演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

DYNLT3TCTEX1L

dynein light chain Tctex-type 3

DYNLT3 編碼 dynein light chain Tctex-type 3,屬於細胞質 dynein 1 複合體的非催化性輔助成分。

Homo sapiensXp11.4UniProt P51808
OFFICIAL SYMBOL
DYNLT3
CHROMOSOME
X
UNIPROT
P51808
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

DYNLT3 是位於 X 染色體的蛋白質編碼基因,產物名稱為 dynein light chain Tctex-type 3,屬於 dynein light chain Tctex-type 家族。此蛋白是細胞質 dynein 1 複合體的非催化性輔助成分之一;該複合體另含催化性重鏈,以及中間鏈、輕中間鏈和輕鏈等非催化性亞基。來源指出,複合體中部分亞基的組成可能有所差異。這些資訊將 DYNLT3 定位為分子馬達複合體中的輔助組成,而非催化性重鏈。

Official symbol
DYNLT3
Gene name
dynein light chain Tctex-type 3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11694
UniProt
P51808
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TCTEX1LTCTE1L

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome XXp11.4
chrX · 156,040,895 bp · GRCh38chrXp22.33 · 1–4400000 · gnegchrXp22.32 · 4400001–6100000 · gpos50chrXp22.31 · 6100001–9600000 · gnegchrXp22.2 · 9600001–17400000 · gpos50chrXp22.13 · 17400001–19200000 · gnegchrXp22.12 · 19200001–21900000 · gpos50chrXp22.11 · 21900001–24900000 · gnegchrXp21.3 · 24900001–29300000 · gpos100chrXp21.2 · 29300001–31500000 · gnegchrXp21.1 · 31500001–37800000 · gpos100chrXp11.4 · 37800001–42500000 · gnegchrXp11.3 · 42500001–47600000 · gpos75chrXp11.23 · 47600001–50100000 · gnegchrXp11.22 · 50100001–54800000 · gpos25chrXp11.21 · 54800001–58100000 · gnegchrXp11.1 · 58100001–61000000 · acenchrXq11.1 · 61000001–63800000 · acenchrXq11.2 · 63800001–65400000 · gnegchrXq12 · 65400001–68500000 · gpos50chrXq13.1 · 68500001–73000000 · gnegchrXq13.2 · 73000001–74700000 · gpos50chrXq13.3 · 74700001–76800000 · gnegchrXq21.1 · 76800001–85400000 · gpos100chrXq21.2 · 85400001–87000000 · gnegchrXq21.31 · 87000001–92700000 · gpos100chrXq21.32 · 92700001–94300000 · gnegchrXq21.33 · 94300001–99100000 · gpos75chrXq22.1 · 99100001–103300000 · gnegchrXq22.2 · 103300001–104500000 · gpos50chrXq22.3 · 104500001–109400000 · gnegchrXq23 · 109400001–117400000 · gpos75chrXq24 · 117400001–121800000 · gnegchrXq25 · 121800001–129500000 · gpos100chrXq26.1 · 129500001–131300000 · gnegchrXq26.2 · 131300001–134500000 · gpos25chrXq26.3 · 134500001–138900000 · gnegchrXq27.1 · 138900001–141200000 · gpos75chrXq27.2 · 141200001–143000000 · gnegchrXq27.3 · 143000001–148000000 · gpos100chrXq28 · 148000001–156040895 · gnegDYNLT3pq1 bp156,040,895 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chrX:37,836,611–37,847,593
Gene span
10,983 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000378578 ★37,838,836–37,847,5715
ENST0000037858137,836,611–37,847,5786
ENST0000113065837,836,611–37,847,5783
ENST0000113242337,838,836–37,847,5785
ENST0000085952837,838,837–37,847,5785
ENST0000085952937,839,294–37,847,5786
ENST0000110216437,840,536–37,847,5445
ENST0000110216537,840,539–37,847,5784
ENST0000110216637,840,539–37,847,5784
ENST0000110216737,840,539–37,847,5785
ENST0000043238937,840,543–37,847,4085

顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

DYNLT3 是細胞質 dynein 1 複合體的非催化性輔助成分之一。此類輔助成分被認為可能協助 dynein 連結運送貨物,並與調節 dynein 功能的 adapter proteins 相連;來源以推測語氣描述這些連結作用,並未將其表述為已完全確立的機制。

細胞質 dynein 1 是沿微管運送囊泡與胞器的分子馬達,運輸方向為細胞內逆向移動。DYNLT3 作為其複合體成分,與這項貨物運輸功能相關。來源另指出,DYNLT3 可能在運輸貨物的一部分中與 BUB3 結合;此項關係同樣保留「可能」的限定。

DYNLT3 也被記載為細胞有效進行有絲分裂所需的成分,但此功能註記標示為 By similarity,因此證據屬於相似性推定。現有資訊支持其與 dynein 貨物連結、細胞內運輸及有絲分裂進程相關,未提供更細節的作用機制或實驗條件。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 37847571 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>DYNLT3 ENST00000378578 GRCh38 chrX:37847471-37848571 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ATAAATCTCTGCTTTTGTTGCTTCATTCTTTCCTTGCTTTGTTTGTGCGTTTTGTCCAATTCTTTGTTCA
AAGAGCCAAGAACCTGGACACCCTACACTGGTAACAGAACTGTAAGAGAACAGGACTGTGTTTCTTTAAG
GCACTACATTTACGGTAATTTGTTACAGTAGCAATAGGAAAGTAATACAGTGGTTAAGAGCTTGGGCTCT
GCTATCAGACTACTTGAGCTCAAGTCCCTTTTCTACACCCTACTGGCTGTATGACCTTGGGCAAATTAAA
TTCTCTATACCTCAGTTTCATCTTGATAAAAGCAGTGATGGAAGAACTAACTCCTCTGACTTATTGTGAG
GTTTTGAGGAAGTGTCTAGGATCATCTGGAAATTAGTAATTTATTTTAAAATTACTAATTTAAAATTACT
ACATTTATTTTAAAATTACTAATTTAAAATTACTACATTTATTTTAAAATGTAGTCATTGTTCTCTTGTT
GAGAAGCATCTACTTTAGGAGCCGTGTATACAGCTTCTCATCAGATCCTTACAACCAGTAGTGAAATAGG
TATGATGGTAAGTTTCCATATGAGAAAACTGAAGCTGTGGGAGGTGAATTTTTCCAAGTAACATAGCTAG
TAAGTGGACAAATCAAAGTGGCTGGTTTACCACGAAATTAACTACATTTATGTGCCACATGATGGTGAAT
GAACAAATACGTGCAAGTAATCACAGCAGTGGGCACTCAACCACTAGTGCGGAGTCTAGACTAACTGCCA
CTAGGTCACCCCATCTGATCCACACTGGCGCCATTCCCAGTTCTTTACATTCATCCCTTGTTTCCAGAAA
GGGCAGAGGAAGCGAGGAAAAAGTGCGTGGCCTGAAGTGACGCCTGGCGTTGCCCGAAGCCCGCCCAGCG
CTGCCAGGTGACGCCACTGCGACACAAAGGCGGGGATTGCGTAGGGAAAGGCCCTAGGCCATAAACGGGG
GTGGGGCCTCCCCGGAGGCCAGTGCGCGGCCGCGGTGCTCTACCGGCGTGTCGCTCCGCCCCAGGGAGAG
CCGGCGCTACCATGGAGGAGTACCATCGCCACTGCGACGAGGTACCGCCCC
DYNLT3 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
DYNLT3_1 ↗X:37,847,571負股37,847,561–37,847,620

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSRX_B9HRK · enhancer · 37846745–37847397 · regulatory

ENSRX_B9HRM · promoter · 37847398–37848061 · regulatory

ENSRX_5BWCMR · CTCF_binding_site · 37847678–37847699 · regulatory

ENSRX_5BWCNH · CTCF_binding_site · 37847833–37847854 · regulatory

· motif · 37847680–37847696 · motif

· motif · 37847688–37847703 · motif

· motif · 37847835–37847851 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:116 aa

DYNLT3 的產物屬於 dynein light chain Tctex-type 家族。來源未提供其胺基酸長度、具體結構域或序列功能區域的描述。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P51808…

AlphaFold · P51808

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus;Cytoplasm, cytoskeleton;Chromosome, centromere, kinetochore

DYNLT3 記錄於細胞核、細胞質細胞骨架,以及染色體的著絲點與動粒。 其與 BUB3 在動粒的共定位具有時期差異,特別出現在有絲分裂前期。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Chromosome, centromere, kinetochore。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 7 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TCTEX1LDYNLT3C2orf15CCL28DYNC1I2DYNLT1NIF3L1PMS1ZC3H14
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

DYNLT3 可自我結合並形成同源二聚體,也與 DYNC1I1、DYNC1I2 及 BUB3 有互作記錄。DYNLT1 與 DYNLT3 競爭和 dynein 中間鏈 DYNC1I1 或 DYNC1I2 的結合。另有核內與 SATB1 形成複合體、並涉及 DNA 基質附著區(MARs)的記載。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能DYNLT3 是細胞質 dynein 1 複合體的非催化性輔助成分,推測參與 dynein 與運輸貨物及調節其功能的 adapter proteins 之間的連結。細胞質 dynein 1 沿微管運送囊泡與胞器,方向為細胞內逆向移動;DYNLT3 可能在運輸貨物中結合 BUB3,並依相似性推定為有效進行有絲分裂所需。推論支持
證據與來源

Acts as one of several non-catalytic accessory components of the cytoplasmic dynein 1 complex that are thought to be involved in linking dynein to cargos and to adapter proteins that regulate dynein function. Cytoplasmic dynein 1 acts as a motor for the intracellular retrograde motility of vesicles and organelles along microtubules. Probably binds BUB3 as part of transport cargo. Required for the efficient progression through mitosis (By similarity)

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交互作用DYNLT3 可自我結合形成同源二聚體,並與 DYNC1I1、DYNC1I2、BUB3 及 SATB1 有互作記錄;DYNLT1 與 DYNLT3 競爭結合 dynein 中間鏈。dynein 1 複合體含重鏈及中間鏈、輕中間鏈和輕鏈,部分亞基組成可變;SATB1 在細胞核中與 DYNLT3 形成涉及 DNA 基質附著區的複合體。含實驗來源
證據與來源

Homodimer. The cytoplasmic dynein 1 complex consists of two catalytic heavy chains (HCs) and a number of non-catalytic subunits presented by intermediate chains (ICs), light intermediate chains (LICs) and light chains (LCs); the composition seems to vary in respect to the IC, LIC and LC composition. The heavy chain homodimer serves as a scaffold for the probable homodimeric assembly of the respective non-catalytic subunits. The ICs and LICs bind directly to the HC dimer and the LCs assemble on the IC dimer. DYNLT1 and DYNLT3 compete for association with dynein IC (DYNC1I1 or DYNC1I2). Self-associates. Interacts with DYNC1I1 and DYNC1I2 (By similarity). Interacts with BUB3. Interacts with SATB1 in nucleus to form complex with matrix attachment regions (MARs) of DNA

PMID 16079286 ↗ · PMID 17289665 ↗

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細胞定位DYNLT3 記錄於細胞核、細胞質細胞骨架,以及染色體的著絲點與動粒;它與 BUB3 在動粒共定位的情形具有時期特異性,來源特別指出此共定位發生於有絲分裂前期。資料庫紀錄
證據與來源

Nucleus; Cytoplasm, cytoskeleton; Chromosome, centromere, kinetochore; Colocalizes with BUB3 at kinetochores specifically during prometaphase

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000378578 · 2,151 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTGCGCGGCCGCGGTGCTCTACCGGCGTGTCGCTCCGCC40
41CCAGGGAGAGCCGGCGCTACCATGGAGGAGTACCATCGCC80
81ACTGCGACGAGGTTGGCTTCAATGCTGAGGAAGCCCACAA120
121TATTGTCAAAGAGTGTGTAGATGGGGTTTTAGGTGGTGAA160
161GATTATAATCACAACAACATCAACCAGTGGACTGCAAGCA200
201TAGTGGAACAATCCTTAACACACCTGGTTAAGTTGGGAAA240
241AGCCTATAAATATATTGTGACCTGTGCAGTGGTCCAGAAG280
281AGCGCATATGGCTTTCACACAGCCAGCTCCTGTTTTTGGG320
321ATACCACATCTGATGGAACCTGTACCGTAAGATGGGAGAA360
361CCGGACCATGAACTGTATTGTCAACGTTTTTGCCATTGCT400
401ATTGTTCTTTAACTGACTAAAAATGTTGGGCTAAAGCCAT440
441TAACTTAAGAATTTGTCAGTGTATCCTTTCCAAAAAGAGT480
481AATAGTTGTTTACTAGTGTGCTAGATGAAAAGCGTGCAAT520
521ATGCTTTAAAGCTATCAACAAAAACTGAATATTATAAGCA560
561AGCAATATCATAGTAATTGGCAGATTAGCTCATATTCTAT600
601ACAGCATCGTTTAAATAGGAAAAATTTAATGCTAGCAAAA640
641AATAAATTTAGAAATATGGCATGACATGAAAATACAATCT680
681TATATTTACACCAGCTTTTCACTAATATTTTGTACCTAAG720
721GTGATGGGGAACTCCATTCAGATAATAAAATTCTCTTTCA760
761GCTAGAGAAGTTAACAGGAATAAATATATGAACAAAAAAG800
801CTGCAAGGATAAATGTGGAGAAAATGATGAGAATTAGCTA840
841ACATTTTTAAGTTTTTTTAAACTTTCTTCCCCTCAGTTGT880
881ACTTAATATTTAGTGGAAAGTAATAATTTTTTTAATTTTC920
921TATCAACTAATAGTATAGTAACAACTATGATTAACTTGTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。