演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CRLF2CRL2

cytokine receptor like factor 2

CRLF2 是細胞激素受體家族的蛋白質,作為 thymic stromal lymphopoietin(TSLP)的受體組成部分,參與訊號傳遞與造血系統發育。

Homo sapiensXp22.3 and Yp11.3UniProt Q9HC73
OFFICIAL SYMBOL
CRLF2
CHROMOSOME
X
UNIPROT
Q9HC73
PDB / ALPHAFOLD
5J11
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CRLF2(cytokine receptor like factor 2)是蛋白質編碼基因,產物屬於 type I cytokine receptor family 的 Type 5 subfamily。它是 TSLP 受體系統的組成部分;來源指出,CRLF2 可與 IL7R 形成異源二聚體,並與 TSLP 組成具功能的複合體。CRLF2 有兩種定位不同的異構型:Isoform 1 是單次跨膜蛋白,位於細胞膜;Isoform 2 則為分泌型。這些特徵界定了其受體家族身分、受體角色及異構型差異。

Official symbol
CRLF2
Gene name
cytokine receptor like factor 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14281
UniProt
Q9HC73
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CRL2TSLPR

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome XXp22.3 and Yp11.3
chrX · 156,040,895 bp · GRCh38chrXp22.33 · 1–4400000 · gnegchrXp22.32 · 4400001–6100000 · gpos50chrXp22.31 · 6100001–9600000 · gnegchrXp22.2 · 9600001–17400000 · gpos50chrXp22.13 · 17400001–19200000 · gnegchrXp22.12 · 19200001–21900000 · gpos50chrXp22.11 · 21900001–24900000 · gnegchrXp21.3 · 24900001–29300000 · gpos100chrXp21.2 · 29300001–31500000 · gnegchrXp21.1 · 31500001–37800000 · gpos100chrXp11.4 · 37800001–42500000 · gnegchrXp11.3 · 42500001–47600000 · gpos75chrXp11.23 · 47600001–50100000 · gnegchrXp11.22 · 50100001–54800000 · gpos25chrXp11.21 · 54800001–58100000 · gnegchrXp11.1 · 58100001–61000000 · acenchrXq11.1 · 61000001–63800000 · acenchrXq11.2 · 63800001–65400000 · gnegchrXq12 · 65400001–68500000 · gpos50chrXq13.1 · 68500001–73000000 · gnegchrXq13.2 · 73000001–74700000 · gpos50chrXq13.3 · 74700001–76800000 · gnegchrXq21.1 · 76800001–85400000 · gpos100chrXq21.2 · 85400001–87000000 · gnegchrXq21.31 · 87000001–92700000 · gpos100chrXq21.32 · 92700001–94300000 · gnegchrXq21.33 · 94300001–99100000 · gpos75chrXq22.1 · 99100001–103300000 · gnegchrXq22.2 · 103300001–104500000 · gpos50chrXq22.3 · 104500001–109400000 · gnegchrXq23 · 109400001–117400000 · gpos75chrXq24 · 117400001–121800000 · gnegchrXq25 · 121800001–129500000 · gpos100chrXq26.1 · 129500001–131300000 · gnegchrXq26.2 · 131300001–134500000 · gpos25chrXq26.3 · 134500001–138900000 · gnegchrXq27.1 · 138900001–141200000 · gpos75chrXq27.2 · 141200001–143000000 · gnegchrXq27.3 · 143000001–148000000 · gpos100chrXq28 · 148000001–156040895 · gnegCRLF2pq1 bp156,040,895 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chrX:1,190,490–1,212,723
Gene span
22,234 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000400841 ★1,190,490–1,212,6498
ENST000003815671,190,897–1,212,6347

顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CRLF2 是 thymic stromal lymphopoietin(TSLP)的受體。它與 IL7R 及 TSLP 形成具功能的複合體,該複合體可透過活化 STAT3 與 STAT5 刺激細胞增殖。來源亦指出 CRLF2 可活化 JAK2,但此項註記標示為相似性推論(By similarity),因此應視為推定的功能資訊,而非同等程度的直接證據。

CRLF2 所參與的受體訊號與細胞增殖相關;此外,CRLF2 也被認為與造血系統的發育有關。現有資料未進一步說明該發育關聯涉及哪些細胞類型或具體過程,因此不宜延伸推論其作用細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 1212649 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CRLF2 ENST00000400841 GRCh38 chrX:1212549-1213649 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGAGGAGACGGAAGGGGGAGGGAGAGGGGAGGGAGGAGGGGGTGGGGGGAGGGGGGAGGGGAAGGGAGGG
GAGGGGATGTACACATCTACGTATCCATCTATGCATGCATCCATCCACCCATCCACCTATGTATCTGTTC
ATCCATTTATCCATCCATCCACCCACCTATCCACACATCCTTTCATCCACTTATCCATCCATCCATATAC
CATCCATGGAGGGGAGGGGAGGGGATAGGTGGAGGGGGTGGGGGAAGGGAGGGGGACAAAAGATGAGGGG
ATGGGAGGGGGATGGGAAGGGAGGGGGTGGGGTGGGGGGGAAGGGGAAGGGAGGGGAAGGGAAAGGAAGG
GAAGGGAGGGGAGGGAAGGGGGAGGGGAGGGAAGGGGGAGGGGAGGGGGAGGGGAGGTGGGGAGGAGGAG
GGGAGGGGAGGAAAGGGAAGGGGGAGGGGGAGGGGAGGGAGGAGGGGGTGGGGGAGAGGCAGAAGGGAAG
GGAGGGGAGGGGAGGGGATGGAGGGGAGGGGAGAGGGGAGGGGGAGGGGAAGTGAAAGGAAGGGAAGGGA
GGGGAGGGGAGGGGGAAGGGGAGGGGAGAGGGGGAAGGGGAGGGGAGAGGGGAGGGGAGGGGAAGGGAAA
GGAAGGAAAGAGAGGGGAGGGGAAGGGGGAGGGGAGGGGAGTGGGGAGGGAATGGAGGGGAGGGGAGGGG
AGGGGGAGGGAGGGAAGGGAATGGAGGGGAGGGGGAGGAGATGGGGGAGGGGGAGGGAAGGGGAGGGCTC
AGCTCAGCAGTGTGCGTGGCAGTCCTGATCCTGGATTGATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG
TGTTCTTGACAAGTGTATCTTTGAAAATCAACTGTCACTGTGCTTCCTGCCTGTAATCATTTCCCTAGTT
TCCTTTCTGACTTTTTAAAATCGATGGTGACCTCTGCTTATGAGTCATGAGTGATCTGTTCGTTGTAGGT
CCCTGAGGACCTCACTCTCCACTCCTGTTTCAGGCATGGGGCGGCTGGTTCTGCTGTGGGGAGCTGCCGT
CTTTCTGCTGGGAGGCTGGATGGCTTTGGGGCAAGGAGGAGCAGGTAATTA
CRLF2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSRX_9GZW · promoter · 1212624–1212915 · regulatory

ENSRX_B8HS · enhancer · 1215160–1215684 · regulatory

· motif · 1207801–1207817 · motif

· motif · 1208341–1208353 · motif

· motif · 1208343–1208350 · motif

· motif · 1208343–1208358 · motif

· motif · 1208511–1208520 · motif

· motif · 1208644–1208652 · motif

· motif · 1208765–1208778 · motif

· motif · 1212509–1212517 · motif

· motif · 1212509–1212524 · motif

· motif · 1212659–1212672 · motif

· motif · 1212659–1212672 · motif

· motif · 1212704–1212716 · motif

· motif · 1215241–1215249 · motif

· motif · 1215312–1215325 · motif

· motif · 1215346–1215354 · motif

· motif · 1215346–1215361 · motif

· motif · 1216034–1216049 · motif

· motif · 1216039–1216051 · motif

· motif · 1216042–1216049 · motif

· motif · 1216042–1216057 · motif

· motif · 1216189–1216202 · motif

· motif · 1216357–1216369 · motif

· motif · 1216359–1216366 · motif

· motif · 1216359–1216374 · motif

CRLF2 表現量在活化的周邊單核球及 THP-1 細胞中上調;來源未提供其他調控條件或機制。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:371 aa

1 aa371 aa結構域功能區域基序訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 Q9HC73 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CRLF2 蛋白長 371 個胺基酸,屬於 type I cytokine receptor family 的 Type 5 subfamily。其 N 端訊號胜肽位於第 1–22 個胺基酸,細胞外區域為第 23–231 位,接續第 232–252 位的螺旋型跨膜區;第 253–371 位則位於細胞質側。註解另標示 Fibronectin type-III 結構域、WSXWS motif、Box 1 motif,以及第 322–347 位的無序區。

訊號胜肽1–22 aa
拓樸區域Extracellular23–231 aa
跨膜區Helical232–252 aa
拓樸區域Cytoplasmic253–371 aa
結構域Fibronectin type-III118–211 aa
功能區域Disordered322–347 aa
基序WSXWS motif200–204 aa
基序Box 1 motif261–269 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 5J11…

PDB · 5J11

X-ray · 2.56 A · C=1-221

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Secreted

Isoform 1 位於細胞膜,屬單次跨膜的第一型膜蛋白;Isoform 2 則為分泌型。 兩種異構型的定位不同。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CRL2CRLF2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

CRLF2 與 IL7R 形成異源二聚體;另有功能註記指出,CRLF2、IL7R 與 TSLP 可組成具功能的複合體。資料未提供其他互作資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CRLF2 是 thymic stromal lymphopoietin(TSLP)的受體,可與 TSLP 及 IL7R 形成具功能的複合體,並透過活化 STAT3、STAT5 刺激細胞增殖。另有相似性推論指出它也會活化 JAK2;此外,CRLF2 與造血系統發育有關。含實驗來源
證據與來源

Receptor for thymic stromal lymphopoietin (TSLP). Forms a functional complex with TSLP and IL7R which is capable of stimulating cell proliferation through activation of STAT3 and STAT5. Also activates JAK2 (By similarity). Implicated in the development of the hematopoietic system

PMID 11418668 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用CRLF2 與 IL7R 形成異源二聚體;此項資訊描述兩者組成的二聚體關係,未提供其他結合對象或實驗條件。資料庫紀錄
證據與來源

Heterodimer of CRLF2 and IL7R

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Isoform 1 位於細胞膜,是一種單次跨膜的第一型膜蛋白;此定位描述適用於該異構型。推論支持
證據與來源

Isoform 1; Cell membrane / Single-pass type I membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Isoform 2; Secreted推論支持
證據與來源

Isoform 2; Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

調控CRLF2 在活化的周邊單核球及 THP-1 細胞中上調;此註記指出特定細胞狀態與細胞系中的表現變化,未說明其調控機制。資料庫紀錄
證據與來源

Up-regulated in activated peripheral monocytes and THP-1 cells

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000400841 · 1,538 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1ACTCCTGTTTCAGGCATGGGGCGGCTGGTTCTGCTGTGGG40
41GAGCTGCCGTCTTTCTGCTGGGAGGCTGGATGGCTTTGGG80
81GCAAGGAGGAGCAGCAGAAGGAGTACAGATTCAGATCATC120
121TACTTCAATTTAGAAACCGTGCAGGTGACATGGAATGCCA160
161GCAAATACTCCAGGACCAACCTGACTTTCCACTACAGATT200
201CAACGGTGATGAGGCCTATGACCAGTGCACCAACTACCTT240
241CTCCAGGAAGGTCACACTTCGGGGTGCCTCCTAGACGCAG280
281AGCAGCGAGACGACATTCTCTATTTCTCCATCAGGAATGG320
321GACGCACCCCGTTTTCACCGCAAGTCGCTGGATGGTTTAT360
361TACCTGAAACCCAGTTCCCCGAAGCACGTGAGATTTTCGT400
401GGCATCAGGATGCAGTGACGGTGACGTGTTCTGACCTGTC440
441CTACGGGGATCTCCTCTATGAGGTTCAGTACCGGAGCCCC480
481TTCGACACCGAGTGGCAGTCCAAACAGGAAAATACCTGCA520
521ACGTCACCATAGAAGGCTTGGATGCCGAGAAGTGTTACTC560
561TTTCTGGGTCAGGGTGAAGGCTATGGAGGATGTATATGGG600
601CCAGACACATACCCAAGCGACTGGTCAGAGGTGACATGCT640
641GGCAGAGAGGCGAGATTCGGGATGCCTGTGCAGAGACACC680
681AACGCCTCCCAAACCAAAGCTGTCCAAATTTATTTTAATT720
721TCCAGCCTGGCCATCCTTCTGATGGTGTCTCTCCTCCTTC760
761TGTCTTTATGGAAATTATGGAGAGTGAAGAAGTTTCTCAT800
801TCCCAGCGTGCCAGACCCGAAATCCATCTTCCCCGGGCTC840
841TTTGAGATACACCAAGGGAACTTCCAGGAGTGGATCACAG880
881ACACCCAGAACGTGGCCCACCTCCACAAGATGGCAGGTGC920
921AGAGCAAGAAAGTGGCCCCGAGGAGCCCCTGGTAGTCCAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。