演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

DYNLT2TCTEX1D3

dynein light chain Tctex-type 2

DYNLT2 編碼 dynein light chain Tctex-type 2,屬於 dynein 輕鏈家族,並參與纖毛外 dynein 臂的組成。

Homo sapiens6q27UniProt Q8IZS6
OFFICIAL SYMBOL
DYNLT2
CHROMOSOME
6
UNIPROT
Q8IZS6
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

DYNLT2 是一個蛋白質編碼基因,其產物名稱為 dynein light chain Tctex-type 2,屬於 dynein light chain Tctex-type 家族。此蛋白質為 dynein 的組成部分;dynein 是一類沿微管移動的馬達蛋白。來源資料指出,DYNLT2 也屬於纖毛外 dynein 臂的組成成員,但其具體分子作用與生物學意義,需依功能與互作資料分別理解。

Official symbol
DYNLT2
Gene name
dynein light chain Tctex-type 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11695
UniProt
Q8IZS6
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TCTEX1D3TCTEX2Tctex4oda12TCTE3

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66q27
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegDYNLT2pq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr6:169,740,106–169,751,587
Gene span
11,482 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000366774 ★169,740,109–169,751,5724
ENST00000940845169,740,106–169,751,5762
ENST00001133711169,740,106–169,751,5764

顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

DYNLT2 是 dynein 的組成成分。Dynein 為沿微管移動的馬達蛋白家族,DYNLT2 因而與這類馬達蛋白相關。來源列出兩篇研究作為其 dynein 組成角色的支持,但未進一步說明 DYNLT2 如何影響馬達的運動或調節其活性。

依相似性推定,DYNLT2 對纖毛的結構與功能完整性具有必要性。這項資料支持其與纖毛維持有關,但沒有提供特定實驗條件、作用機制或細胞層級的詳細結果,因此不能據此擴大推論其影響的纖毛活動項目。

來源亦將 DYNLT2 列為可能涉及雄性不育的候選因子;這是依相似性提出的候選關聯,並非已確認的因果關係。資料未說明該關聯所依據的物種或具體生殖過程,也未指出 DYNLT2 對生育能力的作用方式。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 169751572 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>DYNLT2 ENST00000366774 GRCh38 chr6:169751472-169752572 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCCCTGGTTTTCGAACAATCCCAGCAGGCCCTAACAATTAAGTCATCACTAAAGAAATCTACATCAACTA
TTTGTTGATTGGCGATTGTCACTCGCATCCTCCATGTGGCTCTATGGGGCTGGAACTCTGCAGACTACAC
TGGGCCGGTGCTTTGGAGCTGGACTTAAATTTGAATCATTCCTCAGCCTCTGACTACCTCTTGCCTTGGA
AAAGTTACTTTATCGGAATCTCAGTTCTAAGTGAAATAAAACGGTGCCAGGCTGCACCTGGTAGGGCTAC
AGTAATCAGATAACACATGAAAAGCATCTAGCACATAGTACTCAAAAATGGTAGTTATCGTTATCATCAT
TTTGGAGACGGGGTCTCGCCGTCGCCCAGACAGGGGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAGCCTCC
ACCTCCTGGGCTAAAGCGATCCTTCCACCTCAGCCTACGGAGTAGATGGGACCACAGGCCCCACCACGCC
CGGCGATGAACACAAATTTACTGTCCGAGTGTGGACCCTACAGGCAGCGACTAGGAAACTGCGCTTCTAG
GAACGAGCCACGGTCAGGTGAGAGCCCGACCTGCGGCTTTCCGCCCCCGCGCCACCGCGCACAGCCCTCC
CTGACCGTCCGCCGCGTTCCAGCTCAGGGCCAGGAGGCGACGGAGAAACCGAGCCTGGCCCAGGGAGGCC
GGCAGGGCCCGCCAGGCGTCTTGCAGGGCCGAGCGTCCGATACCGCCACAGAGGCCAGGGCCGCGACGTC
GCCAGCGCCCTCCAGCGCGGGACCGCCGGCCACCGCAGGCGCGTGCTCGCTCGCCCACTCCGCGTAGCCG
AGCACCACCCAGCCTGGCGCCGACTCCCTGCCTAGCTCGGGATCGAACCGGGCCCTACACCCGCCCTACC
TCCATAACTTCCGGTGCCCCGCTGCGGCGCGCGTGAATGACGCAGGCGCCTGCGCGCCCCTCCTCCAGGC
GCTTTGGAGCCCTGGCGGGCACTTCCTACCGTACGAGGCGCAGGTGGGAGACTTCCGCCCTCGCGGGACT
GGCTAGGGCGTTTGACCGCCGGCGGTGAAGGGGAGGCGGTGGGCGTCTTGG
DYNLT2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TCTE3_1 ↗6:169,751,572負股169,751,562–169,751,621

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR6_86ZQCX · promoter · 169751562–169751807 · regulatory

ENSR6_53GX2XW · CTCF_binding_site · 169751781–169751802 · regulatory

ENSR6_B38NL3 · enhancer · 169751808–169752728 · regulatory

· motif · 169751425–169751440 · motif

· motif · 169751430–169751442 · motif

· motif · 169751526–169751539 · motif

· motif · 169751532–169751543 · motif

· motif · 169751545–169751554 · motif

· motif · 169751607–169751618 · motif

· motif · 169751607–169751618 · motif

· motif · 169751613–169751624 · motif

· motif · 169751613–169751624 · motif

· motif · 169751646–169751657 · motif

· motif · 169751648–169751657 · motif

· motif · 169751740–169751753 · motif

· motif · 169751754–169751765 · motif

· motif · 169751754–169751765 · motif

· motif · 169751760–169751771 · motif

· motif · 169751783–169751799 · motif

· motif · 169751960–169751973 · motif

· motif · 169752087–169752104 · motif

· motif · 169752089–169752104 · motif

· motif · 169752573–169752593 · motif

· motif · 169752712–169752732 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:198 aa

1 aa198 aa功能區域
依 Q8IZS6 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

dynein light chain Tctex-type 2 長 198 個胺基酸,屬於 dynein light chain Tctex-type 家族。序列註解指出,第 1 至第 34 個胺基酸區段為無序區;來源未提供其他結構域或功能區域註解。

功能區域Disordered1–34 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q8IZS6…

AlphaFold · Q8IZS6

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytoskeleton;Cytoplasmic granule;Membrane

DYNLT2 記錄於細胞質、細胞骨架、細胞質顆粒及周邊膜位置,也見於精子尾部表面。 精子形成期間,該蛋白質儲存於細胞質顆粒中;來源未進一步描述其位置變化的時間或條件。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Cytoplasmic granule;Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TCTEX1D3DYNLT2DCDC2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

依相似性資料,DYNLT2 是纖毛外 dynein 臂(ODA)的組成成員;該複合體至少包含 dynein 軸絲重鏈、輕鏈與中間鏈。ODA 與 DNAAF9 的互作會使 dynein 失活。另有資料指出 DYNLT2 與 CCDC159、CSNK2B 互作,但未說明這兩項互作的具體作用。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能DYNLT2 是 dynein 的組成成分;dynein 為沿微管移動所必需的一類馬達蛋白。依相似性推定,DYNLT2 對纖毛的結構與功能完整性具有必要性;它也被列為可能涉及雄性不育的候選因子,該關聯尚非確立的因果結論。含實驗來源
證據與來源

Component of dynein, a family of motor proteins essential for movement along microtubules. Required for structural and functional integrity of cilia (By similarity). Candidate for involvement in male sterility (By similarity)

PMID 11278908 ↗ · PMID 12584439 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用依相似性資料,DYNLT2 是纖毛外 dynein 臂(ODA)的組成部分;ODA 至少包含 dynein 軸絲重鏈、輕鏈及中間鏈。ODA 與 DNAAF9 的互作會使 dynein 失活。資料另指出 DYNLT2 與 CCDC159 及 CSNK2B 互作。推論支持
證據與來源

Part of the ciliary outer dynein arms (ODAs), at least consisting of dynein axonemal heavy chains, light chains and intermediate chains (By similarity). The ODAs interacts with DNAAF9; this interaction inactivates the dyneins (By similarity). Interacts with CCDC159 (By similarity). Interacts with CSNK2B (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位DYNLT2 記錄於細胞質、細胞骨架、細胞質顆粒與周邊膜位置,也位於精子尾部表面。精子形成期間,該蛋白質儲存於細胞質顆粒中;來源未提供更細的定位變化條件。推論支持
證據與來源

Cytoplasm, cytoskeleton; Cytoplasmic granule; Membrane / Peripheral membrane protein; Found on the surface of sperm tail. Stored in cytoplasmic granules during spermatogenesis

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000366774 · 787 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTTCCTACCGTACGAGGCGCAGGTGGGAGACTTCCGCCC40
41TCGCGGGACTGGCTAGGGCGTTTGACCGCCGGCGGTGAAG80
81GGGAGGCGGTGGGCGTCTTGGAGAACAGAGCGAGATGGAG120
121AAGCGAGGCCGAGGCGTGAAGTCGAGCCCCATCCAGACCC160
161CGAACCAGACCCCTCAGCAGGCTCCGGTGACGCCTAGGAA200
201AGAAAGGAGGCCTAGCATGTTCGAGAAGGAGGCATATACA240
241CAGATTTTAAGAGAAAGACTGAGAGAGTCAATTCACAATG280
281TTCAGTATGTGGAGCCTCCTTTTGATGACTCAATTGCTGA320
321TATAGGTAAAGAATGGAAGAGTGCCCTGGCAAAATTAAAG360
361TTTGCTAATTCATATAGAATGGAGCCATTGAAGAAATTCC400
401AAGCTCATTCAGTAGAAACTAAAGTCCAGCAGATACTAAC440
441AGAAAGTCTTAAAGATGTCAAATATGATGATAAAGTATTC480
481TCTCACTTGTCACTTGAATTGGCAGACCGCATACTGTTAG520
521CAGTCAAAGAATTTGGGTACCACCGTTATAAGTTCATTAT560
561AAAAGTATTATTTATTCAAAAGACTGGCCAAGCAATAAAT600
601ATTGCCAGCAGATGGATCTGGGACATTGCATGGGACAGCT640
641GGGTCGCAGCTAAACACGAAGCAGAATCCTACGTGGCACT680
681GGTCTTGGTGTTTGCCCTTTATTATGAATAGCTCATTACA720
721GGTACTAAGGATTGTTTACTTCCGAACTTTTCAAAAATAA760
761ATGAAATTTACATATTTGTAAACCTCA787

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。