基因總覽
CRAMP1（cramped chromatin regulator 1）是蛋白質編碼基因，產物屬於 cramped family，長度為 1,269 個胺基酸。其蛋白質含有 SANT 結構域，並有多段被註記為無序的區域，分布於蛋白質不同位置。來源將 CRAMP1 描述為轉錄因子，並指出它與組蛋白 H1 基因的表現調控有關；其結構特色提供了認識此蛋白質的基本線索，但現有資料未進一步說明各區域的作用。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000397412 ★ | 1,612,360–1,677,908 | 21 |
| ENST00000674071 | 1,612,337–1,614,798 | 2 |
| ENST00000931996 | 1,612,360–1,677,908 | 21 |
| ENST00000931997 | 1,612,360–1,677,908 | 20 |
| ENST00000931998 | 1,612,360–1,677,908 | 21 |
| ENST00000931999 | 1,612,360–1,677,908 | 20 |
| ENST00000932000 | 1,614,146–1,677,908 | 21 |
| ENST00000293925 | 1,614,640–1,677,906 | 20 |
| ENST00000415022 | 1,662,605–1,668,108 | 5 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CRAMP1 是轉錄因子，來源指出它能特異性促進組蛋白 H1 基因的表現。它會與 NPAT 及 GON4L 一同結合這些基因的啟動子，並正向調控其轉錄。相關基因包括 H1-2、H1-3、H1-4、H1-5，以及 H1-10/H1x。
這些資料顯示，CRAMP1 的功能重點是參與特定組蛋白 H1 基因的轉錄調控，而非泛指所有組蛋白基因。其與 NPAT、GON4L 的共同作用同時涉及啟動子結合及轉錄促進；來源未提供更細節的分子機制，也未說明此調控在其他生物過程中的延伸作用。
Promoter 與基因調控
>CRAMP1 ENST00000397412 GRCh38 chr16:1611360-1612460 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CGGGCGCGGTGGCGCCTCTAGTCTCGGCTACAGGAGGCTGAGGGAGGAGAATCGCCTGAGCCCCGGGAGG CGGAGACTGCAGCGAGCCGAGATCGGGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGTCAAAAAAAAA AAAAAAGAAAAGAAAAAGAAACACTGGAATTTGAGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGCAAACCCAGTAC TTTGGGAGGCTGAGACGAGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACTAGCTTGGCCAACATGGTGAAA CCCCGTATGTACTAAAAACACACAAATTAGCGAGTATGGTGGCGCGCGCCTGTAATTCCAACTACTCGGG AGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGCA CTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAACACTGGAAT TTGAAAAACACCCCTCTGCTTTCTTGCTATGAAGAAAATGACCAAGTGCCCAGCGCCGCTCGGCTACGCT AACGTAGCGCAGAAGCACATACTCCACCCAGGAAAGGGTGCGCTTAACTGCCTCAGACGTGCTTCCACAC TTCTCAGAACTCAGGTTCGCGCCCGATTCCACACTCCGAGCTACCACGCCGTTTTCTTCTCACGTATCCG TCAACACTGCTGCGGCCAATCACAGCACGGGCCCTGGCCTATTGGCTGTCTGTCCACCAATCCAAAGAGA CGCACAGTCCGCAAGGTCGCGAGGCTGGCGTCACAACACTACTGGCGCCGCGGGCTCGCCCCCGACGCCC ACCGGGCTCGTACGTGCGAGCGCGCCCGCCCAGCGCTAGCCAATGGGAGCGCCGTTTTGGGGAGACGGGC CCGAAGAAACATTGGGGGTGCTCGCCCCCGCGTTCGTCGCCCCGCCCCGCGCGCCCGCGCACCCCGGCCC CGCCCCCGCGCGCCGTCCGTGAGGTCCCCACCGGCCGCCGTAGCCGGAACTGCTGCTGAGGGCGGCGGGC CGGCTTCGCTAGGGTGAGTGGCGGCAGTATCTGCGTCCGCAGCCCCCGCAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR16_D469 · enhancer · 1609790–1612061 · regulatory
ENSR16_9M9H · promoter · 1612062–1612370 · regulatory
ENSR16_BBMB · enhancer · 1612371–1613149 · regulatory
ENSR16_9MB5 · promoter · 1614150–1614650 · regulatory
· motif · 1607428–1607442 · motif
· motif · 1607428–1607442 · motif
· motif · 1610052–1610067 · motif
· motif · 1610058–1610070 · motif
· motif · 1610060–1610067 · motif
· motif · 1610440–1610453 · motif
· motif · 1610566–1610579 · motif
· motif · 1610716–1610727 · motif
· motif · 1610716–1610727 · motif
· motif · 1610805–1610814 · motif
· motif · 1610805–1610814 · motif
· motif · 1611503–1611523 · motif
· motif · 1612290–1612303 · motif
· motif · 1612332–1612345 · motif
· motif · 1612338–1612351 · motif
· motif · 1612371–1612388 · motif
· motif · 1612380–1612391 · motif
· motif · 1612382–1612391 · motif
· motif · 1612448–1612461 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1269 aa
CRAMP1 蛋白質長 1,269 個胺基酸，屬於 cramped family，含有 SANT 結構域。多段序列被註記為無序區域，分布在蛋白質 N 端及數個內部與後段區域；來源未說明這些區域各自的功能。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CRAMP1 位於細胞核與染色體，並特異性結合具有轉錄活性的組蛋白基因。 它可透過與 NPAT、GON4L 的關聯被募集至組蛋白基因座小體（HLB）；來源未提供其他定位改變或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Chromosome。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
CRAMP1 分別與 NPAT、GON4L 互作；這兩項互作均與 CRAMP1 被募集至組蛋白基因座小體（HLB）有關。另有資料指出，CRAMP1、NPAT 與 GON4L 一同結合組蛋白 H1 基因啟動子並調控轉錄，但未將三者描述為特定複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CRAMP1 是轉錄因子，能特異性促進組蛋白 H1 基因的表現。它與 NPAT、GON4L 一同結合 H1-2、H1-3、H1-4、H1-5 及 H1-10/H1x 的啟動子，並正向調控這些基因的轉錄。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcription factor, which specifically drives expression of histone H1 genes. Binds to the promoters of H1 genes (H1-2, H1-3, H1-4, H1-5 and H1-10/H1x) together with NPAT and GON4L, positively regulating their transcription PMID 40516528 ↗ · PMID 40516529 ↗ |
| 交互作用 | CRAMP1 與 NPAT 互作，也與 GON4L 互作；這兩種互作都促進 CRAMP1 被募集至組蛋白基因座小體（HLB）。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with NPAT; promoting CRAMP1 recruitment to histone locus bodies (HLB). Interacts with GON4L; promoting CRAMP1 recruitment to histone locus bodies (HLB) PMID 40516528 ↗ · PMID 40516529 ↗ |
| 細胞定位 | CRAMP1 位於細胞核與染色體，並特異性結合具有轉錄活性的組蛋白基因。它可透過與 NPAT、GON4L 的關聯被募集至組蛋白基因座小體（HLB）。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Chromosome; Specifically binds transcriptionally active histone genes. Recruited to histone locus bodies (HLB) via its association with NPAT and GON4L PMID 40516528 ↗ · PMID 40516529 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GAGGTCCCCACCGGCCGCCGTAGCCGGAACTGCTGCTGAG40GGCGGCGGGCCGGCTTCGCTAGGGTGAGTGGCGGCAGTAT80CTGCGTCCGCAGCCCCCGCAGCCGCGCGCCGGCCCGCGGA120GGGGACGTGCCGGGGCTAGCGCCGCTCGACCAGTCGCTTC160CGAGGCGGACGACCAGCCCGGCGTTGCGGCCTCCCTGCAG200CCGGCGCTCGGGGGCCGGGGCTGCCCGGCCCGGCTGGTTC240TGCGGGCACCCGGGGAGGCCCCGGGAAGCCAGGCTGCCGC280CCGGCGTTGATGAAAAAGGATGACAGTGAAGTTGGGCGAC320GGCGGCAGCGGGGAGGACGGGCTCAAGAAGCTGGGCAAGC360GGGCGGCCGATGAGGAGTCCCTGGAAGGAGAAGGGGCCGG400CGGCGCAGACGCGGCCGAGGAGAGCAGCGGCACAAAGAGG440GACGAGAAGACCCCCCGGGCCGGCGCCGACGGCCCCCCCG480CGCCCCCCGGCGCGCCGCAGGCGCCGTCCCCGCCGCAGGG520CAGCCCCCAGGACCAGCACCACTTCCTCCGGTCCAGCGTG560CGGCCGCAGAGCAAGAGGCCCAGGAAGGATCCTCCGAGCG600CTGTGGGGAGCGGCAACGCCGGTGGCTCGGGGCCCCGCGG640AAAAGGAGCTGAAGGTGGTGGATCATCGTCTGGAAATGTG680TCTGGGGTTGCCCCTGCTGCCCCTGCAGGGGGCTCGCGCT720CCTCCTCCCGGAACTTAGGGTCTTCTGGTGGCGAGAAGGA760AGAAGGCAAAAAGGTCCGGCGGCAGTGGGAGTCGTGGAGC800ACAGAGGACAAGAACACCTTCTTCGAGGGGCTGTACGAGC840ATGGGAAAGACTTTGAAGCGATTCAGAACAACATTGCGCT880GAAGTACAAGAAGAAAGGCAAGCCAGCAAGCATGGTGAAG920AACAAGGAGCAGGTCCGCCACTTCTACTACCGCACCTGGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。