

EDARADD 產物是 EDA 訊號路徑中的接頭蛋白。於外胚層器官形態發生期間,它與 EDAR 的 Death domain 互作,將受體連接至 EDA 訊號傳遞路徑。

這項連接作用與 NF-kappa-B 的活化相關。換言之,EDARADD 不只是與受體互作,也在受體訊號傳遞至下游反應的過程中擔任中介;目前提供的功能資料未進一步描述此活化過程的分子細節。

由於其作用發生於外胚層器官形態發生期間,EDARADD 所參與的訊號連結與該發育過程相關。來源支持其作為受體接頭並促進 NF-kappa-B 活化的角色,但未列出特定器官、細胞類型或其他下游效應,因此不宜據此延伸到未載明的發育機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 236394286 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>EDARADD ENST00000334232 GRCh38 chr1:236393286-236394386 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGTGAAGTTATGGAAATATGAAATTTTTCACATGACTCTGAGATTGAGTGTTTGGGTACTATCGGGAAAT
GTTAAAAATGTCCATTTTCTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCT
CACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCCGTGGTGCAATCTCAGCTTACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCA
AGCGATTCTTTTGCCTCAGCTTCCTGAGTGGCTGGGAGTACAGGCATGTGCCACCAATCCAGCTAAGTTT
TTTGTATTTTTAGTAGCGGTGGGGTTTCATCACATTGGCCAGGCTGGCCTCGAACTCCTGACCTCAAATA
ATCCACCTGCCTTGGGCTCCCAAAGTGCTGGGGTTACAGGTGTGAGCCACTGCACCCAGCCCAAAAATGT
CTATTTTCAATAGTGGTTTAAAACACTCTTGGACAGCAAAAGAAATAAAAGTTGAAGGACATTGTGACAG
CAAATTGATTGTATGGGAACTCTGGTGAATGCGAATCATTTTTAAATTACTTTTTTTGTAAAGTGCAAAA
CAACAATAGCACCCATTTGCGTCATACTTTATAGTTCGCAAAGCACATGGGAAAAATAAAGGTAATGATG
GGGATCGTTGCAATTCATAGGAAAGGAGGCACGAGGAAATGAAAATGAAAGGGAGTAATAACTACGTAAC
TAGTCAATCTTCCTTAAAAAAAAAAACCCTTAAAATATACCACCATCTTCTATTTGATATAATGCAGAAT
GGGAATGATAAAAACATGAATTACATTTCAGAGTTTCAAAAAGCAAACCAGCTTTATAGCAATGCTTGAG
GTTGGGCTGCTAACAAGCTCACTCAACTAGTGTTTCCTGACGGCCAACGTCAGAATAATTCCATCTCCAT
GAGAAGTACAGAAAGAACCACAAACCAAACCTCCAAATTGATTCTAAGATAAAATACCCTTAAAAAAAAT
TTCCCTTCCTATCCGAAGGCAGACCAAGAGGAAGTTTATCCTCCCACCTACAAATTCCCCAGAGAGCTTT
CATCTAGAAGGTTTGACTCTGGCCAGACAACCAGCGAGCATCTTCTCGCAA
EDARADD 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
EDARADD_3 ↗1:236,348,259正股236,348,210–236,348,269
EDARADD_2 ↗1:236,394,286正股236,394,237–236,394,296
EDARADD_1 ↗1:236,395,441正股236,395,392–236,395,451

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_95GSBP · enhancer · 236389255–236389618 · regulatory

ENSR1_88XMQ7 · promoter · 236394057–236394296 · regulatory

ENSR1_95GSDD · promoter · 236394923–236395423 · regulatory

ENSR1_CTGCD · enhancer · 236395424–236396594 · regulatory

ENSR1_543L99Z · CTCF_binding_site · 236396000–236396021 · regulatory

· motif · 236394319–236394332 · motif

· motif · 236394319–236394332 · motif

· motif · 236394964–236394971 · motif

· motif · 236395422–236395435 · motif

· motif · 236395424–236395435 · motif

· motif · 236395424–236395435 · motif

· motif · 236395426–236395435 · motif

· motif · 236396002–236396018 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:215 aa

1 aa215 aa結構域功能區域
依 Q8WWZ3 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Ectodysplasin-A receptor-associated adapter protein 長 215 個胺基酸,含有位於第 123–202 位的 Death domain。序列第 1–41 位及第 62–86 位另被註記為無序區域。

結構域Death123–202 aa
功能區域Disordered1–41 aa
功能區域Disordered62–86 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q8WWZ3…

AlphaFold · Q8WWZ3

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

EDARADD 的定位註記為細胞質;資料未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 9 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CREDARADDNTAQ1RNF111SDCBPSHPRHSUMO1SUMO1P1TRAF2TRAF6UBE2I
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 9 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

EDARADD 可與自身形成關聯,並與 EDAR、TRAF1、TRAF2 及 TRAF3 結合。資料未進一步指出這些互作是否組成特定複合體,也未描述各互作的條件。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

EDARADD 變異與兩種外胚層發育不全相關。常染色體顯性 Ectodermal dysplasia 11A(ECTD11A)可見毛髮稀少、牙齒異常或缺失,以及因缺少汗腺而汗液分泌減少。常染色體隱性 Ectodermal dysplasia 11B(ECTD11B)則可見毛髮稀疏或缺失、牙齒異常或缺失,以及因缺少汗腺而無法出汗。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能EDARADD 是接頭蛋白,可與 EDAR 的 Death domain 互作,並在外胚層器官形態發生期間將受體連接至 EDA 訊號路徑;它也介導 NF-kappa-B 的活化。含實驗來源
證據與來源

Adapter protein that interacts with EDAR DEATH domain and couples the receptor to EDA signaling pathway during morphogenesis of ectodermal organs. Mediates the activation of NF-kappa-B

PMID 11882293 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用EDARADD 可與自身形成關聯,並與 EDAR、TRAF1、TRAF2 和 TRAF3 結合。資料庫紀錄
證據與來源

Self-associates and binds EDAR, TRAF1, TRAF2 and TRAF3

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位EDARADD 定位於細胞質。推論支持
證據與來源

Cytoplasm

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯EDARADD 變異與常染色體顯性外胚層發育不全 11A(ECTD11A)相關。此病屬於外胚層發育不全,患者至少兩種外胚層結構發育異常,可有毛髮稀少、牙齒異常或缺失,以及因缺少汗腺而汗液分泌減少。含實驗來源
證據與來源

Ectodermal dysplasia 11A, hypohidrotic/hair/nail type, autosomal dominant ECTD11A A form of ectodermal dysplasia, a heterogeneous group of disorders due to abnormal development of two or more ectodermal structures. It is an autosomal dominant condition characterized by hypotrichosis, abnormal or missing teeth, and hypohidrosis due to the absence of sweat glands. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 614940

PMID 17354266 ↗ · PMID 20979233 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯EDARADD 變異與常染色體隱性外胚層發育不全 11B(ECTD11B)相關。此病因至少兩種外胚層結構發育異常,特徵包括毛髮稀疏或缺失、牙齒異常或缺失,以及因缺少汗腺而無法出汗。含實驗來源
證據與來源

Ectodermal dysplasia 11B, hypohidrotic/hair/tooth type, autosomal recessive ECTD11B A disorder due to abnormal development of two or more ectodermal structures, and characterized by sparse hair (atrichosis or hypotrichosis), abnormal or missing teeth and the inability to sweat due to the absence of sweat glands. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 614941

PMID 11780064 ↗ · PMID 17354266 ↗ · PMID 20222921 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000334232 · 3,088 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGACCAAGAGGAAGTTTATCCTCCCACCTACAAATTCCCC40
41AGAGAGCTTTCATCTAGAAGGTTTGACTCTGGCCAGACAA80
81CCAGCGAGCATCTTCTCGCAATCTGTTGCTTCTTCCATGG120
121CAAACTCCAGAGAATTAAGAAGCCAAACTCAACATCGCCA160
161TGGGCCTCAGGACGACTAAACAGATGGGGAGAGGCACTAA200
201AGCTCCTGGTCACCAAGAGGATCATATGGTAAAGGAACCA240
241GTGGAAGACACAGACCCTAGCACTTTATCCTTTAATATGT280
281CAGACAAATATCCCATTCAAGATACGGAACTCCCTAAAGC320
321TGAAGAATGTGATACAATTACTTTGAACTGCCCACGAAAT360
361TCAGATATGAAAAATCAGGGAGAAGAAAATGGCTTTCCAG400
401ATAGCACTGGAGATCCTCTTCCAGAGATCAGCAAGGACAA440
441CTCCTGCAAAGAAAACTGTACTTGTTCCTCCTGCTTGCTC480
481CGGGCCCCCACCATAAGTGACTTGCTCAATGATCAGGACT520
521TACTAGACGTGATCAGGATAAAGCTGGATCCGTGTCACCC560
561AACGGTGAAAAACTGGAGGAATTTTGCAAGCAAATGGGGG600
601ATGTCCTATGACGAATTGTGCTTCCTGGAGCAGAGGCCAC640
641AGAGCCCCACCTTGGAGTTCTTGCTCCGGAACAGTCAGAG680
681GACGGTGGGCCAGCTGATGGAGCTCTGCAGGCTCTACCAC720
721AGGGCCGACGTGGAGAAGGTTCTGCGCAGGTGGGTGGACG760
761AGGAGTGGCCCAAGCGGGAGCGTGGAGACCCCTCCAGGCA800
801CTTCTAGAGCTCTTCTTCTTCCTTCATTGGCCTCTCCGGA840
841TGTTGAAACAACCACAGGTCAAGAAGGAATGTGAATCTGT880
881TGTTTTATAAGAGTTTAGGACAAGGACGTGGAACAGTGGA920
921CACTGGTTTTCCCCAAAGCTGGCAGTTTTGTGGAGGGGTA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。