基因總覽
CXCL5 的正式名稱為 C-X-C motif chemokine ligand 5，是一種蛋白質編碼基因，其產物屬於 intercrine alpha（chemokine CxC）家族。來源將此蛋白質描述為與嗜中性球活化相關；體外資料也顯示特定形式具有嗜中性球趨化活性。其蛋白質序列長 114 個胺基酸，並具有位於第 1 至第 36 位胺基酸的訊號區段。來源資料指出 CXCL5 可分泌至細胞外，也記載其可呈單體或同源二聚體形式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000296027 ★ | 73,995,642–73,998,677 | 4 |
| ENST00001141535 | 73,995,642–73,998,687 | 4 |
| ENST00001085533 | 73,995,643–73,998,687 | 4 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CXCL5 與嗜中性球活化有關。來源提供的功能資料指出，在體外測試中，ENA-78(8-78) 與 ENA-78(9-78) 對嗜中性球的趨化活性，較 ENA-78(1-78) 高三倍。這項結果限定於體外條件，說明不同形式的 ENA-78 在該測試中的趨化活性有所差異；來源未進一步說明其在體內的作用或造成差異的分子機制。
Promoter 與基因調控
>CXCL5 ENST00000296027 GRCh38 chr4:73998577-73999677 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCTTTCACATGAGCCCTTCAAACTCATCAGCCTCCCACAGCATCTCCAAATGGTGTCAAATACATATCTG GGGCTGGGAACAGAGCTGGGGCAGGCCTGGGATCCCTGGCAAGCTTTAGCCTGCGCTCACCATACTACAC CTCACCCCCAACAAGACCAAAACCTCTTCCAATTCAATAGCATAGCAACTGCCAATAGCAAGGTATCTTC CATGGCAATTTGCTGGGTGATTTTGGAAGATTTTTGTTTAACTACCTGGACACACGTATACTTGCTATAT ACTACAAGTACAGAATTCTCAGTAAGCGGACTTACCAAAGTAGGTGATCTGTAGGGGAGTTAACAAAATT CAGTGGTCCTTTCAGGCCACTGACTTCAAGTGGCAAGAGACAAGGGTCTCTTGTTATCATGTTATCTTGG CTTCCAAAGCTGGTTGAAGTCCAGAGATTCATAAAGTCATTCAAGAAACCTAGAATGACCTGCCTGCAAG GAAGACAGGAAGGACTTTCAGTTTATAGCAATTCAAACATGAATAACATTTCCTGATTAATAGTAATAAT AATTAGAAAGGATTGACTTTCAGAAATTTTTCTCAAATCAAGGCTCCTGTTACTTTGGTTCCACCTTTTC TCTCTAGAAGGAGAGGAGGAGCATCTCCCAGAGGGCTGCGTGCCTCAGAAAAGCCGGCATCCCTAGCCCG CTCTGGCACAGGCCATGAGGCCCTGCTGAATCCTGCTGAATAGCTACTCCCTTCTAGCTGGAGCCACAGC TCCCTCCACCGCGGAGCAGGGTTACAACGTCCCTCTCGGTAGAGGTGCACGCAGCTCCTCCTGGCCACCC TCCCCACCAGTTCCCATTGTCTGGCCCCCCTCCCCCAACCTCTTCTTTCCACACTGCCCCATGAGTTCAG GGAATTTCCCCAGCATCCCAAAGCTTGAGTTTCCTGTCAGTGGGGAGAGATGAGTGTAGATAAAAGGAGT GCAGAAGGCACGAGGAAGCCACAGTGCTCCGGATCCTCCAATCTTCGCTCCTCCAATCTCCGCTCCTCCA CCCAGTTCAGGAACCCGCGACCGCTCGCAGCGCTCTCTTGACCACTATGAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CXCL5_1 ↗ | 4:73,998,677 | 負股 | 73,998,667–73,998,726 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR4_934D2N · promoter · 73998667–73998954 · regulatory
ENSR4_76CH4Z · enhancer · 73998955–73999057 · regulatory
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：114 aa
CXCL5 蛋白質長 114 個胺基酸，屬於 intercrine alpha（chemokine CxC）家族。序列註解將第 1 至第 36 位胺基酸標示為訊號區段。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源將 CXCL5 註記為分泌型蛋白質，未提供更具體的細胞內位置或定位變化條件。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- ACTN3Q08043 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ALPPP05187 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EFEMP2O95967 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FBLN1P23142-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRNP28799 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MEOX2Q6FHY5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VWC2LB2RUY7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
來源記載 CXCL5 可呈單體，也可形成同源二聚體；未提供其他結合夥伴或複合體資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CXCL5 與嗜中性球活化有關；在體外測試中，ENA-78(8-78) 與 ENA-78(9-78) 對嗜中性球的趨化活性，較 ENA-78(1-78) 高三倍。 | 含實驗來源 | 證據與來源Involved in neutrophil activation. In vitro, ENA-78(8-78) and ENA-78(9-78) show a threefold higher chemotactic activity for neutrophil granulocytes PMID 10095777 ↗ |
| 交互作用 | Monomer. Homodimer | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ACAGTGCTCCGGATCCTCCAATCTTCGCTCCTCCAATCTC40CGCTCCTCCACCCAGTTCAGGAACCCGCGACCGCTCGCAG80CGCTCTCTTGACCACTATGAGCCTCCTGTCCAGCCGCGCG120GCCCGTGTCCCCGGTCCTTCGAGCTCCTTGTGCGCGCTGT160TGGTGCTGCTGCTGCTGCTGACGCAGCCAGGGCCCATCGC200CAGCGCTGGTCCTGCCGCTGCTGTGTTGAGAGAGCTGCGT240TGCGTTTGTTTACAGACCACGCAAGGAGTTCATCCCAAAA280TGATCAGTAATCTGCAAGTGTTCGCCATAGGCCCACAGTG320CTCCAAGGTGGAAGTGGTAGCCTCCCTGAAGAACGGGAAG360GAAATTTGTCTTGATCCAGAAGCCCCTTTTCTAAAGAAAG400TCATCCAGAAAATTTTGGACGGTGGAAACAAGGAAAACTG440ATTAAGAGAAATGAGCACGCATGGAAAAGTTTCCCAGTCT480TCAGCAGAGAAGTTTTCTGGAGGTCTCTGAACCCAGGGAA520GACAAGAAGGAAAGATTTTGTTGTTGTTTGTTTATTTGTT560TTTCCAGTAGTTAGCTTTCTTCCTGGATTCCTCACTTTGA600AGAGTGTGAGGAAAACCTATGTTTGCCGCTTAAGCTTTCA640GCTCAGCTAATGAAGTGTTTAGCATAGTACCTCTGCTATT680TGCTGTTATTTTATCTGCTATGCTATTGAAGTTTTGGCAA720TTGACTATAGTGTGAGCCAGGAATCACTGGCTGTTAATCT760TTCAAAGTGTCTTGAATTGTAGGTGACTATTATATTTCCA800AGAAATATTCCTTAAGATATTAACTGAGAAGGCTGTGGAT840TTAATGTGGAAATGATGTTTCATAAGAATTCTGTTGATGG880AAATACACTGTTATCTTCACTTTTATAAGAAATAGGAAAT920ATTTTAATGTTTCTTGGGGAATATGTTAGAGAATTTCCTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。