基因總覽
CXCL14 的正式名稱為 C-X-C motif chemokine ligand 14,屬於 protein-coding 基因,產物歸於 intercrine alpha(chemokine CxC)家族。其蛋白質長 111 個胺基酸,序列包含位於第 1 至 34 位的訊號區,以及第 67 至 81 位的 D-box motif。來源將此蛋白質描述為分泌型趨化因子;其主要細胞趨化特性與功能範圍另見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000512158 ★ | 135,570,679–135,578,991 | 4 |
| ENST00000337225 | 135,570,679–135,579,580 | 4 |
| ENST00000867030 | 135,570,679–135,579,580 | 3 |
| ENST00001139203 | 135,570,679–135,579,580 | 4 |
| ENST00001106331 | 135,574,137–135,579,580 | 4 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CXCL14 對嗜中性球具有強烈的趨化作用,可促使這類細胞朝其訊號方向移動;對樹突細胞也有趨化作用,但效力較弱。這些結果顯示,其所述的趨化效應並非對所有免疫細胞一概相同,對不同細胞類型的反應有所區別。
在測試的細胞中,CXCL14 對 T 細胞、B 細胞、單核球、自然殺手細胞與粒細胞不具趨化作用。來源將嗜中性球與粒細胞分別列出,因此應保留這項區別;資料也沒有支持將其趨化效應擴大解讀為普遍吸引各類白血球。
此外,在骨髓系祖細胞的集落形成分析中,CXCL14 不會抑制這些祖細胞的增殖。此結果限定於該項分析所測量的增殖抑制效應,並不等同於對其他細胞反應或其他生物學過程的判定。綜合來源所述,CXCL14 的已知功能重點是對特定細胞的趨化選擇性,以及在該集落形成分析中未見對骨髓系祖細胞增殖的抑制。
Promoter 與基因調控
>CXCL14 ENST00000512158 GRCh38 chr5:135578891-135579991 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CACAGCCACCCTATCAGAAACACTGTGATGATCTGCACTTTACAGATGATGAAACAAAAGCTGAGAGCGG TAAAGTCACTTGTGCTGGAAAGTAGTGAGGAGGGAATTTCTGCCACTATGGCTGGGCTCACACCACTATA CCTCGCATTCTGGCACAATGTCTAGAACATGGGAAGGCCTTCATCCAGATGGTTACCACTGTCATCGCTC TCCACTAGGGCTCTCTACCTGGCTTTGGAGAGTAGTGTGAGAGTGAGGACTCCTCCTGGTTCTCCCCACC ACCCAGACACTCACACAGCCACCAGGCCACTGACCCACTTTAAGGAGCTTTCCTTTGGGAGTCACCAAAA CTCCTCCCCAATACCCGTCCCCACCCCCGCATACACACACATACCCTCTTTGAGTCAGTTCCAGTGATCA CAGTCAATGACTTTGCTGCTGGACAGTCTATGACAAGCCCCTGTCCAGAACTGGCCTTGTGTTCTGGCCC AGCAGGGGCCCTTGGGGGTCAGGCCTGCAGGCACTCACACTTGGCACCTGCTCCAAAACCCTTTCAGGTC TTTGAGGATCTGAGCCCTGGGCCTGGGTCTCCCGCCGGCTCGGAAAAGCTGGCCTGCCGGGCCAGAGAGA GAACCACACGATTCAGAAAAGCAGTGCCCTTCAGCAGCCTCTCCACCGTCTGGGCTCCCCAAAGGCAGAG CGGGACGCTGGAAATGTGTGCGCGCTGTGGTATGGGTGTGCAAGTGTGCGAAGGCGGCGTGTTGTGTGAG CGAGAGGGTAGCGGATGTGTGTGTGCGTGTGCGCGCGTGGCTCCGGGTGTGCGCCGCTGCGATAGCGGGT CCTTTCCCGGGGCGGGCGACGGGCGGGCTGGGAAGGTCTCCTCCCCTCACCACATTGAGAAATCTCAGTG AGTCACCGAGTGGTTCTGCATATTAATGAGCTCGCTCGCTGCGAGGGCAGGAGCGGATTTAAAAGAGGCC AGGGCGGGCGGAGGGAGGCTGTGGAGAGAGCGCGGAGACAAGCGCAGAGCGCAGCGCACGGCCACAGACA GCCCTGGGCATCCACCGACGGCGCAGCCGGAGCCAGCAGAGCCGGAAGGCG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CXCL14_1 ↗ | 5:135,578,991 | 負股 | 135,578,981–135,579,040 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR5_93ZRX8 · enhancer · 135576148–135576452 · regulatory
ENSR5_93ZRXQ · enhancer · 135577808–135578318 · regulatory
ENSR5_85ZLX5 · promoter · 135578981–135579212 · regulatory
ENSR5_85ZLX9 · promoter · 135579269–135579441 · regulatory
· motif · 135581175–135581186 · motif
細菌脂多醣(LPS)刺激後,周邊血淋巴球中的 CXCL14 表現上升。此調控描述限於該刺激條件與所測細胞群。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:111 aa
CXCL14 蛋白質長 111 個胺基酸,屬於 intercrine alpha(chemokine CxC)家族。序列第 1 至 34 位註記為訊號區,第 67 至 81 位則含有 D-box motif。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CXCL14 被註記為分泌型蛋白質;來源未提供其他定位或定位改變條件。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 9 個夥伴
- CCL21O00585 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL26Q9Y258 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL5P13501 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL11O14625 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL12P48061 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL9Q07325 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PF4P02776 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TEX11Q8IYF3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM23P36406 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CXCL14 對嗜中性球具有強烈趨化作用,對樹突細胞的趨化作用較弱;對 T 細胞、B 細胞、單核球、自然殺手細胞及粒細胞則不具趨化作用。此外,在骨髓系祖細胞的集落形成分析中,未抑制其增殖。 | 含實驗來源 | 證據與來源Potent chemoattractant for neutrophils, and weaker for dendritic cells. Not chemotactic for T-cells, B-cells, monocytes, natural killer cells or granulocytes. Does not inhibit proliferation of myeloid progenitors in colony formation assays PMID 10049774 ↗ · PMID 10946286 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 | |
| 調控 | 細菌脂多醣(LPS)刺激會使周邊血淋巴球中的 CXCL14 表現上升。 | 含實驗來源 | 證據與來源Up-regulated in peripheral blood lymphocytes in response to bacterial lipopolysaccharides (LPS) PMID 10854217 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GTGGAGAGAGCGCGGAGACAAGCGCAGAGCGCAGCGCACG40GCCACAGACAGCCCTGGGCATCCACCGACGGCGCAGCCGG80AGCCAGCAGAGCCGGAAGGCGCGCCCCGGGCAGAGAAAGC120CGAGCAGAGCTGGGTGGCGTCTCCGGGCCGCCGCTCCGAC160GGGCCAGCGCCCTCCCCATGTCCCTGCTCCCACGCCGCGC200CCCTCCGGTCAGCATGAGGCTCCTGGCGGCCGCGCTGCTC240CTGCTGCTGCTGGCGCTGTACACCGCGCGTGTGGACGGGT280CCAAATGCAAGTGCTCCCGGAAGGGACCCAAGATCCGCTA320CAGCGACGTGAAGAAGCTGGAAATGAAGCCAAAGTACCCG360CACTGCGAGGAGAAGATGGTTATCATCACCACCAAGAGCG400TGTCCAGGTACCGAGGTCAGGAGCACTGCCTGCACCCCAA440GCTGCAGAGCACCAAGCGCTTCATCAAGTGGTACAACGCC480TGGAACGAGAAGCGCAGGGTCTACGAAGAATAGGGTGAAA520AACCTCAGAAGGGAAAACTCCAAACCAGTTGGGAGACTTG560TGCAAAGGACTTTGCAGATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA600AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCTTTCTTTCTCACAG640GCATAAGACACAAATTATATATTGTTATGAAGCACTTTTT680ACCAACGGTCAGTTTTTACATTTTATAGCTGCGTGCGAAA720GGCTTCCAGATGGGAGACCCATCTCTCTTGTGCTCCAGAC760TTCATCACAGGCTGCTTTTTATCAAAAAGGGGAAAACTCA800TGCCTTTCCTTTTTAAAAAATGCTTTTTTGTATTTGTCCA840TACGTCACTATACATCTGAGCTTTATAAGCGCCCGGGAGG880AACAATGAGCTTGGTGGACACATTTCATTGCAGTGTTGCT920CCATTCCTAGCTTGGGAAGCTTCCGCTTAGAGGTCCTGGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。