基因總覽
CPVL(carboxypeptidase vitellogenic like)是蛋白質編碼基因,其產物長 476 個胺基酸,屬於 peptidase S10 family。現有資料僅提供其家族歸屬、長度與訊號序列註記,並概述數項可能參與的生物學過程;尚不足以進一步描述其完整結構或作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000265394 ★ | 28,995,235–29,146,537 | 13 |
| ENST00000396276 | 28,994,636–29,146,556 | 13 |
| ENST00000409850 | 28,994,636–29,195,279 | 17 |
| ENST00000886318 | 28,994,636–29,195,279 | 15 |
| ENST00000886319 | 28,994,636–29,195,279 | 16 |
| ENST00000886320 | 28,994,636–29,147,059 | 13 |
| ENST00000886321 | 28,994,636–29,146,548 | 12 |
| ENST00000886322 | 28,994,636–29,146,548 | 13 |
| ENST00000886323 | 28,994,636–29,146,548 | 11 |
| ENST00000886324 | 28,994,636–29,146,548 | 5 |
| ENST00000886325 | 28,994,636–29,146,548 | 11 |
| ENST00000886326 | 28,994,636–29,146,452 | 13 |
顯示 12/44 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
資料指出,CPVL 可能參與溶酶體內對已被吞噬顆粒的消化。這項描述將其功能與吞噬物質進入溶酶體後的處理相連,但未提供特定底物、反應步驟或實驗條件,因此其在此過程中的具體作用仍無法確定。
CPVL 也可能參與發炎相關的蛋白酶級聯反應。來源未說明它在級聯中的位置、作用對象或調控方向,故目前只能保留其可能涉入此類反應的描述,不能據此判定它會促進或抑制發炎。
此外,CPVL 可能參與抗原呈現前的胜肽修整。此說法指出它與供抗原呈現使用的胜肽處理有關,但未交代胜肽的來源、修整方式或後續呈現步驟。上述功能均以「可能參與」表述;現有資料未提供足以界定其分子機制或生物學效應的細節。
Promoter 與基因調控
>CPVL ENST00000265394 GRCh38 chr7:29146437-29147537 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACTTAGGAGAAAACAGATATTCAGTGACATTAGTTTGTTCCAGCTCGTAAAACTAGTGCTTTAGTTAGCC TTAGTTGCATAACAAACTACGCGAAACTGAAAGTGGCTTAAAACAATTTTTCCCCCTGACTGTCGGGTTG GCTGGGCTGCTCTACTGCGGGTTTCCCTGGGCTCACTCCTGCAGCTAGCTGTGAGGAGATGGAGGTTGGC CCGGGACAGTGCAGAAGATTCCCCGTGGCCTCTCCCACCTGTCTGGCAGTTGACGCTGCTGTTGCTGATA ATGATGACCCTCCTTTATTTTGTGTTATCTACTTGCCATTGCAACCTCCTTGCCTTTTTTAGTTCTTGCT CCCGTACTGTCTGGCTCGATGCCCAGCACCTGGTGGTGGCTAATAATATACACTCAGGTCACTTACAAGC AATGTGACCCTGGATGGGTTACTTAACCTCACTTAGTTTGTGTCCCCCAATTGCAAAATGGGTATAATGG TACAGAACACATCAGGTGGCTCTGAGACTCCAGCGCAGTGATTCAGGAGAGTGCTTGGCAGGACAGTGGC ACTTGGTGCGAGCTTACTGCTAGTGCAGCTGGAATGTAGACCATCAGCGAACGTGTGTTGCCTTTTTAAA CAGTGGGAATCAAACACCACTCGCTTTCCAAATGTAAATCCTGGGCTTGCAAGTAAGTCCTAGAGTGCAG AAATAATTTCAAAATACAGGGTTGAAATTTTAAGATAGCAGCTTTTAAAAACTGGGAGACAAAATCAAAA TAAAACAAAGGGACAAACCAACCTGAATGGCACCCCGCCGATGCTCTTCATTAATTTTTAAGATTCCACC CTGGGGCTGCTTGCTTCTTCCAGCATGGGAAGCGCTGACTTGATGCGGCCAGGTTTCTGGGACCAGGAGG TTGGGACACGACGACGCACTTTTTGCCCTGTGGGTCTGGGTCATGTGAGCCTAGAGGAGCGCTTAAAGGC TCGAGTTCTGCAGGGTCCTCGTGACTGGGTGGGGCTGCCTCACTTCTGCCTGATTTGGGAAGCGCTGCAA GGACAACCGGCTGGGGTCCTTGCGCGCCGCGGCTCAGGGAGGAGCACCGAC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CPVL_1 ↗ | 7:29,146,535 | 負股 | 29,146,525–29,146,584 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_B7R6Q · enhancer · 29145805–29146486 · regulatory
ENSR7_B7R6S · promoter · 29146487–29147027 · regulatory
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:476 aa
CPVL 蛋白長 476 個胺基酸,歸屬於 peptidase S10 family。序列註解將第 1 至 22 位胺基酸標示為訊號序列;現有資料未提供其他結構域或功能區域的註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CPVL 可能參與溶酶體內對已被吞噬顆粒的消化,也可能涉入發炎相關的蛋白酶級聯反應,並參與抗原呈現前的胜肽修整。資料未詳述各作用的分子步驟或條件。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源May be involved in the digestion of phagocytosed particles in the lysosome, participation in an inflammatory protease cascade, and trimming of peptides for antigen presentation |
核酸與蛋白質序列
GTGACTGGGTGGGGCTGCCTCACTTCTGCCTGATTTGGGA40AGCGCTGCAAGGACAACCGGCTGGGGTCCTTGCGCGCCGC80GGCTCAGGGAGGAGCACCGACTGCGCCGCACCCTGAGAGA120TGGTTGGTGCCATGTGGAAGGTGATTGTTTCGCTGGTCCT160GTTGATGCCTGGCCCCTGTGATGGGCTGTTTCGCTCCCTA200TACAGAAGTGTTTCCATGCCACCTAAGGGAGACTCAGGAC240AGCCATTATTTCTCACCCCTTACATTGAAGCTGGGAAGAT280CCAAAAAGGAAGAGAATTGAGTTTGGTCGGCCCTTTCCCA320GGACTGAACATGAAGAGTTATGCCGGCTTCCTCACCGTGA360ATAAGACTTACAACAGCAACCTCTTCTTCTGGTTCTTCCC400AGCTCAGATACAGCCAGAAGATGCCCCAGTAGTTCTCTGG440CTACAGGGTGGGCCGGGAGGTTCATCCATGTTTGGACTCT480TTGTGGAACATGGGCCTTATGTTGTCACAAGTAACATGAC520CTTGCGTGACAGAGACTTCCCCTGGACCACAACGCTCTCC560ATGCTTTACATTGACAATCCAGTGGGCACAGGCTTCAGTT600TTACTGATGATACCCACGGATATGCAGTCAATGAGGACGA640TGTAGCACGGGATTTATACAGTGCACTAATTCAGTTTTTC680CAGATATTTCCTGAATATAAAAATAATGACTTTTATGTCA720CTGGGGAGTCTTATGCAGGGAAATATGTGCCAGCCATTGC760ACACCTCATCCATTCCCTCAACCCTGTGAGAGAGGTGAAG800ATCAACCTGAACGGAATTGCTATTGGAGATGGATATTCTG840ATCCCGAATCAATTATAGGGGGCTATGCAGAATTCCTGTA880CCAAATTGGCTTGTTGGATGAGAAGCAAAAAAAGTACTTC920CAGAAGCAGTGCCATGAATGCATAGAACACATCAGGAAGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。