基因總覽
CREG2 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 cellular repressor of E1A stimulated genes 2。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 2q11.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000324768 ★ | 101,345,550–101,387,503 | 4 |
| ENST00001138956 | 101,345,550–101,387,697 | 4 |
| ENST00001115850 | 101,381,560–101,387,697 | 2 |
| ENST00001115851 | 101,381,568–101,387,697 | 3 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>CREG2 ENST00000324768 GRCh38 chr2:101387403-101388503 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ATTCAGAAAAGAATAGCTTTGCAGGGGCTGAGAAAAGCATGTTAAGCTTGCCTTTCGAAACTCATCCATC AGATGAGTCACTTCTCCCATGAGGAGGCAGGAGTAAGAAAACAGCCATGGCCGGGCGTGGTGGTTCACAC CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGAAGGATCACCTGAGCCTGGGAAGTTGAGGCTGCAGTG AGCTGTGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGAAGACAGAGCAAGACCCTTTATCAGAAAAATAAAAAA TAAAAAAGGGTGATTGCATCTGTACTGAACATATATTGGCTTTTTTTCTTGTTCTATTCCCTAAACAATA CAGTAAACAACAATTTACATAGTGTTTACATTGTATTAGGCATTTTATAAGCAAATCAGATATTAAAGGA AGATGTGCATGGGTTATATGCAAATGCTGCACTATTTTTTTATAAGGGACTTCAGCATCTCTGGATTTTG GTATCCACGGGGGTCCTGGAACCAATACCCCTCGGATACCAAGGGACTGCTGTAGAGCGTTTGCTCCATG CCACACACTGTTCTAAGCCTCTTCAAATATTAATCGTTCAACCGTCCCATCCATCATCCTTAAGAGGTAG ATATTATCTTTGTCAGCTAATGAAGGAAATGGGCACAGAGAGGTTAAGTGGCTTGGCAGGTCTCACAGCT GTTGAGCAGACGCGTGTATTAAGCCGGGATTTGAACGCCCACCCTCTGGCTGCGGAACCTGTGCCATCCT GCAGGAAACGAACCCATCCCGGGACCTGGCGCGCGAGGAGGACTCCGCAGGATGCGCGGCGTGTGCGTGG AACCTGGTCTTCTGCGAGCCTGGACTTCTGAGCTTCGCGCGCGGCTGCAGGGATTCGCCGGGACTCGCGC GGGGGACCGCGCCCGGGGATCCTGCAGGGGCGGGAAGGGGGCTCGGGCTCCTTGCTTCCGCCGCAGTGGG GCGCTGCCGGGCTCCCCGGCACTAGCGCTGCTGGCGGCCCCGGCGGCCGGGCGTGCTGCCTGCAAGATGT CCGTGCGCCGCGGCCGGCGGCCGGCGCGGCCGGGGACCCGCCTCTCCTGGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CREG2_1 ↗ | 2:101,387,503 | 負股 | 101,387,493–101,387,552 |
| CREG2_2 ↗ | 2:101,396,475 | 負股 | 101,396,465–101,396,524 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_93H8JP · promoter · 101387493–101387992 · regulatory
ENSR2_93H8JX · enhancer · 101388304–101388658 · regulatory
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:290 aa
Protein CREG2 長 290 個胺基酸,屬於 CREG family。序列註解指出其第 1 至 31 位胺基酸為訊號區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CREG2 註解為分泌型蛋白質。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | Secreted | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACTAGCGCTGCTGGCGGCCCCGGCGGCCGGGCGTGCTGCC40TGCAAGATGTCCGTGCGCCGCGGCCGGCGGCCGGCGCGGC80CGGGGACCCGCCTCTCCTGGCTGCTGTGCTGCAGCGCCCT120GCTGTCCCCGGCCGCGGGCTACGTGATCGTGAGCTCCGTG160TCTTGGGCCGTCACCAACGAGGTGGACGAGGAGCTGGACA200GCGCCTCCACTGAGGAGGCTATGCCCGCGCTGCTAGAGGA240TTCGGGCAGCATCTGGCAGCAAAGCTTCCCCGCCTCTGCC280CACAAGGAGGACGCGCACCTGCGGCCCCGGGCGGGCGCCG320CCCGGGCCAGGCCGCCCCCCGCGCCACCCGGGATGTTCTC360CTACCGGCGCGAGGGCGGCCAGACGGCCAGTGCGCCCCCG400GGCCCTAGACTGCGCGCCGCCACCGCCCGCTCCCTGGCCC440ATGCCAGCGTCTGGGGCTGCCTGGCCACCGTGTCCACCCA480CAAGAAGATCCAAGGACTGCCATTTGGGAACTGCCTGCCC520GTCAGTGATGGCCCCTTCAACAATAGCACTGGGATTCCTT560TCTTCTACATGACAGCCAAGGACCCCGTGGTGGCTGATCT600GATGAAGAACCCCATGGCCTCGCTGATGCTGCCAGAATCA640GAAGGGGAGTTCTGCAGAAAAAACATCGTTGATCCGGAAG680ATCCCCGATGTGTCCAGTTAACGCTCACTGGCCAGATGAT720CGCAGTGTCTCCAGAAGAAGTAGAATTTGCCAAGCAAGCC760ATGTTTTCAAGGCACCCAGGGATGAGGAAGTGGCCTCGTC800AATATGAATGGTTCTTTATGAAGATGAGGATAGAACATAT840CTGGCTTCAGAAATGGTATGGAGGCGCATCCAGTATTTCA880AGGGAGGAATATTTCAAAGCAGTTCCCAGAAAGGCCTGAT920GGAGTGAGAAGAAAGTCCTTGGTGTTTGCACTTAAATGAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。