演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CXCL11H174

C-X-C motif chemokine ligand 11

CXCL11(C-X-C motif chemokine ligand 11)是趨化因子,能吸引經 interleukin 活化的 T 細胞,並與 CXCR3 結合。

Homo sapiens4q21.1UniProt O14625
OFFICIAL SYMBOL
CXCL11
CHROMOSOME
4
UNIPROT
O14625
PDB / ALPHAFOLD
8HNK
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CXCL11 的正式名稱為 C-X-C motif chemokine ligand 11,屬於蛋白質編碼基因,產物歸於 intercrine alpha(chemokine CxC)家族。來源描述其具有趨化作用,能吸引經 interleukin 活化的 T 細胞,並指出它會與 CXCR3 結合。這些資料將 CXCL11 的基本性質定位為參與免疫細胞趨化的 chemokine;來源未提供更完整的序列或結構描述。

Official symbol
CXCL11
Gene name
C-X-C motif chemokine ligand 11
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10638
UniProt
O14625
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
H174b-R1I-TACIP-9SCYB9BSCYB11

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 44q21.1
chr4 · 190,214,555 bp · GRCh38chr4p16.3 · 1–4500000 · gnegchr4p16.2 · 4500001–6000000 · gpos25chr4p16.1 · 6000001–11300000 · gnegchr4p15.33 · 11300001–15000000 · gpos50chr4p15.32 · 15000001–17700000 · gnegchr4p15.31 · 17700001–21300000 · gpos75chr4p15.2 · 21300001–27700000 · gnegchr4p15.1 · 27700001–35800000 · gpos100chr4p14 · 35800001–41200000 · gnegchr4p13 · 41200001–44600000 · gpos50chr4p12 · 44600001–48200000 · gnegchr4p11 · 48200001–50000000 · acenchr4q11 · 50000001–51800000 · acenchr4q12 · 51800001–58500000 · gnegchr4q13.1 · 58500001–65500000 · gpos100chr4q13.2 · 65500001–69400000 · gnegchr4q13.3 · 69400001–75300000 · gpos75chr4q21.1 · 75300001–78000000 · gnegchr4q21.21 · 78000001–81500000 · gpos50chr4q21.22 · 81500001–83200000 · gnegchr4q21.23 · 83200001–86000000 · gpos25chr4q21.3 · 86000001–87100000 · gnegchr4q22.1 · 87100001–92800000 · gpos75chr4q22.2 · 92800001–94200000 · gnegchr4q22.3 · 94200001–97900000 · gpos75chr4q23 · 97900001–100100000 · gnegchr4q24 · 100100001–106700000 · gpos50chr4q25 · 106700001–113200000 · gnegchr4q26 · 113200001–119900000 · gpos75chr4q27 · 119900001–122800000 · gnegchr4q28.1 · 122800001–127900000 · gpos50chr4q28.2 · 127900001–130100000 · gnegchr4q28.3 · 130100001–138500000 · gpos100chr4q31.1 · 138500001–140600000 · gnegchr4q31.21 · 140600001–145900000 · gpos25chr4q31.22 · 145900001–147500000 · gnegchr4q31.23 · 147500001–150200000 · gpos25chr4q31.3 · 150200001–154600000 · gnegchr4q32.1 · 154600001–160800000 · gpos100chr4q32.2 · 160800001–163600000 · gnegchr4q32.3 · 163600001–169200000 · gpos100chr4q33 · 169200001–171000000 · gnegchr4q34.1 · 171000001–175400000 · gpos75chr4q34.2 · 175400001–176600000 · gnegchr4q34.3 · 176600001–182300000 · gpos100chr4q35.1 · 182300001–186200000 · gnegchr4q35.2 · 186200001–190214555 · gpos25CXCL11pq1 bp190,214,555 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr4:76,033,682–76,050,206
Gene span
16,525 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000306621 ★76,033,682–76,036,0704
ENST0000050386076,033,682–76,041,4155
ENST0000110162276,033,682–76,050,2065
ENST0000114136476,033,682–76,036,0884

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CXCL11 對不同免疫細胞的趨化作用具有條件差異:它能吸引經 interleukin 活化的 T 細胞,但來源指出,對未活化的 T 細胞、中性球及單核球沒有相同的趨化作用。這表示其所述效應與 T 細胞的活化狀態相關,不能概括為對所有 T 細胞或免疫細胞均有吸引作用。

在經活化的 T 細胞中,CXCL11 會誘導鈣離子釋放;來源亦指出它會與 CXCR3 結合。這些資料分別描述了受體結合及細胞內鈣離子反應,但未進一步說明兩者之間的詳細分子機制或因果順序。

CXCL11 可能與涉及 T 細胞募集的中樞神經系統疾病有重要關聯,也可能參與皮膚免疫反應。來源以「可能」描述這些角色,未將其表述為已確立的疾病機制或確定功能。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 76036070 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CXCL11 ENST00000306621 GRCh38 chr4:76035970-76037070 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCAGCCATGACACTGCACTACCCTATAGCTGTGGGCCTCAACAAGGGCCACAAGGTGACCAAGAATGTGA
GCAAGCCCAGGCACAGCCACTGTGGGCGCCTGACCAAACTCACTAAATTTGTGTGGGACATGATCCCAGA
GGTGTGTGGCTTCACCCCTAACGAGTGGCGTGGCATGGAGTTACTGAAGGTCTCCAAGGTCAAACAGGCC
CTCAAATTCATCAAGAAAAGGGTAGGGACAAACATCTGCACCAAGAGAAGGCAGGAGGAGCTGAGCAACG
TCCTGGCTGCCATGAGGAAAGCAGCTGCCAAGAAGGACTGAGCCCCCTGCCATCTGCCTATAATGAAAGC
TTTGCAGAATAAAATAAATATAAAATAAAGTAATAAAATTAAATTAAATTTAAAAATAAAATAAAGCAAA
ACAAAATAAAATATATAAAGTAAAAATTGTTGAAAATGCAAAACAATATGGACATAAATACAGAAACACA
GGGAAACTTCTTTAGGCACTCATTTACAGGTAAAAATATGAAATTGAATAAAGGTCATCTGGTGTCAAAT
AATATAGGCCTTATCTATTATAAGAGTTTGGACTGAAAAGCAAAAGTGAGATAATAAAAAAAAGCTTTTC
AGAATATTATTTTGTATAGATATGTGAAGGATGAAGGGTGGGTGAAAGGACCAAAAACAGAAACACAGTC
TTCCTGAATGAATGACAATCAGAATTCCGCTGCCCAAAGTAGTCCGACAATTAAATGGATTTCTAGGAAA
AGCTACCTTAAGAAGGCTGGTTACCATCTGGGTTTTCACAGTGCTTTCACATTCTTATCACTTTCAACAC
TACTGCAAATAGGAAGGGACAGTAACATTTAGAAGAGAACAAAACAGAAACTCTTGGAAGCAGGAAAGGT
GCATGACTCAAAGAGGGAAATTCCTGTGCCATAAAAGGATTGCTGGTGTATAAAATGCTCTATATATGCC
AATTATCAATTTCCTTTCATGTTCAGCATTTCTACTCCTTCCAAGAAGAGCAGCAAAGCTGAAGTAGCAG
CAGCAGCACCAGCAGCAACAGCAAAAAACAAACATGAGTGTGAAGGGCATG
CXCL11 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CXCL11_1 ↗4:76,036,070負股76,036,060–76,036,119

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

CXCL11 可受 IFNG(IFN-gamma)與 IFNB1(IFN-beta)誘導。IFNG 對其誘導作用在單核球、真皮纖維母細胞及內皮細胞中可由 TNF 增強;在星狀膠細胞中,則可由 IL1(interleukin-1)增強。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:94 aa

1 aa94 aa訊號胜肽
依 O14625 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CXCL11 蛋白質長 94 個胺基酸,屬於 intercrine alpha(chemokine CxC)家族。蛋白質序列註解包含位於第 1 至第 21 個胺基酸的訊號肽區域。

訊號胜肽1–21 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8HNK…

PDB · 8HNK

EM · 3.01 A · L=1-94

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

CXCL11 的定位註解為分泌型;來源未提供其定位變化條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 11 個夥伴 · 最多顯示 50 個
H174CXCL11CCL13CCL24CCL26CCL5CXCL12CXCL14DPP4MTUS2PF4PF4V1TNFAIP6
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

CXCL11 與 TNFAIP6 有互作,該互作涉及 TNFAIP6 的 Link domain。來源未將此關係描述為複合體,也未提供其功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CXCL11 能吸引經 interleukin 活化的 T 細胞,但對未活化的 T 細胞、中性球或單核球沒有相同的趨化作用;它會在活化的 T 細胞中誘導鈣離子釋放,並與 CXCR3 結合。其可能參與涉及 T 細胞募集的中樞神經系統疾病,也可能參與皮膚免疫反應。資料庫紀錄
證據與來源

Chemotactic for interleukin-activated T-cells but not unstimulated T-cells, neutrophils or monocytes. Induces calcium release in activated T-cells. Binds to CXCR3. May play an important role in CNS diseases which involve T-cell recruitment. May play a role in skin immune responses

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用CXCL11 與 TNFAIP6 有互作,且互作涉及 TNFAIP6 的 Link domain。此描述指出特定結構域參與互作,但未說明互作形成複合體或造成何種功能結果。含實驗來源
證據與來源

Interacts with TNFAIP6 (via Link domain)

PMID 27044744 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted資料庫紀錄
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

調控CXCL11 可受 IFNG(IFN-gamma)與 IFNB1(IFN-beta)誘導。IFNG 的誘導作用在單核球、真皮纖維母細胞及內皮細胞中可由 TNF 增強;在星狀膠細胞中,則可由 IL1(interleukin-1)增強。資料庫紀錄
證據與來源

By IFNG/IFN-gamma and IFNB1/IFN-beta. Induction by IFNG/IFN-gamma is enhanced by TNF in monocytes, dermal fibroblasts and endothelial cells, and by IL1/interleukin-1 in astrocytes

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000306621 · 1,479 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTTCAGCATTTCTACTCCTTCCAAGAAGAGCAGCAAAGCT40
41GAAGTAGCAGCAGCAGCACCAGCAGCAACAGCAAAAAACA80
81AACATGAGTGTGAAGGGCATGGCTATAGCCTTGGCTGTGA120
121TATTGTGTGCTACAGTTGTTCAAGGCTTCCCCATGTTCAA160
161AAGAGGACGCTGTCTTTGCATAGGCCCTGGGGTAAAAGCA200
201GTGAAAGTGGCAGATATTGAGAAAGCCTCCATAATGTACC240
241CAAGTAACAACTGTGACAAAATAGAAGTGATTATTACCCT280
281GAAAGAAAATAAAGGACAACGATGCCTAAATCCCAAATCG320
321AAGCAAGCAAGGCTTATAATCAAAAAAGTTGAAAGAAAGA360
361ATTTTTAAAAATATCAAAACATATGAAGTCCTGGAAAAGA400
401GCATCTGAAAAACCTAGAACAAGTTTAACTGTGACTACTG440
441AAATGACAAGAATTCTACAGTAGGAAACTGAGACTTTTCT480
481ATGGTTTTGTGACTTTCAACTTTTGTACAGTTATGTGAAG520
521GATGAAAGGTGGGTGAAAGGACCAAAAACAGAAATACAGT560
561CTTCCTGAATGAATGACAATCAGAATTCCACTGCCCAAAG600
601GAGTCCAACAATTAAATGGATTTCTAGGAAAAGCTACCTT640
641AAGAAAGGCTGGTTACCATCGGAGTTTACAAAGTGCTTTC680
681ACGTTCTTACTTGTTGCATTATACATTCATGCATTTCTAG720
721GCTAGAGAACCTTCTAGATTTGATGCTTACAACTATTCTG760
761TTGTGACTATGAGAACATTTCTGTCTCTAGAAGTCATCTG800
801TCTGTATTGATCTTTATGCTATATTACTATCTGTGGTTAC840
841GGTGGAGACATTGACATTATTACTGGAGTCAAGCCCTTAT880
881AAGTCAAAAGCATCTATGTGTCGTAAAACATTCCTCAAAC920
921ATTTTTTCATGCAAATACACACTTCTTTCCCCAAACATCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。