演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CNPY2HP10390

canopy FGF signaling regulator 2

CNPY2 編碼 canopy FGF signaling regulator 2,屬於 canopy family。它可穩定 myosin regulatory light chain,並促進神經突生長。

Homo sapiens12q13.3UniProt Q9Y2B0
OFFICIAL SYMBOL
CNPY2
CHROMOSOME
12
UNIPROT
Q9Y2B0
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CNPY2 是人類的蛋白質編碼基因,其產物為 canopy FGF signaling regulator 2,屬於 canopy family。蛋白質長 182 個胺基酸,具有 Saposin B-type domain,並帶有一段與避免內質網分泌相關的短基序;其 N 端另有訊號序列註解。這些特徵構成 CNPY2 的基本分子屬性。功能資料指出,CNPY2 與神經突生長的正向調節有關,並藉由穩定 myosin regulatory light chain 參與其中;相關作用方式見功能說明。

Official symbol
CNPY2
Gene name
canopy FGF signaling regulator 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13529
UniProt
Q9Y2B0
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HP10390ZSIG9TMEM4

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1212q13.3
chr12 · 133,275,309 bp · GRCh38chr12p13.33 · 1–3200000 · gnegchr12p13.32 · 3200001–5300000 · gpos25chr12p13.31 · 5300001–10000000 · gnegchr12p13.2 · 10000001–12600000 · gpos75chr12p13.1 · 12600001–14600000 · gnegchr12p12.3 · 14600001–19800000 · gpos100chr12p12.2 · 19800001–21100000 · gnegchr12p12.1 · 21100001–26300000 · gpos100chr12p11.23 · 26300001–27600000 · gnegchr12p11.22 · 27600001–30500000 · gpos50chr12p11.21 · 30500001–33200000 · gnegchr12p11.1 · 33200001–35500000 · acenchr12q11 · 35500001–37800000 · acenchr12q12 · 37800001–46000000 · gpos100chr12q13.11 · 46000001–48700000 · gnegchr12q13.12 · 48700001–51100000 · gpos25chr12q13.13 · 51100001–54500000 · gnegchr12q13.2 · 54500001–56200000 · gpos25chr12q13.3 · 56200001–57700000 · gnegchr12q14.1 · 57700001–62700000 · gpos75chr12q14.2 · 62700001–64700000 · gnegchr12q14.3 · 64700001–67300000 · gpos50chr12q15 · 67300001–71100000 · gnegchr12q21.1 · 71100001–75300000 · gpos75chr12q21.2 · 75300001–79900000 · gnegchr12q21.31 · 79900001–86300000 · gpos100chr12q21.32 · 86300001–88600000 · gnegchr12q21.33 · 88600001–92200000 · gpos100chr12q22 · 92200001–95800000 · gnegchr12q23.1 · 95800001–101200000 · gpos75chr12q23.2 · 101200001–103500000 · gnegchr12q23.3 · 103500001–108600000 · gpos50chr12q24.11 · 108600001–111300000 · gnegchr12q24.12 · 111300001–111900000 · gpos25chr12q24.13 · 111900001–113900000 · gnegchr12q24.21 · 113900001–116400000 · gpos50chr12q24.22 · 116400001–117700000 · gnegchr12q24.23 · 117700001–120300000 · gpos50chr12q24.31 · 120300001–125400000 · gnegchr12q24.32 · 125400001–128700000 · gpos50chr12q24.33 · 128700001–133275309 · gnegCNPY2pq1 bp133,275,309 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr12:56,308,024–56,316,363
Gene span
8,340 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000273308 ★56,309,844–56,315,9886
ENST0000092994156,308,024–56,316,3636
ENST0000097170556,308,024–56,316,3466
ENST0000105709056,308,090–56,316,3634
ENST0000114301456,309,844–56,316,3636
ENST0000092994256,309,847–56,316,3156
ENST0000092994456,310,422–56,316,3636
ENST0000092994656,310,427–56,316,3636
ENST0000092994356,310,428–56,316,3466
ENST0000092994556,310,428–56,316,3635
ENST0000092994756,310,428–56,316,3636
ENST0000106311856,310,428–56,316,3635

顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CNPY2 是神經突生長的正向調節因子。其功能與 myosin regulatory light chain(MRLC)的穩定有關,並透過避免 MRLC 被降解,使這種調節性輕鏈得以維持。來源將這項穩定作用連結至神經突生長,但未進一步說明其細胞或實驗條件。

在分子層面,CNPY2 可阻止 MIR 介導的 MRLC 泛素化。泛素化通常會將蛋白質導向後續的蛋白酶體降解;在此情境中,CNPY2 抑制這個前置標記步驟,因此也避免 MRLC 隨後遭蛋白酶體降解。來源描述的是 CNPY2 對這段降解途徑的抑制,未提供其他調節步驟或更詳細的分子機制。

由此可知,CNPY2 對神經突生長的正向作用,與維持 MRLC 穩定性相連。其作用重點不是直接描述神經突如何延伸,而是透過限制 MIR 促進的 MRLC 泛素化及其後續降解,維持 MRLC。現有資料未進一步界定這項作用在不同細胞類型或生理條件下的差異。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 56315988 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CNPY2 ENST00000273308 GRCh38 chr12:56315888-56316988 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TAAACTGCATGTTTTATAAAATAAAAATAAAATATCGTTTGTTATTTATCTCATTAGAGAACTGCTAGTG
TGGGTTCTCTGGCTTCAGTCTTCCTCTCCTTCCTTTGAAGGTAAAGGTCCGGAATCCAAAGTTATGGATA
TGAAAGGGTATAATTAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACTTCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCAGAGGTG
GGTGGAACACGAGGTCAGGAGTTAAAGACCAGCCTGACCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAT
ACAAAAATTAGCTGGGAGTGGTGGATGGCGACTGTAACCCTAGCTGAGGCAGAAAATTGCTTCAACCCGG
GAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGTATGCCAGCCTGGGCGATAGGGCGAGACTCCGT
CTCAAAAAAAGGGGAAAAAGGTATAATTTATGCCTTTTCTGGGCAATGCTGGGTCTTTGCTATAGCTGCC
CAGTACCCTAAGTCAGACTGAAGATGTACAGTATGGTTTCCGTTAATTGTGTAAGCCGACAAACTACAGG
TCCCAGGATAGCTTGAGACTTGTAGTTGCTCACAAAGATGGGTCCGGTGCTGCGGTGCTTCCTGGGAGAT
GTAGTTTCCTGTGTATTGAAACCTGGACTGCTCGCTGGCCGGCAGCGCACCGTTTTGAAGGTCCTAGCCC
ACCTGGGCTGGCTCACGCGCACGACTAGCCGCTCCCATACAGCACGCCCGGACTCTGTCGTCGCTTAAGG
CCACTCCTATTCTACGGCTGACCCCTGGTGGTCACGTGGATCTGTTCGCCACGCAAGTCTGGGTCCTTCG
GCGATTGACCGGGGTCCTTGCTGTTCGGGAGCCTCTCCTAAGCTGCCTGTTCGCGCGAGAGTTTGGAGGG
GCGGGTTTGGGGTCGGTGTCTGATTGGGGCTCGCACCGCAGCACGCTGGAGTCCCGCTTAGGTACCAGTT
AGCGTCAGGGGAGCTGGGTCAGGCGGTCGCCGGGACACCCCGTGTGTGGCAGGCGGCGAAGCGCTCTGGA
GAATCCCGGACAGCCCTGCTCCCTGCAGCCAGGTGTAGTTTCGGGAGCCAC
CNPY2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CNPY2_1 ↗12:56,315,988負股56,315,978–56,316,037
CNPY2_2 ↗12:56,316,346負股56,316,336–56,316,395

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR12_5H8MCR · CTCF_binding_site · 56315897–56315918 · regulatory

ENSR12_BF6QL · promoter · 56315933–56316478 · regulatory

ENSR12_5H8MF5 · CTCF_binding_site · 56316184–56316205 · regulatory

ENSR12_5H8MP2 · CTCF_binding_site · 56317887–56317908 · regulatory

· motif · 56315357–56315368 · motif

· motif · 56315747–56315757 · motif

· motif · 56315893–56315903 · motif

· motif · 56315899–56315915 · motif

· motif · 56315902–56315911 · motif

· motif · 56315954–56315970 · motif

· motif · 56316179–56316188 · motif

· motif · 56316179–56316188 · motif

· motif · 56316181–56316197 · motif

· motif · 56316181–56316197 · motif

· motif · 56316186–56316202 · motif

· motif · 56316268–56316279 · motif

· motif · 56316282–56316291 · motif

· motif · 56316444–56316453 · motif

· motif · 56317889–56317905 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:182 aa

1 aa182 aa結構域基序訊號胜肽
依 Q9Y2B0 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CNPY2 蛋白質長 182 個胺基酸,屬於 canopy family。序列註解包含位於第 1–20 位的訊號序列、第 24–175 位的 Saposin B-type domain,以及第 179–182 位、標示為避免內質網分泌的基序。

訊號胜肽1–20 aa
結構域Saposin B-type24–175 aa
基序Prevents secretion from ER179–182 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9Y2B0…

AlphaFold · Q9Y2B0

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Endoplasmic reticulum

CNPY2 的定位註解為內質網。 來源未提供定位隨條件改變或異構型之間差異的資料。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HP10390CNPY2ADRA2CMYLIP
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

CNPY2 與 MYLIP/MIR 有交互作用。來源將其記為交互作用,未指出兩者形成特定複合體;CNPY2 對 MIR 介導之 MRLC 泛素化的抑制則屬於功能關係,並不等同於 MYLIP/MIR 與 MRLC 的直接結合證據。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CNPY2 是神經突生長的正向調節因子,作用方式與穩定 myosin regulatory light chain(MRLC)有關。它會阻止 MIR 介導的 MRLC 泛素化,並因此避免 MRLC 隨後遭蛋白酶體降解。資料庫紀錄
證據與來源

Positive regulator of neurite outgrowth by stabilizing myosin regulatory light chain (MRLC). It prevents MIR-mediated MRLC ubiquitination and its subsequent proteasomal degradation

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用CNPY2 與 MYLIP/MIR 有交互作用;此項資料未進一步說明互作的條件或作用方式。含實驗來源
證據與來源

Interacts with MYLIP/MIR

PMID 12826659 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位CNPY2 的細胞內定位註解為內質網。推論支持
證據與來源

Endoplasmic reticulum

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000273308 · 1,450 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGGCGGTCGCCGGGACACCCCGTGTGTGGCAGGCGGCGAA40
41GCGCTCTGGAGAATCCCGGACAGCCCTGCTCCCTGCAGCC80
81AGGTGTAGTTTCGGGAGCCACTGGGGCCAAAGTGAGAGTC120
121CAGCGGTCTTCCAGCGCTTGGGCCACGGCGGCGGCCCTGG160
161GAGCAGAGGTGGAGCGACCCCATTACGCTAAAGATGAAAG200
201GCTGGGGTTGGCTGGCCCTGCTTCTGGGGGCCCTGCTGGG240
241AACCGCCTGGGCTCGGAGGAGCCAGGATCTCCACTGTGGA280
281GCATGCAGGGCTCTGGTGGATGAACTAGAATGGGAAATTG320
321CCCAGGTGGACCCCAAGAAGACCATTCAGATGGGATCTTT360
361CCGGATCAATCCAGATGGCAGCCAGTCAGTGGTGGAGGTG400
401CCTTATGCCCGCTCAGAGGCCCACCTCACAGAGCTGCTGG440
441AGGAGATATGTGACCGGATGAAGGAGTATGGGGAACAGAT480
481TGATCCTTCCACCCATCGCAAGAACTACGTACGTGTAGTG520
521GGCCGGAATGGAGAATCCAGTGAACTGGACCTACAAGGCA560
561TCCGAATCGACTCAGATATTAGCGGCACCCTCAAGTTTGC600
601GTGTGAGAGCATTGTGGAGGAATACGAGGATGAACTCATT640
641GAATTCTTTTCCCGAGAGGCTGACAATGTTAAAGACAAAC680
681TTTGCAGTAAGCGAACAGATCTTTGTGACCATGCCCTGCA720
721CATATCGCATGATGAGCTATGAACCACTGGAGCAGCCCAC760
761ACTGGCTTGATGGATCACCCCCAGGAGGGGAAAATGGTGG800
801CAATGCCTTTTATATATTATGTTTTTACTGAAATTAACTG840
841AAAAAATATGAAACCAAAAGTACAAACTGTGTTGTCTTTT880
881CATGCCTGGAATTGCCCTTACATTAAGCTTGAAGATAAGG920
921AGTTATATAGACAGGAAAGATAATGGAGGAGAAAGAAGAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。