演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CSRNP1URAX1

cysteine and serine rich nuclear protein 1

CSRNP1 編碼 cysteine and serine rich nuclear protein 1,屬於 AXUD1 家族;相關註解指出其可能具有轉錄活化、腫瘤抑制及凋亡相關作用。

Homo sapiens3p22.2UniProt Q96S65
OFFICIAL SYMBOL
CSRNP1
CHROMOSOME
3
UNIPROT
Q96S65
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CSRNP1 是蛋白質編碼基因,產物為 cysteine and serine rich nuclear protein 1,並歸屬於 AXUD1 家族。現有資料將其描述為核蛋白,並指出蛋白質全長為 589 個胺基酸。名稱所示的富含 cysteine 與 serine 特徵,以及家族分類,構成目前可確認的基本資訊;來源未提供更完整的家族特徵或蛋白質整體結構說明。其可能的分子作用與生物學角色見功能段落。

Official symbol
CSRNP1
Gene name
cysteine and serine rich nuclear protein 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14300
UniProt
Q96S65
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
URAX1DKFZp566F164FAM130BTAIP-3AXUD1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 33p22.2
chr3 · 198,295,559 bp · GRCh38chr3p26.3 · 1–2800000 · gpos50chr3p26.2 · 2800001–4000000 · gnegchr3p26.1 · 4000001–8100000 · gpos50chr3p25.3 · 8100001–11600000 · gnegchr3p25.2 · 11600001–13200000 · gpos25chr3p25.1 · 13200001–16300000 · gnegchr3p24.3 · 16300001–23800000 · gpos100chr3p24.2 · 23800001–26300000 · gnegchr3p24.1 · 26300001–30800000 · gpos75chr3p23 · 30800001–32000000 · gnegchr3p22.3 · 32000001–36400000 · gpos50chr3p22.2 · 36400001–39300000 · gnegchr3p22.1 · 39300001–43600000 · gpos75chr3p21.33 · 43600001–44100000 · gnegchr3p21.32 · 44100001–44200000 · gpos50chr3p21.31 · 44200001–50600000 · gnegchr3p21.2 · 50600001–52300000 · gpos25chr3p21.1 · 52300001–54400000 · gnegchr3p14.3 · 54400001–58600000 · gpos50chr3p14.2 · 58600001–63800000 · gnegchr3p14.1 · 63800001–69700000 · gpos50chr3p13 · 69700001–74100000 · gnegchr3p12.3 · 74100001–79800000 · gpos75chr3p12.2 · 79800001–83500000 · gnegchr3p12.1 · 83500001–87100000 · gpos75chr3p11.2 · 87100001–87800000 · gnegchr3p11.1 · 87800001–90900000 · acenchr3q11.1 · 90900001–94000000 · acenchr3q11.2 · 94000001–98600000 · gvarchr3q12.1 · 98600001–100300000 · gnegchr3q12.2 · 100300001–101200000 · gpos25chr3q12.3 · 101200001–103100000 · gnegchr3q13.11 · 103100001–106500000 · gpos75chr3q13.12 · 106500001–108200000 · gnegchr3q13.13 · 108200001–111600000 · gpos50chr3q13.2 · 111600001–113700000 · gnegchr3q13.31 · 113700001–117600000 · gpos75chr3q13.32 · 117600001–119300000 · gnegchr3q13.33 · 119300001–122200000 · gpos75chr3q21.1 · 122200001–124100000 · gnegchr3q21.2 · 124100001–126100000 · gpos25chr3q21.3 · 126100001–129500000 · gnegchr3q22.1 · 129500001–134000000 · gpos25chr3q22.2 · 134000001–136000000 · gnegchr3q22.3 · 136000001–139000000 · gpos25chr3q23 · 139000001–143100000 · gnegchr3q24 · 143100001–149200000 · gpos100chr3q25.1 · 149200001–152300000 · gnegchr3q25.2 · 152300001–155300000 · gpos50chr3q25.31 · 155300001–157300000 · gnegchr3q25.32 · 157300001–159300000 · gpos50chr3q25.33 · 159300001–161000000 · gnegchr3q26.1 · 161000001–167900000 · gpos100chr3q26.2 · 167900001–171200000 · gnegchr3q26.31 · 171200001–176000000 · gpos75chr3q26.32 · 176000001–179300000 · gnegchr3q26.33 · 179300001–183000000 · gpos75chr3q27.1 · 183000001–184800000 · gnegchr3q27.2 · 184800001–186300000 · gpos25chr3q27.3 · 186300001–188200000 · gnegchr3q28 · 188200001–192600000 · gpos75chr3q29 · 192600001–198295559 · gnegCSRNP1pq1 bp198,295,559 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr3:39,141,854–39,154,852
Gene span
12,999 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000273153 ★39,141,855–39,153,5915
ENST0000051418239,141,854–39,154,6485
ENST0000090928239,141,854–39,154,6885
ENST0000090928339,141,854–39,154,0275
ENST0000090928439,141,854–39,153,6595
ENST0000090928539,141,854–39,153,6596
ENST0000090928639,141,854–39,154,0235
ENST0000090928739,141,854–39,153,6594
ENST0000090928839,141,854–39,148,0485
ENST0000090928939,141,854–39,147,8695
ENST0000090929039,141,854–39,147,2085
ENST0000093886339,141,854–39,154,8525

顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CSRNP1 被註解為可結合特定 DNA 共識序列 5'-AGAGTG-3',並具有轉錄活化因子活性;這項結合與活性描述標示為依相似性推定,因此不應視為已在此資料中直接確認的作用機制。

來源另指出 CSRNP1 可能具有腫瘤抑制功能,也可能參與細胞凋亡。這些角色均以「可能」表述,資料未提供其作用條件、調控路徑或具體分子機制,因此只能保留為尚未確定的功能註記,不能據此推定其對腫瘤或凋亡的影響方向與程度。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 39153591 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CSRNP1 ENST00000273153 GRCh38 chr3:39153491-39154591 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGGCATTGGGATTCTGGTAAGCAGAGAGAGGGCAGGAGAGCATTCCAGTCGAGAAGACCGGCTGCAGTAA
AAGCGTGAGGGTGGAAACGCTCGAGGTGATGAGTAGACTCGTACCTGCGGTTGGGAAGTGGGGCTGAGGG
TGGGCTCCCAGGCCAGGACTTGGTTGCCGGGGCATGTCGTACCGGGAGGGTTGGCCCCGAGTCAGGAAAG
GCCTTGGCGGGAGCAGAGAAGGCAGTGGACCATTTTAAGTGGCCAAGATCTGGCCCGGAAGAAACCAGCC
TTTTTATTTTTTTAAGGGAAGGTTGAGGTGGGAGTGGGGAAGCTAGTTCTAAGAACCCCTAGTTTGGAAC
TTCTGCAGGGAAGGGTCTCTTGGCCCGTGGGCAGGAATGAAGTTCAGGCCCACTGATTACATCCATCCTT
CCCGCTCCCTGCCTCCCCGCTCCCCACACACCCCAGATTCCTCTCCAGCCACAGTTTACTTTTCCGGCGG
ATCTGGGGGTGGGTGGTAGGTTGGGGGCGGAGGGGGGAACTTTTAGATTGGAATAAAATAAACTCCCTCT
AGAGGGGTGGGGGTGGAGAGCGTACAGGAGACGTCGGCTCTGCCACTGTCTAGCCCGTGGCCTTGCGGAG
TTACGAGGTGCTCCCGGCCTCGGTCTACCCATCTGTAAACTGGGGCGGTGGGGCGAGGTGGGGATCTCTA
CGCTCGGCTCTGCCGGCTTGAGTCGTCCGCGCCTTTAGGGACCGTGCTGGAAGCGGGGCGGGGAGGGCGC
TGGCGGGAGAGGGCTGGGGGCGGAGAGCGGCGGAGGCGCAGTCGCCGGGTCACAGTCCGCAGGGAGGCCC
CCAGGCCGCTGCGCCAGGCTCCAGGCGGGGGAGGAGGCGGCGCCTCCGGGGCGGGGCTGCCGGGCGGCCT
GGCTGGAGGCCCGGCGTGCGTCAGCGCAGTGAGCCCCGGAGTTTTCCACTGACGAGGAGGGCGGAGCGGC
GGGCGGGGCTGGGCGCAGGCAGTCTCCCGCCGCCGCCGCCGCTGCCGGACGCGCAGAGCGAGGGGCGGCT
GGACCGACGGCTGCCGGGCCGAGCGCACAGAGTCGCGGCGCAGGGGGCGTC
CSRNP1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CSRNP1_1 ↗3:39,153,591負股39,153,581–39,153,640
CSRNP1_2 ↗3:39,154,611負股39,154,601–39,154,660

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR3_5C7M8M · CTCF_binding_site · 39151638–39151659 · regulatory

ENSR3_5C7MD6 · CTCF_binding_site · 39152398–39152419 · regulatory

ENSR3_9KJKW · promoter · 39152416–39152916 · regulatory

ENSR3_B9QRJ · enhancer · 39152917–39153580 · regulatory

ENSR3_5C7MGQ · CTCF_binding_site · 39152959–39152980 · regulatory

ENSR3_5C7MJ3 · CTCF_binding_site · 39153239–39153260 · regulatory

ENSR3_5C7MJJ · CTCF_binding_site · 39153342–39153363 · regulatory

ENSR3_9KJL8 · promoter · 39153581–39154081 · regulatory

ENSR3_5C7MMN · CTCF_binding_site · 39154023–39154044 · regulatory

ENSR3_9KJLH · promoter · 39154552–39155052 · regulatory

ENSR3_9KJLS · enhancer · 39155699–39156050 · regulatory

ENSR3_9KJM3 · enhancer · 39156446–39156806 · regulatory

· motif · 39148817–39148833 · motif

· motif · 39148817–39148833 · motif

· motif · 39148826–39148835 · motif

· motif · 39148826–39148835 · motif

· motif · 39148877–39148893 · motif

· motif · 39148877–39148893 · motif

· motif · 39148886–39148895 · motif

· motif · 39148886–39148895 · motif

· motif · 39149097–39149112 · motif

· motif · 39149097–39149112 · motif

· motif · 39149593–39149601 · motif

· motif · 39149640–39149653 · motif

· motif · 39149640–39149653 · motif

· motif · 39149997–39150009 · motif

· motif · 39150645–39150658 · motif

· motif · 39150645–39150658 · motif

· motif · 39150761–39150776 · motif

· motif · 39150775–39150782 · motif

· motif · 39151169–39151182 · motif

· motif · 39151169–39151182 · motif

· motif · 39151456–39151466 · motif

· motif · 39151589–39151598 · motif

· motif · 39151597–39151610 · motif

· motif · 39151627–39151637 · motif

· motif · 39151640–39151656 · motif

· motif · 39151646–39151658 · motif

· motif · 39151648–39151655 · motif

· motif · 39151653–39151665 · motif

· motif · 39151656–39151663 · motif

· motif · 39151657–39151670 · motif

· motif · 39151664–39151677 · motif

· motif · 39151807–39151817 · motif

· motif · 39151844–39151866 · motif

· motif · 39151844–39151866 · motif

· motif · 39151852–39151865 · motif

· motif · 39152250–39152260 · motif

· motif · 39152308–39152323 · motif

· motif · 39152350–39152363 · motif

· motif · 39152392–39152402 · motif

· motif · 39152400–39152416 · motif

· motif · 39152771–39152784 · motif

· motif · 39152825–39152833 · motif

· motif · 39152908–39152916 · motif

· motif · 39152953–39152960 · motif

· motif · 39152961–39152977 · motif

· motif · 39152984–39153001 · motif

· motif · 39153032–39153045 · motif

· motif · 39153090–39153105 · motif

· motif · 39153200–39153217 · motif

· motif · 39153241–39153257 · motif

· motif · 39153344–39153360 · motif

· motif · 39153695–39153705 · motif

· motif · 39153715–39153725 · motif

· motif · 39153761–39153776 · motif

· motif · 39153796–39153806 · motif

· motif · 39153828–39153838 · motif

· motif · 39154025–39154041 · motif

· motif · 39154642–39154652 · motif

· motif · 39154759–39154769 · motif

· motif · 39154763–39154773 · motif

· motif · 39157539–39157548 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:589 aa

1 aa589 aa功能區域
依 Q96S65 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Cysteine and serine rich nuclear protein 1 長 589 個胺基酸,屬於 AXUD1 家族。序列註解指出,胺基酸 1–62 與 309–388 為無序區域;資料未列出其他結構域或功能區域。

功能區域Disordered1–62 aa
功能區域Disordered309–388 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q96S65…

AlphaFold · Q96S65

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

CSRNP1 的定位註解為細胞核。 此定位依相似性提供,來源未說明不同條件下的定位變化或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 9 個夥伴 · 最多顯示 50 個
URAX1CSRNP1AQP1MCRS1PPP1CAPPP1CBPPP1CCPRPF18TCEANCZNF417ZNF587
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 9 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CSRNP1 可結合 5'-AGAGTG-3' 共識序列,並具有轉錄活化因子活性;此項描述是依相似性推定。此外,來源指出它可能具有腫瘤抑制功能,也可能參與細胞凋亡,兩項可能性均未提供進一步條件或機制。含實驗來源
證據與來源

Binds to the consensus sequence 5'-AGAGTG-3' and has transcriptional activator activity (By similarity). May have a tumor-suppressor function. May play a role in apoptosis

PMID 11526492 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位CSRNP1 的細胞內定位註記為細胞核;此定位資訊依相似性提供,來源未補充特定實驗系統或條件。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000273153 · 3,164 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGTCTCCCGCCGCCGCCGCCGCTGCCGGACGCGCAGAGCG40
41AGGGGCGGCTGGACCGACGGCTGCCGGGCCGAGCGCACAG80
81AGTCGCGGCGCAGGGGGCGTCCCCGGCCGGGACGCGGGTC120
121GCGTCGTTGTCCTCCGCGAGCGTCCGGATTGCAGGCTGTC160
161TGTCCCCAGACCCCAGAGCACGTCCGGCACCACCATGACT200
201GGGCTGTTGAAGAGGAAATTTGACCAGCTGGATGAGGACA240
241ACTCCTCGGTCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCTGGGTGCCA280
281GTCTCGCTCCTGCTCCCCAAGCTCTTCTGTCTCCCGTGCC320
321TGGGACTCAGAGGAGGAAGGCCCCTGGGATCAGATGCCCC360
361TGCCTGACCGTGACTTCTGCGGCCCCAGAAGTTTCACCCC400
401CCTGTCTATCCTGAAGCGGGCTCGCCGGGAGCGCCCAGGC440
441CGTGTAGCCTTTGATGGGATCACCGTCTTCTACTTCCCCC480
481GCTGCCAGGGCTTCACCAGTGTGCCCAGCCGTGGTGGCTG520
521TACTCTGGGTATGGCCCTTCGCCACAGTGCTTGCCGTCGC560
561TTCTCTTTGGCTGAGTTTGCGCAGGAGCAAGCCCGTGCAC600
601GGCACGAGAAGCTCCGCCAGCGCTTGAAAGAGGAGAAGTT640
641GGAGATGCTGCAGTGGAAGCTTTCGGCAGCTGGGGTACCC680
681CAGGCAGAGGCAGGGCTGCCACCTGTGGTGGATGCCATTG720
721ATGACGCCTCTGTGGAGGAGGACTTGGCAGTCGCTGTGGC760
761AGGTGGCCGGTTGGAAGAAGTGAGCTTCCTACAGCCCTAC800
801CCAGCCCGGCGACGTCGAGCTCTGCTGAGGGCTTCAGGTG840
841TGCGAAGGATCGATCGGGAGGAGAAGCGGGAGCTGCAGGC880
881ACTGCGCCAATCCCGGGAGGATTGTGGCTGTCACTGCGAT920
921AGGATCTGCGACCCTGAGACCTGCAGCTGCAGCCTGGCAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。