基因總覽
CNTNAP2（contactin associated protein 2）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 neurexin 家族。蛋白質長 1,331 個胺基酸，具有單次跨膜結構：細胞外區域約涵蓋胺基酸 28 至 1,262，跨膜螺旋位於 1,263 至 1,283，之後接上短的細胞質區域。其細胞外部分包含多種結構域，包括 F5/8 type C、數個 Laminin G-like 區域、EGF-like 區域及 Fibrinogen C-terminal 區域；此外，序列註解指出胺基酸 1,026 至 1,045 為無序區。這些特徵構成具有大型細胞外部分、單次跨膜區及細胞質尾端的膜蛋白架構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000361727 ★ | 146,116,801–148,420,998 | 24 |
| ENST00000625365 | 146,116,002–146,839,861 | 4 |
| ENST00000628930 | 148,133,684–148,420,998 | 9 |
| ENST00000463592 | 148,339,461–148,420,998 | 4 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CNTNAP2 參與有髓軸突的組織，並與 CNTNAP1 一同支持軸突在徑向及縱向上的排列。來源指出，這項作用涉及有髓軸突的整體組織，但沒有進一步說明兩種蛋白質如何協同完成此過程。
在有髓神經纖維中，神經衝動以跳躍式傳導方式傳遞；此傳導依賴軸突上不同功能區域的形成。CNTNAP2 參與建立這些功能上彼此區分的區域，因而與跳躍式傳導所需的軸突組織有關。現有資料未詳述其形成區域的分子步驟或對傳導效率的具體影響。
CNTNAP2 也標示軸突與膠細胞交界處的旁結區（juxtaparanodal region），使其與有髓軸突上的特定區域分布相連。另有一項帶有「可能」限定的註解，指出 CNTNAP2 可能是形成 gap junction 所必需；此項功能的確定程度有限，不宜視為已確立的作用。這些資料共同將 CNTNAP2 的功能指向有髓軸突的空間組織，以及與神經衝動跳躍式傳導相關的區域形成。
Promoter 與基因調控
>CNTNAP2 ENST00000361727 GRCh38 chr7:146115801-146116901 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATCTTTATCTGAAGGGGAGGAGAGAAGGAAAGGAGAAGGCATCCGAGCGAGGGTGTTCTCCTTCCTGCAG CCGGGTAGGGGGCAGCCAGGTTTGGAGCAGGGTTCTAGGATTACACGGCAAATCCCCAACTTCAGCACCG CGGACAGCATCACCTCCCGCCCAGGGAGAGGCGCGCGCCTCCTTGCTCCGCCCCCGCCCCAGCTGATGGA CCCCGGCCGGTCGGCTCAGTCTCCCTTTTGCTTTCAAACGAGGCCAGGGCAGGGCAGAAGGGTTTTGACA GCCAGAGGGGTACGGTAAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGCGGAGGAGGAGGAGGAGCCGAGGAGGGAA CCGAGAAGGGAAGAGAAGGGAGGGCTTCCCTCCGCCTCGCTCGCCGCCCGGGCTCACAGGAGCTGGCGGC GGCGGCGGCGGCGGCGGCGTCTCCTGCTCTCCGCGGCTGTTGCTGCTGCTCGCGCTCCGCCGCCCGGGAG ATGCTTCCTCGCGCGGCGCAGCGCTGAGGCCGTGCGTGCGCCCCGGCTGCGCTGCGCGCTCCCCACATAC ACAAGCTCTCCATGTGAGCTGACAGGCGAGTGGAAACCCCTCGAGTCACGCTGCCCGGCGGCGGAGGGAG CGCTCGCCCGCAGTGGCAACAGCTGCACCACCGTCCCCGTCGCTCTGCCTTCCTCTTCTGCAGCCTCTGC TCTTCTGATTACCTCCCTCCCCCGTCCTTTGGTGATTTTTTTTTTTCAAGAAGGAGAGGGCGGGGTAGGT GTCCGTTCCCTCCCCTCTTCCCCCTCCTTTGCCTTCTTGGTTTGAATTTCCTCCCCCGGCGTTGCACTGG CACACAGTGCAAGAGGCAATACCCGCACGGAGGGAGAACGAAGGCTGAGACTCCCCTGCCGCTCCAAGCC CGGAAGAACTGGAGCCTGGAGGGGGGTGAGGGGAGAAGAGGAAGCGGGAGGGGCTTGGCTTCCTCGCGTA TTTGAGGACAGCCCATCTCCCTTCAAGAACCCTACGGAGAGTCGGACTGCATCTCCGCAGCGAGCTCTTG GAGCGCCGCCGGCCGGGAGGCGAAGGATGCAGGCGGCTCCGCGCGCCGGCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CNTNAP2_2 ↗ | 7:146,116,642 | 正股 | 146,116,593–146,116,652 |
| CNTNAP2_1 ↗ | 7:148,339,461 | 正股 | 148,339,412–148,339,471 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR7_945ZW4 · promoter · 146116311–146116811 · regulatory
ENSR7_539CXPM · CTCF_binding_site · 146119163–146119184 · regulatory
· motif · 146115985–146115995 · motif
· motif · 146115991–146116001 · motif
· motif · 146119165–146119181 · motif
· motif · 146119242–146119253 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1331 aa
CNTNAP2 蛋白質長 1,331 個胺基酸，具有 27 個胺基酸的訊號序列、長約 1,235 個胺基酸的細胞外區、單一跨膜螺旋，以及 48 個胺基酸的細胞質區。細胞外區含 F5/8 type C、四個 Laminin G-like、兩個 EGF-like 與 Fibrinogen C-terminal 結構域；胺基酸 1,026–1,045 註解為無序區。該蛋白屬於 neurexin 家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CNTNAP2 是單次跨膜的第一型膜蛋白，定位於軸突細胞突起及旁結型細胞連接，並表現在軸突與膠細胞交界的旁結區。 資料未提供定位改變的條件或異構型差異。
未繪示構造：Membrane；Cell projection, axon；Cell junction, paranodal septate junction。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 25 個夥伴
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CNTNAP2 透過其 C 端與 KCNA2 互作，並與 GPR37 互作。來源記載的是蛋白質互作，未提供這些互作是否構成特定複合體，或其功能關係與生物學後果。
疾病與遺傳關聯
CNTNAP2 的基因變異與自閉症 15 的疾病易感性相關；另有一名自閉症類群障礙患者帶有涉及 CNTNAP2 的染色體臂內倒位，斷點同時破壞 AUTS2 與 CNTNAP2。Pitt-Hopkins-like syndrome 1 則被記載為由影響 CNTNAP2 的變異所致，患者可有嚴重智能障礙，並伴隨程度不一的言語發展受損、癲癇、自閉行為、呼吸異常或寬嘴等表現；其動作里程碑正常，或僅輕度至中度延遲。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CNTNAP2 可能是 gap junction 形成所必需；此作用帶有可能性的限定。它與 CNTNAP1 一同參與有髓軸突的徑向及縱向組織，並協助形成有髓神經纖維中不同的功能區域。這些區域對神經衝動的跳躍式傳導至關重要；CNTNAP2 也標示軸突與膠細胞交界的旁結區。 | 推論支持 | 證據與來源Required for gap junction formation (Probable). Required, with CNTNAP1, for radial and longitudinal organization of myelinated axons. Plays a role in the formation of functional distinct domains critical for saltatory conduction of nerve impulses in myelinated nerve fibers. Demarcates the juxtaparanodal region of the axo-glial junction PMID 33238150 ↗ |
| 交互作用 | CNTNAP2 透過 C 端與 KCNA2 互作，並與 GPR37 互作。資料記載這兩項蛋白質互作，但未說明是否形成複合體或其功能後果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | CNTNAP2 是單次跨膜的第一型膜蛋白，位於軸突細胞突起及旁結型細胞連接，並表現在軸突與膠細胞交界的旁結區。資料未指出定位變化的條件或異構型差異。 | 推論支持 | 證據與來源Membrane / Single-pass type I membrane protein; Cell projection, axon; Cell junction, paranodal septate junction; Expressed in the juxtaparadonal region |
| 疾病關聯 | 自閉症 15 是一種複雜、多因素的廣泛性發展障礙，可見社交互動與溝通受損、興趣及活動受限且具刻板性，以及三歲前出現發展異常；多數患者也有中度智能障礙。影響 CNTNAP2 的基因變異與此病的易感性相關，資料未將此關聯表述為直接因果。 | 含實驗來源 | 證據與來源Autism 15 AUTS15 A complex multifactorial, pervasive developmental disorder characterized by impairments in reciprocal social interaction and communication, restricted and stereotyped patterns of interests and activities, and the presence of developmental abnormalities by 3 years of age. Most individuals with autism also manifest moderate intellectual disability. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry MIM: 612100 PMID 18179895 ↗ |
| 疾病關聯 | 一名自閉症類群障礙患者被發現帶有涉及 CNTNAP2 的染色體異常，具體為 46,XY,inv(7)(q11.22;q35) 的臂內倒位。該倒位的斷點破壞 AUTS2 與 CNTNAP2；資料未提供此個案以外的因果證據。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源A chromosomal aberration involving CNTNAP2 is found in a patient with autism spectrum disorder. Paracentric inversion 46,XY,inv(7)(q11.22;q35). The inversion breakpoints disrupt the genes AUTS2 and CNTNAP2 |
| 疾病關聯 | Pitt-Hopkins-like syndrome 1 由影響 CNTNAP2 的變異所致，特徵包括嚴重智能障礙，並可能有言語發展受損、癲癇、自閉行為、呼吸異常及寬嘴等不同表現。與 Pitt-Hopkins syndrome 相比，患者的動作里程碑正常，或僅有輕度至中度延遲。 | 含實驗來源 | 證據與來源Pitt-Hopkins-like syndrome 1 PTHSL1 A syndrome characterized by severe intellectual disability and variable additional symptoms, such as impaired speech development, seizures, autistic behavior, breathing anomalies and a broad mouth, resembling Pitt-Hopkins syndrome. In contrast to patients with Pitt-Hopkins syndrome, PTHSL1 patients present with normal or only mildly to moderately delayed motor milestones. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 610042 PMID 16571880 ↗ · PMID 19896112 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CTTCAAGAACCCTACGGAGAGTCGGACTGCATCTCCGCAG40CGAGCTCTTGGAGCGCCGCCGGCCGGGAGGCGAAGGATGC80AGGCGGCTCCGCGCGCCGGCTGCGGGGCAGCGCTCCTGCT120GTGGATTGTCAGCAGCTGCCTCTGCAGAGCCTGGACGGCT160CCCTCCACGTCCCAAAAATGTGATGAGCCACTTGTCTCTG200GACTCCCCCATGTGGCTTTCAGCAGCTCCTCCTCCATCTC240TGGTAGCTATTCTCCCGGCTATGCCAAGATAAACAAGAGA280GGAGGTGCTGGGGGATGGTCTCCATCAGACAGCGACCATT320ATCAATGGCTTCAGGTTGACTTTGGCAATCGGAAGCAGAT360CAGTGCCATTGCAACCCAAGGAAGGTATAGCAGCTCAGAT400TGGGTGACCCAATACCGGATGCTCTACAGCGACACAGGGA440GAAACTGGAAACCCTATCATCAAGATGGGAATATCTGGGC480ATTTCCCGGAAACATTAACTCTGACGGTGTGGTCCGGCAC520GAATTACAGCATCCGATTATTGCCCGCTATGTGCGCATAG560TGCCTCTGGATTGGAATGGAGAAGGTCGCATTGGACTCAG600AATTGAAGTTTATGGCTGTTCTTACTGGGCTGATGTTATC640AACTTTGATGGCCATGTTGTATTACCATATAGATTCAGAA680ACAAGAAGATGAAAACACTGAAAGATGTCATTGCCTTGAA720CTTTAAGACGTCTGAAAGTGAAGGAGTAATCCTGCACGGA760GAAGGACAGCAAGGAGATTACATTACCTTGGAACTGAAAA800AAGCCAAGCTGGTCCTCAGTTTAAACTTAGGAAGCAACCA840GCTTGGCCCCATATATGGCCACACATCAGTGATGACAGGA880AGTTTGCTGGATGACCACCACTGGCACTCTGTGGTCATTG920AGCGCCAGGGGCGGAGCATTAACCTCACTCTGGACAGGAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。