基因總覽
DMRT3(doublesex and mab-3 related transcription factor 3)是蛋白質編碼基因,產物屬於 DMRT 家族,為轉錄因子。其蛋白質含有 DM DNA 結合區域及 DMA 結構域,並具有數段被註記為無序的區域。這些特徵構成其分子辨識與調控相關的基本架構;來源將其主要生物學角色描述為參與脊髓神經迴路與性發育相關的轉錄調節。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000190165 ★ | 976,655–991,732 | 2 |
| ENST00000905222 | 976,373–991,746 | 3 |
| ENST00001135901 | 976,649–991,746 | 2 |
| ENST00000417254 | 989,837–990,333 | 1 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
DMRT3 被描述為可能的轉錄因子,參與脊髓中控制步態的神經迴路配置。在脊髓特定神經元亞群中,它與神經元特化有關;這類細胞層級的發展作用,可能進一步支持協調肢體運動的神經網路形成。來源指出其功能與脊椎動物的步態控制及肢體動作協調相關,但未提供更細的分子調控步驟或特定神經元亞群名稱,因此不宜延伸解讀為已確立的單一路徑或直接因果機制。
此外,DMRT3 可能在性發育期間調節轉錄。此項描述帶有「By similarity」的證據限定,表示這是依相似性推論的功能註解,並非在此來源中直接確認的性發育作用。來源也未進一步說明受調控的基因、組織或發育階段,因此只能概括為可能參與該期間的轉錄調節。
Promoter 與基因調控
>DMRT3 ENST00000190165 GRCh38 chr9:975655-976755 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCATCTTGTGAAGGACCCTCTCCCCCAAGACATCTATGACTGGGGTCTATGGGTTAAGGAGGTGAAAAAG TGGCCCCATCCCATATCCATAACTGAATCACAGAATCCGTGGGGATTTGAACTGAGTGGCTGGCGCAAGA CCTCCGTTTGCTTCCAGTAGCTGCTGGGAGCGAGGGAAGAGGATATCGGTAACTTTGGGGGCGCCAATGT GGCTTCTGTGTCTGCCCCTTGAAAGTTTATACCCGGCGCTTAACAAATCCTTTACAGGAGCACGTACGTC CCTGACCTTTCAGGATACTGTTTTATATTAAAACATGGACAGGAGGGTAGAAAAGTAAAATTCGCCTGCA AAATGGCTTGTCATCCTTGGGCCGGCAGATCTCCAAAACCATTTTCTTCTAAAGCAACAAAAGAGAAAAA AATACGTTCTAAAAGGAAATTACGAAAAGAGCCTAACTTTCCTAAACCAACATCACTTCACTCCCCTATC CTAAACTCCACCCAGGTCCGGGGTGCAACCGCAACACTCCCGTAGGTTCGAGTTCTCCCGGAGCTGAGCT TCTGCGGCCAAATGTCGGGATAAAAGCGGCCTTGGGCTCGGAAAAACGCGGCCAGATCTGGACTGGAGGG AGGAGAAGAGAGAGAAGCGGAGCGGCCACCTCACTCGCTTACAGGCACCCCCACCCTCACTCCCGCTGGT CCTCCCCTTCTCCGCCCCGCGAGCACCGCCGCGTTCTGGAGCGCCGCAGTCTCCAGCCGCGGGCTGGGGT AGCGGAGAGGGCTTGGAGGAGGGGGCCGCGAGCGCCCCCGCGAGAGTGGCCTGGCTGCAGGTGGCAAGGA AGGTGAAGTGCAGGCACCCGAGGGGCGCAAAGGAGGAGGAAGGCGTGGGGCGGGGAGTGCAAGGAGACAG GGACCCCAGGGGCGGGGGTGGCGGTGGGAAGGAGGAGGGGTTGGGGGAGGGCGGCGGAGGTGTTGGGTCC GGCCGGCTCACGAGGGAGCTGCAGAAGAGCTGGCTCAGACCTTAATCAGAGCTGTCGCCGGCTCCTTGCA GCCGCCGCAGCGCCTCCGCGAAGGAGGACGTGCCGACCCGGCTGCGCGCCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR9_C4LB · enhancer · 971442–973107 · regulatory
ENSR9_9DFR · enhancer · 973585–974093 · regulatory
ENSR9_B784 · enhancer · 974714–975500 · regulatory
ENSR9_9DGJ · promoter · 976165–976665 · regulatory
ENSR9_587J8 · CTCF_binding_site · 977012–977033 · regulatory
ENSR9_587KJ · CTCF_binding_site · 977292–977313 · regulatory
ENSR9_9DJ3 · enhancer · 981593–981915 · regulatory
· motif · 977014–977030 · motif
· motif · 977294–977310 · motif
· motif · 980733–980747 · motif
· motif · 980740–980751 · motif
· motif · 981256–981269 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:472 aa
DMRT3 蛋白長 472 個胺基酸,屬於 DMRT family。其 DM DNA 結合區域位於第 29–76 位胺基酸,DMA 結構域位於第 249–284 位。第 89–128、155–191 與 430–472 位胺基酸區段被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
DMRT3 蛋白定位於細胞核。 來源未提供定位改變的條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 78 個夥伴
- AKAP8LQ9ULX6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ASPGQ86U10 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATN1Q86V38 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATP6V0D1P61421 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
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- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
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- FHL5Q5TD97 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FOXN1O15353 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
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- GPSM1Q86YR5-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
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- HSF2BPO75031 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- INCA1Q0VD86 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- KHDRBS3O75525 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KPRPQ5T749 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- KRT31Q15323 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- KRT34O76011 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT35Q92764 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT36O76013-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT38O76015 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT40Q6A162 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- KRTAP1-1Q07627 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP1-3Q8IUG1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
DMRT3 可能形成同源二聚體;此註記指向同種蛋白質彼此組成二聚體的可能性,來源未提供其他結合夥伴或更詳細的複合體資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | DMRT3 是可能的轉錄因子,參與脊椎動物中控制步態的脊髓神經迴路配置;它與脊髓特定神經元亞群的神經元特化,以及協調肢體運動的神經網路發育有關。此外,蛋白質可能在性發育期間調節轉錄,這項功能註記依相似性推論。 | 推論支持 | 證據與來源Probable transcription factor that plays a role in configuring the spinal circuits controlling stride in vertebrates. Involved in neuronal specification within specific subdivision of spinal cord neurons and in the development of a coordinated locomotor network controlling limb movements. May regulate transcription during sexual development (By similarity) |
| 交互作用 | DMRT3 可能與另一個 DMRT3 分子形成同源二聚體;來源以可能性描述此關係,未提供其他互作夥伴或複合體組成資訊。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | DMRT3 蛋白定位於細胞核。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GCAGAAGAGCTGGCTCAGACCTTAATCAGAGCTGTCGCCG40GCTCCTTGCAGCCGCCGCAGCGCCTCCGCGAAGGAGGACG80TGCCGACCCGGCTGCGCGCCCAAGGCAGAGGCCCGCGTCG120GCGTTGGCTGGGCGTGAGCTGGGAGGCCGAGCTGTGAGCG160CGAAGGGAGCTGGAGAGACGACTGCGGCACCTCCGGCCGC200CCCGGAGCACACACGACCACCGGGGCTGCGGGACCAAGGG240CCGCGTCGCCCGGAGGCCGCCCCTGAGCGGGCCTCGCAGC280CCCGCCGTCCAGCGCTCCCTGGCCCTCTCCCGCAGCCAGG320CTGCCAACTCATTCGGGAGCCCGGGGCATGAACGGCTACG360GCTCCCCCTACCTGTACATGGGCGGCCCGGTGTCGCAGCC400GCCACGGGCGCCCCTGCAGCGCACGCCCAAGTGCGCGCGC440TGCCGCAACCATGGCGTCCTGTCCTGGCTCAAGGGCCACA480AGCGTTACTGCCGCTTCAAGGACTGCACCTGCGAGAAGTG520CATCCTCATCATCGAGCGGCAGCGGGTCATGGCTGCGCAG560GTGGCGCTGCGCCGGCAGCAGGCCAACGAGAGCTTGGAGA600GCCTCATCCCCGACTCGCTGCGCGCTCTGCCAGGGCCCCC640GCCGCCGGGGGACGCCGTCGCCGCCCCGCAGCCGCCGCCA680GCCTCTCAGCCGTCGCAGCCGCAGCCGCCGCGCCCTGCTG720CCGAGTTGGCCGCGGCCGCCGCGCTGCGTTGGACTGCCGA760GCCGCAGCCCGGGGCTCTGCAGGCGCAGCTCGCCAAGCCA800GATTTGACTGAAGAACGACTTGGAGACGGCAAGTCGGCAG840ACAATACAGAGGTCTTCAGTGACAAAGACACTGACCAGAG880GAGTTCCCCAGATGTGGCAAAGAGTAAGGGCTGCTTCACC920CCTGAGAGCCCTGAGATAGTGTCCGTGGAGGAAGGGGGAT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。