基因總覽
DDX24 的正式名稱為 DEAD-box helicase 24，屬於蛋白質編碼基因，其產物是 DEAD-box helicase family 的成員，並歸入 DDX24/MAK5 subfamily。這是一種 ATP 依賴性 RNA 解旋酶，蛋白質全長為 859 個胺基酸。序列中具有 Q motif、DEAD box、Helicase ATP-binding domain 與 Helicase C-terminal domain；另有數段被註記為無序區域。這些序列特徵構成其 RNA 解旋酶的基本分子架構。DDX24 與多種 RNA 代謝及細胞調節過程有關，以下功能說明聚焦於來源所述的具體作用。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000621632 ★ | 94,048,287–94,081,202 | 9 |
| ENST00000544005 | 94,048,287–94,081,202 | 8 |
| ENST00000555054 | 94,048,287–94,081,216 | 9 |
| ENST00000900312 | 94,048,287–94,081,216 | 9 |
| ENST00000900313 | 94,048,287–94,081,216 | 8 |
| ENST00000900314 | 94,048,287–94,081,216 | 9 |
| ENST00000900316 | 94,048,287–94,081,216 | 8 |
| ENST00000934361 | 94,048,287–94,081,216 | 9 |
| ENST00000946905 | 94,048,287–94,081,216 | 9 |
| ENST00000946906 | 94,048,287–94,080,592 | 9 |
| ENST00001135838 | 94,048,287–94,081,216 | 9 |
| ENST00000900315 | 94,050,921–94,081,216 | 9 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
DDX24 是 ATP 依賴性 RNA 解旋酶，參與多種 RNA 代謝過程，包括前驅 mRNA 剪接。來源將這些作用與細胞週期調節及先天免疫等生物過程相連結；其酵素反應為 ATP 水解，產生 ADP、磷酸與 H⁺。現有資料未進一步說明不同 RNA 代謝作用的分子步驟，因此不宜將其概括為特定底物或單一反應機制。
在 TP53 調控方面，DDX24 會抑制 TP53 的轉錄活性，並藉由抑制 EP300 介導的 TP53 乙醯化，降低 TP53 所控制的細胞生長停滯與細胞衰老。這指出 DDX24 可透過影響轉錄因子的修飾狀態，參與細胞生長相關調節。
DDX24 也會負向調節由細胞質 RNA 介導的先天免疫訊號；來源指出，此作用至少部分與影響 RIPK1 和 IRF7 的互作有關。另一方面，在 gammaherpesvirus 潛伏感染重新活化的情境中，DDX24 可辨識病毒轉錄本並具有抗病毒活性。這些描述呈現其在不同免疫或感染情境下的作用，不能簡化為單一方向的抗病毒功能。
在血管平滑肌細胞中，DDX24 被指出對細胞週期調節具有必要作用，並透過與 FANCA mRNA 互作及調節該 RNA 參與其中；此項敘述標示為相似性推定。微生物感染時，DDX24 另可促進 HIV-1 感染，方式包括促進 Rev 依賴的病毒 RNA 核輸出，以及將這些 RNA 包裝進病毒顆粒。這項作用描述的是感染情境中的病毒 RNA 處理，不應與其在其他病毒情境中所述的抗病毒活性混為一談。
Promoter 與基因調控
>DDX24 ENST00000621632 GRCh38 chr14:94081102-94082202 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCTGTAGCCGGTTTTATTTTCTATCCAAACCACTAAAATTTTCTCCAAATCAGCAATAAACTGTTTCGCT TTCATATCATTCATGTGTTCATTAGAGTAAAATGTTTAATTTCCTTCAGTAACTTTTCCTTTGCATTCAC AAACTGGCTAACTTTTTGGTGCAAACTTTCAGCCTAGCTTTCAGCCTATCTTGCCTTTTGACATCCCTTC CTCACTAAGCTTAACCATTTCTAGCTTTTGAGTTAAAGTGAGAGATGTGCGACTCTTTCTTTCACTTGAA CACTTAGAGGCCCATTGTAGGGTTATTAATTGACCTAATTTCAACACTGTTGTGTCTCAGGGAATAGAGA CCCAAGGAAAGGGAGAGAGAAGGAAGAACGGCCTGTCAGTGGATTAGTCTGAACACACACAACATTTATC AATTACGTTTGTATCTTATATGGGCACAGCTCATGGCGCCCCAAAACAATTACAATACAAGGAACACTCA TCACACGTCACCCTTGTAGCAGAGCACATCTCCCTATGATCTAGGTACGAGCATTGTACCTAGGATGGAC GCGTTCGTCCTCTTACCTTCGGGAACGCCCTACTCTGTCTACGGAGTAAAGTACTTAATAAACTTGCTTT TGCTTTGCTATGCGGACTCACCCTGAATTCTTTCCTGTGCAAGATCCAAGAACCCTCTCTTGGGGTCTGG ATCGAGACCCCTTTCCGGTAACGAAACTACACTAAGAATACAAGAAAACTTACGTTACTGTGCGGGAGCT GACAAAGTCTCTCGCCGGAGGGAGCACACAGAATTTCACCTTCTCCGGCCTTTTCCCAAGCTGGCAGGAG TAAAGCTGTAAGAGGAGGTGCCAGCGCCCCAAGCCAGCTCTCCCGCCGGCACTGCTGCGGTCCGCGAGGC AGCCAATCAGGTAGCTGAGTTTGCCATAGGGGCGGGACTTCCTCCCCAGCGCGCACGAGTACGTGCGTGG AGGTCCCGCCCCGGAACTGCAGTTGCTGCTGCAGCTGAGGTACAGCGGCGGTTTCTGAGGTTCTTCACTC GCGACTGACGGAGCTGCGGTGGCGTCTCCACACGGTGAGTACCAAAACGAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| DDX24_1 ↗ | 14:94,081,202 | 負股 | 94,081,192–94,081,251 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR14_CCC3K · enhancer · 94079737–94081191 · regulatory
ENSR14_5S5GS3 · CTCF_binding_site · 94080744–94080765 · regulatory
ENSR14_84QNH7 · promoter · 94081192–94081406 · regulatory
ENSR14_93DC8N · enhancer · 94081407–94081910 · regulatory
· motif · 94077643–94077665 · motif
· motif · 94079004–94079015 · motif
· motif · 94080486–94080499 · motif
· motif · 94080621–94080632 · motif
· motif · 94080622–94080637 · motif
· motif · 94080669–94080686 · motif
· motif · 94080746–94080762 · motif
· motif · 94081160–94081177 · motif
· motif · 94081204–94081213 · motif
· motif · 94081255–94081265 · motif
DDX24 的調控與 type I interferons 有關；來源未說明調控方向或具體機制。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：859 aa
DDX24 蛋白長 859 個胺基酸，屬於 DEAD box helicase family 的 DDX24/MAK5 subfamily。序列註記包含 Q motif（第 192–220 位）、Helicase ATP-binding domain（第 224–528 位）、DEAD box（第 471–474 位）及 Helicase C-terminal domain（第 578–723 位）。另有數段序列被標示為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
DDX24 被記錄位於細胞質與細胞核；來源未提供其定位改變的條件或不同異構型間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- CSNK2A1P68400 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
DDX24 與 FADD、NIP7、RIPK1 及 EP300 有互作記錄。DDX24 與 RIPK1 的互作會干擾 RLR 訊號對 IFN 依賴性轉錄因子 IRF7 的活化；與 EP300 的互作則會阻止 EP300 介導的 TP53 乙醯化。微生物感染情境下，DDX24 也與 HIV-1 的 Gag 和 Rev 蛋白互作。來源未將上述互作描述為同一複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | DDX24 是 ATP 依賴性 RNA 解旋酶，參與包括前驅 mRNA 剪接在內的 RNA 代謝，並與細胞週期調節及先天免疫相關。它會抑制 TP53 的轉錄活性及 EP300 介導的 TP53 乙醯化，進而抑制 TP53 控制的細胞生長停滯與細胞衰老；也會至少部分透過影響 RIPK1／IRF7 互作，負向調節細胞質 RNA 介導的先天免疫訊號。於 gammaherpesvirus 潛伏感染重新活化時，DDX24 可辨識病毒轉錄本並具有抗病毒活性；在血管平滑肌細胞調節細胞週期的作用則為相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源ATP-dependent RNA helicase that plays a role in various aspects of RNA metabolism including pre-mRNA splicing and is thereby involved in different biological processes such as cell cycle regulation or innate immunity. Plays an inhibitory role in TP53 transcriptional activity and subsequently in TP53 controlled cell growth arrest and senescence by inhibiting its EP300 mediated acetylation. Negatively regulates cytosolic RNA-mediated innate immune signaling at least in part by affecting RIPK1/IRF7 interactions. Alternatively, possesses antiviral activity by recognizing gammaherpesvirus transcripts in the context of lytic reactivation. Plays an essential role in cell cycle regulation in vascular smooth muscle cells by interacting with and regulating FANCA (Fanconi anemia complementation group A) mRNA (By similarity) PMID 24204270 ↗ · PMID 24980433 ↗ · PMID 25867071 ↗ · PMID 36298642 ↗ |
| 功能 | 在微生物感染情境中，DDX24 會促進 HIV-1 感染，方式包括促進 Rev 依賴的病毒 RNA 核輸出，以及使病毒 RNA 得以包裝進病毒顆粒。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Plays a positive role in HIV-1 infection by promoting Rev-dependent nuclear export of viral RNAs and their packaging into virus particles PMID 18289627 ↗ · PMID 24204270 ↗ |
| 分子活性 | ATP + H2O = ADP + phosphate + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | DDX24 與 FADD、RIPK1、NIP7 及 EP300 有互作記錄。DDX24 與 RIPK1 的互作會干擾 RLR 訊號活化 IFN 依賴性轉錄因子 IRF7；DDX24 與 EP300 的互作則會阻止 EP300 介導的 TP53 乙醯化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with FADD. Interacts with RIPK1; this interaction disrupts RLR signaling activation of IFN-dependent transcription factor IRF7. Interacts with NIP7. Interacts with EP300; this interaction prevents TP53 acetylation mediated by EP300 PMID 24204270 ↗ · PMID 24980433 ↗ · PMID 25867071 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中，DDX24 與 HIV-1 病毒蛋白 Gag 及 Rev 有互作記錄。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | DDX24 的細胞內定位記錄包括細胞質與細胞核。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | DDX24 與 type I interferons 的調控有關；這筆資料未指出調控方向或具體方式。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGTTGCTGCTGCAGCTGAGGTACAGCGGCGGTTTCTGAGG40TTCTTCACTCGCGACTGACGGAGCTGCGGTGGCGTCTCCA80CACGCAACCATGAAGTTGAAGGACACAAAATCAAGGCCAA120AGCAGTCAAGCTGTGGCAAATTTCAGACAAAGGGAATCAA160AGTTGTGGGAAAATGGAAGGAAGTGAAGATTGACCCAAAT200ATGTTTGCAGATGGACAGATGGATGACTTGGTGTGCTTTG240AGGAATTGACAGATTACCAGTTGGTCTCCCCTGCCAAGAA280TCCCTCCAGTCTCTTCTCAAAGGAAGCACCCAAGAGAAAG320GCACAAGCTGTTTCAGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAGGGAA360AGTCTAGCTCACCAAAGAAAAAGATCAAGTTGAAGAAAAG400TAAAAATGTAGCAACTGAAGGAACCAGTACCCAGAAAGAA440TTTGAAGTGAAAGATCCTGAGCTGGAGGCCCAGGGAGATG480ACATGGTTTGTGATGATCCGGAGGCTGGGGAGATGACATC520AGAAAACCTGGTCCAAACTGCTCCAAAAAAGAAGAAAAAT560AAAGGGAAAAAAGGGTTGGAGCCTTCTCAGAGCACTGCTG600CCAAGGTGCCCAAAAAAGCGAAGACATGGATTCCTGAAGT640TCATGATCAGAAAGCAGATGTGTCAGCTTGGAAGGACCTG680TTTGTTCCCAGGCCGGTTCTCCGAGCACTCAGCTTTCTAG720GCTTCTCTGCACCCACACCAATCCAAGCCCTGACCTTGGC760ACCTGCCATCCGTGACAAACTGGACATCCTTGGGGCTGCT800GAGACAGGAAGTGGGAAAACTCTTGCCTTTGCCATCCCAA840TGATTCATGCGGTGTTGCAGTGGCAGAAGAGGAATGCTGC880CCCTCCTCCAAGTAACACCGAAGCACCACCTGGAGAGACC920AGAACTGAGGCCGGAGCTGAGACTAGATCACCAGGCAAGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。