基因總覽
CXCR5（C-X-C motif chemokine receptor 5）是由蛋白質編碼基因產生的細胞激素受體，屬於 G protein-coupled receptor 1 家族。它能結合 B-lymphocyte chemoattractant（BLC），並與 B 細胞在特定淋巴組織中的遷移相關。其蛋白質具有多次穿越細胞膜的結構；來源資料未提供更多可用於描述其分子構造或其他基本性質的資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000292174 ★ | 118,883,892–118,897,787 | 2 |
| ENST00001142082 | 118,883,868–118,897,787 | 2 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CXCR5 是可結合 B-lymphocyte chemoattractant（BLC）的細胞激素受體。來源指出，此受體與 B 細胞遷移至脾臟及 Peyer patches 的 B 細胞濾泡有關；這項遷移關聯具有組織差異，並未涵蓋腸繫膜或周邊淋巴結中的 B 細胞濾泡。因此，CXCR5 所涉及的 B 細胞移動並非在所列淋巴組織中一概相同。
來源也提出 CXCR5 可能在 Burkitt lymphoma（BL）的淋巴瘤生成調節及／或 B 細胞分化中具有調節功能。這是可能性的描述，並未限定其作用方向或具體分子機制；資料亦未進一步說明這些作用如何發生。就現有資訊而言，CXCR5 的功能關聯包括特定組織中的 B 細胞濾泡遷移，以及可能涉及 BL 淋巴瘤生成調節或 B 細胞分化。
Promoter 與基因調控
>CXCR5 ENST00000292174 GRCh38 chr11:118882892-118883992 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTTCAAGTCCCAGCTCTGCCACTGGTTAGCTGTGGGATCTCGGGTAAGTTGCTCTCCCTCTCGGCCTCAC GGACCTCCTGAATAAAAATTGAGGGTTAGACTGGATGATCTCTGAAGCCATCTCTAGCTTGGTAGTTTAT GAGGTTAATAATTTATGAGCAAACAAAGTTAATTTATAGATAGAACATCATTATTTTTGAGTCAGAAAAT GACTCTGTAACTATGTGCTTTTCTTGGTGATTTCACTTTTTTTTTTTCTTTTAGAGACATGGTCTTGCTA TGTTGCCCAGGCTGGTATCCAACTCCTGGCCTCAAGCCATCCTCCTGCCTCGGCCTTCCAAAGTTGATTT CATTTTTGTCTTCCAGTATTGTTTTACTGTTGTTCCCTTTGAAAAATTCTAACCTATCTTTTCTGAACTT GAGCTGAGAAGGGAAGGGGTTTTGCCTCTGTTGGGCAAAAGGATGGTGGCAAGTAGTGTGACCAAGTGCC CTAACTTGCCAGGACTTAGGGGTTTCCCAAGTCAAGGGACTTTTCAGTCCTTGGCAGACTGGAATGGTTG ATCACCCTAGTGGTGAGGAAAATGAAGGTTTGGAGGTGGCTTGGAGGAGAGGTTGCTGGGAGAGCTCTTC TCCTGTTCTCTGTTGATCAGGAGTTTCCCTCATCAACCTGCTGACTTTGCGTGGTGGTTTCATTACAAGT TGTGAGCCCCTTATTGGGGGTATAGGGAGGAGAAGTGAGGGCAGCCTTTAAACTAGTCATAGGCCCCAGT TGAGACAATTATTGCCGGGAAAGAAGCTGAAATGCTTGACTAGCACTGATGCTGTGGGGGATTTTCCCTC TTTCTTCAAAAAAACAGAAAAGACCCAGTGGAAAAAAAAAAAAAAGTGATGAGTTGTGAGGCAGGTCGCG GCCCTACTGCCTCAGGAGACGATGCGCAGCTCATTTGCTTAAATTTGCAGCTGACGGCTGCCACCTCTCT AGAGGCACCTGGCGGGGAGCCTCTCAACATAAGACAGTGACCAGTCTGGTGACTCACAGCCGGCACAGCC ATGAACTACCCGCTAACGCTGGAAATGGACCTCGAGAACCTGGAGGACCTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CXCR5_1 ↗ | 11:118,882,792 | 正股 | 118,882,743–118,882,802 |
| CXCR5_2 ↗ | 11:118,883,897 | 正股 | 118,883,848–118,883,907 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_85HD3T · enhancer · 118882590–118882826 · regulatory
ENSR11_93Q737 · promoter · 118883402–118883902 · regulatory
ENSR11_BTL35 · enhancer · 118886725–118887731 · regulatory
ENSR11_93Q74G · promoter · 118887732–118888232 · regulatory
· motif · 118882488–118882500 · motif
· motif · 118883672–118883683 · motif
· motif · 118883831–118883844 · motif
· motif · 118884090–118884112 · motif
· motif · 118884090–118884112 · motif
· motif · 118884428–118884441 · motif
· motif · 118884428–118884441 · motif
· motif · 118885080–118885095 · motif
· motif · 118885080–118885095 · motif
· motif · 118885081–118885095 · motif
· motif · 118886357–118886370 · motif
· motif · 118886816–118886828 · motif
· motif · 118886819–118886826 · motif
· motif · 118886922–118886934 · motif
· motif · 118886930–118886943 · motif
· motif · 118887012–118887025 · motif
· motif · 118887021–118887034 · motif
· motif · 118887021–118887034 · motif
· motif · 118887068–118887080 · motif
· motif · 118887070–118887083 · motif
· motif · 118887117–118887124 · motif
· motif · 118887117–118887130 · motif
· motif · 118887179–118887192 · motif
· motif · 118887179–118887192 · motif
· motif · 118887902–118887910 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：372 aa
CXCR5 蛋白質長 372 個胺基酸，屬於 G protein-coupled receptor 1 家族。序列註解顯示其具有七段螺旋型跨膜區，並由細胞外區段與細胞質區段交替連接；N 端位於細胞外，C 端較長的末端區段位於細胞質側。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CXCR5 位於細胞膜，並註記為多次穿膜蛋白。 現有定位資料未描述定位變化的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- CXCR4P61073 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GNA13Q14344 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- GNAI2P04899 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GNB3P16520 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GNG8Q9UK08 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RAMP2O60895 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- RAMP3O60896 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CXCR5 是可結合 B-lymphocyte chemoattractant（BLC）的細胞激素受體，與 B 細胞遷移至脾臟及 Peyer patches 的 B 細胞濾泡有關，但此關聯不包括腸繫膜或周邊淋巴結的濾泡。CXCR5 也可能參與 Burkitt lymphoma（BL）淋巴瘤生成的調節及／或 B 細胞分化。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Cytokine receptor that binds to B-lymphocyte chemoattractant (BLC). Involved in B-cell migration into B-cell follicles of spleen and Peyer patches but not into those of mesenteric or peripheral lymph nodes. May have a regulatory function in Burkitt lymphoma (BL) lymphomagenesis and/or B-cell differentiation |
| 細胞定位 | CXCR5 是位於細胞膜的多次穿膜蛋白。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
CTCTCAACATAAGACAGTGACCAGTCTGGTGACTCACAGC40CGGCACAGCCATGAACTACCCGCTAACGCTGGAAATGGAC80CTCGAGAACCTGGAGGACCTGTTCTGGGAACTGGACAGAT120TGGACAACTATAACGACACCTCCCTGGTGGAAAATCATCT160CTGCCCTGCCACAGAGGGGCCCCTCATGGCCTCCTTCAAG200GCCGTGTTCGTGCCCGTGGCCTACAGCCTCATCTTCCTCC240TGGGCGTGATCGGCAACGTCCTGGTGCTGGTGATCCTGGA280GCGGCACCGGCAGACACGCAGTTCCACGGAGACCTTCCTG320TTCCACCTGGCCGTGGCCGACCTCCTGCTGGTCTTCATCT360TGCCCTTTGCCGTGGCCGAGGGCTCTGTGGGCTGGGTCCT400GGGGACCTTCCTCTGCAAAACTGTGATTGCCCTGCACAAA440GTCAACTTCTACTGCAGCAGCCTGCTCCTGGCCTGCATCG480CCGTGGACCGCTACCTGGCCATTGTCCACGCCGTCCATGC520CTACCGCCACCGCCGCCTCCTCTCCATCCACATCACCTGT560GGGACCATCTGGCTGGTGGGCTTCCTCCTTGCCTTGCCAG600AGATTCTCTTCGCCAAAGTCAGCCAAGGCCATCACAACAA640CTCCCTGCCACGTTGCACCTTCTCCCAAGAGAACCAAGCA680GAAACGCATGCCTGGTTCACCTCCCGATTCCTCTACCATG720TGGCGGGATTCCTGCTGCCCATGCTGGTGATGGGCTGGTG760CTACGTGGGGGTAGTGCACAGGTTGCGCCAGGCCCAGCGG800CGCCCTCAGCGGCAGAAGGCAGTCAGGGTGGCCATCCTGG840TGACAAGCATCTTCTTCCTCTGCTGGTCACCCTACCACAT880CGTCATCTTCCTGGACACCCTGGCGAGGCTGAAGGCCGTG920GACAATACCTGCAAGCTGAATGGCTCTCTCCCCGTGGCCA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。