基因總覽
DYNLT2 是一個蛋白質編碼基因,其產物名稱為 dynein light chain Tctex-type 2,屬於 dynein light chain Tctex-type 家族。此蛋白質為 dynein 的組成部分;dynein 是一類沿微管移動的馬達蛋白。來源資料指出,DYNLT2 也屬於纖毛外 dynein 臂的組成成員,但其具體分子作用與生物學意義,需依功能與互作資料分別理解。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000366774 ★ | 169,740,109–169,751,572 | 4 |
| ENST00000940845 | 169,740,106–169,751,576 | 2 |
| ENST00001133711 | 169,740,106–169,751,576 | 4 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
DYNLT2 是 dynein 的組成成分。Dynein 為沿微管移動的馬達蛋白家族,DYNLT2 因而與這類馬達蛋白相關。來源列出兩篇研究作為其 dynein 組成角色的支持,但未進一步說明 DYNLT2 如何影響馬達的運動或調節其活性。
依相似性推定,DYNLT2 對纖毛的結構與功能完整性具有必要性。這項資料支持其與纖毛維持有關,但沒有提供特定實驗條件、作用機制或細胞層級的詳細結果,因此不能據此擴大推論其影響的纖毛活動項目。
來源亦將 DYNLT2 列為可能涉及雄性不育的候選因子;這是依相似性提出的候選關聯,並非已確認的因果關係。資料未說明該關聯所依據的物種或具體生殖過程,也未指出 DYNLT2 對生育能力的作用方式。
Promoter 與基因調控
>DYNLT2 ENST00000366774 GRCh38 chr6:169751472-169752572 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCCCTGGTTTTCGAACAATCCCAGCAGGCCCTAACAATTAAGTCATCACTAAAGAAATCTACATCAACTA TTTGTTGATTGGCGATTGTCACTCGCATCCTCCATGTGGCTCTATGGGGCTGGAACTCTGCAGACTACAC TGGGCCGGTGCTTTGGAGCTGGACTTAAATTTGAATCATTCCTCAGCCTCTGACTACCTCTTGCCTTGGA AAAGTTACTTTATCGGAATCTCAGTTCTAAGTGAAATAAAACGGTGCCAGGCTGCACCTGGTAGGGCTAC AGTAATCAGATAACACATGAAAAGCATCTAGCACATAGTACTCAAAAATGGTAGTTATCGTTATCATCAT TTTGGAGACGGGGTCTCGCCGTCGCCCAGACAGGGGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAGCCTCC ACCTCCTGGGCTAAAGCGATCCTTCCACCTCAGCCTACGGAGTAGATGGGACCACAGGCCCCACCACGCC CGGCGATGAACACAAATTTACTGTCCGAGTGTGGACCCTACAGGCAGCGACTAGGAAACTGCGCTTCTAG GAACGAGCCACGGTCAGGTGAGAGCCCGACCTGCGGCTTTCCGCCCCCGCGCCACCGCGCACAGCCCTCC CTGACCGTCCGCCGCGTTCCAGCTCAGGGCCAGGAGGCGACGGAGAAACCGAGCCTGGCCCAGGGAGGCC GGCAGGGCCCGCCAGGCGTCTTGCAGGGCCGAGCGTCCGATACCGCCACAGAGGCCAGGGCCGCGACGTC GCCAGCGCCCTCCAGCGCGGGACCGCCGGCCACCGCAGGCGCGTGCTCGCTCGCCCACTCCGCGTAGCCG AGCACCACCCAGCCTGGCGCCGACTCCCTGCCTAGCTCGGGATCGAACCGGGCCCTACACCCGCCCTACC TCCATAACTTCCGGTGCCCCGCTGCGGCGCGCGTGAATGACGCAGGCGCCTGCGCGCCCCTCCTCCAGGC GCTTTGGAGCCCTGGCGGGCACTTCCTACCGTACGAGGCGCAGGTGGGAGACTTCCGCCCTCGCGGGACT GGCTAGGGCGTTTGACCGCCGGCGGTGAAGGGGAGGCGGTGGGCGTCTTGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TCTE3_1 ↗ | 6:169,751,572 | 負股 | 169,751,562–169,751,621 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_86ZQCX · promoter · 169751562–169751807 · regulatory
ENSR6_53GX2XW · CTCF_binding_site · 169751781–169751802 · regulatory
ENSR6_B38NL3 · enhancer · 169751808–169752728 · regulatory
· motif · 169751425–169751440 · motif
· motif · 169751430–169751442 · motif
· motif · 169751526–169751539 · motif
· motif · 169751532–169751543 · motif
· motif · 169751545–169751554 · motif
· motif · 169751607–169751618 · motif
· motif · 169751607–169751618 · motif
· motif · 169751613–169751624 · motif
· motif · 169751613–169751624 · motif
· motif · 169751646–169751657 · motif
· motif · 169751648–169751657 · motif
· motif · 169751740–169751753 · motif
· motif · 169751754–169751765 · motif
· motif · 169751754–169751765 · motif
· motif · 169751760–169751771 · motif
· motif · 169751783–169751799 · motif
· motif · 169751960–169751973 · motif
· motif · 169752087–169752104 · motif
· motif · 169752089–169752104 · motif
· motif · 169752573–169752593 · motif
· motif · 169752712–169752732 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:198 aa
dynein light chain Tctex-type 2 長 198 個胺基酸,屬於 dynein light chain Tctex-type 家族。序列註解指出,第 1 至第 34 個胺基酸區段為無序區;來源未提供其他結構域或功能區域註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
DYNLT2 記錄於細胞質、細胞骨架、細胞質顆粒及周邊膜位置,也見於精子尾部表面。 精子形成期間,該蛋白質儲存於細胞質顆粒中;來源未進一步描述其位置變化的時間或條件。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Cytoplasmic granule;Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- DCDC2Q9UHG0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
依相似性資料,DYNLT2 是纖毛外 dynein 臂(ODA)的組成成員;該複合體至少包含 dynein 軸絲重鏈、輕鏈與中間鏈。ODA 與 DNAAF9 的互作會使 dynein 失活。另有資料指出 DYNLT2 與 CCDC159、CSNK2B 互作,但未說明這兩項互作的具體作用。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | DYNLT2 是 dynein 的組成成分;dynein 為沿微管移動所必需的一類馬達蛋白。依相似性推定,DYNLT2 對纖毛的結構與功能完整性具有必要性;它也被列為可能涉及雄性不育的候選因子,該關聯尚非確立的因果結論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of dynein, a family of motor proteins essential for movement along microtubules. Required for structural and functional integrity of cilia (By similarity). Candidate for involvement in male sterility (By similarity) PMID 11278908 ↗ · PMID 12584439 ↗ |
| 交互作用 | 依相似性資料,DYNLT2 是纖毛外 dynein 臂(ODA)的組成部分;ODA 至少包含 dynein 軸絲重鏈、輕鏈及中間鏈。ODA 與 DNAAF9 的互作會使 dynein 失活。資料另指出 DYNLT2 與 CCDC159 及 CSNK2B 互作。 | 推論支持 | 證據與來源Part of the ciliary outer dynein arms (ODAs), at least consisting of dynein axonemal heavy chains, light chains and intermediate chains (By similarity). The ODAs interacts with DNAAF9; this interaction inactivates the dyneins (By similarity). Interacts with CCDC159 (By similarity). Interacts with CSNK2B (By similarity) |
| 細胞定位 | DYNLT2 記錄於細胞質、細胞骨架、細胞質顆粒與周邊膜位置,也位於精子尾部表面。精子形成期間,該蛋白質儲存於細胞質顆粒中;來源未提供更細的定位變化條件。 | 推論支持 | 證據與來源Cytoplasm, cytoskeleton; Cytoplasmic granule; Membrane / Peripheral membrane protein; Found on the surface of sperm tail. Stored in cytoplasmic granules during spermatogenesis |
核酸與蛋白質序列
ACTTCCTACCGTACGAGGCGCAGGTGGGAGACTTCCGCCC40TCGCGGGACTGGCTAGGGCGTTTGACCGCCGGCGGTGAAG80GGGAGGCGGTGGGCGTCTTGGAGAACAGAGCGAGATGGAG120AAGCGAGGCCGAGGCGTGAAGTCGAGCCCCATCCAGACCC160CGAACCAGACCCCTCAGCAGGCTCCGGTGACGCCTAGGAA200AGAAAGGAGGCCTAGCATGTTCGAGAAGGAGGCATATACA240CAGATTTTAAGAGAAAGACTGAGAGAGTCAATTCACAATG280TTCAGTATGTGGAGCCTCCTTTTGATGACTCAATTGCTGA320TATAGGTAAAGAATGGAAGAGTGCCCTGGCAAAATTAAAG360TTTGCTAATTCATATAGAATGGAGCCATTGAAGAAATTCC400AAGCTCATTCAGTAGAAACTAAAGTCCAGCAGATACTAAC440AGAAAGTCTTAAAGATGTCAAATATGATGATAAAGTATTC480TCTCACTTGTCACTTGAATTGGCAGACCGCATACTGTTAG520CAGTCAAAGAATTTGGGTACCACCGTTATAAGTTCATTAT560AAAAGTATTATTTATTCAAAAGACTGGCCAAGCAATAAAT600ATTGCCAGCAGATGGATCTGGGACATTGCATGGGACAGCT640GGGTCGCAGCTAAACACGAAGCAGAATCCTACGTGGCACT680GGTCTTGGTGTTTGCCCTTTATTATGAATAGCTCATTACA720GGTACTAAGGATTGTTTACTTCCGAACTTTTCAAAAATAA760ATGAAATTTACATATTTGTAAACCTCA787cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。