演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

DNALI1P28

dynein axonemal light intermediate chain 1

DNALI1(dynein axonemal light intermediate chain 1)屬於內部 dynein 臂輕鏈家族,與精子鞭毛組裝有關。

Homo sapiens1p34.3UniProt O14645
OFFICIAL SYMBOL
DNALI1
CHROMOSOME
1
UNIPROT
O14645
PDB / ALPHAFOLD
8J07
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

DNALI1 是蛋白質編碼基因,其產物為 dynein axonemal light intermediate chain 1,屬於內部 dynein 臂輕鏈家族。蛋白質全長 258 個胺基酸,序列中有兩段被註記為無序區域:第 1–60 位與第 207–231 位胺基酸。現有資料指出此蛋白質與精子鞭毛組裝有關。

Official symbol
DNALI1
Gene name
dynein axonemal light intermediate chain 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14353
UniProt
O14645
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
P28hp28dJ423B22.5

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11p34.3
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegDNALI1pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr1:37,556,918–37,566,857
Gene span
9,940 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000652629 ★37,556,940–37,566,8576
ENST0000029621837,556,919–37,566,8576
ENST0000085295437,556,919–37,566,8573
ENST0000097066337,556,919–37,566,8576
ENST0000114355137,556,919–37,566,8576
ENST0000091833137,556,971–37,566,8576

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

DNALI1 與精子鞭毛組裝有關。現有資料僅指出這項關聯,未進一步說明 DNALI1 在組裝過程中的具體分子作用、作用步驟或所需條件,因此不宜據此推定其機制或其他功能。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 37556940 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>DNALI1 ENST00000652629 GRCh38 chr1:37555940-37557040 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCGGACCACGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACG
TGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTTAGCCGGGCATGGGGGCACGCGCCTGTAGTCCCAG
CTACTCAGAAGGCTGAAGCAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAC
GCCACTGCACTTCAGCCTGGGCAACAGAGAGAGACTCCGTCTCAATTTAAAAATCAAAACAAGCCCTTTC
TTGCGGTGACGACCTACCCACGAGAACATGCCTCTCGCAAAGGATCTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAGG
AGAAGAGGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTTCATGGATGTGAAATGCCC
AGGATGCTATAAAATCACCACAGTCTTTAGCCATGCACAAACGGCAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACT
GTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGTAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAGGAAGCAGCACT
AAAAGCACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACAATCTCAATGAACACATTTTGGGAACAACTACAACAAC
AAAAAAAACCTTCAAAAAACCTAGGAACTCCAGATGACTTCCTTTGGGAATTGTCCCTTAACCCTTCATG
AGAAGTCAGGAGATGACTCCTGTTTTTCAGGTGACAAAATTGGAGCATGGCAAAGGTGATCTGCCCACTT
CAAATCGCTAGCTAGACGGAGCATAGGGACTCGAACTGCCGTTTTCCTCGCCTCCAAGAGTACAGGGACG
AACCGGTGAGCAGAAGGCCTAAGAAGTCAGGCACAAGAGGTTTCTGCCCAGGAGGCACAGAATGAAACTT
GCCGGCTGTTGGCCCCGCCCCACTTCGAAGCTCCGCCCAGGCCAAGAAGCGCGGGGGCGGGAGTGAGGGG
GCGGTTTCCATGGTGACGGCAAACAAGGCCCACACTGGACAGGGCAGCTGCTGGGTTGCTACTCTCGCCT
CCGCCATGATTCCGCCCGCAGACTCTTTGCTCAAGTACGACACCCCAGTGC
DNALI1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
DNALI1_1 ↗1:37,556,980正股37,556,931–37,556,990

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_9JWGG · promoter · 37554283–37554655 · regulatory

ENSR1_9JWH5 · promoter · 37556594–37556950 · regulatory

ENSR1_747M4Z · enhancer · 37560611–37560711 · regulatory

· motif · 37553799–37553807 · motif

· motif · 37554021–37554038 · motif

· motif · 37554308–37554317 · motif

· motif · 37554308–37554319 · motif

· motif · 37554308–37554319 · motif

· motif · 37554308–37554321 · motif

· motif · 37554314–37554323 · motif

· motif · 37554314–37554325 · motif

· motif · 37554361–37554370 · motif

· motif · 37554361–37554370 · motif

· motif · 37554559–37554570 · motif

· motif · 37556897–37556910 · motif

· motif · 37556911–37556924 · motif

· motif · 37556983–37556996 · motif

· motif · 37556988–37556998 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:258 aa

1 aa258 aa功能區域
依 O14645 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

DNALI1 蛋白質長 258 個胺基酸,屬於內部 dynein 臂輕鏈家族。序列註解將第 1–60 位及第 207–231 位胺基酸標示為無序區域;資料未提供其他結構域或功能區域的描述。

功能區域Disordered1–60 aa
功能區域Disordered207–231 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8J07…

PDB · 8J07

EM · 4.10 A · e0/e1/e2/e3/e4/e5/e6/e7/e8/e9=1-258

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell projection, cilium;Cell projection, cilium, flagellum;Dynein axonemal particle;Cytoplasm

DNALI1 的定位資料包括細胞質、纖毛與鞭毛,以及軸絲 dynein 顆粒。 這些註記未進一步說明不同位置之間的轉換條件或定位動態。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Cell projection, cilium;Cell projection, cilium, flagellum;Dynein axonemal particle。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 50 個夥伴 · 最多顯示 50 個
P28DNALI1AK8AKAP9ALAS1ANXA4ANXA8AP3B1APPASB9ASIC4ATP6V1B1BCAT1BECN1CD209CENPVCHMP7DBNLDDI1DPP9DPYSDXOE2F8EIF3FEIF3KESRP1FAM135BFGF21FYNGABPB1GINS3GMPPAHTTIFI35IQUBITGB3BPKLF15KLF5LGALS9CLRRC61LZTS2METTL27MSGN1MT2AOTUB1OTUD7BPADI3PAIP2PIGPPPP1R21PRMT6RAP1GAP
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 71 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

DNALI1 與 CFAP45 有互作記錄;另有依相似性推定其與 DYNC1H1 互作的註記,後者屬推論性資料,並非此處明確描述的實驗確認。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

Spermatogenic failure 83(SPGF83)是一種常染色體隱性男性不孕症,特徵包括弱精子症與畸形精子症。患者精子的鞭毛可見不對稱的纖維鞘;資料指出,影響 DNALI1 所代表基因的變異可能造成此病。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能DNALI1 與精子鞭毛的組裝有關;現有敘述未交代其具體作用方式或其他實驗條件。含實驗來源
證據與來源

Involved in sperm flagellum assembly

PMID 36792588 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用DNALI1 與 CFAP45 有互作記錄;與 DYNC1H1 的互作則是依相似性推定,證據性質不同。含實驗來源
證據與來源

Interacts with CFAP45. Interacts with DYNC1H1 (By similarity)

PMID 33139725 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位DNALI1 的定位註記涵蓋細胞質、纖毛與鞭毛,並包括軸絲 dynein 顆粒;資料未說明定位變化條件。含實驗來源
證據與來源

Cell projection, cilium; Cell projection, cilium, flagellum; Dynein axonemal particle; Cytoplasm

PMID 27120127 ↗ · PMID 31178125 ↗ · PMID 39503742 ↗ · PMID 40146200 ↗ · PMID 36792588 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Spermatogenic failure 83(SPGF83)為常染色體隱性男性不孕症,患者可有弱精子症與畸形精子症,且精子鞭毛呈現不對稱纖維鞘。影響 DNALI1 所代表基因的變異可能造成此病,來源未將此表述為確定因果。含實驗來源
證據與來源

Spermatogenic failure 83 SPGF83 An autosomal recessive male infertility disorder characterized by asthenoteratozoospermia. Patient sperm exhibit an asymmetric fibrous sheath of the flagella. The disease may be caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620354

PMID 36792588 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000652629 · 2,628 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AAACAAGGCCCACACTGGACAGGGCAGCTGCTGGGTTGCT40
41ACTCTCGCCTCCGCCATGATTCCGCCCGCAGACTCTTTGC80
81TCAAGTACGACACCCCAGTGCTGGTGAGCCGGAACACGGA120
121GAAACGGAGCCCCAAGGCTCGGCTACTGAAAGTCAGCCCC160
161CAGCAGCCTGGACCTTCAGGTTCAGCCCCACAGCCACCCA200
201AGACCAAGCTCCCCTCAACTCCCTGTGTCCCAGATCCTAC240
241AAAGCAGGCAGAAGAAATCTTGAATGCCATACTACCCCCA280
281AGGGAGTGGGTGGAAGACACGCAGCTATGGATCCAGCAGG320
321TGTCCAGCACCCCTAGCACCAGGATGGACGTGGTGCACCT360
361CCAGGAGCAGTTAGACTTAAAGCTGCAGCAGCGGCAGGCC400
401AGGGAAACAGGCATCTGCCCTGTCCGCAGGGAACTCTACT440
441CACAGTGTTTTGATGAGTTGATCCGGGAGGTCACCATCAA480
481CTGTGCGGAGAGGGGGCTGCTGCTGCTGCGAGTCCGGGAC520
521GAGATCCGCATGACCATCGCTGCCTACCAGACCCTGTACG560
561AGAGCAGCGTGGCGTTTGGCATGAGGAAGGCACTGCAGGC600
601TGAGCAGGGGAAGTCAGACATGGAGAGGAAAATCGCAGAA640
641TTGGAGACGGAAAAGAGAGACCTGGAGAGGCAAGTGAACG680
681AGCAGAAGGCAAAATGTGAAGCCACTGAGAAGCGGGAGAG720
721CGAGAGGCGGCAGGTGGAGGAGAAGAAGCACAATGAGGAG760
761ATTCAGTTCCTGAAGCGAACAAATCAGCAGCTGAAGGCCC800
801AACTGGAAGGCATTATTGCACCAAAGAAGTGATAATTTCC840
841ACATGATTAATTTCCAACAAGACACTTGGGAGTTATTTAC880
881TGTGTTCCTCTGGCAGCCAATAAAATCATCATAAGCCCTT920
921TGTAATAAAAAGCTAGTTTCCTGAGTGAACAAGCCATAAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。