基因總覽
DEXI 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 Dexi homolog。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 16p13.13。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000331808 ★ | 10,928,891–10,942,468 | 2 |
| ENST00000469379 | 10,928,891–10,942,468 | 3 |
| ENST00000570440 | 10,936,607–10,942,460 | 1 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>DEXI ENST00000331808 GRCh38 chr16:10942368-10943468 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGGATAAGAGTGGAGAGTTAATGGTTTGTCCTGTAATTCATATAGAGTGGGGCAAGACAAAGTCATGGAG CAAAAAAGAACAGGATCTGGCCTCCAAAGAAACACACCCAGGCTCAGAAATGTAGGATCCCTGGGCTCGT ATTTTTCATCTGTAAAAAGTACGCACATACATACTACACTGCCTTGTATACCTCCGATTAAGCGATGCAT GTAAAATACTCAGCTCAGTGTGGCCTGAGATTTAAAGGTTTCTTGAACTGCTTTGGAAGGCTCTTTGGGC GAGATCATGTTTTCCTGAAAGACATGCAACGGTTACCCAAGAGCAGGGGAACCAGTGGGTGGGAGAGACT CACTTTTCTGTGTACTTCACGGTTGTTTGAATGTTTAGCCATGTGTATTATTGCTTTTAAACATGATTCA CAAAGTAAAAAGAAACAAAAAGCATCCTTATGGTTGAAGATCTGAACTACCTCGGAATCTCTTTATTCAG GTGTTCCTTAACTCTAGGATGCAGGTTCCGTAGTGGGCGGACCTTCCAGCAACCAGAGTTTGGAGAAGCG AAGGGGACACTGGTGGATCTCCACCATGAAAATTGGCGCTTTGGGAATGTCCAAAATTTCCAGGGCAACC GTCCGTCGCCCCTCCCCGACCCCGCCTCCTTTTAAAGGAGAAACGGAGTCCCAAAGAGGCATGCAGCAAG GTGCAGCGGTAGCCCGGGTTTCCTTCGGCTTTTGCGGCCTTAGCATTATGTCTAGGTTTGAACTGTGTTC AGTCTCTTTTACCTCCCCCTATTCGATACGCAGAGCGAATTCGATTTGAGATCTGAGGGCAGACCCGAAC CAGGAAAGCAACTCAGACGCTAGGGCCCCGAGGGGCGGAGCGAAGCGGTACCCGCCCCCTGGCGGCCGGA GCCAATCAGCGCGGGCGTTGAGCCGGCCAATTAGCGCGTGCAGGGGGCGGCCTGCCAATGAGCTCGGGGC CCCTCGGGAGGCGGAGCTCCGAGCGCCACCGGGAGGGCTACGCGGCGGCCGCAGCCATGGGTGCTGGGCC TGCGGGGGCGCGGGGGGTGCGCGAGGACCTGCGGGGCGGGGCGGGAGAGAA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| DEXI_1 ↗ | 16:10,942,468 | 負股 | 10,942,458–10,942,517 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR16_B46LD · enhancer · 10937123–10937730 · regulatory
ENSR16_B46LK · enhancer · 10938233–10939147 · regulatory
ENSR16_B46M5 · promoter · 10942121–10942958 · regulatory
ENSR16_54KH9J · CTCF_binding_site · 10942449–10942470 · regulatory
ENSR16_54KHB3 · CTCF_binding_site · 10942560–10942581 · regulatory
ENSR16_B46MD · promoter · 10944049–10944591 · regulatory
ENSR16_B46MH · enhancer · 10944592–10945560 · regulatory
ENSR16_54KHNP · CTCF_binding_site · 10944865–10944886 · regulatory
ENSR16_B46MN · enhancer · 10946160–10946701 · regulatory
ENSR16_8BNM9 · enhancer · 10947326–10947457 · regulatory
· motif · 10937757–10937770 · motif
· motif · 10937757–10937770 · motif
· motif · 10937920–10937935 · motif
· motif · 10938147–10938159 · motif
· motif · 10939065–10939078 · motif
· motif · 10939065–10939080 · motif
· motif · 10939065–10939080 · motif
· motif · 10939243–10939256 · motif
· motif · 10942407–10942420 · motif
· motif · 10942451–10942467 · motif
· motif · 10942562–10942578 · motif
· motif · 10942729–10942746 · motif
· motif · 10944047–10944060 · motif
· motif · 10944346–10944357 · motif
· motif · 10944359–10944376 · motif
· motif · 10944590–10944605 · motif
· motif · 10944867–10944883 · motif
· motif · 10944962–10944975 · motif
· motif · 10944968–10944975 · motif
· motif · 10944988–10945000 · motif
· motif · 10945135–10945150 · motif
· motif · 10945141–10945153 · motif
· motif · 10945143–10945150 · motif
· motif · 10945143–10945156 · motif
· motif · 10945995–10946006 · motif
· motif · 10946261–10946272 · motif
DEXI 的相關調控註記為受到 Dexamethasone 誘導。
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 10 個夥伴
- BMP10O95393 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KAT5Q92993 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO3Q8TAP4-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PEX16Q9Y5Y5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRKCAP17252 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SETDB1Q15047-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SGTBQ96EQ0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TTMPQ5BVD1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN1Q9UMX0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YWHAGP61981 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 調控 | DEXI 的調控註記指出其與 Dexamethasone 有關,但未提供誘導條件、實驗系統或表現變化的具體資訊。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GAGCGCCACCGGGAGGGCTACGCGGCGGCCGCAGCCATGG40GTGCTGGGCCTGCGGGGGCGCGGGGGGTGCGCGAGGACCT80GCGGGGCGGGGCGGGAGAGAAGGCTGCCGGGACCGGCCCT120AGACACTGAGCCGCGGTGGGATCCCCACCGGCTCTGCGAG160GCCCTGCGAGCGCCAGGGAGGCGCCACGAGGGAGCCGGGC200AGCCGCGGGCCACTTCAGGGGGGCCCGCCTCGCCGCCCGG240GCGGTCGAGAGATCCTTGGGGGCACATCTCGGGGTGCGGT280GACCCGCCCGGCGCATTTCGGGGGTCGGGGCGCAATTGCC320AGGGGACATCTGGAGCCCGGCCCTGCTTCTGTCGGGCTCC360AGGGTACCCCTGGATGGCTGCGCTGTGCCCTCGCCGGCCG400CCCGGGCGCCGCAGCGGCTGAGTTCGCCGGGATCGCCGGG440CCGCCGCCCTTGCCACCCGCTGCATGCTCGGCGCCCGGGT480CGCGGCCCACCTGGACGCACTGGGCCCCCTGGTCCCCTAC520GTGCCGCCGCCGCTGCTGCCCTCTATGTTCTACGTGGGCC560TGTTCTTCGTCAATGTGCTGATCCTGTACTACGCCTTCCT600CATGGAGTACATCGTCCTCAACGTGGGCCTCGTCTTCCTG640CCCGAGGACATGGACCAGGCGCTCGTGGACCTCGGCGTGC680TCTCCGACCCCGGCTCGGGCCTTTACGATGCTGACTCGGA720GCTCGACGTCTTTGATGCGTACTTGGAGTAGGGTCTCGAC760TGCTGTTCCCCTCTTCCCTACACGATCCGCAACCCATGCC800CTGGACCAGCCGCCCAGATCATGCCGCCGCAGCTGGTTGG840GGGCACCATCTGGACGGGGATGGTTCCCCAGGAGGAGACC880CTCCCCTGCCTCCGAGGCCTACCTGCTCCCCTCAAAAGCT920TCGTGCCAACAGAGAGGTTCCTGTTTGAACCCAGGAGAGT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。