基因總覽
DRC5(dynein regulatory complex subunit 5)是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於 DRC5 family。現有資料將它列為 nexin-dynein regulatory complex(N-DRC)的組成部分,並指出它與纖毛及鞭毛運動的調控有關。蛋白質序列註解包括多個 LRR 重複區,以及兩段預測為無序的區域。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000371505 ★ | 44,278,734–44,297,698 | 5 |
| ENST00000371504 | 44,278,718–44,286,353 | 2 |
| ENST00000897136 | 44,278,718–44,297,688 | 5 |
| ENST00001138420 | 44,278,718–44,297,725 | 5 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
DRC5 是 nexin-dynein regulatory complex(N-DRC)的組成部分。N-DRC 是纖毛與鞭毛運動的重要調節者,與運動型軸絲的微管滑動調控有關;資料也指出,這個複合體可維持遠端軸絲的排列與完整性。這些資訊說明 DRC5 位於參與軸絲運動調節的複合體中,但來源未進一步描述 DRC5 單獨作用的分子機制。
資料指出,DRC5 可能參與 N-DRC 的組裝;此處為可能性描述,並未將其表述為已確立的作用。此外,DRC5 可能是精子運動所需的因子。來源未提供相關實驗條件或具體效應,因此無法據此進一步判定其對精子運動的作用方式。
Promoter 與基因調控
>DRC5 ENST00000371505 GRCh38 chr6:44297598-44298698 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTCTCATTCTAATTAAGGCACTGATGATTTGCTGGTAAGGCACTGCTGAGGGCTTGAAGGGACCCAATCC CGGGTGCCTGGCCCCTCACTGCTTGCAAAGCAGCATCCTGGCCACTGGGGCAGTAGCCTGTTTAGCAGTG CTCACCACAGGCCCAGGTTCAAGCTCCTCCGCGAGCGCCAAGATGAGTTTTGGCACCCCTGATTTATTGA TGAGTTAACAGAGCTTCGAGATGTTCATCCAGGGTAACCAACTAGTAGTCCTCGGCAGAGCTGAAGTCAA AGCTACCCTTTGAAAGCCCCGCCACCCTGGCTGCCTCTCCCTTCCTGAAGGCCAATTTCTTTTTTTTTAC TAGCCGTCCCTCTGGTCTGTCCCTCTCGCCCTCCAGGAGATCTGGGGCCCCAACCACATCTTGTCGCGCC AGGGCTGGAAGAGAGTTTGGCACAGGGCATGGACTGTGTGAAGGAGCGCTGTGTTGGCCTGGAACCTTCC TGCGTCTGGTACCAGACCTTCAGCTGGGGGAAAGGTGGAAGGTGCCCTCCCTCCCGCAGGGCCTAAGGTC AACAGGAGGCCTCACGGGAGTTCCAGTGACTTCTACAGGTGCCTTGGAGAAGGTGCGTCCACCCTCCTCT TCTTCCACAGACGCTTTTCCTGGACCAGCTCCCTATCCATTGCCACACAAAAGCTACCAAGAGAGCACAA GCACTCCAGACCAGCAGCCCTGCCCGACCCCCGCCTCCCGCAGAAAGCCCACCCGTTCCTAGACACGTCC CACGGAAGCACAGGGCATAGCGCAAGGCCACAGTCCCACTACCCGCAAAGCGGCCGCTTCCACGGAACCG TCCCGAGGCCGGGCCTGGCCACCCTGCGCGCGAGTAAGCCGCGTGCCTGGCGCGCAGCGGCAGCGGCAGC GGAGGAAGCAGCGGCGCGCTCGTCCTCCCGGCCCGGCCCGCTCCTAGCAACGCGGGGCGTCCCCAACGAC AAAGACCTGCGCCGGCGCGCGGGACTCTGCGTGAGGCGAGCGCCGGGGCTCCCGGAGCGGGTGAGGCGAC CTCCGGGAGTGGGGACACCCAGCCCCGGTCTCCCTTATCGGGGCCCCCTCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TCTE1_2 ↗ | 6:44,292,224 | 負股 | 44,292,214–44,292,273 |
| TCTE1_1 ↗ | 6:44,297,695 | 負股 | 44,297,685–44,297,744 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_BBRCP · enhancer · 44296707–44297687 · regulatory
ENSR6_9MKPN · promoter · 44297688–44298188 · regulatory
· motif · 44297814–44297830 · motif
· motif · 44297814–44297830 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:501 aa
DRC5 蛋白質長 501 個胺基酸,屬於 DRC5 family。序列註解列出五段 LRR 重複區,位置約在胺基酸 308–439;另有兩段預測為無序的區域,分別位於 1–56 與 202–222。資料未提供這些區域的具體作用說明。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 DRC5 定位於纖毛、鞭毛及鞭毛軸絲,也指出其沿精子鞭毛全長可被檢出。 來源未描述不同異構型、細胞狀態或條件改變時的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Cell projection, cilium, flagellum。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
DRC5 是 N-DRC 的組成部分。資料指出它與 DRC1 有交互作用,並列出 FBXL13/DRC6、DRC3 與 DRC7 為其交互作用對象;來源未進一步說明這些關係是否代表直接結合。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | DRC5 是 nexin-dynein regulatory complex(N-DRC)的組成部分;N-DRC 是纖毛與鞭毛運動的重要調節者,可維持遠端軸絲的排列及完整性,並調控運動型軸絲中的微管滑動。DRC5 可能參與 N-DRC 組裝,也可能是精子運動所需的因子。 | 推論支持 | 證據與來源Component of the nexin-dynein regulatory complex (N-DRC) a key regulator of ciliary/flagellar motility which maintains the alignment and integrity of the distal axoneme and regulates microtubule sliding in motile axonemes. May play a role in the assembly of N-DRC. May be required for sperm motility |
| 交互作用 | DRC5 是 nexin-dynein regulatory complex(N-DRC)的組成部分。資料指出 DRC5 與 DRC1 有交互作用,也列出 FBXL13/DRC6、DRC3 和 DRC7 為其交互作用對象;未進一步界定這些關係是否為直接結合。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the nexin-dynein regulatory complex (N-DRC). Interacts with DRC1. Interacts with FBXL13/DRC6, DRC3 and DRC7 PMID 34169321 ↗ |
| 細胞定位 | DRC5 的定位資料涵蓋纖毛、鞭毛,以及細胞質骨架中的鞭毛軸絲;另指出可沿精子鞭毛全長檢出。來源沒有說明定位隨條件變化或異構型而異的情形。 | 推論支持 | 證據與來源Cell projection, cilium, flagellum; Cytoplasm, cytoskeleton, flagellum axoneme; Detected along the length of the sperm flagellum |
核酸與蛋白質序列
GGGACTCTGCGTGAGGCGAGCGCCGGGGCTCCCGGAGCGG40ATCCCTACCTGTTTCAAGGACCTGCCAGTCTGAGAAGCTT80CTTGTCATAAGGCCATCCAGGGGCCACGCACCCCTACCTT120GCCAGCCTCCAGCATGCAGGATACCGTAACGACATCAGCA160TTGTTGGACCCCAGCCACTCCTCAGTCTCCACCCAGGACA200ATTCCTCCACTGGAGGACACACTTCAAGCACAAGCCCACA240GCTCTCAAAGCCTTCAATCACACCAGTCCCTGCAAAGTCC280AGGAACCCACATCCCAGGGCCAATATCCGTCGGATGCGCC320GGATCATTGCTGAGGATCCTGAGTGGTCACTGGCCATCGT360GCCCCTCCTCACAGAGCTCTGCATTCAGCACATTATCAGG400AACTTCCAGAAAAACCCTATCCTGAAGCAGATGCTCCCGG440AACACCAGCAGAAGGTCCTGAACCACCTGTCCCCTGACCT480ACCACTGGCTGTGACCGCCAACCTGATAGACAGTGAGAAC520TACTGGCTCCGCTGCTGCATGCATCGCTGGCCCGTGTGCC560ACGTGGCCCACCATGGCGGCAGCTGGAAACGCATGTTCTT600CGAGCGGCACCTGGAGAACCTGCTAAAGCACTTTATCCCA640GGCACCACAGACCCTGCGGTGATCCTCGACCTGCTGCCGC680TCTGCCGGAATTACGTGCGCAGGGTCCACGTCGATCAGTT720CCTTCCGCCGGTGCAGCTCCCGGCCCAGCTCCGGCCGGGC760GACCAGTCCGACTCAGGCAGCGAGGGAGAGATGGAGGAGC800CCACCGTTGACCACTACCAACTGGGCGATCTGGTAGCTGG840CCTGAGCCACCTGGAGGAGCTGGACCTGGTGTACGATGTC880AAGGACTGCGGCATGAATTTCGAGTGGAATCTCTTCCTCT920TCACCTACCGTGACTGCCTCTCCTTGGCAGCCGCCATCAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。