基因總覽
DERL3（derlin 3）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 derlin 家族，為內質網膜上的多次穿膜蛋白。蛋白質全長 235 個胺基酸，具有四段跨膜螺旋；其拓樸結構包含朝向細胞質與內質網腔的區域，並有一段被註記為無序的末端區域。DERL3 的基本特性與其在內質網蛋白品質管制中的角色相連，來源資料指出它是內質網相關降解途徑的一個功能組成部分。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000318109 ★ | 23,834,503–23,839,006 | 7 |
| ENST00000404056 | 23,834,503–23,839,131 | 5 |
| ENST00000406855 | 23,834,503–23,839,131 | 7 |
| ENST00000993129 | 23,834,503–23,839,131 | 7 |
| ENST00001018274 | 23,834,503–23,839,131 | 7 |
| ENST00001018275 | 23,834,503–23,839,131 | 7 |
| ENST00001018276 | 23,834,503–23,839,131 | 5 |
| ENST00001066479 | 23,834,503–23,839,131 | 7 |
| ENST00001066480 | 23,834,503–23,839,131 | 7 |
| ENST00001066482 | 23,834,503–23,839,131 | 6 |
| ENST00001127251 | 23,834,503–23,839,131 | 6 |
| ENST00001134114 | 23,834,503–23,839,131 | 7 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
DERL3 是內質網相關降解（ERAD）的功能組成部分，參與處理錯誤摺疊的內質網腔內糖蛋白；來源明確區分，這項功能不包括錯誤摺疊的非糖蛋白。因此，DERL3 所涉的底物範圍具有特定限制，不能概括為處理所有錯誤摺疊蛋白。
DERL3 可能透過形成通道，協助錯誤摺疊的糖蛋白由內質網腔逆向轉運至細胞質。抵達細胞質後，這些蛋白質會被泛素化，並由蛋白酶體降解。來源以「可能」描述通道作用，故此機制應視為提出的功能模型，而非確定無疑的描述。
DERL3 也可能介導 VCP 與錯誤摺疊糖蛋白之間的互動。這項可能的連結與底物逆向轉運及後續處理相呼應，但來源並未進一步界定其分子步驟或作用條件，因此不宜延伸為更具體的機制主張。
此外，DERL3 可能參與內質網壓力誘發的預先品質管制。此機制會選擇性降低新合成蛋白質轉運進入內質網的程度，並將其改導至細胞質進行蛋白酶體降解。這與處理已位於內質網腔中的錯誤摺疊糖蛋白有所不同，著重於新生蛋白進入內質網之前的品質管制；DERL3 在此過程中的參與同樣以可能性表述。
Promoter 與基因調控
>DERL3 ENST00000318109 GRCh38 chr22:23838906-23840006 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGCAAAGTGACAAACTTTAGAGGTATCCCAGGTCACCCCACCTGGCACTGCGGACGCCCACGTGGCCCCA CCCCTCACTTGGCAATATTCTCATCAAGTGTCAGCACTAGCTTATTGTATTGACTGCCTCCTGGCTGGAC TCTAAGAGACAGTGTCTTTTATTGCATGCTACATCCCCAACATCTAGAACAGTGTCAGGCAAACAGTTGT TTAATAAACGGTGGAAGGAAGGAAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAAGGAGGGAAGGAAGGTGGGTAGGTTG GTTTCTATTTTCCACCAAAATATTGAGGACCTCTCCTGCCTGTCCACTTGCTCTGGTGCGCCTCTCAACC CTCGCGCCCCACCTGGACTCAATCCCGCAGTCCTGCCTCTCCTTCCTTGGGCCCCCGGGGAAGAACCCCG ACAGCGGCCGGCACATTTGAGTGGGGCCCTGGACGTTTGGGGAGGTTTGGACACATTCCCGAATGCCTCC CTGCTGTGGGTTAGGTGGGCCTGTCTTGGGCTGGCAGCGAGGACAACGTTGTGGCTAGGTCGTCAGTTAG TGAGCCAGCACGGTCTGAGCCGCCACACTCCGCGCCCCGCCCACGCGCCCCGCCCTTTCCAGTTTTGCCT CGCCTGCTCGGGTCTTCGCTCCTGTAACCCATACGATCTTAGCCCCGCCCCCGTGGTGTCGTGGGTCCAC GCTACTGGTCCTCTCCTAGAAAGCCGCGAAATGACCAGTTCCTCATTGGCCACACGTTCTCCCGCGCCAC CACCGCAGCCACAACAACCGCCACGTGCTCAACCTTGGCGCCTGCCCATTGGCCACCAGCCTCTACCCGC CCACTCTCCCTTTCCGCCCCTAATTTCCCTCTTCTTCCTTCCATTGGCTGTCGGGCTCAGGGGCTCTCTT TTCAGCCTGGGGCGCGCAGCGCCTCGGATGCGGATTGGCCGAAGGCGGGGCTGGGAGGCGGGTTAAAGAG CGCGTTGCTGGCTGGGCCACGCGTGCTTGAGAAGGTTCAATGGCGTGGCAGGGACTAGCGGCCGAGTTCC TGCAGGTGCCGGCGGTGACGCGGGCTTACACCGCAGCCTGTGTCCTCACCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| DERL3_1 ↗ | 22:23,839,004 | 負股 | 23,838,994–23,839,053 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR22_B6PPG · enhancer · 23835571–23836219 · regulatory
ENSR22_9CGG6 · enhancer · 23836338–23836819 · regulatory
ENSR22_57LDJB · CTCF_binding_site · 23838463–23838484 · regulatory
ENSR22_9CGGW · promoter · 23838996–23839402 · regulatory
ENSR22_B6PQ2 · enhancer · 23839403–23840037 · regulatory
ENSR22_B6PQD · enhancer · 23841886–23842479 · regulatory
· motif · 23838465–23838481 · motif
· motif · 23838591–23838604 · motif
· motif · 23838682–23838691 · motif
· motif · 23838715–23838724 · motif
· motif · 23838715–23838726 · motif
· motif · 23838715–23838726 · motif
· motif · 23838947–23838956 · motif
· motif · 23839033–23839043 · motif
· motif · 23839158–23839171 · motif
· motif · 23839163–23839173 · motif
· motif · 23839189–23839200 · motif
· motif · 23839208–23839217 · motif
· motif · 23839208–23839217 · motif
· motif · 23839214–23839231 · motif
· motif · 23839220–23839237 · motif
· motif · 23839223–23839240 · motif
· motif · 23839258–23839271 · motif
· motif · 23839320–23839333 · motif
· motif · 23839325–23839335 · motif
· motif · 23839390–23839400 · motif
· motif · 23839398–23839411 · motif
· motif · 23839403–23839413 · motif
· motif · 23839496–23839513 · motif
· motif · 23843353–23843365 · motif
· motif · 23843548–23843570 · motif
· motif · 23843548–23843570 · motif
內質網壓力下，DERL3 的表現會經由未摺疊蛋白反應（UPR）的 ERN1-XBP1 路徑上調。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：235 aa
DERL3 蛋白長 235 個胺基酸，屬於 derlin 家族。其序列註記有四段跨膜螺旋，並由細胞質側與內質網腔側的區域交錯構成拓樸；C 端第 216–235 位胺基酸區域被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
DERL3 位於內質網膜，為多次穿膜蛋白。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 15 個夥伴
- EHHADHQ08426 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GAD2Q05329 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GNLYP22749 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPR101Q96P66 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IL27RAQ6UWB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NDRG4Q9ULP0-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RTP4Q96DX8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SDCBPO00560 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SLC13A4Q9UKG4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- STATHP02808 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SYT16Q17RD7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TEX29Q8N6K0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM179BQ7Z7N9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM92Q6UXU6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ULBP2Q9BZM5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
DERL3 可與 DERL2 形成同源及異源寡聚體，與 DERL1 的寡聚作用程度較低。來源另記載 DERL3 與 VCP、EDEM1、SELENOK 及 SELENOS 有互作；在內質網壓力誘發的預先品質管制過程中，也與 signal recognition particle（SRP）及 SRP receptor 互作。這些互作紀錄不等同於所有分子均構成同一複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | DERL3 是內質網相關降解（ERAD）的功能組成部分，作用對象為錯誤摺疊的內質網腔內糖蛋白，而非錯誤摺疊的非糖蛋白。它可能形成通道，使糖蛋白逆向轉運至細胞質，之後經泛素化並由蛋白酶體降解；也可能介導 VCP 與底物互動，並參與內質網壓力誘發的預先品質管制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Functional component of endoplasmic reticulum-associated degradation (ERAD) for misfolded lumenal glycoproteins, but not that of misfolded nonglycoproteins. May act by forming a channel that allows the retrotranslocation of misfolded glycoproteins into the cytosol where they are ubiquitinated and degraded by the proteasome. May mediate the interaction between VCP and the misfolded glycoproteins. May be involved in endoplasmic reticulum stress-induced pre-emptive quality control, a mechanism that selectively attenuates the translocation of newly synthesized proteins into the endoplasmic reticulum and reroutes them to the cytosol for proteasomal degradation PMID 16449189 ↗ · PMID 22607976 ↗ · PMID 26565908 ↗ |
| 交互作用 | DERL3 可與 DERL2 形成同源及異源寡聚體，與 DERL1 的寡聚作用較少；另與 VCP、EDEM1、SELENOK 及 SELENOS 互作。在內質網壓力誘發的預先品質管制過程中，DERL3 也與 signal recognition particle（SRP）及 SRP receptor 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Forms homo- and heterooligomers with DERL2 and, to a lesser extent, with DERL1. Interacts with VCP and EDEM1. Interacts with SELENOK and SELENOS. Interacts with the signal recognition particle/SRP and the SRP receptor; in the process of endoplasmic reticulum stress-induced pre-emptive quality control PMID 16449189 ↗ · PMID 22016385 ↗ · PMID 26565908 ↗ |
| 細胞定位 | DERL3 是定位於內質網膜的多次穿膜蛋白。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | 內質網壓力會透過未摺疊蛋白反應（UPR）中的 ERN1-XBP1 路徑，使 DERL3 表現上調。 | 含實驗來源 | 證據與來源Up-regulated in response to endoplasmic reticulum stress via the ERN1-XBP1 pathway of the unfolded protein response (UPR) PMID 16449189 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCGTGCTTGAGAAGGTTCAATGGCGTGGCAGGGACTAGCG40GCCGAGTTCCTGCAGGTGCCGGCGGTGACGCGGGCTTACA80CCGCAGCCTGTGTCCTCACCACCGCCGCGGTGCAGCTGGA120GCTCCTCAGCCCCTTTCAACTCTACTTCAACCCGCACCTT160GTGTTCCGGAAGTTCCAGGTCTGGAGGCTCGTCACCAACT200TCCTCTTCTTCGGGCCCCTGGGATTCAGCTTCTTCTTCAA240CATGCTCTTCGTGTTCCGCTACTGCCGCATGCTGGAAGAG280GGCTCCTTCCGCGGCCGCACGGCCGACTTCGTCTTCATGT320TTCTCTTCGGGGGCGTCCTTATGACCCTGCTGGGACTCCT360GGGCAGCCTGTTCTTCCTGGGCCAGGCCCTCATGGCCATG400CTGGTGTACGTGTGGAGCCGCCGCAGCCCTCGGGTGAGGG440TCAACTTCTTCGGCCTGCTCACTTTCCAGGCACCGTTCCT480GCCTTGGGCGCTCATGGGCTTCTCGCTGCTGCTGGGCAAC520TCCATCCTCGTGGACCTGCTGGGGATTGCGGTGGGCCATA560TCTACTACTTCCTGGAGGACGTCTTCCCCAACCAGCCTGG600AGGCAAGAGGCTCCTGCAGACCCCTGGCTTCCTAAAGCTG640CTCCTGGATGCCCCTGCAGAAGACCCCAATTACCTGCCCC680TCCCTGAGGAACAGCCAGGACCCCATCTGCCACCCCCGCA720GCAGTGACCCCCACCCAGGGCCAGGCCTAAGAGGCTTCTG760GCAGCTTCCATCCTACCCATGACCCCTACTTGGGGCAGAA800AAAACCCATCCTAAAGGCTGGGCCCATGCAAGGGCCCACC840TGAATAAACAGAATGAGCTGCAGTCTCTTGGCCCACAGCA880CTGGCTTCCCCATCTCACCTGGCCACATCCTTCTATGCCT920GCCCCGTCCTCACTCAGTGTGGCCTCTCAGCCCAACTGCA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。