演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

DNAJC28C21orf78

DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C28

DNAJC28 是蛋白質編碼基因,其產物屬於 DnaJ heat shock protein family (Hsp40);目前資料指出它可能參與蛋白質折疊或作為分子伴護蛋白。

Homo sapiens21q22.11UniProt Q9NX36
OFFICIAL SYMBOL
DNAJC28
CHROMOSOME
21
UNIPROT
Q9NX36
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

DNAJC28 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C28。其蛋白質產物長 388 個胺基酸,屬於 DnaJ heat shock protein family (Hsp40)。現有資料僅指出它可能參與蛋白質折疊或作為分子伴護蛋白,未提供更詳細的家族分工或作用機制資訊。

Official symbol
DNAJC28
Gene name
DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C28
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1297
UniProt
Q9NX36
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
C21orf78C21orf55

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2121q22.11
chr21 · 46,709,983 bp · GRCh38chr21p13 · 1–3100000 · gvarchr21p12 · 3100001–7000000 · stalkchr21p11.2 · 7000001–10900000 · gvarchr21p11.1 · 10900001–12000000 · acenchr21q11.1 · 12000001–13000000 · acenchr21q11.2 · 13000001–15000000 · gnegchr21q21.1 · 15000001–22600000 · gpos100chr21q21.2 · 22600001–25500000 · gnegchr21q21.3 · 25500001–30200000 · gpos75chr21q22.11 · 30200001–34400000 · gnegchr21q22.12 · 34400001–36400000 · gpos50chr21q22.13 · 36400001–38300000 · gnegchr21q22.2 · 38300001–41200000 · gpos50chr21q22.3 · 41200001–46709983 · gnegDNAJC28pq1 bp46,709,983 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr21:33,485,615–33,491,753
Gene span
6,139 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000381947 ★33,488,055–33,491,7162
ENST0000031439933,485,615–33,491,4732
ENST0000040220233,485,615–33,491,6912
ENST0000088549133,485,615–33,491,7492
ENST0000092226733,485,615–33,491,7493
ENST0000094977633,485,615–33,491,7533
ENST0000094977733,485,615–33,491,7533
ENST0000113141933,485,615–33,491,7532

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

DNAJC28 的蛋白質功能目前僅有概括性描述:它可能參與蛋白質折疊,或作為分子伴護蛋白。這表示其可能與蛋白質折疊相關,但現有資料沒有說明它作用於哪些蛋白質、如何影響折疊,也沒有指出這些作用發生的細胞條件或生物學過程,因此不宜將可能性描述為已確立的具體機制。

資料亦未交代 DNAJC28 是否直接協助蛋白質取得或維持特定構形,或其分子伴護角色是否涉及其他蛋白質。因而,目前能支持的功能解讀限於蛋白質折疊與分子伴護這兩種可能方向,不能據此推定其作用對象、調控方式或下游效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 33491716 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>DNAJC28 ENST00000381947 GRCh38 chr21:33491616-33492716 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCAATGAAGTTGATACAATTATTATTTCATTATATGTAAAATAGGGAAAATAACAGCATTTATCTCAGAG
GGCTGTTGTAAAGATTAAATGAATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAAAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCT
TAGCTCAGGGGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTGGTCTCCACTAAAAATACAAAAAAAT
TAGCTGGGCATGGTGGTGCGCGCCTGTAATTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTAAA
CCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGCGAGCCGAGATCGCGCCACCACACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGAC
TCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAAATGAGAATATACATAAAGCACTTAGCACAATGGCATACTA
TTTACTATAGTTTACTATTTATTGCAACTCTCATTTTGCAGGTATCTTGCCTAAGGTGCAAGCAGAAGAA
ACAGGATTTTCAACCCAGATCTGAAAACTCCCAAGCCTCTGCCTTTTTCTTTTTATCCTTTTTCTTTTTC
CTTGTTAAAAAACTTGCTTCCTGTACAGAGAGGGGAAATGCTCAGTCCCCACGTCAGTGGTTGAACTCCA
AGCCAGAAGATCCCTATTTTGATTTTGTCCTCTGGCCTGTCGCCAGCCCCTCAACAGTACTTGAATTAAT
AAAAGGGCAGGTTTTAAGCCTCATGTATCTGCGCAGGTGACTCCTTCTGTGACCCCGAATAAACCTGTTC
CGGTCCCGTTCCGGGGAAACAGCCTTGCCTTCCCCTGCCCCCAGAAAGTTACCCTCGCCCTCCGAGCCAC
AACTCCCCACGCCGCCAACTCGGTCTTTACATCATTTTCGACGCCCCCTAAGTCCCTCCCGAGAGGCGCA
GGCGCACATCGCCCCTTCTAGCGAACTACATCTCCCACAATCCCAATCGGCCGGACCACCTCCGCTCGGG
GCGGGGACGGAGGTGGAGCTGGTGGTCCCCGGTCGGGACGAAGGCTCCCGAGGTGCCCTGCCTGGGTCCT
CCGGGGTAAAGTTCGTTTGGCGGAAGATTGTCCGTTTTCCTGGTAAGGTCA
DNAJC28 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
DNAJC28_2 ↗21:33,491,398負股33,491,388–33,491,447
DNAJC28_1 ↗21:33,491,715負股33,491,705–33,491,764

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR21_B8MGC · enhancer · 33490899–33491462 · regulatory

ENSR21_B8MGG · promoter · 33491463–33492206 · regulatory

ENSR21_59TNPC · CTCF_binding_site · 33491514–33491535 · regulatory

ENSR21_8ZKTD · enhancer · 33492694–33492843 · regulatory

· motif · 33489123–33489137 · motif

· motif · 33489123–33489137 · motif

· motif · 33489130–33489141 · motif

· motif · 33491400–33491410 · motif

· motif · 33491402–33491415 · motif

· motif · 33491448–33491458 · motif

· motif · 33491471–33491482 · motif

· motif · 33491471–33491482 · motif

· motif · 33491507–33491517 · motif

· motif · 33491516–33491532 · motif

· motif · 33491640–33491651 · motif

· motif · 33491726–33491739 · motif

· motif · 33491739–33491752 · motif

· motif · 33491801–33491812 · motif

· motif · 33491801–33491812 · motif

· motif · 33492149–33492169 · motif

· motif · 33492733–33492742 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:388 aa

1 aa388 aa結構域
依 Q9NX36 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

DNAJC28 蛋白質長 388 個胺基酸。序列註解標示一個 J domain,位於第 51 至第 115 個胺基酸;資料未提供其他功能區域的註解。

結構域J51–115 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9NX36…

AlphaFold · Q9NX36

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
C21orf78DNAJC28
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能DNAJC28 可能參與蛋白質折疊,也可能作為分子伴護蛋白。此描述以可能性表達,未指出作用對象、具體分子機制、發生條件或相關生物學過程,因此不能據此進一步推定其作用方式或功能結果。資料庫紀錄
證據與來源

May have a role in protein folding or as a chaperone

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000381947 · 1,485 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGTGGTCCCCGGTCGGGACGAAGGCTCCCGAGGTGCCCTG40
41CCTGGGTCCTCCGGGGTAAAGTTCGTTTGGCGGAAGATTG80
81TCCGTTTTCCTGGTAAGGTCACCTGTCCCAATCAGGTCAT120
121TGCTAGGAAGAACTCTGGGTACAATAATGAATACAATGTA160
161TGTGATGATGGCTCAGATCTTAAGATCTCACCTGATAAAG200
201GCTACAGTGATTCCTAATCGAGTGAAAATGCTTCCATATT240
241TTGGTATCATTAGAAATAGAATGATGTCAACCCATAAATC280
281CAAAAAGAAGATCAGAGAATATTATAGACTGCTGAACGTG320
321GAGGAAGGATGCTCTGCAGATGAAGTCAGGGAATCTTTTC360
361ATAAGCTTGCCAAGCAATATCATCCTGACAGTGGCTCTAA400
401TACTGCTGATTCTGCAACATTTATAAGGATTGAAAAAGCT440
441TATAGAAAGGTGCTCTCCCATGTGATAGAACAAACAAATG480
481CCAGTCAGAGTAAAGGTGAAGAAGAAGAAGATGTAGAAAA520
521ATTCAAATATAAAACACCCCAACACCGACATTATTTAAGT560
561TTTGAAGGTATTGGTTTTGGGACTCCAACTCAACGAGAGA600
601AGCATTATAGGCAATTTAGGGCAGACCGTGCTGCTGAACA640
641AGTGATGGAATATCAAAAGCAGAAACTACAAAGCCAGTAT680
681TTTCCTGATAGTGTAATTGTTAAAAATATAAGACAGAGCA720
721AACAGCAAAAGATAACGCAAGCTATAGAACGTTTAGTGGA760
761GGACCTCATTCAAGAATCCATGGCAAAAGGAGACTTTGAC800
801AATCTCAGTGGGAAAGGAAAACCTCTGAAAAAGTTTTCTG840
841ACTGTTCTTACATTGATCCCATGACTCACAACCTGAACCG880
881AATACTGATCGATAATGGATACCAACCAGAATGGATCCTT920
921AAGCAAAAGGAAATAAGCGATACTATTGAGCAACTCAGAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。