演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

DNAJC2MPP11

DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C2

DNAJC2 產生 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C2,能在細胞質參與新生多肽的摺疊,也能在細胞核協助解除特定染色質上的抑制狀態。

Homo sapiens7q22.1UniProt Q99543
OFFICIAL SYMBOL
DNAJC2
CHROMOSOME
7
UNIPROT
Q99543
PDB / ALPHAFOLD
6CGH
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

DNAJC2 是蛋白質編碼基因,產物正式名稱為 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C2,屬於 Hsp40/DnaJ 型分子伴護蛋白家族。這種蛋白質具有多個區域,包括 J domain、兩個 SANT domain,以及 ZRF1-UBD 區域;序列中另有被註記為無序的區段。其特點是能在細胞質與細胞核執行不同類型的工作:細胞質中的角色與蛋白質品質維持相關,細胞核中的角色則涉及染色質調控。這些不同位置的功能,使 DNAJC2 同時連結蛋白質處理與基因轉錄調節。

Official symbol
DNAJC2
Gene name
DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13192
UniProt
Q99543
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
MPP11MPHOSPH11ZUO1zuotinZRF1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77q22.1
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegDNAJC2pq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr7:103,310,497–103,344,837
Gene span
34,341 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000379263 ★103,312,289–103,344,76717
ENST00000249270103,310,497–103,344,83015
ENST00000915316103,310,497–103,344,83017
ENST00001142962103,310,497–103,344,83017
ENST00000426036103,322,600–103,344,5888
ENST00000454277103,322,727–103,344,7788
ENST00000412522103,335,242–103,344,8303
ENST00001129054103,341,655–103,344,8302

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

DNAJC2 依所在位置參與兩類不同的細胞活動:在細胞質中協助蛋白質摺疊,在細胞核中則參與染色質調控。這些作用分別關聯新生多肽的處理,以及特定受抑制基因轉為活化狀態。

在細胞質中,DNAJC2 是核糖體相關複合體 RAC 的組成成分。RAC 參與新生多肽的摺疊,或維持其仍具備正確摺疊能力的狀態。當核糖體上合成的多肽鏈與 HSPA14 結合時,DNAJC2 會促進 HSPA14 的 ATPase 活性;HSPA14 屬於 Hsp70 型分子伴護蛋白。由此,DNAJC2 在 RAC 中協助調節與新生多肽相連的分子伴護作用,支持新合成蛋白質進入適當的摺疊過程。

在細胞核中,DNAJC2 參與解除 Polycomb 介導的基因抑制。它會被特異性招募至帶有 H2AK119ub 標記的組蛋白 H2A,並促進 Polycomb PRC1 複合體離開染色質。此變化有助於受抑制基因轉入活化狀態,進而促進轉錄。來源描述的是 DNAJC2 對這項染色質狀態轉換的參與,並未將其作用概括為對所有基因的普遍活化。

因此,DNAJC2 的功能跨越蛋白質摺疊與基因表現調控兩個層面:一方面協助新生多肽維持可摺疊狀態,另一方面促進特定染色質區域解除抑制。這兩類作用依其細胞內位置而異。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 103344767 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>DNAJC2 ENST00000379263 GRCh38 chr7:103344667-103345767 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ATGTATTTAATTGGCCTGGCACAGTGACTCACGCCTCTAATCCCAGAGTTTTGGGAGACTGAGGCAGGAG
GATCCCTTGAGGCCAGGAGTTCAAGACCACCTTGGGCAACATAGTGAGACCCTGTCTCTACAAAAAAAAA
TATACATATATATATATATAATATATTTAAAAACTTTAATTGTGAAAATATAATGAAATTAGTAAGTTAT
TTTCTAATTTACTAATTTCTGGTGGTCCTTGCTAAAGAGTGGCATATCAAGTTTATTTTATTGAACCTGT
TTCAGATACTGCTGTTGGGGGTGAGCCTTTACCCACTGTTTGTTTTTGCTAGTTTTTGCTTTTGACTGCA
GTCTTAGAAGGAAGCATATAGTAGGAATACAATTGATTTTATTATACATTAAAAAATTAAGTCCCAGAGT
CCTATAATTGGGAATATCTTGAATAAAAACTTCATTAGAACAAGGTAAAAATATTGCTGGCCTTGGAATA
CAATCTAACACACTAGAGAGAGGTTTCTTCTCCAAGCGAGTATTAAAAGATATAATGCAGGTAAATTAGT
AATAGCACGACAAATATTAGCTGCTATTATCATCATCAAGTTAAACACAAATGTATCACAAATACACGTA
CGTAATTCTCCGCAAATGTATATACTAGTCGTCGATACTGGTTCATACAGGTATTTTCATTTTTTACTTA
AAAGTATAGCGCTCCTGGGAAAATCACTGATTAGGTTCAGATTAATACATAAAGCAGTAAGAACTTAAAG
ATAATATAAAAAGAACTGCTTTTAAAGGTTATGTTCTATGTATTGCACTGGGACGTGGAATATAATCCTT
TTTACAGGAAAACTGATGCGCCTAGGAACCATTCTCTCGTGCGACTTGGTCTCCAGCCGGATCTCAGTCA
GTATAGAACTAGGTTACCGCACACGTTGGCGGGGGTGGGAGGGTGTGAGACTGGCCTCCACACCACGAAA
GATCCATCCCGGAAGTGCTTACTGGTCGTCTCCATGCGCCGGTTCCTGGGCGTCTTAGAGCCAAGGCGCG
AGGCTCGGAGTGAGAGGTAGAGCTGGAGGGGACCCTAAGCGCCCTCCGCCC
DNAJC2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
DNAJC2_2 ↗7:103,341,855負股103,341,845–103,341,904
DNAJC2_1 ↗7:103,344,767負股103,344,757–103,344,816

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR7_93J2HR · promoter · 103343830–103344330 · regulatory

ENSR7_5WBB9B · CTCF_binding_site · 103344613–103344634 · regulatory

ENSR7_93J2J2 · promoter · 103344656–103344924 · regulatory

ENSR7_BQHQK · enhancer · 103344925–103345452 · regulatory

ENSR7_BQHQT · promoter · 103347146–103347681 · regulatory

ENSR7_CD8TZ · enhancer · 103347682–103348756 · regulatory

· motif · 103344201–103344217 · motif

· motif · 103344201–103344217 · motif

· motif · 103344307–103344321 · motif

· motif · 103344307–103344321 · motif

· motif · 103344461–103344473 · motif

· motif · 103344463–103344470 · motif

· motif · 103344463–103344476 · motif

· motif · 103344559–103344571 · motif

· motif · 103344561–103344568 · motif

· motif · 103344567–103344580 · motif

· motif · 103344577–103344587 · motif

· motif · 103344615–103344631 · motif

· motif · 103344771–103344780 · motif

· motif · 103344771–103344782 · motif

· motif · 103344771–103344782 · motif

· motif · 103344806–103344818 · motif

· motif · 103344819–103344832 · motif

· motif · 103346671–103346683 · motif

· motif · 103347618–103347627 · motif

· motif · 103347618–103347629 · motif

· motif · 103347651–103347660 · motif

· motif · 103347667–103347681 · motif

· motif · 103347667–103347681 · motif

· motif · 103347836–103347858 · motif

· motif · 103347836–103347858 · motif

· motif · 103349668–103349683 · motif

· motif · 103349673–103349685 · motif

· motif · 103349676–103349683 · motif

CEBPA 會抑制 DNAJC2 的表現;另有資料指出,DNAJC2 在白血病細胞中呈現強烈過度表現。這些描述涉及表現調控與細胞中的表現狀態,未提供兩者之間的因果關係。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:621 aa

1 aa621 aa結構域功能區域
依 Q99543 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C2 長 621 個胺基酸。其 J domain 位於第 88–161 位,SANT 1 domain 位於第 449–511 位,SANT 2 domain 位於第 549–604 位;另有第 160–250 位的 ZRF1-UBD 區域。第 294–315 位及第 426–453 位被註記為無序區段。來源亦標示第 23–31 位為可被 CD8(+) 細胞毒性 T 淋巴球辨識的表位。

結構域J88–161 aa
結構域SANT 1449–511 aa
結構域SANT 2549–604 aa
功能區域Epitope (recognized by CD8(+) cytotoxic T-lymphocytes)23–31 aa
功能區域ZRF1-UBD160–250 aa
功能區域Disordered294–315 aa
功能區域Disordered426–453 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6CGH…

PDB · 6CGH

NMR · - · A=346-432

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus;Cytoplasm, cytosol

DNAJC2 位於細胞核與細胞質(胞質溶膠)。 來源同時描述其在這兩處執行不同功能,但未提供定位隨條件改變或異構型間定位差異的資料。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
MPP11DNAJC2H2AC17HSPA14
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

DNAJC2 與 HSPA14 組成核糖體相關複合體 RAC;RAC 是由 HSPA14(Hsp70/DnaK 型分子伴護蛋白)及 DNAJC2(Hsp40/DnaJ 型分子伴護蛋白)構成的異源二聚體。此外,DNAJC2 透過 ZRF1-UBD 區域與 ID1 互作;此項互作標示為依相似性推定。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能DNAJC2 在細胞質中作為 RAC 的分子伴護蛋白成分,協助新生多肽摺疊或維持其可摺疊狀態,並促進與多肽鏈結合的 HSPA14 ATPase 活性;在細胞核中則被招募至 H2AK119ub,促進 PRC1 離開染色質,協助受抑制基因活化。含實驗來源
證據與來源

Acts both as a chaperone in the cytosol and as a chromatin regulator in the nucleus. When cytosolic, acts as a molecular chaperone: component of the ribosome-associated complex (RAC), a complex involved in folding or maintaining nascent polypeptides in a folding-competent state. In the RAC complex, stimulates the ATPase activity of the ribosome-associated pool of Hsp70-type chaperones HSPA14 that bind to the nascent polypeptide chain. When nuclear, mediates the switching from polycomb-repressed genes to an active state: specifically recruited at histone H2A ubiquitinated at 'Lys-119' (H2AK119ub), and promotes the displacement of the polycomb PRC1 complex from chromatin, thereby facilitating transcription activation

PMID 15802566 ↗ · PMID 16002468 ↗ · PMID 21179169 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用DNAJC2 與 HSPA14 組成異源二聚體 RAC,屬於核糖體相關複合體;另有透過 ZRF1-UBD 區域與 ID1 互作的描述,此項互作是依相似性推定。含實驗來源
證據與來源

Component of ribosome-associated complex (RAC), a heterodimer composed of Hsp70/DnaK-type chaperone HSPA14 and Hsp40/DnaJ-type chaperone DNAJC2. Interacts (via ZRF1-UBD region) with ID1 (By similarity)

PMID 16002468 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位DNAJC2 的細胞內定位包括細胞核,以及細胞質中的胞質溶膠;來源未提供定位改變的條件或異構型差異。含實驗來源
證據與來源

Nucleus; Cytoplasm, cytosol

PMID 21179169 ↗ · PMID 16002468 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控CEBPA 會抑制 DNAJC2 表現;DNAJC2 另被描述為在白血病細胞中強烈過度表現。來源未說明這兩項現象之間的因果關係。含實驗來源
證據與來源

Expression is repressed by CEBPA. Strongly overexpressed in leukemic cells

PMID 12800198 ↗ · PMID 14696097 ↗ · PMID 17242690 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000379263 · 2,291 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTGGTCGTCTCCATGCGCCGGTTCCTGGGCGTCTTAGAG40
41CCAAGGCGCGAGGCTCGGAGTGAGAGGTAGAGCTGGAGGG80
81GACCCTAAGCGCCCTCCGCCCGGGACGTGAGCCGCTGCGC120
121CCACCGGGCTAGACCCGGCGCCATCATGCTGCTTCTGCCA160
161AGCGCCGCGGACGGCCGGGGCACCGCCATCACCCACGCTC200
201TGACCTCTGCCTCTACACTCTGTCAAGTTGAACCTGTGGG240
241AAGATGGTTTGAAGCTTTTGTTAAGAGGAGAAACAGAAAT280
281GCTTCTGCCTCTTTTCAGGAACTGGAGGATAAGAAAGAGT320
321TATCCGAGGAATCAGAAGATGAAGAATTGCAGTTGGAAGA360
361GTTTCCCATGCTGAAAACACTTGATCCCAAAGACTGGAAG400
401AACCAAGATCATTATGCAGTTCTTGGACTTGGCCATGTGA440
441GATACAAGGCTACACAGAGACAGATCAAAGCAGCTCATAA480
481AGCAATGGTTTTAAAACATCACCCAGACAAACGGAAAGCA520
521GCTGGTGAACCAATAAAAGAAGGAGATAATGACTACTTCA560
561CTTGCATAACTAAAGCTTATGAAATGTTATCTGATCCAGT600
601GAAAAGACGAGCATTTAACAGTGTAGATCCTACTTTTGAT640
641AACTCAGTTCCTTCTAAAAGTGAAGCAAAGGATAATTTCT680
681TCGAAGTGTTTACCCCAGTGTTTGAAAGGAATTCCAGATG720
721GTCAAATAAAAAAAATGTTCCTAAACTTGGTGATATGAAT760
761TCATCATTTGAAGATGTAGATATATTTTATTCTTTCTGGT800
801ATAATTTTGATTCTTGGAGAGAATTTTCTTATTTAGATGA840
841AGAAGAAAAAGAAAAAGCAGAATGTCGTGATGAGAGGAGA880
881TGGATTGAAAAGCAGAACAGAGCAACAAGAGCACAAAGAA920
921AAAAAGAAGAAATGAACAGAATAAGAACATTAGTTGACAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。