基因總覽
DNAJC28 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C28。其蛋白質產物長 388 個胺基酸,屬於 DnaJ heat shock protein family (Hsp40)。現有資料僅指出它可能參與蛋白質折疊或作為分子伴護蛋白,未提供更詳細的家族分工或作用機制資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000381947 ★ | 33,488,055–33,491,716 | 2 |
| ENST00000314399 | 33,485,615–33,491,473 | 2 |
| ENST00000402202 | 33,485,615–33,491,691 | 2 |
| ENST00000885491 | 33,485,615–33,491,749 | 2 |
| ENST00000922267 | 33,485,615–33,491,749 | 3 |
| ENST00000949776 | 33,485,615–33,491,753 | 3 |
| ENST00000949777 | 33,485,615–33,491,753 | 3 |
| ENST00001131419 | 33,485,615–33,491,753 | 2 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
DNAJC28 的蛋白質功能目前僅有概括性描述:它可能參與蛋白質折疊,或作為分子伴護蛋白。這表示其可能與蛋白質折疊相關,但現有資料沒有說明它作用於哪些蛋白質、如何影響折疊,也沒有指出這些作用發生的細胞條件或生物學過程,因此不宜將可能性描述為已確立的具體機制。
資料亦未交代 DNAJC28 是否直接協助蛋白質取得或維持特定構形,或其分子伴護角色是否涉及其他蛋白質。因而,目前能支持的功能解讀限於蛋白質折疊與分子伴護這兩種可能方向,不能據此推定其作用對象、調控方式或下游效應。
Promoter 與基因調控
>DNAJC28 ENST00000381947 GRCh38 chr21:33491616-33492716 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCAATGAAGTTGATACAATTATTATTTCATTATATGTAAAATAGGGAAAATAACAGCATTTATCTCAGAG GGCTGTTGTAAAGATTAAATGAATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAAAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCT TAGCTCAGGGGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTGGTCTCCACTAAAAATACAAAAAAAT TAGCTGGGCATGGTGGTGCGCGCCTGTAATTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTAAA CCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGCGAGCCGAGATCGCGCCACCACACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGAC TCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAAATGAGAATATACATAAAGCACTTAGCACAATGGCATACTA TTTACTATAGTTTACTATTTATTGCAACTCTCATTTTGCAGGTATCTTGCCTAAGGTGCAAGCAGAAGAA ACAGGATTTTCAACCCAGATCTGAAAACTCCCAAGCCTCTGCCTTTTTCTTTTTATCCTTTTTCTTTTTC CTTGTTAAAAAACTTGCTTCCTGTACAGAGAGGGGAAATGCTCAGTCCCCACGTCAGTGGTTGAACTCCA AGCCAGAAGATCCCTATTTTGATTTTGTCCTCTGGCCTGTCGCCAGCCCCTCAACAGTACTTGAATTAAT AAAAGGGCAGGTTTTAAGCCTCATGTATCTGCGCAGGTGACTCCTTCTGTGACCCCGAATAAACCTGTTC CGGTCCCGTTCCGGGGAAACAGCCTTGCCTTCCCCTGCCCCCAGAAAGTTACCCTCGCCCTCCGAGCCAC AACTCCCCACGCCGCCAACTCGGTCTTTACATCATTTTCGACGCCCCCTAAGTCCCTCCCGAGAGGCGCA GGCGCACATCGCCCCTTCTAGCGAACTACATCTCCCACAATCCCAATCGGCCGGACCACCTCCGCTCGGG GCGGGGACGGAGGTGGAGCTGGTGGTCCCCGGTCGGGACGAAGGCTCCCGAGGTGCCCTGCCTGGGTCCT CCGGGGTAAAGTTCGTTTGGCGGAAGATTGTCCGTTTTCCTGGTAAGGTCA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| DNAJC28_2 ↗ | 21:33,491,398 | 負股 | 33,491,388–33,491,447 |
| DNAJC28_1 ↗ | 21:33,491,715 | 負股 | 33,491,705–33,491,764 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR21_B8MGC · enhancer · 33490899–33491462 · regulatory
ENSR21_B8MGG · promoter · 33491463–33492206 · regulatory
ENSR21_59TNPC · CTCF_binding_site · 33491514–33491535 · regulatory
ENSR21_8ZKTD · enhancer · 33492694–33492843 · regulatory
· motif · 33489123–33489137 · motif
· motif · 33489123–33489137 · motif
· motif · 33489130–33489141 · motif
· motif · 33491400–33491410 · motif
· motif · 33491402–33491415 · motif
· motif · 33491448–33491458 · motif
· motif · 33491471–33491482 · motif
· motif · 33491471–33491482 · motif
· motif · 33491507–33491517 · motif
· motif · 33491516–33491532 · motif
· motif · 33491640–33491651 · motif
· motif · 33491726–33491739 · motif
· motif · 33491739–33491752 · motif
· motif · 33491801–33491812 · motif
· motif · 33491801–33491812 · motif
· motif · 33492149–33492169 · motif
· motif · 33492733–33492742 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:388 aa
DNAJC28 蛋白質長 388 個胺基酸。序列註解標示一個 J domain,位於第 51 至第 115 個胺基酸;資料未提供其他功能區域的註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | DNAJC28 可能參與蛋白質折疊,也可能作為分子伴護蛋白。此描述以可能性表達,未指出作用對象、具體分子機制、發生條件或相關生物學過程,因此不能據此進一步推定其作用方式或功能結果。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GGTGGTCCCCGGTCGGGACGAAGGCTCCCGAGGTGCCCTG40CCTGGGTCCTCCGGGGTAAAGTTCGTTTGGCGGAAGATTG80TCCGTTTTCCTGGTAAGGTCACCTGTCCCAATCAGGTCAT120TGCTAGGAAGAACTCTGGGTACAATAATGAATACAATGTA160TGTGATGATGGCTCAGATCTTAAGATCTCACCTGATAAAG200GCTACAGTGATTCCTAATCGAGTGAAAATGCTTCCATATT240TTGGTATCATTAGAAATAGAATGATGTCAACCCATAAATC280CAAAAAGAAGATCAGAGAATATTATAGACTGCTGAACGTG320GAGGAAGGATGCTCTGCAGATGAAGTCAGGGAATCTTTTC360ATAAGCTTGCCAAGCAATATCATCCTGACAGTGGCTCTAA400TACTGCTGATTCTGCAACATTTATAAGGATTGAAAAAGCT440TATAGAAAGGTGCTCTCCCATGTGATAGAACAAACAAATG480CCAGTCAGAGTAAAGGTGAAGAAGAAGAAGATGTAGAAAA520ATTCAAATATAAAACACCCCAACACCGACATTATTTAAGT560TTTGAAGGTATTGGTTTTGGGACTCCAACTCAACGAGAGA600AGCATTATAGGCAATTTAGGGCAGACCGTGCTGCTGAACA640AGTGATGGAATATCAAAAGCAGAAACTACAAAGCCAGTAT680TTTCCTGATAGTGTAATTGTTAAAAATATAAGACAGAGCA720AACAGCAAAAGATAACGCAAGCTATAGAACGTTTAGTGGA760GGACCTCATTCAAGAATCCATGGCAAAAGGAGACTTTGAC800AATCTCAGTGGGAAAGGAAAACCTCTGAAAAAGTTTTCTG840ACTGTTCTTACATTGATCCCATGACTCACAACCTGAACCG880AATACTGATCGATAATGGATACCAACCAGAATGGATCCTT920AAGCAAAAGGAAATAAGCGATACTATTGAGCAACTCAGAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。