基因總覽
CXCL10（C-X-C motif chemokine ligand 10）是由蛋白質編碼基因 CXCL10 產生的分泌型細胞激素，屬於 intercrine alpha（chemokine CxC）家族。它是促發炎介質，能參與多種免疫與細胞相關過程。其蛋白質具有訊號序列，註解範圍為第 1 至第 21 個胺基酸；這項特徵與其分泌型性質相符。CXCL10 也可呈現單體、二聚體或四聚體形式，並能與受體 CXCR3 互作。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000306602 ★ | 76,021,118–76,023,497 | 4 |
| ENST00001135003 | 76,021,118–76,023,518 | 4 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CXCL10 是促發炎細胞激素，參與趨化作用、周邊免疫細胞的分化與活化，也與細胞生長調節、細胞凋亡及血管生成抑制效應的調節相關。這些作用使它能介入多種細胞反應，而非僅限於免疫細胞的移動。
在病毒感染期間，CXCL10 被認為可促進免疫細胞活化並移向感染部位；此感染相關角色的證據標示為相似性推論。因而，CXCL10 可能參與感染部位的免疫細胞動員，但此處的敘述不應視為所有病毒感染情境均已逐一確立。
CXCL10 與受體 CXCR3 結合後，會啟動 G 蛋白介導的訊號傳遞，進一步活化依賴 phospholipase C 的路徑，並引起細胞內鈣離子增加及 actin 重組。這些下游變化與細胞反應及移動相關；在發炎部位，CXCL10/CXCR3 訊號可促使已活化的 Th1 淋巴球聚集，將免疫細胞引導至局部發炎環境。
CXCL10/CXCR3 軸也被認為參與腦損傷後的反應：在神經元受損情境中，此軸可活化小膠細胞，並引導這些中樞神經系統的駐留巨噬細胞前往病灶。這種募集被描述為神經元重新組織的重要環節；該項神經系統相關角色同樣屬於相似性推論。
Promoter 與基因調控
>CXCL10 ENST00000306602 GRCh38 chr4:76023397-76024497 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATTAAGTTTTGCCACGATTCATCATCCAGTTAAAATTGTGCCAATTTCAGTTATCACTGTTACTAGCTCA ATGGCCAACACTTTTTTTTTCTTTTTCTTTGCATTTAACAGTGTCTTGGAGCTGAACCCCATCGTAAATC AACCTGTTTCCCTTCTGTCTCAAGCTACTTTCCCAAGGTCTGTCTCTATGCGTGCCCCCCCGCTTTTAAA TTCATTTCCTCAAAAAGCACCCTTTGTTTTTTACAATAACCCTAGGATAGCTATGAATCCTTTTCTCACA CCATTCTAGATACCATCTTATGATGTTTTCATTCAGGGACTGCTATAAGACGTGAAACTTGTTTTAACAC ACCACAAATCAGATACCCAAATGAGCAATGTTTTCCCTCAAAATAGTTATGTTGGAGGCTATTTACTTAA TCTAATGGTGTTATGAATGATCAAAGCATTTATTGAATTATTTAAAACTTGCCAGTTCCAGATCTTTGAC CCTGTCAAAGCAGGCCAGTCCTATTACTTTATAGTATTTGATCAAGGAGGACTGTCCAGGTAAATCACTG TTCTAATAATCAGGCACAACTTGCTGTTACCAAAAAATTAGGTTTACCTATAAAGGATGAAAAATTTCTA TTACTGGGGATATTTTGAAAAATAACCTCTGAAAGTAACTGTAAAAGTTTAAGTGTTGAGAAAAAGCATT ATAGTTAGAATGGATTGCAACCTTTGTTTTTTTCTATATGCAATGAAGTTCTTTTTTTCAAGAAACAGTT CATGTTTTGGAAAGTGAAACCTAATTCACTATTACCAAAAAAAGAGGAGCAGAGGGAAATTCCGTAACTT GGAGGCTACAATAAATAATACCTTCGAGTCTGCAACATGGGACTTCCCCAGGAACAGCCAGCAGGTTTTG CTAAGTCAACTGTAATGCCCTTATCCAATCAGAATTAGGGAGGGAAAATGGCTTTGCAGATAAATATGGC ACACTAGCCCCACGTTTTCTGAGACATTCCTCAATTGCTTAGACATATTCTGAGCCTACAGCAGAGGAAC CTCCAGTCTCAGCACCATGAATCAAACTGCCATTCTGATTTGCTGCCTTAT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CXCL10_1 ↗ | 4:76,023,497 | 負股 | 76,023,487–76,023,546 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR4_9356PK · promoter · 76023487–76023774 · regulatory
ENSR4_9356R2 · enhancer · 76028361–76028776 · regulatory
IFNG/IFN-gamma 可促使多種不同細胞類型迅速增加編碼 CXCL10 的 mRNA 轉錄。這項快速反應提示，CXCL10 可能是 IFNG/IFN-gamma 反應的重要介質。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：98 aa
CXCL10 蛋白質長 98 個胺基酸，屬於 intercrine alpha（chemokine CxC）家族。其第 1 至第 21 個胺基酸被註記為訊號序列，與蛋白質分泌特性相符。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CXCL10 被註記為分泌型蛋白質；來源未提供其定位隨條件或異構型改變的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 10 個夥伴
- CCL11P51671 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL13Q99616 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL21O00585 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL26Q9Y258 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL28Q9NRJ3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL5P13501 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL12P48061 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL9Q07325 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DPP4P27487 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PF4P02776 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
CXCL10 可與 CXCR3 互作，作用區域位於 CXCL10 的 N 端。另有資料指出 CXCL10 可形成單體、二聚體及四聚體；這些是其自身的分子組態，不代表與其他蛋白質形成複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CXCL10 是促發炎細胞激素，參與趨化、周邊免疫細胞分化與活化、細胞生長調節、細胞凋亡及血管生成抑制效應調節。感染相關角色依相似性推論描述；CXCL10 結合 CXCR3 後啟動 G 蛋白訊號及 phospholipase C 依賴路徑，引起細胞內鈣增加與 actin 重組，並促使發炎部位募集已活化的 Th1 淋巴球。腦損傷時，CXCL10/CXCR3 軸被認為可活化小膠細胞並引導其至病灶，這項募集被描述為神經元重新組織的重要環節，亦屬相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Pro-inflammatory cytokine that is involved in a wide variety of processes such as chemotaxis, differentiation, and activation of peripheral immune cells, regulation of cell growth, apoptosis and modulation of angiostatic effects. Plays thereby an important role during viral infections by stimulating the activation and migration of immune cells to the infected sites (By similarity). Mechanistically, binding of CXCL10 to the CXCR3 receptor activates G protein-mediated signaling and results in downstream activation of phospholipase C-dependent pathway, an increase in intracellular calcium production and actin reorganization. In turn, recruitment of activated Th1 lymphocytes occurs at sites of inflammation. Activation of the CXCL10/CXCR3 axis also plays an important role in neurons in response to brain injury for activating microglia, the resident macrophage population of the central nervous system, and directing them to the lesion site. This recruitment is an essential element for neuronal reorganization (By similarity) PMID 11157474 ↗ · PMID 12663757 ↗ · PMID 12750173 ↗ · PMID 19151743 ↗ · PMID 22652417 ↗ · PMID 7540647 ↗ |
| 交互作用 | CXCL10 可呈現單體、二聚體或四聚體形式，並可透過 N 端與 CXCR3 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Monomer, dimer, and tetramer. Interacts with CXCR3 (via N-terminus) PMID 12737818 ↗ · PMID 19151743 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 含實驗來源 | |
| 調控 | IFNG/IFN-gamma 可使多種不同細胞類型迅速提高編碼 CXCL10 的 mRNA 轉錄；這項反應提示，CXCL10 可能是 IFNG/IFN-gamma 反應的重要介質。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源By IFNG/IFN-gamma. A diverse population of cell types rapidly increases transcription of mRNA encoding this protein. This suggests that gamma-induced protein may be a key mediator of the IFNG/IFN-gamma response |
核酸與蛋白質序列
GAGACATTCCTCAATTGCTTAGACATATTCTGAGCCTACA40GCAGAGGAACCTCCAGTCTCAGCACCATGAATCAAACTGC80CATTCTGATTTGCTGCCTTATCTTTCTGACTCTAAGTGGC120ATTCAAGGAGTACCTCTCTCTAGAACTGTACGCTGTACCT160GCATCAGCATTAGTAATCAACCTGTTAATCCAAGGTCTTT200AGAAAAACTTGAAATTATTCCTGCAAGCCAATTTTGTCCA240CGTGTTGAGATCATTGCTACAATGAAAAAGAAGGGTGAGA280AGAGATGTCTGAATCCAGAATCGAAGGCCATCAAGAATTT320ACTGAAAGCAGTTAGCAAGGAAAGGTCTAAAAGATCTCCT360TAAAACCAGAGGGGAGCAAAATCGATGCAGTGCTTCCAAG400GATGGACCACACAGAGGCTGCCTCTCCCATCACTTCCCTA440CATGGAGTATATGTCAAGCCATAATTGTTCTTAGTTTGCA480GTTACACTAAAAGGTGACCAATGATGGTCACCAAATCAGC520TGCTACTACTCCTGTAGGAAGGTTAATGTTCATCATCCTA560AGCTATTCAGTAATAACTCTACCCTGGCACTATAATGTAA600GCTCTACTGAGGTGCTATGTTCTTAGTGGATGTTCTGACC640CTGCTTCAAATATTTCCCTCACCTTTCCCATCTTCCAAGG680GTACTAAGGAATCTTTCTGCTTTGGGGTTTATCAGAATTC720TCAGAATCTCAAATAACTAAAAGGTATGCAATCAAATCTG760CTTTTTAAAGAATGCTCTTTACTTCATGGACTTCCACTGC800CATCCTCCCAAGGGGCCCAAATTCTTTCAGTGGCTACCTA840CATACAATTCCAAACACATACAGGAAGGTAGAAATATCTG880AAAATGTATGTGTAAGTATTCTTATTTAATGAAAGACTGT920ACAAAGTAGAAGTCTTAGATGTATATATTTCCTATATTGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。