基因總覽
DLEU2(deleted in lymphocytic leukemia 2)屬於非編碼 RNA 基因座,而非蛋白質編碼基因。此基因座具有兩類相關產物:它是 microRNA 的宿主基因,也會產生經可變剪接形成的長鏈非編碼 RNA。來源未提供這些 RNA 的長度、序列或各異構型的完整資訊,因此無法進一步描述其結構差異。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000621282 ★ | 49,982,552–50,125,541 | 14 |
| ENST00000665220 | 49,956,669–49,979,183 | 2 |
| ENST00000651713 | 49,956,733–50,044,768 | 7 |
| ENST00000661799 | 49,956,825–49,979,448 | 3 |
| ENST00000668133 | 49,974,773–49,979,546 | 2 |
| ENST00000658343 | 49,975,947–49,997,136 | 3 |
| ENST00000732550 | 49,976,082–49,997,414 | 3 |
| ENST00000732551 | 49,976,098–49,996,717 | 3 |
| ENST00000732559 | 49,990,500–49,997,491 | 4 |
| ENST00000732461 | 49,991,274–50,125,416 | 8 |
| ENST00000732471 | 49,991,274–50,081,991 | 8 |
| ENST00000732472 | 49,991,274–50,081,588 | 8 |
顯示 12/128 個RNA轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
DLEU2 基因座與細胞增殖及細胞週期進程有關,但不同轉錄產物呈現的作用方向並不一致。研究觀察到,該基因組區域在白血病中可能發生缺失或表觀遺傳抑制,並據此將其與細胞增殖的負向調節關聯起來;這些描述指出的是相關性與調節作用,並未在來源中限定其適用的白血病類型或提供更完整的實驗條件。
另一方面,DLEU2 基因座產生的一種替代轉錄本則被發現可促進細胞週期進展。來源指出,此作用涉及 angiotensin I converting enzyme 2 與 cyclin D1,但沒有進一步說明該轉錄本如何作用於這兩者,也未提供其分子步驟或作用條件。因此,不宜將此替代轉錄本的結果概括為所有 DLEU2 轉錄產物的共同功能。
這些結果顯示,理解 DLEU2 的功能需要區分基因座層級的缺失或表觀遺傳抑制,以及特定替代轉錄本的作用。前者與較低的細胞增殖相關,後者則與細胞週期進展增加相關;來源未提供足夠資訊來判定兩者之間的關係,也未說明 microRNA 宿主功能是否參與上述效應。
Promoter 與基因調控
>DLEU2 ENST00000621282 GRCh38 chr13:50125441-50126541 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTGTAAGGCCTTCCTCTGGTGTTTACCGCCCTCCTTGTTTACATGAAGCTCAGGAACAGCGGCTTTAGGC CGGTAGGGAGCTCAGTTTCATTTCAAGGGTATGGCAAGGCCTATCATTTCGTCATAAGGCTTTGAAGGAA AGTTCGTCTGTTTTTGTCTCACATCTAACTTCCAGTAACTTCTCAAAAACTATATTCTTCCAACTGTAGC TCCGGTCTGCAAACTCCCTTCTCCCTAGCTGTCCGGGAAGGGGGACTCGAGCTCGCGCAACGCCCCGCTG CACCTGCGGAGGAGGGAGAGCGTCTGGGTGCGCCATGGAACGCCCGCACCGCGCTTCCCGCGCTCCGCCC GCCTGCCCGCGAACGGCTGCGAGCCACCCCCGCATCCCTCACACCTCTGCCCTCCCCAGTCGTGCGCGGG AGAGGGGGCTAGCACCGCAATGCCTGGAAGAGCGGCCGCGCGAGGGGCCTGGGGACAGGACAGCCTCCCG GCTCCGAGGCGAGGCCCGAATGCGCGCACACTCGGCGAGCGGGGCGGCGACTGGGGAGCCGGAGACGAGA GAGGGCGGAAGTGCGGGACGCCCCGCAGCACTCCCACAGGTCGCGGAGCCCGAGATCCTCGTCGGGTGGC GAGGGCGTGGGTGCCCACGCTATGCGTGACGCCTGAGCCGCGGCCCGAGCCCACGAGCTGGGTGAGGCCG CTGCCGCCGCCGCCGCCACGAAGCCTGGCGGGCGGCGCGGAGCCCCGGGGAGCTGGTTTTCCCGGGCGGG CACGTGACGGGGTTGGCAGCGTTCGGGCCCCGGCTGGGAGGGGGAAGAAGCGGGGAGCAGAAGGCCGCGG GCGGGCGGCTGGCGCGCTGTGTACTTAGGTCGTGTGCTGGGGCTTTTCTCTCCCAGGAGCCGGCGGGGGG AGGGGAGGGGGAGGGGCCACCGCTCCGCCTTCTCCTTTTCGCAATGTTGACGCAATCTATAAATAGTGGA ACAAAAGGACCAACTTCCTCGGAGCTTTGCTGAAACTGCACAAAAAATCGAGCCGGGGGGTTCCCTGGTC CCCGGCGATGGGGCGGGGAGCGCTGCGCCGGGGGAGGGGGCGGGCGCGGCG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| DLEU2_2 ↗ | 13:50,081,994 | 負股 | 50,081,984–50,082,043 |
| DLEU2_1 ↗ | 13:50,125,541 | 負股 | 50,125,531–50,125,590 |
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR13_BCXKJ · enhancer · 50122388–50122951 · regulatory
ENSR13_C6Z9S · enhancer · 50123134–50124185 · regulatory
ENSR13_9PW6L · promoter · 50124186–50124686 · regulatory
ENSR13_5FRBNX · CTCF_binding_site · 50124288–50124309 · regulatory
ENSR13_5FRBRD · CTCF_binding_site · 50124814–50124835 · regulatory
ENSR13_5FRBSR · CTCF_binding_site · 50125124–50125145 · regulatory
ENSR13_9PW6Z · promoter · 50125531–50125865 · regulatory
ENSR13_5FRBZP · CTCF_binding_site · 50125971–50125992 · regulatory
· motif · 50123150–50123164 · motif
· motif · 50123150–50123165 · motif
· motif · 50123150–50123165 · motif
· motif · 50123907–50123918 · motif
· motif · 50123929–50123937 · motif
· motif · 50123985–50123998 · motif
· motif · 50123985–50123998 · motif
· motif · 50124205–50124218 · motif
· motif · 50124211–50124224 · motif
· motif · 50124214–50124227 · motif
· motif · 50124214–50124227 · motif
· motif · 50124270–50124283 · motif
· motif · 50124290–50124306 · motif
· motif · 50124293–50124306 · motif
· motif · 50124395–50124408 · motif
· motif · 50124461–50124472 · motif
· motif · 50124463–50124472 · motif
· motif · 50124493–50124506 · motif
· motif · 50124493–50124506 · motif
· motif · 50124520–50124533 · motif
· motif · 50124611–50124624 · motif
· motif · 50124617–50124630 · motif
· motif · 50124678–50124691 · motif
· motif · 50124803–50124816 · motif
· motif · 50124816–50124832 · motif
· motif · 50125126–50125142 · motif
· motif · 50125521–50125535 · motif
· motif · 50125521–50125535 · motif
· motif · 50125764–50125773 · motif
· motif · 50125764–50125773 · motif
· motif · 50125823–50125836 · motif
· motif · 50125826–50125839 · motif
· motif · 50125889–50125902 · motif
· motif · 50125897–50125910 · motif
· motif · 50125903–50125916 · motif
· motif · 50125969–50125978 · motif
· motif · 50125969–50125980 · motif
· motif · 50125969–50125980 · motif
· motif · 50125973–50125989 · motif
· motif · 50126156–50126169 · motif
· motif · 50126199–50126216 · motif
· motif · 50128842–50128859 · motif
· motif · 50129074–50129086 · motif
· motif · 50129561–50129574 · motif
· motif · 50129561–50129574 · motif
RNA 轉錄本與序列
DLEU2 依 HGNC/Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000621282 ★ | lncRNA | 3,068 nt | 14 |
| ENST00000665220 | lncRNA | 3,078 nt | 2 |
| ENST00000651713 | lncRNA | 1,333 nt | 7 |
| ENST00000661799 | lncRNA | 1,579 nt | 3 |
| ENST00000668133 | lncRNA | 3,166 nt | 2 |
| ENST00000658343 | lncRNA | 740 nt | 3 |
| ENST00000732550 | lncRNA | 807 nt | 3 |
| ENST00000732551 | lncRNA | 719 nt | 3 |
| ENST00000732559 | lncRNA | 1,155 nt | 4 |
| ENST00000732461 | lncRNA | 1,187 nt | 8 |
| ENST00000732471 | lncRNA | 993 nt | 8 |
| ENST00000732472 | lncRNA | 1,447 nt | 8 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | DLEU2 基因座可作為 microRNA 宿主基因,也會產生長鏈可變剪接非編碼 RNA。該基因組區域在白血病中曾被觀察到缺失或受到表觀遺傳抑制,並被認為與細胞增殖的負向調節有關;但此基因座的另一種替代轉錄本則被發現可透過 angiotensin I converting enzyme 2 與 cyclin D1 促進細胞週期進展。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源This locus represents a microRNA host gene and also produces long alternatively spliced non-coding RNAs. This genome region was observed to be deleted or epigenetically suppressed in leukemia, and was implicated as a negative regulator of cell proliferation. However, an alternative transcript produced at this locus was also found to promote progression through the cell cycle via angiotensin I converting enzyme 2 and cyclin D1. |
DNA 與 RNA 序列
GGAGCTTTGCTGAAACTGCACAAAAAATCGAGCCGGGGGG40TTCCCTGGTCCCCGGCGATGGGGCGGGGAGCGCTGCGCCG80GGGGAGGGGGCGGGCGCGGCGGCGCGGGCCCCGCCGAGGG120GGGACACCTGGCTGAGGCACAGCTGCCGCCGTGCCTTTCC160GCGCGAGCCCAGAGCTCCGATCCCTGCGCGGGCTCGAGAG200CTCGCCCCGAACGGGGGTCTTCCTCCTCCGCCGTTGACAG240GTTTTGACCTGTAGCAGAGAACCAATTCTGGAGAACAGCC280TCACTTCTTTGATTGAATACTTACATAATGCATTGGAACA320TGACATGAGATTAAGCTGGGAGCAGAGGCTGGGAGATCGA360TGCTGCTTGTCAGCTGTTGTGCAGAATAACATCAATATGC400AATAATGGTGGCCAAAGGAGCCTGCACCCATCCGTTTTTA440CAAACCCAGTGTATAAAGCCAAATGTCCCATTTAAAGTTT480GACATTTGCAATAGCATTCTATTTAAAAGGTTTAATAATG520ATAGAATGAAGACCACAATAAAAGAGACCTCTACTTAGCT560CAGCAATTCTTACCTTTCTTACCTATTTGATGAAGATGTC600TTTTGAAAGGTGTACTGCAAGGAACAAAATGTTTGTAAAT640TCTCCTTTTACCAAGGTTTCTTTTTTAATTGATGCCAAAG680AGTTCCAATATTGAACATCTTAAGTCTGTTACTTGGATTA720CGGATTGAGTTTGGAGCTTACTCAGAGGACTACAGGAGAG760TATCCAGGAAGTGGATAATTACTGTACCTTCCTCATGGAA800AAAGTTTTATTTAAAGTGTTATTTCTCATTGAATACTATC840AAAAAGGAAAAAAAAATGACCTAAACTTTTGAGATAGATT880TGGCTCTAGTAAGTATTTAGGCCTACTCTAGGTGCGGTAC920TTCACTATAGTTTATAAAAGATGGTCCCTGTCAGCAAAGA960cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。