基因總覽
DMRTC1 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 DMRT like family C1。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 Xq13.1。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000615063 ★ | 72,872,025–72,943,837 | 7 |
| ENST00000596389 | 72,872,025–72,877,864 | 5 |
| ENST00000595412 | 72,872,025–72,875,974 | 6 |
| ENST00001092391 | 72,872,025–72,878,136 | 7 |
| ENST00001092393 | 72,872,025–72,877,864 | 7 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>DMRTC1 ENST00000615063 GRCh38 chrX:72943737-72944837 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GACGACGTCGACCGTTTTGTTATGTGTGAGGAGGCTATACTGGTTACTGTCTAGAAAGGTTAGGATGAAA GAAAGGAATGCTAAGTTGTACCACGATACAATAAGAGAATGCACTTGCTAGGGTGGAGGAGTCTTCTTGC TATTTATTTGCAGGCTTCCTAGGGGCTGACCTCAAAGCAGGAGTCGATTTAAGGTCCCCGAATCGCAGAT GAGAGGTGAAATGGGAGAGAGCGCTCTGTAGAGAAAGGATGAGGCGCAGTGACATGAGAGTAAGAGAGGC AAGAAGAGGATGTCATTATGGGAATGGTGGTTTGCAAAGTTAGATTACAATTAACAATAACTTTCCAGAC TGTGTAGGAGAGAAAGAATACGCAAGAGAACTGATGTTGTGCACCCCAGATCCACTGATCATAAAGAAAA GGAAACACATCTTCAGTTCTCCATGGAGGTCACTTGTTTCCCGGGTCCTTCCTCCACATCTAGATGACCA CACAGGGTGCAAGCAATGTAGATGCGATGTACACTATAATAATGAAACGAACGCAAAGGAAAACTCACTA AGTGCTTACTCTAGGCCAGGCACTGAGCAAAGCAACTTCAGGTAGATGATCTGAAGAGGAAGCTGCAGAG GCAGCCGCTGGACAGAAATGCCTACGCTCTTAGGAGCCTTCTCCACAGGAGAGAAGGAGGGATACGAAGA TAATCCAGAATGATCGGATTCATCACAACAACAGGTAACAGTTATTAAGCGCTTACACTGGGCCTGGCTT TTAGGCTTATGGTCTCTTTCAAGCCTCACATGAGCAGCCCCACCTCTGGGAGCAGCGCCCCCGCATCCCT CAGGCTGTAGCCTGCGGTACTGTTTTCTGCCAGAAGAGGCACTGCGGGGCGGCGCCCGCCCATTCCCACA GCTCCGGGAAGACCCGGGCGGCGGAGGCTTAGCCCCCTCCCCTCCCGCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCC TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTGCTCCTCCTCCTCCTGCTCCTCCTCCTCCTCCT CCTCCTCCTCCTCCTTCTCCTCCTCCTCCCGGTCTGAGGGCGGCGGTCTCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| DMRTC1_1 ↗ | X:72,943,774 | 負股 | 72,943,764–72,943,823 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSRX_845WF4 · enhancer · 72942387–72942583 · regulatory
ENSRX_BJGT6 · enhancer · 72942953–72943826 · regulatory
ENSRX_933XPH · promoter · 72943827–72944281 · regulatory
· motif · 72942094–72942105 · motif
· motif · 72944001–72944014 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:192 aa
DMRTC1 是 DMRT 家族成員,蛋白質長 192 個胺基酸。序列註解指出,第 142–176 位胺基酸區段為無序區;此區域註解依據為計算預測。
蛋白質三維結構
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
CTCCTCCTCCTCCTCCTGCTCCTCCTCCTCCTGCTCCTCC40TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTCTCCTCCTCCTCCC80GGTCTGAGGGCGGCGGTCTCCGACTCAAGACCCTGGGGCT120CCGGGTCTTCTTAGCAGCCGCCGCAGCAGCCGCGGCGACG160TCACTGTCCTCTCGGCCTGGCACACAGCGCTCCGGCCGCC200GAATGCCCGTGGACGCGCATCTCTTCCCAGAGTTCCTGCT240TCCTGGGCCAGCCAAAGCCGCAGAGAACGCCTCAGGGTCT280TGCCTGCTGTGAGTGCCTTGAAGAGGGAGCAGCGGGCACG320ATCAAAGAGACACCTGGCTCAAGGACCAATAAGGAGTATG360GCTGCCCCTCCCAAAGCTCCCATCCGTGTCAGGAATTTGA400CCATCAGAGCAGGAGCCCTCACTGGGAAGGAGAACAACAT440GCTGCAGCCCGAGACCCACATCTTCACAGCCCCCGAGGAG480GGGAGCTCCCAAGGGGCTCTGCTGCTTGGCCAGGCCCCAG520AACCTTTGTCTCTGCCCTGTACTCCAGTGACCTTGGAGCA560GCAACTGGTTTCTCCTTCTGGGGATCCCCACAGGGCCCCT600GCCCTGCCCAGCATATGCTCAACTCTGATCCTCCAGCCCT640GTGCCACCCTTGACCCTCTTCTACTGCAGCCACAGGTCCC680CAAAGTCTCTGACCAGGCTTTGGTTTCTGCCCACTCAGAG720TGGCAGCGGAAGCTGGAGGCCGCTGAGGCTCTGCTGACTC760TGAGAAACTCTGCCCAGGCCCCTCCTGACTCCATCTCCCT800GCACCAGCCTTGCAACCCACCAGCTCCTGCTGGAGATAAA840GGATTCCAGCCTCCCAGCCCCTCTCTCCGCCCCAGGCCAG880CCAGCTCCATCTCGCTGCCTATTGGACATCTGGGATGCAT920CTCCCTCTTGAGCTAGGAACCCAGAGGAGGAGGCCTCAAT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。