基因總覽
CXCL6 的正式名稱為 C-X-C motif chemokine ligand 6，屬於蛋白質編碼基因，其產物歸於 intercrine alpha（chemokine CxC）家族。此蛋白質全長 114 個胺基酸，序列 N 端第 1 至 37 個胺基酸註記為訊號肽。這些資料界定了 CXCL6 的家族歸屬與基本序列特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000226317 ★ | 73,836,678–73,838,760 | 4 |
| ENST00000515050 | 73,836,622–73,837,406 | 3 |
| ENST00001134958 | 73,836,622–73,838,760 | 4 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CXCL6 可吸引嗜中性粒細胞，並透過結合及活化受體 CXCR1 與 CXCR2 傳遞訊號。其趨化作用與這些受體的活化相關，來源亦指出 CXCL6 具有血管生成特性，但未提供其作用機制的進一步細節。
除了趨化與血管生成相關特性，CXCL6 對革蘭氏陽性菌及革蘭氏陰性菌具有強抗菌活性。來源指出，與 CXCL5 及 CXCL7 相比，CXCL6 的抗菌活性高 90 倍；此比較適用於所述抗菌活性，並不代表其他功能也有相同差異。
Promoter 與基因調控
>CXCL6 ENST00000226317 GRCh38 chr4:73835678-73836778 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTGGTTCCATATGAACTTTCAAGTAGTTTTTTCCAATTCTGTGAAGAAAGTCATTGGTAGCTTGATGGGG ATGGTATTGAATCTATAAGTTACCTTGGGCAGTATGGCCATATTCACGATATTGATTTTTCCTACCCATG AGCATGGAATATTCTTCCATTTGTTTGTATCCTCTTTTATTTCATTGAGCAGTGGTTTGTAGTTCTCCTT GAAGAGGTCCTTCATGTCCCTTGTAAGTTGGATTCCTAGGTATTTTATTCTCTTTGAAGCAATTGTGAAT GGGAGTTCACTCATGATTTGGCTCTCTGTTTGTTTGTTATTGGTGTATAAGAATGCTTGTGATTTTTGTG CATTGATTTTGTATCCTGAGACTTTGCTGAAGTTGCTTATCAGCTTAAGGAGATTTTGGGCTGAGACCAT GTCTCTGTTTGTTTGTTATTGGTGTATAAGAATGCTTGTGATTTTTGTGCATTGATTTTGTATCCTGAGA CTTTGCTGAAGTTGCTTATCAGCTTAAGGAGATTTTGGGCTGAGACCATGGGGTTTTCTAGATATACAAT TATGTAATTTGCAAATAGGGACAATTTGACTTCCTCTTTTCCTAATTGAATACCCTTTATTTCCTTCTCC TGCCTAATTGTCCTGGCCATTGGAGAGGAGGAGCATCTCCCAGACAGCTGCGTGCCTCAGAGAAGCCAGC CTCGCTAACCCCTCAAGCCCAGGGGATGAGACCCTGCTGAATCGCTGCTCTATTTTGGCTGGAGCCACAG CTCCCTCCACCGCGGGGCGGGGCTAAAATGTCCTCCCCCTTAAGGGAGCAGGCAGCTCCTCCCAGCCACC CACCCCACCAATTCCCATCCTCCCGCCCCCCTCCACCAACCCCTTCTTTCCACACTGCCCCCTGAGTTCA GGGAATTTCCCCAGCATCCCAAAGCTTGAGTTTCCTGCCAGTCGGGAGGGATGAATGCAGATAAAGGGAG TGCAGAAGGCACGAGGAAACCAAAGTGCTCTGTATCCTCCAGTCTCCGCGCCTCCACCCAGCTCAGGAAC CCGCGAACCCTCTCTTGACCACTATGAGCCTCCCGTCCAGCCGCGCGGCCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CXCL6_1 ↗ | 4:73,836,679 | 正股 | 73,836,630–73,836,689 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR4_846LGP · enhancer · 73831631–73831885 · regulatory
ENSR4_BJMLS · enhancer · 73832506–73833085 · regulatory
ENSR4_934B9P · promoter · 73836340–73836688 · regulatory
ENSR4_934B9W · promoter · 73836967–73837260 · regulatory
ENSR4_846LNG · enhancer · 73841622–73841764 · regulatory
· motif · 73832830–73832844 · motif
· motif · 73832892–73832906 · motif
· motif · 73832892–73832906 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：114 aa
CXCL6 是 114 個胺基酸的蛋白質，屬於 intercrine alpha（chemokine CxC）家族。其第 1 至 37 個胺基酸區段註記為訊號肽。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CXCL6 被註記為分泌型蛋白質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- CCL5P13501 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL12P48061 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PF4P02776 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CXCL6 可吸引嗜中性粒細胞，並藉由結合及活化 CXCR1 與 CXCR2 傳遞訊號。除趨化作用外，它也具有血管生成特性，且對革蘭氏陽性菌與革蘭氏陰性菌有強抗菌活性；此抗菌活性相較 CXCL5 與 CXCL7 高 90 倍。 | 含實驗來源 | 證據與來源Chemotactic for neutrophil granulocytes. Signals through binding and activation of its receptors (CXCR1 and CXCR2). In addition to its chemotactic and angiogenic properties, it has strong antibacterial activity against Gram-positive and Gram-negative bacteria (90-fold-higher when compared to CXCL5 and CXCL7) PMID 18443119 ↗ · PMID 8399143 ↗ · PMID 8423327 ↗ · PMID 9057843 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
CAAAGTGCTCTGTATCCTCCAGTCTCCGCGCCTCCACCCA40GCTCAGGAACCCGCGAACCCTCTCTTGACCACTATGAGCC80TCCCGTCCAGCCGCGCGGCCCGTGTCCCGGGTCCTTCGGG120CTCCTTGTGCGCGCTGCTCGCGCTGCTGCTCCTGCTGACG160CCGCCGGGGCCCCTCGCCAGCGCTGGTCCTGTCTCTGCTG200TGCTGACAGAGCTGCGTTGCACTTGTTTACGCGTTACGCT240GAGAGTAAACCCCAAAACGATTGGTAAACTGCAGGTGTTC280CCCGCAGGCCCGCAGTGCTCCAAGGTGGAAGTGGTAGCCT320CCCTGAAGAACGGGAAGCAAGTTTGTCTGGACCCGGAAGC360CCCTTTTCTAAAGAAAGTCATCCAGAAAATTTTGGACAGT400GGAAACAAGAAAAACTGAGTAACAAAAAAGACCATGCATC440ATAAAATTGCCCAGTCTTCAGCGGAGCAGTTTTCTGGAGA480TCCCTGGACCCAGTAAGAATAAGAAGGAAGGGTTGGTTTT520TTTCCATTTTCTACATGGATTCCCTACTTTGAAGAGTGTG560GGGGAAAGCCTACGCTTCTCCCTGAAGTTTACAGCTCAGC600TAATGAAGTACTAATATAGTATTTCCACTATTTACTGTTA640TTTTACCTGATAAGTTATTGAACCCTTTGGCAATTGACCA680TATTGTGAGCAAAGAATCACTGGTTATTAGTCTTTCAATG720AATATTGAATTGAAGATAACTATTGTATTTCTATCATACA760TTCCTTAAAGTCTTACCGAAAAGGCTGTGGATTTCGTATG800GAAATAATGTTTTATTAGTGTGCTGTTGAGGGAGGTATCC840TGTTGTTCTTACTCACTCTTCTCATAAAATAGGAAATATT880TTAGTTCTGTTTCTTGGGGAATATGTTACTCTTTACCCTA920GGATGCTATTTAAGTTGTACTGTATTAGAACACTGGGTGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。