基因總覽
CRIPTO（cripto, EGF-CFC family member）是蛋白質編碼基因，產物為 188 個胺基酸的蛋白質，屬於 EGF-CFC（Cripto-1/FRL1/Cryptic）家族。蛋白質具有 N 端訊號序列與 EGF-like 區域，並以 GPI 錨定於細胞膜。其主要角色與 Nodal 訊號相關；此外，來源指出它可能參與後續形成中胚層的上胚層細胞命運決定，但此作用以可能性描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000296145 ★ | 46,577,788–46,582,457 | 6 |
| ENST00000938305 | 46,573,633–46,584,684 | 7 |
| ENST00000863382 | 46,574,482–46,584,684 | 7 |
| ENST00000938306 | 46,574,482–46,584,684 | 7 |
| ENST00000542931 | 46,574,534–46,584,684 | 6 |
| ENST00000938307 | 46,577,190–46,584,684 | 4 |
| ENST00000938308 | 46,577,190–46,584,684 | 6 |
| ENST00000938309 | 46,577,190–46,584,684 | 6 |
| ENST00000938311 | 46,577,190–46,584,684 | 5 |
| ENST00000938312 | 46,577,190–46,584,684 | 6 |
| ENST00000938313 | 46,577,190–46,584,684 | 3 |
| ENST00000938314 | 46,577,190–46,584,684 | 6 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CRIPTO 參與 Nodal 訊號傳遞。與細胞膜相連的 CRIPTO 可在同一細胞上作為 Nodal 的共受體，也就是以 cis 方式協助 Nodal 訊號作用。這項功能使 CRIPTO 不只是膜上的蛋白質，也參與受體訊號傳遞的調節。
CRIPTO 的作用形式會隨其是否仍連接於細胞膜而改變。TMEM8A 可促進 CRIPTO 脫離細胞膜；被釋出的可溶性 CRIPTO，則能在其他細胞上作為 Nodal 共受體。因此，CRIPTO 的脫落可調節 Nodal 訊號，使其共受體作用不再限於原本表現 CRIPTO 的細胞，而能延伸至其他細胞。來源描述的是訊號調節方式，並未指出其影響的方向或幅度。
此外，CRIPTO 可能參與上胚層細胞的命運決定；這些細胞之後會形成中胚層。此功能以「可能」描述，來源未進一步說明具體分子機制或作用條件，因此不宜視為已確立的因果關係。
Promoter 與基因調控
>CRIPTO ENST00000296145 GRCh38 chr3:46576788-46577888 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TAACCCGGAGGATTGAAATGTTAGGTGAGGCGACTCCGGCTCATAGACGCGCCTCTCCATCTGGGGCGTC TGGCACTTAGTGGAACCACTCAATAAACACGTTTACCCCTGCAAGCGGCACATCAGAGTCCGGGGGTAAT TCTCGGTGTCGTGGGGCCAGGACGGCGAGGGGCTGGAAGAGGCCGCCCTGTGGGAGCTGGGAGGCTGAGA TAAATTCCCGTGATTGGGGGCTGAAATGGCCTCCCATGCCGGACTGCCGTGGTTCTAGAACTTTTTCCTG GAACAGGCCGGCACTCCCACTGGAGAGTCCCAGCTGCTGCGCCTCTGGCCGCCCCTCCCCTCTCCCGGGC ACCTGGCGCCGGCTCCCGCGTCCTTTCAGGAATTCACGTCCGCCTGGAATTTGCACTTCAAGTCTGGAGC CCCCAAGGAACCCCTCCTGACCCTGAACTTCTATCTCAGTTTCAAGCTTCCTAGTCTTCCCCACACACAC ACACCTAGCTCCTCAGGCGGAGAGCACCCCTTTCTTGGCCACCCGGGTATCCCCCAGGGGGAGTACGGGG CTCAAAACACCCTTCTGGAAAAACAAAGGTGGAAGCAAATTTCAGGAAGTAAAACTTCCTGAAATAAAAT AAAATATCGAATGCCTTGAGACCCATACATTTTCAGGTTTTCCTAATTAAAGCAATTACTTTCCACCACC CCTCCAACCTGGAATCACCAACTTGATTAGAGAAACTGATTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTCCCAAAAGA GTACCTCTGATCATTTTAGCCTGCAACTAATGATAGAGATATTAGGGCTAGTTAACCACAGTTTTACAAG ACTCCTCTTCCCGCGTGTGGGCCATTGTCATGCTGGTGGGCGTCCCGCCCACCTGAAAGGTCTCCCCGCC CCGACTGGGGTTTGTTGTTGAAGAAGGAGAATCCCCGGAAAGGCTGAGTCTCCAGCTCAAGGTCAAAACG TCCAAGGCCGAAAGCCCTCCAGTTTCCCCTGGACGCCTTGCTCCTGCTTCTGCTACGACCTTCTGGGGAA AACGAATTTCTCATTTTCTTCTTAAATTGCCATTTTCGCTTTAGGAGATGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TDGF1_2 ↗ | 3:46,577,272 | 正股 | 46,577,223–46,577,282 |
| TDGF1_1 ↗ | 3:46,577,788 | 正股 | 46,577,739–46,577,798 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_9NH5C · promoter · 46574115–46574544 · regulatory
ENSR3_BC8KC · enhancer · 46575208–46575773 · regulatory
ENSR3_BC8KK · enhancer · 46576779–46577321 · regulatory
· motif · 46574518–46574528 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：188 aa
CRIPTO 蛋白質長 188 個胺基酸，N 端第 1–30 位為訊號序列，第 78–107 位具有 EGF-like 區域。其家族歸屬為 EGF-CFC（Cripto-1/FRL1/Cryptic）家族；來源並指出蛋白質以 GPI 錨定於細胞膜。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CRIPTO 可藉由 GPI 錨定於細胞膜，也可被釋出成為分泌形式。 GPI 錨被切除時，CRIPTO 會由細胞膜釋放；TMEM8A 促進其脫落後，則可形成能在其他細胞上作用的可溶形式。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
CRIPTO 與 activin type-1 receptor ACVR1B 有交互作用。來源僅記載此交互作用，未進一步說明兩者是否形成特定複合體或其結合對訊號功能的影響。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CRIPTO 是以 GPI 錨定於細胞膜的蛋白質，參與 Nodal 訊號傳遞。與細胞相連的 CRIPTO 可在同一細胞上作為 Nodal 共受體；TMEM8A 促使 CRIPTO 脫落後，可溶性 CRIPTO 則能在其他細胞上擔任 Nodal 共受體。此外，CRIPTO 可能參與上胚層細胞的命運決定，這些細胞之後會形成中胚層。 | 含實驗來源 | 證據與來源GPI-anchored cell membrane protein involved in Nodal signaling. Cell-associated CRIPTO acts as a Nodal coreceptor in cis. Shedding of CRIPTO by TMEM8A modulates Nodal signaling by allowing soluble CRIPTO to act as a Nodal coreceptor on other cells. Could play a role in the determination of the epiblastic cells that subsequently give rise to the mesoderm PMID 11909953 ↗ · PMID 27881714 ↗ |
| 交互作用 | CRIPTO 與 activin type-1 receptor ACVR1B 有交互作用。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | CRIPTO 可位於細胞膜並以 GPI 錨定，也可呈分泌形式；GPI 錨切除後，蛋白質會由細胞膜釋放。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Lipid-anchor, GPI-anchor; Secreted; Released from the cell membrane by GPI cleavage PMID 18930707 ↗ · PMID 27881714 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTTTCCCCTGGACGCCTTGCTCCTGCTTCTGCTACGACC40TTCTGGGGAAAACGAATTTCTCATTTTCTTCTTAAATTGC80CATTTTCGCTTTAGGAGATGAATGTTTTCCTTTGGCTGTT120TTGGCAATGACTCTGAATTAAAGCGATGCTAACGCCTCTT160TTCCCCCTAATTGTTAAAAGCTATGGACTGCAGGAAGATG200GCCCGCTTCTCTTACAGTGTGATTTGGATCATGGCCATTT240CTAAAGTCTTTGAACTGGGATTAGTTGCCGGGCTGGGCCA280TCAGGAATTTGCTCGTCCATCTCGGGGATACCTGGCCTTC320AGAGATGACAGCATTTGGCCCCAGGAGGAGCCTGCAATTC360GGCCTCGGTCTTCCCAGCGTGTGCCGCCCATGGGGATACA400GCACAGTAAGGAGCTAAACAGAACCTGCTGCCTGAATGGG440GGAACCTGCATGCTGGGGTCCTTTTGTGCCTGCCCTCCCT480CCTTCTACGGACGGAACTGTGAGCACGATGTGCGCAAAGA520GAACTGTGGGTCTGTGCCCCATGACACCTGGCTGCCCAAG560AAGTGTTCCCTGTGTAAATGCTGGCACGGTCAGCTCCGCT600GCTTTCCTCAGGCATTTCTACCCGGCTGTGATGGCCTTGT640GATGGATGAGCACCTCGTGGCTTCCAGGACTCCAGAACTA680CCACCGTCTGCACGTACTACCACTTTTATGCTAGTTGGCA720TCTGCCTTTCTATACAAAGCTACTATTAATCGACATTGAC760CTATTTCCAGAAATACAATTTTAGATATCATGCAAATTTC800ATGACCAGTAAAGGCTGCTGCTACAATGTCCTAACTGAAA840GATGATCATTTGTAGTTGCCTTAAAATAATGAATACATTT880CCAAAATGGTCTCTAACATTTCCTTACAGAACTACTTCTT920ACTTCTTTGCCCTGCCCTCTCCCAAAAAACTACTTCTTTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。