基因總覽
CYP4F11 的正式名稱為 cytochrome P450 family 4 subfamily F member 11，屬於蛋白質編碼基因，其產物歸入 cytochrome P450 家族。此蛋白質是單加氧酶，涉及多種內源性物質的代謝，來源列出的底物包括脂肪酸及其氧化衍生物 oxylipins，也包括維生素 K 的特定形式。它亦能代謝若干藥物與 dialkylresorcinol。蛋白質長 524 個胺基酸，序列中有一段螺旋型跨膜區域；資料將其描述為單次跨膜蛋白。這些基本特徵界定了 CYP4F11 的蛋白質家族、膜相關性質與廣泛的代謝角色；各類底物的反應方式與已知功能細節如下文所述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000402119 ★ | 15,912,377–15,934,529 | 12 |
| ENST00000326742 | 15,912,367–15,934,839 | 11 |
| ENST00000248041 | 15,912,367–15,934,867 | 13 |
| ENST00000620614 | 15,912,367–15,934,933 | 12 |
| ENST00000904116 | 15,912,367–15,934,933 | 13 |
| ENST00000904117 | 15,912,367–15,934,933 | 12 |
| ENST00000904118 | 15,912,367–15,934,841 | 13 |
| ENST00000904119 | 15,912,367–15,934,839 | 12 |
| ENST00000904120 | 15,912,367–15,934,933 | 13 |
| ENST00000904121 | 15,912,367–15,934,933 | 11 |
| ENST00000904122 | 15,912,367–15,934,841 | 13 |
| ENST00000904123 | 15,912,367–15,934,825 | 13 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CYP4F11 是 cytochrome P450 單加氧酶，參與脂肪酸及其氧化衍生物 oxylipins 等內源性底物的代謝。反應時使用分子氧，將其中一個氧原子引入底物，另一個氧原子則還原形成水；所需的兩個電子由 NADPH 經 cytochrome P450 reductase 傳遞。這類反應可在脂肪酸末端碳進行 omega-氧化，形成末端羥基產物。
CYP4F11 對 3-hydroxy fatty acids 的末端氧化效率高，底物例子包括 3-hydroxyhexadecanoic acid 與 3-hydroxyoctadecanoic acid。此反應可能參與長鏈 3-hydroxydicarboxylic acids 的生合成。它也能 omega-羥基化 phylloquinone（vitamin K1）及 menaquinone-4（MK-4，vitamin K2 的一種形式），並使這些物質失活；兩者均是血液凝固的輔因子。
此酵素亦可氧化其他脂肪酸，包括 dodecanoate、hexadecanoate、(9Z)-octadecenoate、arachidonate 與 docosahexaenoate，產物分別包括相應的羥基化脂肪酸。對 arachidonate 及其氧化代謝物 8-HETE 的代謝效率較低；此外，來源記載它可進一步氧化若干羥基化 eicosatetraenoate。這些反應與脂質代謝及 oxylipin 生合成相關。
除內源性脂質與維生素 K 形式外，CYP4F11 也催化 erythromycin、benzphetamine、ethylmorphine、chlorpromazine、imipramine 和 verapamil 等藥物的 N-及 O-去甲基化，並可氧化 dialkylresorcinol 2。這些底物反映其參與外來物質代謝的能力；來源未進一步說明其在個體中的生理或藥物反應影響。
Promoter 與基因調控
>CYP4F11 ENST00000402119 GRCh38 chr19:15934429-15935529 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTCAGCCTTACCTCCCATCTCCCCTCTCTGTCCTCCTATGCTGAACCTAGCCTCCAGGTATTCTCCTCCA GCGGGGCTCTTTATCTCTAAAATCTGACCGGGTAATCCCCAGCACAGTTAGATAGTTTGTTCCTACTCCT GTCAGTCATGTCTCGACCCAGGCCCTGGGTTGCCTGGAGGCAGGACTTGAACTCCTGCCAGACTGTGAAG CCAGAGGCCAGGAGCTTCTGTCTCTGAATCTCCTAAGTCTGCACTGAGAAATGGTGCATGATGAACTCCT GGACCACATGTGGAGAGGAGCTCAGAACATGATCTGGCACAATGGTTGGCCTGGCCCCACTCTCTTGCCA CCTGAACTCTCAAGTTCATGACTTTATCTGCCACACTCTTGCCTTGGAAGGGCAAGGTGGCTGTAAACTT TGGGGCTCAGAGTCACCTTTGACTCTTCCTCAAGATCCCCTCCCACTCAGGTGTGAGATGTTGAGACCTG CGGATCCTGTGCCCATGCTGTGTCACCCTGAGCTGGCTCCTCTGCACCCAGCTGGCCCTACGCCAGGTTT TGGTTGGTTGCCCAGGCTTGGAAGACACACCCAGTCCATGGGGATTGGCTCGACCAGCCCAGCCCAGCCT CGCCTCCCACAGCCTTCCGGAAATCAGGGGCCAGAGGCAAAGACCTCCTAGCAGAGGGGGAGAGGAGGGT ATGTGGGACAAGCTGCTTCTGATAGGAGCCAGGCTGGCAGTGGCAGGGCTGGAGGGTCCTGGCCTGGGAT GGGGAGGGGACTGCCCAAGGTTGGGGTGGGTCAAGGCTGCTGGCCTGGGAGACTGGTGATTTCCTGGTAA CTGGACCCCTGGCAACCTCCCAGTGATTCAGGCTGGGCCTTTTTGGATTCTAATCAGCCTCTCTCTCTCT TTCCCTTTCTGTGTAACTGGAGGCCACTTGGCTGCTGGTTTTCATTGGGCATTTCTGGACTTTAGATCTC AGCTCTTGTTTACCCATCTCAGAGCCTTCCCTGATCTGCCTCCAGCACTGCCCATCCTTGCCCCTTTCCA CTGTCCTTGGAGCTTCCTGGGCCCTTCCCTGGGCCTCAGGATCCCACCCTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CYP4F11_2 ↗ | 19:15,934,496 | 負股 | 15,934,486–15,934,545 |
| CYP4F11_1 ↗ | 19:15,934,867 | 負股 | 15,934,857–15,934,916 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_8GMJ3 · enhancer · 15933877–15934091 · regulatory
ENSR19_B56DD · promoter · 15934400–15935357 · regulatory
· motif · 15934551–15934566 · motif
· motif · 15934764–15934777 · motif
· motif · 15935084–15935097 · motif
· motif · 15935155–15935168 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：524 aa
CYP4F11 長 524 個胺基酸，屬於 cytochrome P450 家族。其序列第 15 至 37 位註解為螺旋型跨膜區域，與單次跨膜蛋白的描述一致。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CYP4F11 位於內質網膜及微粒體膜，並被註解為單次跨膜蛋白。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Microsome membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- MESDQ14696 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 22 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CYP4F11 是 cytochrome P450 單加氧酶，代謝脂肪酸及其氧化衍生物。它以 NADPH 經 cytochrome P450 reductase 取得電子，利用分子氧進行氧化；對 3-hydroxy fatty acids 的末端氧化效率高，可能參與長鏈 3-hydroxydicarboxylic acids 生合成。它也會使 phylloquinone 與 menaquinone-4 羥基化並失活，低效率代謝 arachidonate 和 8-HETE，並作用於部分藥物及 dialkylresorcinol。 | 含實驗來源 | 證據與來源A cytochrome P450 monooxygenase involved in the metabolism of various endogenous substrates, including fatty acids and their oxygenated derivatives (oxylipins). Mechanistically, uses molecular oxygen inserting one oxygen atom into a substrate, and reducing the second into a water molecule, with two electrons provided by NADPH via cytochrome P450 reductase (CPR; NADPH-ferrihemoprotein reductase). Catalyzes with high efficiency the oxidation of the terminal carbon (omega-oxidation) of 3-hydroxy fatty acids, such as 3-hydroxyhexadecanoic and 3-hydroxyoctadecanoic acids, likely participating in the biosynthesis of long-chain 3-hydroxydicarboxylic acids. Omega-hydroxylates and inactivates phylloquinone (vitamin K1), and menaquinone-4 (MK-4, a form of vitamin K2), both acting as cofactors in blood coagulation. Metabolizes with low efficiciency fatty acids, including (5Z,8Z,11Z,14Z)-eicosatetraenoic acid (arachidonate) and its oxygenated metabolite 8-hydroxyeicosatetraenoic acid (8-HETE). Catalyzes N- and O-demethylation of drugs such as erythromycin, benzphetamine, ethylmorphine, chlorpromazine, imipramine and verapamil. Catalyzes the oxidation of dialkylresorcinol 2 PMID 15364545 ↗ · PMID 18065749 ↗ · PMID 19932081 ↗ · PMID 24138531 ↗ · PMID 36565673 ↗ · PMID 37373382 ↗ |
| 分子活性 | an organic molecule + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = an alcohol + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源an organic molecule + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = an alcohol + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) PMID 15364545 ↗ · PMID 18065749 ↗ · PMID 19932081 ↗ · PMID 24138531 ↗ · PMID 37373382 ↗ |
| 分子活性 | an omega-methyl-long-chain fatty acid + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = an omega-hydroxy-long-chain fatty acid + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源an omega-methyl-long-chain fatty acid + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = an omega-hydroxy-long-chain fatty acid + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) PMID 15364545 ↗ · PMID 19932081 ↗ · PMID 37373382 ↗ |
| 分子活性 | dodecanoate + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 12-hydroxydodecanoate + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源dodecanoate + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 12-hydroxydodecanoate + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) PMID 18065749 ↗ |
| 分子活性 | hexadecanoate + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 16-hydroxyhexadecanoate + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源hexadecanoate + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 16-hydroxyhexadecanoate + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) PMID 19932081 ↗ · PMID 37373382 ↗ |
| 分子活性 | (9Z)-octadecenoate + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 18-hydroxy-(9Z)-octadecenoate + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源(9Z)-octadecenoate + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 18-hydroxy-(9Z)-octadecenoate + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) PMID 19932081 ↗ |
| 分子活性 | (5Z,8Z,11Z,14Z)-eicosatetraenoate + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 20-hydroxy-(5Z,8Z,11Z,14Z)-eicosatetraenoate + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源(5Z,8Z,11Z,14Z)-eicosatetraenoate + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 20-hydroxy-(5Z,8Z,11Z,14Z)-eicosatetraenoate + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) PMID 15364545 ↗ · PMID 37373382 ↗ |
| 分子活性 | (4Z,7Z,10Z,13Z,16Z,19Z)-docosahexaenoate + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 22-hydroxy-(4Z,7Z,10Z,13Z,16Z,19Z)-docosahexaenoate + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源(4Z,7Z,10Z,13Z,16Z,19Z)-docosahexaenoate + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 22-hydroxy-(4Z,7Z,10Z,13Z,16Z,19Z)-docosahexaenoate + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) PMID 19932081 ↗ |
| 分子活性 | 8-hydroxy-(5Z,9E,11Z,14Z)-eicosatetraenoate + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 8,20-dihydroxy-(5Z,9E,11Z,14Z)-eicosatetraenoate + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源8-hydroxy-(5Z,9E,11Z,14Z)-eicosatetraenoate + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 8,20-dihydroxy-(5Z,9E,11Z,14Z)-eicosatetraenoate + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) PMID 15364545 ↗ |
| 分子活性 | 3-hydroxyhexadecanoate + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 3,16-dihydroxyhexadecanoate + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源3-hydroxyhexadecanoate + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 3,16-dihydroxyhexadecanoate + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) PMID 18065749 ↗ · PMID 19932081 ↗ |
| 分子活性 | 3-hydroxyoctadecanoate + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 3,18-dihydroxyoctadecanoate + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源3-hydroxyoctadecanoate + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 3,18-dihydroxyoctadecanoate + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) PMID 18065749 ↗ |
| 分子活性 | phylloquinone + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = omega-hydroxyphylloquinone + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源phylloquinone + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = omega-hydroxyphylloquinone + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) PMID 24138531 ↗ |
| 分子活性 | menaquinone-4 + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = omega-hydroxymenaquinone-4 + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源menaquinone-4 + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = omega-hydroxymenaquinone-4 + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) PMID 24138531 ↗ |
| 分子活性 | 2-hexyl-5-pentylresorcinol + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 2-hexyl-5-(5-hydroxypentyl)resorcinol + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源2-hexyl-5-pentylresorcinol + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 2-hexyl-5-(5-hydroxypentyl)resorcinol + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) PMID 36565673 ↗ |
| 分子活性 | 2-hexyl-5-heptylresorcinol + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 2-hexyl-5-(7-hydroxyheptyl)resorcinol + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源2-hexyl-5-heptylresorcinol + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 2-hexyl-5-(7-hydroxyheptyl)resorcinol + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) PMID 36565673 ↗ |
| 分子活性 | 12-hydroxy-(5Z,8Z,10E,14Z)-eicosatetraenoate + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 12,20-dihydroxy-(5Z,8Z,10E,14Z)-eicosatetraenoate + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) | 推論支持 | 證據與來源12-hydroxy-(5Z,8Z,10E,14Z)-eicosatetraenoate + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 12,20-dihydroxy-(5Z,8Z,10E,14Z)-eicosatetraenoate + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) PMID 37373382 ↗ |
| 分子活性 | 15-hydroxy-(5Z,8Z,11Z,13E)-eicosatetraenoate + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 15,20-dihydroxy-(5Z,8Z,11Z,13E)-eicosatetraenoate + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) | 推論支持 | 證據與來源15-hydroxy-(5Z,8Z,11Z,13E)-eicosatetraenoate + reduced [NADPH--hemoprotein reductase] + O2 = 15,20-dihydroxy-(5Z,8Z,11Z,13E)-eicosatetraenoate + oxidized [NADPH--hemoprotein reductase] + H2O + H(+) PMID 37373382 ↗ |
| 分子活性 | 此功能分類將 CYP4F11 與脂質代謝及 arachidonate 代謝相連，指出其所涉及的代謝領域；這項分類本身未提供額外的反應條件、底物轉化細節或生理結果。 | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | 此功能分類將 CYP4F11 列入脂質代謝，並標示其與 oxylipin 生合成相關；分類內容未進一步說明特定底物、反應步驟或產物，也未提供其他實驗情境。 | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | 此功能分類指出 CYP4F11 涉及輔因子降解，並特別列出 phylloquinone 降解；分類本身未描述反應條件或其他結果。 | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | 此功能分類將 CYP4F11 與外來物質降解相連，但未列出特定底物、代謝反應或發生條件，也未說明相關生理結果。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | CYP4F11 被註解位於內質網膜及微粒體膜，並描述為單次跨膜蛋白。此定位資料未提供不同條件下的定位變化，亦未指出異構型間的差異。 | 含實驗來源 | 證據與來源Endoplasmic reticulum membrane / Single-pass membrane protein; Microsome membrane / Single-pass membrane protein PMID 18065749 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGAGCCTTCCCTGATCTGCCTCCAGCACTGCCCATCCTTG40CCCCTTTCCACTGTCCTTGGAGCTTCCTGGGCCCTTCCCT80GGGCCTCAGGATCCCACCCTCCATCCCGTCTGCCCTGCAG120GATGCCGCAGCTGAGCCTGTCCTGGCTGGGCCTCGGGCCC160GTGGCAGCATCCCCGTGGCTGCTTCTGCTGCTGGTTGGAG200GCTCCTGGCTCCTGGCCCGCGTCCTGGCCTGGACCTACAC240CTTCTATGACAACTGCCGCCGCCTCCAGTGTTTTCCTCAA280CCCCCGAAACAGAACTGGTTTTGGGGACACCAGGGCCTGG320TCACTCCCACGGAAGAGGGCATGAAGACATTGACCCAGCT360GGTGACCACATATCCCCAGGGCTTTAAGTTGTGGCTGGGT400CCTACCTTCCCCCTCCTCATTTTATGCCACCCTGACATTA440TCCGGCCTATCACCAGTGCCTCAGCTGCTGTCGCACCCAA480GGATATGATTTTCTATGGCTTCCTGAAGCCCTGGCTGGGG520GATGGGCTCCTGCTGAGTGGTGGTGACAAGTGGAGCCGCC560ACCGTCGGATGTTGACGCCTGCCTTCCATTTCAACATCTT600GAAGCCTTATATGAAGATTTTCAACAAGAGTGTGAACATC640ATGCACGACAAGTGGCAGCGCCTGGCCTCAGAGGGCAGCG680CCAGACTGGACATGTTTGAACACATCAGCCTCATGACCTT720GGACAGTCTGCAGAAATGTGTCTTCAGCTTTGAAAGCAAT760TGTCAGGAGAAGCCCAGTGAATATATTGCCGCCATCTTGG800AGCTCAGTGCCTTTGTAGAAAAGAGAAACCAGCAGATTCT840CTTGCACACGGACTTCCTGTATTATCTCACTCCTGATGGG880CAGCGCTTCCGCAGGGCCTGCCACCTGGTGCACGACTTCA920CAGATGCCGTCATCCAGGAGCGGCGCTGCACCCTCCCCAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。