基因總覽
CXCL11 的正式名稱為 C-X-C motif chemokine ligand 11,屬於蛋白質編碼基因,產物歸於 intercrine alpha(chemokine CxC)家族。來源描述其具有趨化作用,能吸引經 interleukin 活化的 T 細胞,並指出它會與 CXCR3 結合。這些資料將 CXCL11 的基本性質定位為參與免疫細胞趨化的 chemokine;來源未提供更完整的序列或結構描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000306621 ★ | 76,033,682–76,036,070 | 4 |
| ENST00000503860 | 76,033,682–76,041,415 | 5 |
| ENST00001101622 | 76,033,682–76,050,206 | 5 |
| ENST00001141364 | 76,033,682–76,036,088 | 4 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CXCL11 對不同免疫細胞的趨化作用具有條件差異:它能吸引經 interleukin 活化的 T 細胞,但來源指出,對未活化的 T 細胞、中性球及單核球沒有相同的趨化作用。這表示其所述效應與 T 細胞的活化狀態相關,不能概括為對所有 T 細胞或免疫細胞均有吸引作用。
在經活化的 T 細胞中,CXCL11 會誘導鈣離子釋放;來源亦指出它會與 CXCR3 結合。這些資料分別描述了受體結合及細胞內鈣離子反應,但未進一步說明兩者之間的詳細分子機制或因果順序。
CXCL11 可能與涉及 T 細胞募集的中樞神經系統疾病有重要關聯,也可能參與皮膚免疫反應。來源以「可能」描述這些角色,未將其表述為已確立的疾病機制或確定功能。
Promoter 與基因調控
>CXCL11 ENST00000306621 GRCh38 chr4:76035970-76037070 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCAGCCATGACACTGCACTACCCTATAGCTGTGGGCCTCAACAAGGGCCACAAGGTGACCAAGAATGTGA GCAAGCCCAGGCACAGCCACTGTGGGCGCCTGACCAAACTCACTAAATTTGTGTGGGACATGATCCCAGA GGTGTGTGGCTTCACCCCTAACGAGTGGCGTGGCATGGAGTTACTGAAGGTCTCCAAGGTCAAACAGGCC CTCAAATTCATCAAGAAAAGGGTAGGGACAAACATCTGCACCAAGAGAAGGCAGGAGGAGCTGAGCAACG TCCTGGCTGCCATGAGGAAAGCAGCTGCCAAGAAGGACTGAGCCCCCTGCCATCTGCCTATAATGAAAGC TTTGCAGAATAAAATAAATATAAAATAAAGTAATAAAATTAAATTAAATTTAAAAATAAAATAAAGCAAA ACAAAATAAAATATATAAAGTAAAAATTGTTGAAAATGCAAAACAATATGGACATAAATACAGAAACACA GGGAAACTTCTTTAGGCACTCATTTACAGGTAAAAATATGAAATTGAATAAAGGTCATCTGGTGTCAAAT AATATAGGCCTTATCTATTATAAGAGTTTGGACTGAAAAGCAAAAGTGAGATAATAAAAAAAAGCTTTTC AGAATATTATTTTGTATAGATATGTGAAGGATGAAGGGTGGGTGAAAGGACCAAAAACAGAAACACAGTC TTCCTGAATGAATGACAATCAGAATTCCGCTGCCCAAAGTAGTCCGACAATTAAATGGATTTCTAGGAAA AGCTACCTTAAGAAGGCTGGTTACCATCTGGGTTTTCACAGTGCTTTCACATTCTTATCACTTTCAACAC TACTGCAAATAGGAAGGGACAGTAACATTTAGAAGAGAACAAAACAGAAACTCTTGGAAGCAGGAAAGGT GCATGACTCAAAGAGGGAAATTCCTGTGCCATAAAAGGATTGCTGGTGTATAAAATGCTCTATATATGCC AATTATCAATTTCCTTTCATGTTCAGCATTTCTACTCCTTCCAAGAAGAGCAGCAAAGCTGAAGTAGCAG CAGCAGCACCAGCAGCAACAGCAAAAAACAAACATGAGTGTGAAGGGCATG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CXCL11_1 ↗ | 4:76,036,070 | 負股 | 76,036,060–76,036,119 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
CXCL11 可受 IFNG(IFN-gamma)與 IFNB1(IFN-beta)誘導。IFNG 對其誘導作用在單核球、真皮纖維母細胞及內皮細胞中可由 TNF 增強;在星狀膠細胞中,則可由 IL1(interleukin-1)增強。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:94 aa
CXCL11 蛋白質長 94 個胺基酸,屬於 intercrine alpha(chemokine CxC)家族。蛋白質序列註解包含位於第 1 至第 21 個胺基酸的訊號肽區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CXCL11 的定位註解為分泌型;來源未提供其定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
- CCL13Q99616 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL24O00175 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL26Q9Y258 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL5P13501 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL12P48061 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CXCL14O95715 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DPP4P27487 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MTUS2Q5JR59 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PF4P02776 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PF4V1P10720 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TNFAIP6P98066 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
CXCL11 與 TNFAIP6 有互作,該互作涉及 TNFAIP6 的 Link domain。來源未將此關係描述為複合體,也未提供其功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CXCL11 能吸引經 interleukin 活化的 T 細胞,但對未活化的 T 細胞、中性球或單核球沒有相同的趨化作用;它會在活化的 T 細胞中誘導鈣離子釋放,並與 CXCR3 結合。其可能參與涉及 T 細胞募集的中樞神經系統疾病,也可能參與皮膚免疫反應。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Chemotactic for interleukin-activated T-cells but not unstimulated T-cells, neutrophils or monocytes. Induces calcium release in activated T-cells. Binds to CXCR3. May play an important role in CNS diseases which involve T-cell recruitment. May play a role in skin immune responses |
| 交互作用 | CXCL11 與 TNFAIP6 有互作,且互作涉及 TNFAIP6 的 Link domain。此描述指出特定結構域參與互作,但未說明互作形成複合體或造成何種功能結果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 | |
| 調控 | CXCL11 可受 IFNG(IFN-gamma)與 IFNB1(IFN-beta)誘導。IFNG 的誘導作用在單核球、真皮纖維母細胞及內皮細胞中可由 TNF 增強;在星狀膠細胞中,則可由 IL1(interleukin-1)增強。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源By IFNG/IFN-gamma and IFNB1/IFN-beta. Induction by IFNG/IFN-gamma is enhanced by TNF in monocytes, dermal fibroblasts and endothelial cells, and by IL1/interleukin-1 in astrocytes |
核酸與蛋白質序列
GTTCAGCATTTCTACTCCTTCCAAGAAGAGCAGCAAAGCT40GAAGTAGCAGCAGCAGCACCAGCAGCAACAGCAAAAAACA80AACATGAGTGTGAAGGGCATGGCTATAGCCTTGGCTGTGA120TATTGTGTGCTACAGTTGTTCAAGGCTTCCCCATGTTCAA160AAGAGGACGCTGTCTTTGCATAGGCCCTGGGGTAAAAGCA200GTGAAAGTGGCAGATATTGAGAAAGCCTCCATAATGTACC240CAAGTAACAACTGTGACAAAATAGAAGTGATTATTACCCT280GAAAGAAAATAAAGGACAACGATGCCTAAATCCCAAATCG320AAGCAAGCAAGGCTTATAATCAAAAAAGTTGAAAGAAAGA360ATTTTTAAAAATATCAAAACATATGAAGTCCTGGAAAAGA400GCATCTGAAAAACCTAGAACAAGTTTAACTGTGACTACTG440AAATGACAAGAATTCTACAGTAGGAAACTGAGACTTTTCT480ATGGTTTTGTGACTTTCAACTTTTGTACAGTTATGTGAAG520GATGAAAGGTGGGTGAAAGGACCAAAAACAGAAATACAGT560CTTCCTGAATGAATGACAATCAGAATTCCACTGCCCAAAG600GAGTCCAACAATTAAATGGATTTCTAGGAAAAGCTACCTT640AAGAAAGGCTGGTTACCATCGGAGTTTACAAAGTGCTTTC680ACGTTCTTACTTGTTGCATTATACATTCATGCATTTCTAG720GCTAGAGAACCTTCTAGATTTGATGCTTACAACTATTCTG760TTGTGACTATGAGAACATTTCTGTCTCTAGAAGTCATCTG800TCTGTATTGATCTTTATGCTATATTACTATCTGTGGTTAC840GGTGGAGACATTGACATTATTACTGGAGTCAAGCCCTTAT880AAGTCAAAAGCATCTATGTGTCGTAAAACATTCCTCAAAC920ATTTTTTCATGCAAATACACACTTCTTTCCCCAAACATCA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。