演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CXCL14BRAK

C-X-C motif chemokine ligand 14

CXCL14(C-X-C motif chemokine ligand 14)是 intercrine alpha(chemokine CxC)家族的分泌型趨化因子,對嗜中性球具有強趨化作用,對樹突細胞的作用較弱。

Homo sapiens5q31.1UniProt O95715
OFFICIAL SYMBOL
CXCL14
CHROMOSOME
5
UNIPROT
O95715
PDB / ALPHAFOLD
2HDL
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CXCL14 的正式名稱為 C-X-C motif chemokine ligand 14,屬於 protein-coding 基因,產物歸於 intercrine alpha(chemokine CxC)家族。其蛋白質長 111 個胺基酸,序列包含位於第 1 至 34 位的訊號區,以及第 67 至 81 位的 D-box motif。來源將此蛋白質描述為分泌型趨化因子;其主要細胞趨化特性與功能範圍另見功能說明。

Official symbol
CXCL14
Gene name
C-X-C motif chemokine ligand 14
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10640
UniProt
O95715
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
BRAKNJACbolekineKecMIP-2gBMACKS1SCYB14

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 55q31.1
chr5 · 181,538,259 bp · GRCh38chr5p15.33 · 1–4400000 · gnegchr5p15.32 · 4400001–6300000 · gpos25chr5p15.31 · 6300001–9900000 · gnegchr5p15.2 · 9900001–15000000 · gpos50chr5p15.1 · 15000001–18400000 · gnegchr5p14.3 · 18400001–23300000 · gpos100chr5p14.2 · 23300001–24600000 · gnegchr5p14.1 · 24600001–28900000 · gpos100chr5p13.3 · 28900001–33800000 · gnegchr5p13.2 · 33800001–38400000 · gpos25chr5p13.1 · 38400001–42500000 · gnegchr5p12 · 42500001–46100000 · gpos50chr5p11 · 46100001–48800000 · acenchr5q11.1 · 48800001–51400000 · acenchr5q11.2 · 51400001–59600000 · gnegchr5q12.1 · 59600001–63600000 · gpos75chr5q12.2 · 63600001–63900000 · gnegchr5q12.3 · 63900001–67400000 · gpos75chr5q13.1 · 67400001–69100000 · gnegchr5q13.2 · 69100001–74000000 · gpos50chr5q13.3 · 74000001–77600000 · gnegchr5q14.1 · 77600001–82100000 · gpos50chr5q14.2 · 82100001–83500000 · gnegchr5q14.3 · 83500001–93000000 · gpos100chr5q15 · 93000001–98900000 · gnegchr5q21.1 · 98900001–103400000 · gpos100chr5q21.2 · 103400001–105100000 · gnegchr5q21.3 · 105100001–110200000 · gpos100chr5q22.1 · 110200001–112200000 · gnegchr5q22.2 · 112200001–113800000 · gpos50chr5q22.3 · 113800001–115900000 · gnegchr5q23.1 · 115900001–122100000 · gpos100chr5q23.2 · 122100001–127900000 · gnegchr5q23.3 · 127900001–131200000 · gpos100chr5q31.1 · 131200001–136900000 · gnegchr5q31.2 · 136900001–140100000 · gpos25chr5q31.3 · 140100001–145100000 · gnegchr5q32 · 145100001–150400000 · gpos75chr5q33.1 · 150400001–153300000 · gnegchr5q33.2 · 153300001–156300000 · gpos50chr5q33.3 · 156300001–160500000 · gnegchr5q34 · 160500001–169000000 · gpos100chr5q35.1 · 169000001–173300000 · gnegchr5q35.2 · 173300001–177100000 · gpos25chr5q35.3 · 177100001–181538259 · gnegCXCL14pq1 bp181,538,259 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr5:135,570,679–135,579,580
Gene span
8,902 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000512158 ★135,570,679–135,578,9914
ENST00000337225135,570,679–135,579,5804
ENST00000867030135,570,679–135,579,5803
ENST00001139203135,570,679–135,579,5804
ENST00001106331135,574,137–135,579,5804

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CXCL14 對嗜中性球具有強烈的趨化作用,可促使這類細胞朝其訊號方向移動;對樹突細胞也有趨化作用,但效力較弱。這些結果顯示,其所述的趨化效應並非對所有免疫細胞一概相同,對不同細胞類型的反應有所區別。

在測試的細胞中,CXCL14 對 T 細胞、B 細胞、單核球、自然殺手細胞與粒細胞不具趨化作用。來源將嗜中性球與粒細胞分別列出,因此應保留這項區別;資料也沒有支持將其趨化效應擴大解讀為普遍吸引各類白血球。

此外,在骨髓系祖細胞的集落形成分析中,CXCL14 不會抑制這些祖細胞的增殖。此結果限定於該項分析所測量的增殖抑制效應,並不等同於對其他細胞反應或其他生物學過程的判定。綜合來源所述,CXCL14 的已知功能重點是對特定細胞的趨化選擇性,以及在該集落形成分析中未見對骨髓系祖細胞增殖的抑制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 135578991 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CXCL14 ENST00000512158 GRCh38 chr5:135578891-135579991 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CACAGCCACCCTATCAGAAACACTGTGATGATCTGCACTTTACAGATGATGAAACAAAAGCTGAGAGCGG
TAAAGTCACTTGTGCTGGAAAGTAGTGAGGAGGGAATTTCTGCCACTATGGCTGGGCTCACACCACTATA
CCTCGCATTCTGGCACAATGTCTAGAACATGGGAAGGCCTTCATCCAGATGGTTACCACTGTCATCGCTC
TCCACTAGGGCTCTCTACCTGGCTTTGGAGAGTAGTGTGAGAGTGAGGACTCCTCCTGGTTCTCCCCACC
ACCCAGACACTCACACAGCCACCAGGCCACTGACCCACTTTAAGGAGCTTTCCTTTGGGAGTCACCAAAA
CTCCTCCCCAATACCCGTCCCCACCCCCGCATACACACACATACCCTCTTTGAGTCAGTTCCAGTGATCA
CAGTCAATGACTTTGCTGCTGGACAGTCTATGACAAGCCCCTGTCCAGAACTGGCCTTGTGTTCTGGCCC
AGCAGGGGCCCTTGGGGGTCAGGCCTGCAGGCACTCACACTTGGCACCTGCTCCAAAACCCTTTCAGGTC
TTTGAGGATCTGAGCCCTGGGCCTGGGTCTCCCGCCGGCTCGGAAAAGCTGGCCTGCCGGGCCAGAGAGA
GAACCACACGATTCAGAAAAGCAGTGCCCTTCAGCAGCCTCTCCACCGTCTGGGCTCCCCAAAGGCAGAG
CGGGACGCTGGAAATGTGTGCGCGCTGTGGTATGGGTGTGCAAGTGTGCGAAGGCGGCGTGTTGTGTGAG
CGAGAGGGTAGCGGATGTGTGTGTGCGTGTGCGCGCGTGGCTCCGGGTGTGCGCCGCTGCGATAGCGGGT
CCTTTCCCGGGGCGGGCGACGGGCGGGCTGGGAAGGTCTCCTCCCCTCACCACATTGAGAAATCTCAGTG
AGTCACCGAGTGGTTCTGCATATTAATGAGCTCGCTCGCTGCGAGGGCAGGAGCGGATTTAAAAGAGGCC
AGGGCGGGCGGAGGGAGGCTGTGGAGAGAGCGCGGAGACAAGCGCAGAGCGCAGCGCACGGCCACAGACA
GCCCTGGGCATCCACCGACGGCGCAGCCGGAGCCAGCAGAGCCGGAAGGCG
CXCL14 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CXCL14_1 ↗5:135,578,991負股135,578,981–135,579,040

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR5_93ZRX8 · enhancer · 135576148–135576452 · regulatory

ENSR5_93ZRXQ · enhancer · 135577808–135578318 · regulatory

ENSR5_85ZLX5 · promoter · 135578981–135579212 · regulatory

ENSR5_85ZLX9 · promoter · 135579269–135579441 · regulatory

· motif · 135581175–135581186 · motif

細菌脂多醣(LPS)刺激後,周邊血淋巴球中的 CXCL14 表現上升。此調控描述限於該刺激條件與所測細胞群。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:111 aa

1 aa111 aa基序訊號胜肽
依 O95715 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CXCL14 蛋白質長 111 個胺基酸,屬於 intercrine alpha(chemokine CxC)家族。序列第 1 至 34 位註記為訊號區,第 67 至 81 位則含有 D-box motif。

訊號胜肽1–34 aa
基序D-box67–81 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2HDL…

PDB · 2HDL

NMR · - · A=35-111

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

CXCL14 被註記為分泌型蛋白質;來源未提供其他定位或定位改變條件。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 9 個夥伴 · 最多顯示 50 個
BRAKCXCL14CCL21CCL26CCL5CXCL11CXCL12CXCL9PF4TEX11TRIM23
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 9 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CXCL14 對嗜中性球具有強烈趨化作用,對樹突細胞的趨化作用較弱;對 T 細胞、B 細胞、單核球、自然殺手細胞及粒細胞則不具趨化作用。此外,在骨髓系祖細胞的集落形成分析中,未抑制其增殖。含實驗來源
證據與來源

Potent chemoattractant for neutrophils, and weaker for dendritic cells. Not chemotactic for T-cells, B-cells, monocytes, natural killer cells or granulocytes. Does not inhibit proliferation of myeloid progenitors in colony formation assays

PMID 10049774 ↗ · PMID 10946286 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted資料庫紀錄
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

調控細菌脂多醣(LPS)刺激會使周邊血淋巴球中的 CXCL14 表現上升。含實驗來源
證據與來源

Up-regulated in peripheral blood lymphocytes in response to bacterial lipopolysaccharides (LPS)

PMID 10854217 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000512158 · 1,687 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTGGAGAGAGCGCGGAGACAAGCGCAGAGCGCAGCGCACG40
41GCCACAGACAGCCCTGGGCATCCACCGACGGCGCAGCCGG80
81AGCCAGCAGAGCCGGAAGGCGCGCCCCGGGCAGAGAAAGC120
121CGAGCAGAGCTGGGTGGCGTCTCCGGGCCGCCGCTCCGAC160
161GGGCCAGCGCCCTCCCCATGTCCCTGCTCCCACGCCGCGC200
201CCCTCCGGTCAGCATGAGGCTCCTGGCGGCCGCGCTGCTC240
241CTGCTGCTGCTGGCGCTGTACACCGCGCGTGTGGACGGGT280
281CCAAATGCAAGTGCTCCCGGAAGGGACCCAAGATCCGCTA320
321CAGCGACGTGAAGAAGCTGGAAATGAAGCCAAAGTACCCG360
361CACTGCGAGGAGAAGATGGTTATCATCACCACCAAGAGCG400
401TGTCCAGGTACCGAGGTCAGGAGCACTGCCTGCACCCCAA440
441GCTGCAGAGCACCAAGCGCTTCATCAAGTGGTACAACGCC480
481TGGAACGAGAAGCGCAGGGTCTACGAAGAATAGGGTGAAA520
521AACCTCAGAAGGGAAAACTCCAAACCAGTTGGGAGACTTG560
561TGCAAAGGACTTTGCAGATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA600
601AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCTTTCTTTCTCACAG640
641GCATAAGACACAAATTATATATTGTTATGAAGCACTTTTT680
681ACCAACGGTCAGTTTTTACATTTTATAGCTGCGTGCGAAA720
721GGCTTCCAGATGGGAGACCCATCTCTCTTGTGCTCCAGAC760
761TTCATCACAGGCTGCTTTTTATCAAAAAGGGGAAAACTCA800
801TGCCTTTCCTTTTTAAAAAATGCTTTTTTGTATTTGTCCA840
841TACGTCACTATACATCTGAGCTTTATAAGCGCCCGGGAGG880
881AACAATGAGCTTGGTGGACACATTTCATTGCAGTGTTGCT920
921CCATTCCTAGCTTGGGAAGCTTCCGCTTAGAGGTCCTGGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。