演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CRISP2CRISP-2

cysteine rich secretory protein 2

CRISP2 編碼 cysteine rich secretory protein 2,屬於 CRISP family;資料指出它可能在精子獲能期間調節部分離子通道活性與鈣離子通量。

Homo sapiens6p12.3UniProt P16562
OFFICIAL SYMBOL
CRISP2
CHROMOSOME
6
UNIPROT
P16562
PDB / ALPHAFOLD
2CQ7
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CRISP2 是蛋白質編碼基因,產物為 cysteine rich secretory protein 2,屬於 CRISP family。其蛋白質序列包含訊號區段,以及 SCP 與 ShKT 兩個註記區域。現有資料對其主要生物學角色的描述集中於精子獲能期間可能調節離子通道活性;相關作用細節見功能說明。

Official symbol
CRISP2
Gene name
cysteine rich secretory protein 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12024
UniProt
P16562
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CRISP-2CT36GAPDL5TPX1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66p12.3
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegCRISP2pq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr6:49,692,358–49,714,703
Gene span
22,346 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000339139 ★49,692,359–49,713,54310
ENST0000061672549,692,358–49,713,5909
ENST0000061891749,692,358–49,713,59411
ENST0000085693649,692,358–49,714,70310
ENST0000085693749,692,358–49,714,7039
ENST0000085693849,692,358–49,713,5949
ENST0000085693949,692,358–49,713,5708
ENST0000085694049,692,358–49,713,59410
ENST0000109907049,692,358–49,713,5709
ENST0000109907149,692,358–49,713,57010
ENST0000113613649,692,358–49,713,59010

顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CRISP2 可能參與精子獲能期間的離子通道調節。資料指出,它或可調節部分離子通道的活性,並因此影響鈣離子通量;此敘述帶有不確定性,並未指出受影響的通道種類或調節方向。

這項可能作用與精子獲能過程中的鈣離子通量相關,但現有資料沒有進一步說明 CRISP2 如何作用於離子通道,也未描述其調節是否直接、作用發生的位置或其他參與因子。因此,來源所支持的功能範圍限於「可能調節部分離子通道活性,進而調節精子獲能期間的鈣離子通量」,不宜據此延伸出更具體的分子機制或生理結果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 49713543 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CRISP2 ENST00000339139 GRCh38 chr6:49713443-49714543 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTTAAGCAGTCTAAATTCCAAAATTTTTAGTCAGTGCTGCATGAACTGAAATAAGCAGCAAAAGAAAACT
AAAACAATGTCTGTGTGCTGATCCCTTGAAATTACCTTGTAACACTGCCAAAGGAAAATGGCACTGAGCA
CCAAGTTTGTTATAGTTTCAGTTGTGCCCAAGTGAGTCTCCAGAGTTGGTGAAATCTCAAGCCTCTTATT
GCATGGCTTACAGAGAACCAAGGTATGACGGATATTAATCCTTGGCTTGACATCTTTTGACCCATCTCTC
TTCCTCTAGGTCATAAGCGAATTCACTCCTTTTCGCTTTGAAAACAACTGTGAATAGAAGAAAATGCACC
TATTACTCATCCGCCTTCTGAGAGAGAAAACATGTCTTTAACCCATGCTTGATACGTATGCTAAACTTGC
AGCCAGTAGCCTTGGGTCAGGAGTTCTGCGTATTTTCATAAGAGTTGTTCCTGTTACTCTTCGTGAATTT
TCTCACCATAAAACTGTTGCCAACGGGGAAGAGGGACAAGAACATGAAGTGTTTATGAGGGAGCCTGAAA
CTGACAACCTGTGTAACTGGAGTGCGTCGTTGGCATGACACTGGCAGCGCACTGCAAACTTAAGCACCTG
TGGACTCCTAATTAGCTCTTTAAATTGAACTACATTAATTCAGGCATTCTTGTTTGAATGCGAACGCCTC
CTTTTTCAAGCCACCCCCTGGGCAACCCGAATCCTTATATGACCTCCCTCCTCCTCCTAGTACGGCGCAG
GTATGCGAACAGACATTTTCTTTCCTCATCAACTGGTGGTAATGAGAAAAAGAGAACTCTGCTTTTCACA
AGGGAAAACGTGCAAGATTTTCTCCGTAGTAGGGGAGGCGGGGGCGATGGGAGGAGAGCAGCTCACGTAG
GCAGATAGCGGCGATGAAAGCATAAAGCCCAGTGACGTCGCCCACACGTGGCGCCTGGCAAGTGAACAAT
CGCGGTGAGAGGGGCGCGCCGCAGCTCCTCAACGCCGCAACGCGCCGGCCCAACTGCAGGAAGGTCTGTG
CTCTGGAGCCAGGGTAAATGTAAGACCCGGATTGGAGACTAGAAATGGCTA
CRISP2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CRISP2_1 ↗6:49,713,541負股49,713,531–49,713,590

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR6_5FNNFB · CTCF_binding_site · 49708569–49708590 · regulatory

ENSR6_5FNNFH · CTCF_binding_site · 49708613–49708634 · regulatory

ENSR6_83GGJG · promoter · 49713533–49713690 · regulatory

· motif · 49708571–49708587 · motif

· motif · 49708615–49708631 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:243 aa

1 aa243 aa結構域訊號胜肽
依 P16562 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CRISP2 蛋白質長 243 個胺基酸。序列註記包含位於第 1–21 個胺基酸的訊號區段、位於第 41–169 個胺基酸的 SCP domain,以及第 205–238 個胺基酸的 ShKT domain;蛋白質屬於 CRISP family。

訊號胜肽1–21 aa
結構域SCP41–169 aa
結構域ShKT205–238 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2CQ7…

PDB · 2CQ7

NMR · - · A=204-239

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

資料將 CRISP2 註記為分泌型蛋白質;未提供其定位變化條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CRISP-2CRISP2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

CRISP2 與 NSUN4 isoform 3 有互作註記;資料未進一步說明這是實體結合或複合體關係,也未提供互作的功能結果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CRISP2 可能在精子獲能期間調節部分離子通道的活性,並因此調節鈣離子通量。來源未指出相關通道的種類或活性變化方向,因此此功能及其作用細節仍應保留不確定性。推論支持
證據與來源

May regulate some ion channels' activity and thereby regulate calcium fluxes during sperm capacitation

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用CRISP2 與 NSUN4 isoform 3 有互作關係的註記;來源未進一步界定互作的性質,也未說明其功能意義。推論支持
證據與來源

Interacts with NSUN4 isoform 3

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted推論支持
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000339139 · 1,365 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCAGCTCCTCAACGCCGCAACGCGCCGGCCCAACTGCAGG40
41AAGGTCTGTGCTCTGGAGCCAGGGTAAATGGTTATAAAAT80
81TATACACCATGGCCCTCCTAAAGACACTCTAGGAAAACCA120
121TGTCATCCTGATCTTAAAACACCTGCAAGAAAGAGCACAG160
161TACTTCACCATTAATAAAGTAGATATTTCATCCTGCTCAG200
201AAAACCAACATTTCCAGCAATGGCTTTACTACCGGTGTTG240
241TTTCTGGTTACTGTGCTGCTTCCATCTTTACCTGCAGAAG280
281GAAAGGATCCCGCTTTTACTGCTTTGTTAACCACCCAGTT320
321GCAAGTGCAAAGGGAGATTGTAAATAAACACAATGAACTA360
361AGGAAAGCAGTCTCTCCACCTGCCAGTAACATGCTAAAGA400
401TGGAATGGAGCAGAGAGGTAACAACGAATGCCCAAAGGTG440
441GGCAAACAAGTGCACTTTACAACATAGTGATCCAGAGGAC480
481CGCAAAACCAGTACAAGATGTGGTGAGAATCTCTATATGT520
521CAAGTGACCCTACTTCCTGGTCTTCTGCAATCCAAAGCTG560
561GTATGACGAGATCCTAGATTTTGTCTATGGTGTAGGACCA600
601AAGAGTCCCAATGCAGTTGTTGGACATTATACTCAGCTTG640
641TTTGGTACTCGACTTACCAGGTAGGCTGTGGAATTGCCTA680
681CTGTCCCAATCAAGATAGTCTAAAATACTACTATGTTTGC720
721CAATATTGTCCTGCTGGTAATAATATGAATAGAAAGAATA760
761CCCCGTACCAACAAGGAACACCTTGTGCCGGTTGCCCTGA800
801TGACTGTGACAAAGGACTATGCACCAATAGTTGCCAGTAT840
841CAAGATCTCCTAAGTAACTGTGATTCCTTGAAGAATACAG880
881CTGGCTGTGAACATGAGTTACTCAAGGAAAAGTGCAAGGC920
921TACTTGCCTATGTGAGAACAAAATTTACTGATTTACCTAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。